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蛋白家族信息查询数据库

数据库输入 对于这个数据库而言,数据库提供了多种输入方式,我们可以: 1)输入序列来进行比对查看具体是哪个蛋白家族的;2)可以输入蛋白相关的结果:结构域; 3) 也可以通过检测词来检索符合要求的蛋白家族信息...;4)同时可以基于物种来见来查找某一物种的所有蛋白家族信息。...在这个表格当中,可以看到每一个相关家族在数据库当中都包括哪些信息。 我们以Bcl-2家族来进行结果说明。...基本家族信息汇总 在总的结果的界面,我们首先看到的是这个蛋白家族的基本信息,这些基本的介绍主要来自于维基百科。这里我们能看到这个蛋白家族基本的构造、功能、家族相关结构域以及可能相关的基因。...数据库使用场景 以上就是这个数据库的基本内容了。主要还是通过检索某一个特定结构域来获得相关的蛋白家族的信息。如果有研究蛋白家族的同学可以尝试的使用一下这个数据库。算是一个很老派很经典的数据库了。

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数据库信息速递-- 如何评估矢量数据库 (翻译)

什么是矢量数据库 传统的关系数据库系统通过预定义格式在结构化表中管理数据,并且在执行精确的搜索操作方面表现出色,相反,矢量数据库专注于通过矢量嵌入高维数据值来表示存储和检索非结构数据,如音像,音频,视频和文本...功能性 我将矢量数据库的功能分为两个主要类别,即面向数据库的功能和面向矢量的功能。...面向数据库的功能 对于传统数据库有益的许多功能也适用于矢量数据库,例如变更数据捕获(CDC)、多租户支持、资源组和基于角色的访问控制(RBAC)。...Milvus和一些配备了矢量插件的传统数据库有效地支持这些面向数据库的功能。 性能 性能是评估矢量数据库的最关键指标。...与传统数据库不同,矢量数据库进行的是近似搜索,这意味着检索到的前k个结果不能保证100%的准确性。

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SpringBoot数据库配置信息加密

比如你想要连接mysql数据库,只需要的配置文件里面加入mysql的一些配置信息就可以了。为了保护数据的安全性,越来越多的公司选择加密这些重要信息。...接下来一起来看看如何实现配置加密文件并且成功连接数据库的。 配置信息加密有好几种方式,这里我只详细的写一下我比较常用的一种方式。...在spring-boot-autoconfigurejar包的META-INF/spring.factories文件中指定了一个类用来加载数据库配置信息,这个类就是org.springframework.boot.autoconfigure.jdbc.DataSourceAutoConfiguration...自定义数据源 这里使用HikariDataSource作为自定义的数据源,自定义的数据源目的就是为了解密配置文件中的配置信息。...下一篇: SpringBoot 整合mybatis操作数据库

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Mysql自带数据库中的信息

当你新接触一个数据库,对其中的数据库,表,字段什么的都不清楚,这时候需要查找某个字段,怎么办呢?...test 这些数据库完全可以当成是普通的数据库,使用查询语句去获取其中的信息....接下来逐一看一下里面保存了哪些数据. information_schema 这个数据库主要用来存储数据的数据,即你的数据库信息,数据表信息,字段信息等等.表非常的多,这里不逐一列举,仅查看一些常用的表....SCHEMATA:提供了当前mysql实例中所有数据库信息,我们经常使用的show databases就是从这里读取数据的. TABLES:提供了关于数据库中的表的信息(包括视图)。...VIEWS:给出了关于数据库中的视图的信息。 TRIGGERS:提供了关于触发器的信息

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GEO数据库中platform信息详解

GEO数据库中的platform代表测序平台或者芯片平台,每一个platform用GPL开头的编号唯一标识。...soft和miniml都是表示该platform的基础信息,比如GPL编号,上传日期等,soft文件的部分内容如下 ^DATABASE = GeoMiame !...DATABASE代表GEO数据库的基本信息,PLATFORM代表该平台的基本信息,SAMPLE代表用该平台得到的样本信息,SERIES代表使用该平台得到的一组样本。...开头代表一种类型的信息,常规格式为key = value, 比如 Platform_geo_accession = GPL20814 对于芯片平台而言,还会提供探针和基因之间的对应关系等信息,在对应的网页上...miniml中的内容和soft是一样的,只是用XML格式来存储上述信息,而supplement file则是由提交者自己上传的一些补充文件,没有明确的格式。

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PostgreSql 数据库统计信息 why when what

统计信息,没有数据是没有的,但统计信息怎么收集,标准是什么,怎么使用,就值得去看看了。...要说统计信息,首先说一个表 pg_statistic ,这个表本身是存储数据库的状态信息,其中信息通过analyze 命令来获得,并存在在这个表里面,并且这个表被用于查询计划中。...这时一定有人会问, 1 怎么收集统计信息 2 统计信息怎么能更精确 3 是否可以差异化来做,避免对所有表进行统计信息 1 一般来说收集表的统计信息,使用的命令 analyze 来进行,对大表,ANALYZE...而analyze 如果不指定表名,则针对当前数据库的所有表,分区表,继承表,物化视图等。所以建议如果没有特殊的需求,还是给出表名,有针对的进行手动的统计数据更新。 ?...2 - 3 统计信息上面说了,是对表的内容进行随机抽样,而如何让一个表的统计信息更准确,则需要针对你的需要,来调整某个表,可能有人想,都调整了不行吗,这里会牵扯两个问题 1 是否有必要 ,一个基础表,你要那么详尽的统计信息

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3DSNP 数据库 | 注释 SNP 信息

今天给大家介绍的 3DSNP 是一个集成数据库,通过探索人类非编码突变在基因和调控元件之间的远端相互作用来注释突变。...其整合了千人基因组计划中 3D 染色质的相互作用,不同细胞类型中的局部染色质特征以及连锁不平衡(LD)信息。同时也提供了信息丰富的可视化工具,以显示局部和三维的染色质特征以及突变之间的遗传关联。...为了对改变转录因子结合序列的 SNPs 进行注释,3DSNP 使用 TFM-Scan 软件,利用从 TRANSFAC 和 JASPAR 数据库中收集到的一组位置权重矩阵(PWMs) ,在基因组中定位推测的...首先,在搜索框中键入完整 rsid 例如,rs12740374,然后关于该 SNP 的信息将会出现在下面: ?...这里,我们单击“rs12740374”打开一个新页面,其中包含了该 SNP 的所有详细信息。 所有功能类别的得分 ?

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数据库系统中信息与数据

数据库系统基本原理 4.1数据库的基本概念 4.1.1信息、数据、数据处理与数据库技术 信息和数据是数据库管理的基本内容和对象 ? 1. 信息是现实世界事物的存在方式或运动状态的反映 ?...2.数据:是记录现实世界中各种信息并可以被识别的符号,他是信息的载体,是信息的具体 表现形式 3.数据和信息的关系:信息是向人们提供关于现实有关事物的知识,数据则是载荷信息的物理符号,二者是不可分离而又有区别的两个概念...4.数据处理:又称信息处理(严格的说信息处理包含了数据处理),指对各种形式的数据进行收集、存储、加工、传播。...数据库系统阶段:20世纪60年代后期 数据库技术为了解决数据的独立性、实现数据的统一管理、达到数据共享的目的诞生出高级数据库技术(分布式数据库、面向对象数据库) 分布式数据库与面向对象数据库 分布式数据库数据库技术与网络技术相互结合的产物...,他的重要特性就是数据分布的透明性 ,分布式数据库系统是一个统一的整体,用户不需要关心数据的逻辑分布,更不必关心数 据的物理分布 面向对象数据库数据库技术与面向对象设计方法相结合的产物

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