如果这里面确实没有你需要的NGS技术,你需要做的仍然是看完我这些视频,搞清楚我是如何学习一个ngs技术的,然后把这个技能迁移到你自己的ngs数据。你会发现,万变不离其宗,本质上都是Linux能力,如何在服务器里面配置和管理软件,如何看各个软件说明书文档。
腾讯视频链接:https://v.qq.com/x/page/x3230xgj0x6.html
发表在Cancer Cell 2019 Sep的文章 PMID: 31474569:《Single-Cell Transcriptomics in Medulloblastoma Reveals Tumor-Initiating Progenitors and Oncogenic Cascades during Tumorigenesis and Relapse. 》
比如Nextflow、Snakemake等等,这方面的各种教程多如牛毛,我这里就不赘述了,大家根据关键词搜索即可自行学习。
但是读者多了之后我接受到的大家的反馈就是从ncbi的sra数据库里面下载sra文件实在是太慢了,因为我做演示的服务器在境外,所以自己压根就没有意识到这点。但是陆陆续续有小伙伴告诉我应该是使用aspera从ebi的ena数据库直接下载fastq文件即可,高速而且还少了一个sra文件转为fastq的步骤。所以后来我也开始在日常更新的公众号里面推荐这个方法,就是参考:使用ebi数据库直接下载fastq测序数据 , 需要自行配置好,然后去EBI里面搜索到的 fq.txt 路径文件:
一些小伙伴根据我们提供的资料做出来了自己的系列笔记,比如新鲜出炉的一篇NC单细胞文章图表复现的7个笔记:
现如今,随着互联网上提供免费视频的网站越来越多,但是为了让用户在体验上会不断的增强,在选择网站的时候还是要掌握好一些技巧,这样才能够在观看视频过程中越来越方便快捷,大大地提高了在这方面的体验感。接下来,由小编告诉你几个技巧,对选择还是很有帮助的。
比如肿瘤异质性研究的标准思路(多组学+多位点取样),发表在 Clin Cancer Res 2021; 的 文章:《Multiomic Analysis Reveals Comprehensive Tumor Heterogeneity and Distinct Immune Subtypes in Multifocal Intrahepatic Cholangiocarcinoma》
无论是出于分享、娱乐或是教育的目的,视频都被广泛应用在社交平台、短视频APP甚至是新闻平台。与此同时,个人和自媒体对于视频剪辑软件的需求也随之增加。比如,你可能会想要将电视剧中的精彩片段截取出来混剪成一段有趣的视频后分享等,这就需要视频剪辑软件了。
我之所以注意到它,主要是他们做了芯片加上测序再结合qPCR,非常的保险。胞外囊泡的芯片分析共发现了85种差异circRNA分子,癌与癌旁组织的高通量测序分析发现了140种显著差异的circRNA分子。两种分析的结果中发现了3个circRNA变化趋势一致,最后又使用QPCR分析,如下所示:
去年,我们的Volume I成功发表40篇论文,获得60000多次阅读和下载量,效果良好,所以Frontier出版社主动联系我们积极筹办Volume II,现已开放在线投稿,欢迎赐稿主题为“计算表观遗传学”,与细胞重编程,人类疾病,细胞分化相关的计算表观遗传学方向的研究者不要错失良机。
但是在高通量测序大行其道的这10年,困扰大家的问题在于如何从繁多的基因定位到少量的几个基因,这也就是数据挖掘的核心,缩小目标基因!各种数据挖掘文章本质上都是要把目标基因集缩小,比如表达量矩阵通常是2万多个蛋白编码基因,不管是表达芯片还是RNA-seq测序的,采用何种程度的差异分析,最后都还有成百上千个目标基因。如果是临床队列,通常是会跟生存分析进行交集,或者多个数据集差异结果的交集,比如:多个数据集整合神器-RobustRankAggreg包 ,这样的基因集就是100个以内的数量了,但是仍然有缩小的空间,比如lasso等统计学算法,最后搞成10个左右的基因组成signature即可顺利发表。
每个癌症基本上都对应一个CNS文章,集中在2012年前后发表的,然后就爆发了2016年前后的TCGA数据库挖掘的大潮,但是TCGA官方在2018和2020自己团队就出了两次CNS子刊级别的TCGA数据库挖掘系列文章,基本上就断绝了TCGA数据库挖掘出好文章的可能性。
CNS图表复现之旅前面我们已经进行了9讲,你可以点击图表复现话题回顾。如果你感兴趣也想加入交流群,自己去:你要的rmarkdown文献图表复现全套代码来了(单细胞)找到我们的拉群小助手哈。
今天有一位小伙伴让我教他下载公众号,因为没有基础,我推荐了之前一番看过的一个python系列视频课程。
学习课件、视频作品、影视剧素材,网上海量的视频资源不断拓宽着人们的认知水平。将珍贵的视频下载到各种存储介质中长期保存,方便以后反复观看的同时,还能防止资源下架、失效、被封杀的情况出现。有关下载网络视频的软件,怎样把网上的视频下载下来的相关问题,本文将进行详细介绍。
多年来,我们一直渴望了解更多关于Vulkan Video API的信息,该API本应在2020年上半年推出,现在终于推出了1.2.175临时更新版。新的Vulkan Video扩展允许GPU加速视频编解码。最初的公共工程被视为一个临时规范,编解码器覆盖范围有限,但会随着时间的推移而迭代更新。
1、首先依次点击windows->preference->java->install JARs->选中你的jre->点击Duplicate
git command git command 前端九部-前端入门手册 前端九部-前端入门手册 Vuejs开源项目 vuejs开源项目汇总 react开源项目汇总 一套优秀的中后台前端解决方案 网易云音乐第三方 一个 react + redux 的完整项目 和 个人总结 react 后台管理系统解决方案 这是一个用来查看GitHub最受欢迎与最热项目的App,它基于React Native支持Android和iOS双平台 RN写的饿了么,还原度相当高,实现了各类动效 仿知乎日报 react + Ant De
今天给大家分享11个非常好用的资源、工具网站。不论你是做运营、设计,还是个人生活中的应用,甚至只是提升你在线冲浪的快乐感,你都值得拥有它们。
第一个 Nodejs 程序 本教程仅适合您已经有一定的JS编程的基础或者是后端语言开发的基础。 如果您是零基础,建议您先学一下老马的前端免费视频教程 第一步:创建项目文件夹 首先创建 demos 文件夹。然后在此文件夹下创建01_hello.js文件 # 以下是linux/mac下使用终端用命令行创建文件,windows下请直接用资源管理可视化鼠标操作 $ mkdir demos && cd demos # 创建 01_hello.js文件 $ touch 01_hello.js 第二步:编写 nodejs
文章数据分析流程图如下: 任务 如果你有R代码基础,那么你可能需要阅读我在生信技能树的甲基化教程列表: 01-甲基化的一些基础知识.pdf 02-甲基化芯片的一般分析流程.pdf 03-甲基化芯片
对于初学者而言,应该从本手开始,本手的功夫扎实了,棋力才会提高。一些初学者热衷于追求妙手,而忽视更为常用的本手。本手是基础,妙手是创造。一般来说,对本手理解深刻,才可能出现妙手;否则,难免下出俗手,水平也不易提升。
而且目前看来,中国疫情控制成果令人瞩目!不过这一点我是不敢居功的,虽然说大家的确宅家了,但是生信技能树B站的超50万学习量的免费视频教程合辑:https://space.bilibili.com/338686099/#/ 表现很一般,弹幕讨论也不多,所以肯定是有其它神奇的能力带领中国人民完成了这一壮举!
最近发布的AV1是一种全新的开源、专利免费视频编码标准,重点是希望压缩效率方面更进一步。不久前Facebook发布了包含详细测试环境的AV1 基准测试,现在开始为Facebook视频增加AV1编码支持。官方AV1发布版本的浏览器支持仍在开发中,编码速度仍然滞后于当前的编码器替代品如:x264和libvpx-vp9。为了Facebook视频支持AV1,我们通过Chrome Canary上的MPEG-DASH来实现。要启动此功能,我们必须使用早期版本的AV1,一旦Chrome和Firefox等主流网页浏览器正式支持AV1,我们就会切换到官方的AV1发行版。
代码已上传至github github代码地址:https://github.com/Miofly/mio.git
如果大家的网站内容大多数都是涉及到一些图片、视频、音频或者文件等大量资源,就会发现网站的打开速度变得十分缓慢,不仅影响到用户体验,也会影响到网站关键词的排名。想要更好的解决网站打开速度慢的问题,可以使用cdn加速服务,通过内容网络分发来提高网站速度。那么如何使用cdn?
要想网站快,离不开CDN加速,CDN还有一个好处,可以隐藏源站ip(真想搞你的人怎么防都防不住),不知道你是否听说过内容分发网络这个东东,啊对,它也叫CDN,今天就说说境内境外CDN的那些事,先说用过的。
如果是一个免疫组库项目,走igblastn或者MiXCR流程只需要800元人民币即可,但是如果要提供结果解读服务或者个性化的统计可视化,需要具体谈。都会提供全套代码。不管是公共数据集还是你自己的实验测序数据,一样的费用!我们会代替你跑如下所示的流程:
由于我自己的个人网站是放在韩国首尔的甲骨文云上,在中国部分地区确实无法快速访问。 于是我想通过CDN+OSS的方式来加速访问。
静电说:前一阵我们推出了Figma的隐藏小技巧第一辑,现在作者Prabhu Baba推出了第二辑。快使用这些Figma小技巧加速自己的工作效率吧!一起来看。
学过或正在学习MXNet框架的同学,一定很熟悉《动手学深度学习》这个课程。该课程算是第一个最硬国语版讲解深度学习的课程(从理论到实战)。Amusi记得该课程首次推出是2017年9月,紧跟着吴恩达大佬的《DeepLearning.ai》课程发布。
内容分发网络(Content Delivery Network,CDN)通过将站点内容发布至遍布全球的海量加速节点,使其用户可就近获取所需内容,避免网络拥堵、地域、运营商等因素带来的访问延迟问题,有效提升下载速度、降低响应时间,提供流畅的用户体验。
2015年A轮融资的846家创业公司,如今倒闭了一大批,股灾、O2O泡沫破灭之后,资本的寒冬骤然降临。但某些细分市场,比如企业级服务、视频直播、共享经济等,仍为资本的宠儿。CDN作为互联网的基础设施,一直不温不火,市场被网宿、蓝汛、帝联等传统厂商垄断。但随着视频直播的崛起,需求发生了新变化,阿里云、腾讯云等相继在CDN上发力,云帆加速、星域等一批新兴CDN服务商也迅速崛起,共享CDN等新模式被提出,试图打造CDN行业的Uber。这是一场好戏,还仅是一场美梦?
亲爱的朋友们,在这个粉丝稀少的年代,承蒙各位丰厚的鼓励和支持。过去的几个月里,我开始尝试录制视频作品,做PPT,学习视频录制、剪辑软件、注册课堂到审核通过发布。实话讲,相比录制视频的繁琐程序,使用敲打文字来沉淀自己的思想更让我有愉悦感,今后我会更专注地写更多的小文分享给大家。但对于入门一个工具软件来讲,文字的效果的确远不及视频。在几位忠实读者的建议下,我录制了三季视频课程,全长约 8 个小时。通过它,我也迈出了知识变现的第一步。
每个开发都会涉及到一个工作,就是网站开发。开发过程势必会涉及到需要对网站加速的部分,很多开发同学对此都很是头疼。
前提是需要已经购买课程,把购买下载过得加密视频进行导出,还需要使用原有播放器播放。
Github (opens new window) | 掘金 (opens new window) | 简书 (opens new window) | 思否 (opens new window) | 鱼塘热榜 (opens new window) | 力扣 (opens new window)
但是实际上肿瘤外显子队列是很烧钱的,通常来说,一个肿瘤病人需要测50X的血液加上200X的肿瘤,基本上3000块钱是跑不了的,100人的队列就是三十好几万了。而且收集100个肿瘤病人也只能说是背靠大医院平台了。
这是一个广告营销案例、文案策划案例的宝藏网站。上面有全世界多个行业的品牌营销案例,支持多个维度搜索,包括热门搜索、营销日历搜索、品牌搜索等等。
在CDN流量包购买界面根据具体需求选购流量包(图1-1)。选择“有效期规格”、“流量规格”和“适合区域”,点击“立即购买”即可完成购买操作。
随着互联网行业的快速发展,人们的日常生活也渐渐离不开互联网的帮助,无论是吃喝玩乐还是外出旅行购物都会用到互联网,就拿现在的购物来说,以前是需要到实体店选购的,现在在手机或者电脑上就可以浏览各种商品,通过文字、图片或者视频的介绍就能了解到商品的具体信息。平时浏览网页的时候内容是越来越多的,这就会造成用户们打开网页速度过慢或者打不开的问题,相信很多人都是听说过cdn这个网页加速方式,那么cdn是什么意思?cdn如何使用?
EdgeOne 作为腾讯云下一代的 CDN ,提供域名解析、动静态智能加速、TCP/UDP 四层加速、DDoS/CC/Web/Bot 防护、边缘函数计算等一体化服务,也支持用户按业务需求,配置自定义复杂访问控制规则。
我自己搭建的网站https://price.monitor4all.cn/网页打开的速度一直比较慢,经查证是我的网站有很多静态js大文件,通过浏览器读取这些js比较耗时间。
内容分发网络(Content Delivery Network),是在现有 Internet 中增加的一层新的网络架构,由遍布全国的高性能加速节点构成。这些高性能的服务节点都会按照一定的缓存策略存储您的业务内容,当您的用户向您的某一业务内容发起请求时,请求会被调度至最接近用户的服务节点,直接由服务节点快速响应,有效降低用户访问延迟,提升可用性。虽然距离并不是绝对因素,但这么做可以尽可能提高性能,用户将会觉得比较顺畅。这使得一些比较高带宽的应用(传输高清画质的视频)更容易推动。内容分发网络另外一个好处在于有异地备援。当某个服务器故障时,系统将会调用其他邻近地区的服务器服务,进而提供接近100%的可靠度。
一款程序员的工具箱,里面包含非常多实用工具,不仅有各种程序相关功能,还有很多不懂程序人也能用的简易功能。PHP在线加密工具、在线网页工具、JSON格式转化转换工具
互联网直播是目前最火的技术之一,涵盖了很多方面的知识(网络,CDN,GPU,算法,图像处理),以下我介绍互联网直播的大体框架和关键技术点:
遵循在最小化存储成本的约束下最大化主观质量的设计标准,本文提出了一种基于质量的比特率阶梯设计,用于 OTT 视频流服务。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云