在示例代码中，我们将睡眠数据从以小时为单位的数据更改为分钟。...示例代码将返回动物名称的最后一个单词并使其为小写。...如果同时具有数字和字符列，则尝试对数据进行舍入将导致错误。...（两个level） ifelse（）语句可用于将数字列转换为离散列。...如果要添加另一个数据框的信息，可以使用dplyr中的连接函数。
tibble 是一种简单数据框，它对传统数据框的功能进行了一些修改，其所提供的简单数据框更易于在 tidyverse 中使用。 多数情况下，我们会交替使用 tibble 和数据框这两个术语。...（例如，不能将字符串转换为因子）、变量的名称，也不能创建行名称。...tribble() 是定制化的，可以对数据按行进行编码：列标题由公式（以 ~ 开头） 定义，数据条目以逗号分隔，这样就可以用易读的方式对少量数据进行布局： tribble( ~x, ~y, ~z,...打印 tibble 的打印方法进行了优化，只显示前 10 行结果，并且列也是适合屏幕的，这种方式非 常适合大数据集。...最后总结 tibble 相对于数据框来说，更简单，但更方便使用，两者的主要区别是： tibble 不能创建行名。 tibble 不能改变输入的类型（例如，不能将字符串转换为因子）、变量的名称。
下面介绍 R 中用于存储数据的多种数据结构。 R 的数据结构 在大多数情况下，结构化的数据是一个由很多行和很多列组成的数据集。在 R 中，这种数据集被称为数据框。...因子在 R 中非常重要，它决定了数据的展示和分析方式。数据存储时因子经常以整数向量形式存储。所以在进行数据分析之前，经常需要将它们用函数 factor( ) 转换为因子。...与矩阵不同的是，数据框里不同的列可以是不同模式（数值型、字符型等）的数据。数据框可以通过函数 data.frame( ) 创建。...，要显示或使用数据框的某一变量（列），可以使用 $ 符号加上变量名。...在进行数据分析时，分析者需要对数据的类型熟稔于心，因为数据分析方法的选择与数据的类型是有密切联系的。R 提供了一系列用于判断某个对象的数据类型的函数，还提供了将某种数据类型转换为另一种数据类型的函数。
) 5、complete.cases( ) 判断对象中是否数据完全 6、grep（）找出所数据框中元素所在的列值（仅数据框中） 7、assign（）通过变量名的字符串来赋值 8、 split（）根据因子变量拆分数据框...4 5 6 7 8 9 10 8、 split（）根据因子变量拆分数据框/向量 split（x，f）；x 可以为向量或者数据框，f 为对应的因子，函数以列表的形式返回 > x = data.frame...：把数值型对象分区间转换为因子 table：交叉频数表 split：按因子分组 aggregate：计算各数据子集的概括统计量 tapply：对“不规则”数组应用函数 17、数学计算 +, -, *,...lower.tri：矩阵的下三角部分 mat.or.vec：生成矩阵或向量 t：矩阵转置 cbind：把列合并为矩阵 rbind：把行合并为矩阵 diag：矩阵对角元素向量或生成对角矩阵 aperm：...数组转置 nrow, ncol：计算数组的行数和列数 dim：对象的维向量 dimnames：对象的维名 row/colnames：行名或列名 %*%：矩阵乘法 crossprod：矩阵交叉乘积（内积）
正文 本篇描述了如何计算R中的数据框并将其添加到数据框中。一般使用dplyr R包中以下R函数： Mutate（）：计算新变量并将其添加到数据表中。 它保留了现有的变量。...同时还有mutate（）和transmutate（）的三个变体来一次修改多个列： Mutate_all（）/ transmutate_all（）：将函数应用于数据框中的每个列。...tbl：一个tbl数据框 funs：由funs（）生成的函数调用列表，或函数名称的字符向量，或简称为函数。predicate：要应用于列或逻辑向量的谓词函数。...mutate_if（）对于将变量从一种类型转换为另一种类型特别有用。...# 将所有因子列转化成字符 my_data %>% mutate_if(is.factor, as.character) # 将左右数字列四舍五入 my_data %>% mutate_if(is.numeric
为方便大家理解记忆，对每种数据结构的基本操作概括为四大类： 创建数据结构 往里面添加数据 从里面查询数据 对里面的数据进行修改 这篇文章我们将介绍数据框的使用 数据框 数据框是R语言中的一种类似于表格的数据结构...数据框中的每个向量可以是不同的类型，但同一列的元素必须是相同的类型。 创建数据框 创建数据框的一种常用方法是使用data.frame()函数，它可以将多个向量组合成一个数据框。...即使check.names为FALSE，如果要保留""作为名称，也需要将此参数设置为FALSE。 stringsAsFactors: 逻辑值，指定是否将字符向量转换为因子向量。...，并不将字符向量转换为因子向量 df3 <- data.frame(color = c("red", "green", "blue"), code = c("#FF0000...行列索引号从1开始，表示第一行或第一列，负数表示排除对应位置的元素。名称是指数据框中每个向量的名称，可以用双引号或单引号包围。使用方括号[]访问数据框中的元素时，返回的结果仍然是一个数据框。
数据框dataframe 一个合适表格就和问卷一样，是包含不同类型的数据的。但需要注意的是，数据框的每一列只 包含一种数据类型 ，也就是说每一列如果单独提取出来，都是一个向量。...数据框的来源 image.png as.data.frame(matrix)，可以将矩阵数据转为数据框。 查看数据框 通过head()与tail()快速查看，默认提取前六行。...修改数据框 和向量是一样的，也就是选择+赋值。...当通过名称对数据框进行选择的子集不存在时，R会帮我们创建一个新的内容。 排序 order() 会将其中的元素按照大小顺序排列，并按照大小顺序返回元素所在的位置数据。...tbl_df, tbl, data.frame，用as_tibble()可以将一个数据框转换为tibble，或者直接通过tibble 像创建数据框般创建tibble 数据框： t.bp <- tibble
数据框 由于不同的列可以包含不同模式（数值型、字符型等）的数据，数据框的概念较矩阵来说更为一般。它与你通常在SAS、SPSS和Stata中看到的数据集类似。数据框将是你在R中最常处理的数据结构。...每一列数据的模式必须唯一，不过你却可以将多个模式的不同列放到一起组成数据框。由于数据框与分析人员通常设想的数据集的形态较为接近，我们在讨论数据框时将交替使用术语列和变量。...基于标记(如果存在)或离开的参数本身创建组件名称。row.names参数为NULL或单个整数或字符串，指定要用作行名称的列，或给出数据框行名称的字符或整数向量。...check.rows如果为真，则检查行长度和名称的一致性。check.names 如果为真，则检查数据框中变量的名称，以确保它们是语法上有效的变量名称，并且不重复。...stringsAsFactors字符向量应该转换为因子吗?“factory-fresh”默认值为TRUE，但是可以通过设置选项来更改(stringsAsFactors = FALSE)。
因子具有因子水平（Levels），用于限制因子的元素的取值范围，R强制：因子水平是字符类型，因子的元素只能从因子水平中取值，这意味着，因子的每个元素要么是因子水平中的字符（或转换为其他数据类型），要么是缺失值...通常情况下，在创建数据框变量时，R隐式把数据类型为字符的列创建为因子，这是因为R会把文本类型默认为类别数据，并自动转换为因子。前面我们在讲数据框时，就有提到。...在数据清理时，可能需要去掉与因子水平对应的数据，通常情况下，需要删除未使用的因子水平，可以使用droplevels函数，它接受因子或是数据框作为参数。...如果x是数据框，那么把数据框中未使用的因子删除。...,c(150,170,190)) [1] (150,170] (170,190] (150,170] Levels: (150,170] (170,190] 8 修改数据框中的因子 一般情况下，数据框中的字符类型的列会转换为因子类型
一、基本 1.数据管理 vector：向量 numeric：数值型向量 logical：逻辑型向量character；字符型向量 list：列表 data.frame：数据框c：连接为向量或列表 length...因子 factor：因子 codes：因子的编码 levels：因子的各水平的名字nlevels：因子的水平个数 cut：把数值型对象分区间转换为因子table：交叉频数表 split：按因子分组aggregate...数组 array：建立数组 matrix：生成矩阵data.matrix：把数据框转换为数值型矩阵lower.tri：矩阵的下三角部分 mat.or.vec：生成矩阵或向量t：矩阵转置 cbind：把列合并为矩阵...rbind：把行合并为矩阵diag：矩阵对角元素向量或生成对角矩阵aperm：数组转置 nrow, ncol：计算数组的行数和列数dim：对象的维向量 dimnames：对象的维名row/colnames...sweep：计算数组的概括统计量aggregate：计算数据子集的概括统计量 scale：矩阵标准化matplot：对矩阵各列绘图 cor：相关阵或协差阵Contrast：对照矩阵 row：矩阵的行下标集
: xts() 1.5 因子Factor：factor（补充） 2.查看数据概况 summary()和str() 3.修改/替换/重定义数据 4.数据合并 3.1 向量合并 3.2 cbind列合并（等长...以下4种类型是最常用的：向量、矩阵、数据框、时间序列。...("C.1", "C.2", "C.3")) 定义矩阵行名和列名 1.3 数据框 DataFrame: data.frame() #其中" <- "是赋值的意思，将向量c(11:15)赋值给对象x >...x数据集中第一列数据 #方法二：dplyr::mutate#数值重定义和赋值 #将Ozone列取负数赋值给new，然后Temp列重新计算为(Temp - 32) / 1.8 mutate(airquality...转置是一个数学名词，把行和列进行互换，一般用于对矩阵的操作。
", "B2", "B3"), c("C1", "C2", "C3", "C4"))) 4)数据框(data.frame)：不同的列可以包含不同模式(数值型、字符型等)的数据，很重要！...5)因子(factor)：类别(名义型)变量和有序类别(有序型)变量在R中称为因子（factor），绘图时候重要。 6)列表(list)是R的数据类型中最为复杂的一种。...选择多行或多列时，下标i 和j 可为数值型向量。 3)数组：从数组中选取元素的方式与矩阵相同 4)数据框：可以使用前述（如矩阵中的）下标记号，亦可直接指定列名。...) #检查搜索路径中的数据框，以定位到这个变量plot(mpg, disp)detach(mtcars) #函数detach()将数据框从搜索路径中移除 with(mtcars, {nokeepstats...logical_value,sep="delimiter", row.names="name") 注1：help(read.table)：更多详情 注2：stringsAsFactors=FALSE，可禁止将字符型变量将转换为因子
(user_id，item_id)作为每行的一对标识ID（因子），前面的“.”号省略数据框名称；summrize是一个函数fun；liulan是一个变量，最后生成的数据框只有user_id，item_id...详情参见例子 R语言利器之ddply transform(x，y)——将x和y的列转换成·一个数据框。...修改数据组织结构，创建一个数据矩阵，以id.var作为每行的编号，剩余列数据取值仅作为1列数值，并用原列名作为新数值的分类标记。...as.order()——将向量转化为有序因子 is.factor()——判断是否为无序因子 is.order()——判断是否为有序因子 列表和数据框...vecter_horizontal>, , color = )——绘图类似plot dplyr——输出处理包 tbl_df（）——将数据转换为一种特殊的数据框类型
R有很多内置的示例数据集包括向量、矩阵数据框等，可以使用data()进行查看，接下来我们以R内置数据mtcars（32辆汽车在11个指标上的数据）为例进行分析，如下所示： ⑴内容添加与修改 ①添加修改新变量...，可以使用fix()函数，该函数可以调用文本编辑器然后使用键盘来对数据框进行修改，如下所示： 使用names()函数可以调用或重新赋值变量名，如下所示： ②数据融合与删除 横向合并两个数据框，需要使用...如果仅仅是合并数据（不关心行、列的对应情况或者确定行、列正好对应），可以使用函数cbind()和函数rbind()来横向、纵向合并数据框或者矩阵、向量。...其中x为向量或矩阵，method为标准化方法，MARGIN=1按行处理，MARGIN=2按列处理： ①method="pa"，将数据转换为有-无（1-0）类型，若分析不加权的情况群结构下可以使用； ②method...ggplot2不能识别矩阵，所有分组信息也必须转换为因子变量组成数据框。由于数据框存储的数据量要远大于矩阵，因此ggplot2可以做出信息含量更加丰富的图形。
$赋值mlist[[5]]=iris删除#负值删除，或=NULLmlist[[5]]=NULL数据框创建state=data.frame(state.name,state.abb,state.x77)访问...$名称访问3.attach()4.with()单双括号的区别因子factor——用于统计分析因子用factor()函数把字符型向量转换成因子x <- c("男", "女", "男", "男", "女"...# Levels: 男 女attributes(sex)## $levels## [1] "男" "女"## ## $class## [1] "factor"as.numeric(sex) #把因子转换为纯粹的整数值...#labels：指定各水平的标签, 不指定时用各水平值的对应字符串 #exclude：指定要转换为缺失值(NA)的元素值集合 #ordered：取真值时表示因子水平是有次序的(按编码次序)cut()函数连续取值的变量...，可以用cut()函数将其分段， 转换成因子使用breaks()参数指定分点， 最小分点要小于数据的最小值， 最大分点要大于等于数据的最大值， 默认使用左开右闭区间分组cut(1:10, breaks=
为每列创建vectors/factors(提示：您可以键入每个vectors/factors，如果您希望更快速的创建，可以尝试使用rep()函数) 将它们放到一个数据框中，这个数据框命名为meta 使用...检查meta数据框中的行名称是否与counts(内容和顺序)中的列名称相同 将现有 stage列转换为因子数据类型 1str(meta) 2all(rownames(meta) %in% colnames...WT的样本的所有数据 使用filter()/ select()仅返回myc> 50的那些样本的stage和genotype列 在数据框的开头添加一个名为pre_treatment的列，其值为T、F、T、...将列的名称更改为：“ A”，“ B”，“ C”，“ D”，“ E” 1meta[,c(2,3)] 2#or 3meta[,c("stage","genotype")] 4 5meta[c(1,7,8...让我们创建一个包含count和metadata的数据列表，为后续分析做准备。 使用meta和count对象创建名为project1的列表，并从两个数据框之一中提取所有样本名称创建一个新向量。
在数据文件中有行头且首行的字段名比数据列少一个的情况下，数据文件中第1列将被视为行名称。除此情况外，在没有给定row.names参数时，读取的行名将会自动编号。...()函数读取字符型数据时是否转换为因子型变量。...当其取值为FALSE时，该函数将把字符型数据转换为因子型数据，取值为TRUE时，仍将其保留为字符型数据。...其取值可以是逻辑值向量（必要时可以循环赋值），数值型向量或字符型向量，以控制哪些列不被转换为因子。...注意：可以通过设置参数 colClasses = "character"来阻止所有列转换为因子，包括数值型的列。 （10）na.strings 可选的用于表示缺失值的字符向量。
逻辑值，指示表格是否包含文件第一行中的变量名称 sep 分隔数据值的分隔符。...例如，colClasses = c（“numeric”，“numeric”，“character”，“NULL”，“numeric”）将前两列读取为numeric，将第三列读取为character，跳过第四列...此选项对于跳过文件中的标题注释很有用 stringsAsFactors 逻辑值，指示是否应将字符变量转换为因子。除非被colClasses覆盖，否则默认值为TRUE。...",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名 (3)数据框的导出 write.table(X,file = "yu.txt",sep...，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列） (6)直接使用数据框中的变量 plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width) #iris是R语言的内置数据，可以直接使用
[第几行 ,第几列] = 赋值修改后的数据修改一个列的数据文件名$列名 = c()赋值修改后的向量（先提取一个列$，再修改）增加一列的数据文件名$列名 = c()赋值修改后的向量（$提取的是一个全新的列名...，之前不存在的）修改行名rownames() = c()赋值修改后的向量 （行名都是一样的）修改其中一列的列名colnames(文件名)[第几列]= “”赋值列的名字（每一列名字都不一样）两个数据框的连接...：merge(数据框1，数据框2，by = “共同列的名字”) (有一个相同列的名字)merge(数据框1，数据框2，by.x = “x列的名字”, by.y = “y列的名字”) （没有相同的列的名字...t()转置（将行和列互转，要先给列改名，不然转置没有区别> colnames(m) m a b c[1,] 1 4 7...9转换为数据框 m = as.data.frame()可以用class来判断是否转换成功list列表 新建> x <- list(m1 = matrix(1:9, nrow = 3), +
8.GSE是整体数据集的编号 GSM是每个样本的编号 GPL是平台号 GDS是多个GSE9.gset = getGEO(GEO='GSE12417', destdir="."...11.ctrl+f是网页对应的搜索键。12.转录组测序测的是mRNA。包括前体和成熟的rna。第一行样本名 第一列是基因。...0维是点 是元素1维是线 是向量2维是面 是数据框13、向量vectors 矩阵，数组，数据框，列表14.数据类型 数值型 字符型 逻辑型 因子型15.使用c（）来创建向量，向量具有有序性，单个向量数据类型相同...数值型转字符型16.涉及字符要加引号17.library一般不加引号18.c可以创建向量或列表数据框按照列的方式排列19.a1=c[3,c(1，2)]提取第三行一二列 a1[3,] a 美元符号第二列名称...21.构造数据框的函数a=data.frame()。22.图片第四行说明其是芯片数据。at是探针 引物不特异导致了一个ID对应多个基因。phenodata 中data临床数据和expr表达矩阵很重要。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
即时通信 IM
ICP备案
对象存储
实时音视频
