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使用基于pythonvelocyto软件RNA速率分析

单细胞领域一个高级分析是RNA速率分析,使用velocyto软件可以,我们同样把它区分为上下游分析。...上游分析需要在Linux操作环境里面,前面对10x测序数据fq文件完成了 cellranger命令之后会有一个outputs文件夹。...在该文件夹运行conda安装好Python版本velocyto软件即可,输出loom文件,供下游R里面操作。...从cellranger得到loom文件 这里需要 使用基于pythonvelocyto软件,它需要3个参数,其中两个是gtf文件,一个是前面cellranger命令outputs目录哦,完整命令如下...号外: 我们提供单细胞数据分析服务哦 明码标价之10X技术单细胞(2.5万每个)(标准100G测序数据) 明码标价之10X转录组原始测序数据cellranger流程 明码标价之单细胞转录组质控降维聚类分群和生物学注释

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数据分析有Excel了,还需要BI软件吗?

Excel应该是被用得最多数据统计和数据分析软件了,它具备了很多强大功能,像数据记录整理、数据加工计算、数据透视表、数据可视化等。...作为一个数据分析入门工具,Excel具有十分突出优势,就算是初学者,通过简单学习就能够掌握基本操作技巧。很多人也认为数据分析用Excel就可以解决了,不再需要BI软件。...很多小型企业用Excel数据分析,可能只是每周或每月汇报基本数据报告,并不需要做深入问题研究及策略分析。但是,如果是为了辅助决策者实时、高效、科学决策,Excel是完全无法满足领导者需求。...在数据可视化方面,Excel和BI软件一些简单图表分析所使用图形工具有相同,比如两者都有的柱状图,饼图、折线图等等,但BI软件中在图形多样化展示上远多于EXCEL。...Excel从本质上来说,只是数据统计、数据分析数据可视化一种基础工具,而BI软件就是从数据接入、数据准备、数据分析数据可视化到数据分发应用一个产品平台,不仅包含Excel能做部分,真正目的是通过最终得出数据结果发现问题

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如何薪酬数据回归分析

回归分析是统计学里一个数据分析方法,可能很多小伙伴不清楚什么是回归分析,我们先来介绍下 ? ?...回归分析在薪酬数据分析应用,就是我们可以通过这种数据分析方法来分析职级和对应薪酬是否是合理,我们通过案例来讲解。...,我们来分析下,这个表各个职级和职级对应薪酬拟合度是否是合理,我们先在EXCEL表上找到数据分析工具。...数据--数据分析工具 ? 然后打开数据分析工具,找到回归分析 ? 点击确认,选择Y值和X值数据,并且勾选下面的显示图表,X值是指职级,Y值是指薪资。 ?...点击确认,会生产这样几张图表,黄色表示是一个标准线性函数,蓝色是我们实际数据函数。

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为什么学了那么多软件,还是不好数据分析

大概是自带了亲和属性,经常会有很多机会听到身边同事、朋友,甚至一些仅有数面之缘的人分享他们对于职业看法和困惑。前不久,身边相熟妹子,非常困惑地问我,为什么学了那么多软件,还是不好数据分析?...据不完全统计(也就是我身边案例),我至少知道有4,5个小伙伴因为选择了这样开始,最后彻底放弃了数据分析念头。 以严谨著称特质,使得大部分统计学教材都非常系(sheng)统(se)。...一本优秀教程书不是写多高深,而是尽可能让人读起来引人入胜,用起来回味无穷。 一句话总结:虽然我经常说能用Excel事,我绝不用其他软件。但是SQL这个东西,还是一定要学。...所以这一类软件里,请给自己先留一点遗憾,我们只学习Excel,包括但不限于数据表格,数据透视表,Excel统计分析工具箱,以及一些常用公式。...3)第三类:SPSS,SAS,Matlab,Stata,Eviews 把这两个软件放在一起,可能对于很多SAS牛人来说,有点折价。诚然,都是数据分析软件

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用Python数据分析

下面是Python数据分析和处理任务中重要库与工具: 1. Numpy 官网:http://www.numpy.org/ Numpy库是Python数值计算基石。...Pandas将表格和关系型数据灵活数据操作能力与Numpy高性能数组计算理解相结合。提供复杂索引函数,使得数据重组、切块、切片、聚合、子集选择更为简单。...Pandas是数据分析和处理工作中,实际使用占比最多工具,使用频率最高,也是本教程主要介绍内容。 ...但如果对于数据分析、处理、机器学习等相关工作,我强烈推荐基于webJupyter notebook。 这个代码测试、开发、编辑、文字工具,真的是谁用谁知道,并且也是本教程主要内容之一,吐血推荐!...在我以前数学建模过程中,使用Python完全可以取代MATLAB。

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使用admixture软件祖先成分分析小实例

参考文章 •宇宙实验媛 公众号文章 《群体结构分析三种常用方法(下篇)》 admixture软件下载 http://software.genetics.ucla.edu/admixture/download.html...不需要安装,解压出来即可使用 数据 使用这篇文章中获得 https://www.jianshu.com/p/5938ca3b6725 vcf 文件 第一步:plink格式转化 plink --vcf...版本是1.9 第二步:admixture软件祖先成分分析 这里K随便选择一个5 admixture --cv KiwifruitPathogen.bed 5 | tee log5.out 遇到报错 *...Use integers找到解决办法 https://www.biostars.org/p/236704/ 有人说将第一步plink生成.bim文件第一列内容改成整数 我这里数据用到是细菌单倍体...,输出结果 意外是将bim文件中CM000染色体编号替换为数字1后,使用smartpca做主成分分析也成功了!

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数据产品竞品分析怎么

有和一些产品经理交流过关于竞品分析体会,他们问题相信你也曾经遇到过。 一、数据产品竞品分析困惑 何时分析,需求评审时却经常被开发或领导Diss,你知道竞品是怎么么?...在着手竞品分析之前,你要想清楚本次分析想要达成什么目标。研究竞品目标跟产品所处阶段密切相关。当你产品还未上线,处于前期调研和规划阶段,那么竞品分析需要重点解决产品做什么,为什么要做问题。...表现层:用户操作体验如何,有哪些值得借鉴交互流程。例如针对全局筛选器功能,在兼顾功能复杂性和用户操作易用性方面,竞品都是怎样?...三、总结:数据产品竞品四要三不要 竞品分析文章很多,本文主要结合数据产品特性分享数据产品竞品分析技巧,除了讲到五个步骤三个方法外,还有几点建议,希望对你未来数据产品工作有所帮助: 四要: 要养成定期竞品分析习惯...不要罗列功能缺少洞见,知道竞品是做什么有什么功能不是目标,重要是优缺点判断以及你准备怎么结论。 在做竞品分析过程中,你最常用分析方法是什么,分析过程曾遇到过哪些困惑,是如何解决呢?

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风控中必数据分析

数据领域就没有不做数据分析,大数据风控也不例外。 我观点是风控和其他互联网业务都是互通,本文介绍下风控中必数据分析,用以说明数据分析是一通百通。 工欲善其事,必先利其器。...SQL是数据分析师以及算法工程师用最多技能。能不能从海量业务数据中取出正确数据,是解决问题前提。而Excel透视表强大到万物皆可透视。不夸张地说,我就没见过透视表解决不了问题。...数据分析平台,开源有metabase,收费有tableau,都可以连接数据库实时交互,并提供丰富智能仪表盘。...我们可以围绕这些数据构建出对业务理解,例如统计出如下数据结果。 需要说明是,对于业务理解,需要分析绝不止以上内容。...如大家所见,在风控领域所在数据分析,应该和其他互联网领域数分并无本质区别。 因为风控和其他业务一样,本质都是用户生命周期管理。基于相同底层逻辑,数据分析必然也并无二致。

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【职业】为什么学了那么多软件,还是不好数据分析

大概是自带了亲和属性,经常会有很多机会听到身边同事、朋友,甚至一些仅有数面之缘的人分享他们对于职业看法和困惑。前不久,身边相熟妹子,非常困惑地问我,为什么学了那么多软件,还是不好数据分析?...据不完全统计(也就是我身边案例),我至少知道有4,5个小伙伴因为选择了这样开始,最后彻底放弃了数据分析念头。 以严谨著称特质,使得大部分统计学教材都非常系(sheng)统(se)。...一本优秀教程书不是写多高深,而是尽可能让人读起来引人入胜,用起来回味无穷。 一句话总结:虽然我经常说能用Excel事,我绝不用其他软件。但是SQL这个东西,还是一定要学。...所以这一类软件里,请给自己先留一点遗憾,我们只学习Excel,包括但不限于数据表格,数据透视表,Excel统计分析工具箱,以及一些常用公式。...3)第三类:SPSS,SAS,Matlab,Stata,Eviews 把这两个软件放在一起,可能对于很多SAS牛人来说,有点折价。诚然,都是数据分析软件

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AlexNet文档布局分析 (版面分析)&数据

文档布局分析 (Document Layout Analysis) 是识别和分类文本文档扫描图像中感兴趣区域(RoI, Regions of Interest) 过程。...阅读系统需要从非文本区域分割文本区域,并按正确阅读顺序排列。将文本正文,插图,数学符号和嵌入文档中表格等不同区域(或块)检测和标记称为几何布局分析。...但文本区域在文档中扮演不同逻辑角色(标题,标题,脚注等),这种语义标记是逻辑布局分析范围。 ?...项目相关代码 和预训练模型 、数据集 获取: 关注微信公众号 datayx 然后回复 版面分析 即可获取。 AI项目体验地址 https://loveai.tech ? ?...AlexNet特点: 更深网络结构 使用层叠卷积层,即卷积层+卷积层+池化层来提取图像特征 使用Dropout抑制过拟合 使用数据增强Data Augmentation抑制过拟合

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“大数据”时代,什么是数据分析不了

决策之时他并没有忘记那些数据,但最终他采用了另一种不同思维方式。当然,他是正确。商业建立在信任之上。信任是一种披着情感外衣互惠主义。...在困境中做出正确决策的人和机构能够赢得自尊和他人尊敬,这种感情上东西是非常宝贵,即便它不能为数据所捕捉和反映。 这个故事反映出了数据分析长处和局限。...即便是一部普普通通小说,数据分析也无法解释其中思路。...最佳经济刺激手段到底是什么?人们对此争论不休,尽管数据像海浪一般涌来,就我所知,这场辩论中尚未有哪位主要“辩手”因为参考了数据分析而改变立场。...数据分析结果看似客观公正,但其实价值选择贯穿了从构建到解读全过程。 这篇文章并不是要批评大数据不是一种伟大工具。只是,和任何一种工具一样,大数据有拿手强项,也有不擅长领域。

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“大数据”时代,什么是数据分析不了

决策之时他并没有忘记那些数据,但最终他采用了另一种不同思维方式。当然,他是正确。商业建立在信任之上。信任是一种披着情感外衣互惠主义。...在困境中做出正确决策的人和机构能够赢得自尊和他人尊敬,这种感情上东西是非常宝贵,即便它不能为数据所捕捉和反映。 这个故事反映出了数据分析长处和局限。...即便是一部普普通通小说,数据 分析也无法解释其中思路。 数据会制造出更大“干草垛” 这一观点是由纳西姆?...大数据时代特征之一就是,“重大”发现数量被数据扩张带来噪音所淹没。 大数据无法解决大问题 如果你只想分析哪些邮件可以带来最多竞选资金赞助,你可以做一个随机控制实验。...人们对此争论不休,尽管数据像海浪一般涌 来,就我所知,这场辩论中尚未有哪位主要“辩手”因为参考了数据分析而改变立场

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PandasAI——让AI数据分析

前言 PandasAI是一款数据分析领域ChatGPT应用,本文对原项目进行翻译旨在进行知识科普和梳理。...这个项目的github地址为:https://github.com/gventuri/pandas-ai PandasAI Pandas AI 是一个 Python 库,它为 Pandas(一款流行数据分析和操作工具...它使 Pandas 具有对话能力,允许你向你数据以 Pandas DataFrame 形式提问并获得答案。...隐私和安全 为了生成运行 Python 代码,我们取 dataframe head,将其随机化(对敏感数据使用随机生成,对非敏感数据进行打散)并只发送head。...PandasAI对象 我们主要关注一下它run方法: 环境变量 由于需要借助LLM(大模型)能力进行分析结果生成,这里需要设置LLMAPI key。

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常用网站软件、网站制作软件分享

网站制作中用到软件很多,针对前端开发人员有Dreamweaver,图片软件有Firework和photoshop,正对后端开发软件更多,不同开发语言用到软件都不一样,如果您不是开发人员,只想做网站的话可以去下载网站管理系统来...,比如国内PageAdmin系统,Discuz系统等等都是很不错建站系统,下载下来不需要什么经验就可以自己网站。...这里正对开发人员软件,介绍几块主要网站制作开发软件。...二、图像处理软件: 1、Flash是由macromedia公司推出交互式矢量图和 Web 动画标准,由Adobe公司收购。Flash动画的人被称之为闪客。...三、数据软件: 1、MSSQL是指微软SQLServer数据库服务器,它是一个数据库平台,提供数据从服务器到终端完整解决方案,其中数据库服务器部分,是一个数据库管理系统,用于建立、使用和维护数据

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数据分析应该了解——留存率模型

举个例子,假如要算7天留存用户,那么第7天活跃总用户数 = 第7天新增用户数 + 第6天新增用户数 x 第1天留存率 + 第5天新增用户数 x 第2天留存率 + …… + 第1天新增用户数...模型2.0 一旦可以算出未来活跃用户数量,我们就可以粗略计算未来收益、销售额等数据。 而这个模型可以继续优化,增加更多参数,使得计算结果更加接近真实情况。...但是只要公式正确,结果总归会趋近于真实情况。 尽管你可能一时看不懂,但是我们还是YY了一个产品,YY了一些数据,把它成本测算和收益预估做出来了。 ? ?...有了两个渠道用户、成本后,就可以算更多数据了!先把总成本算出来(蓝底部分),再算用户数据(绿底部分),再然后,可以添加自己转化数据(黄底部分)进行测算了!GMV都能算出来!...注意最后一行红底部分,如果添加了KPI,就可以直接知道是否需要调整策略了! 当然,这里面的所有数据都是我胡诌,你要是真以为我们11月可以做到近2000万GMV,那你真是可爱极了。 03.

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有用数据分析,从做好MVP开始

数据分析MVP方法,是在数据正式生产出来以前,先根据数据需求和使用场景,提供虚拟数据结果,从而检验数据有效性,发现真正数据需求。 这套方法在数据分析领域非常好使!...因为它能解决数据分析核心难题:做了半天,没有屁用。数据分析背后《统计学》《数学》《运筹学》《博弈论》《机器学习》各种理论多了去了,因此极易引发自嗨。...数据自己嗨得不行,各种理论算腾挪跌宕,到了用户那里: ★ “我早知道了!” ★ “你有啥用!” ★ “你咋落地!” 一键三连。这项目就必败无疑了。...这里就需要引入更多分析,因为“好”“不好”本身就需要做分析 1、用什么指标衡量好 2、连续好,还是单次好 3、在什么范围内评选好 在这个阶段,MVP时,可以直接把一些可预计,很纠结问题提前丢出来,...业绩是一线做出来,一线需要是SOP,是弹药,因此数据要进一步,比如: 1、优秀标杆数据指标(呼叫次数?时间分配?跟进机会?) 2、优秀标杆目标客户(是否特定客户容易成功?)

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【译文】R数据分析有用包清单

R提供了很多包可以来数据分析。除了给我们提供一个非常好界面以便于我们进行统计分析以外,而且它最大优点就在于R语言得到了全球开发者和许多数据科学大师们鼎力支持。...现在,可供世界各地使用者下载R包多达7000个。 除了一些大家熟悉R包,比如caret、ggplot、dplyr、lattice,还有很多被证实数据分析很有用但是不易被我们察觉包。...鉴于此,我们创立了一个与数据分析相关且易于理解R包清单。 为了使这份向导更有参考价值,我们还进一步做了两件事: 1映射这些R包以用于让这些平台可以进行预建模、建模以及再建模操作。...2创造了一个这些常用包信息图。而分析师可以方便快捷打出一份参考资料。这个信息图如下: ? Ryan He 翻译 王陆勤审核 PPV课原创文章,转载请注明出处!.../www.analyticsvidhya.com/blog/2015/08/list-r-packages-data-analysis/ PPV课其他精彩文章: ---- 1、回复“干货”查看干货 数据分析师完整知识结构

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活动效果数据分析,这样才对!

“如果让你来评估这次活动,你会怎么分析”无论是面试还是工作,数据分写同学都经常遇到这个问题。今天我们系统讲解一下。...比如,如何评价该活动,可以回答: 1、这个活动很好,该继续; 2、这个活动不好,不能做 3、这个活动不好不坏,鸡肋 4、这个活动没有任何改变,做了也白做 这才是评估类分析核心结论。...4、浑水摸鱼:这是改变用户心智资源,数据岂能衡量! 总之,十个运营里最多只有俩,能准确说清楚现状和目标。这时候就需要数据分析师自己有独立判断能力。能分析业务逻辑、梳理业务过程,才能得出客观结论。...数据评估,最忌讳搞几百个指标然后巨复杂评估公式,混淆进来东西越多,就有越多搞文字游戏空间,就越容易粉饰太平。越简单清晰评估,才越容易看出问题。 第三步 设定判断标准。...第四步 找影响结果过程。 以上1、2、3步都是为了得出判断铺垫。有了“好/坏”判断。就能进一步分析为啥好,为啥坏。这时候就需要细化梳理业务流程,找到能影响结果关键点。

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