关于在R Markdown (PDF输出)中引用图形的问题？

在R Markdown中，可以使用以下方法引用图形：

1. 使用R代码块生成图形并引用：在R代码块中使用绘图函数（如plot()）生成图形，然后使用fig.cap参数为图形添加标题。在需要引用图形的地方，使用ref.label语法引用图形，例如图@ref(fig:example)。这将在PDF输出中自动为图形生成编号，并在文本中引用该编号。

plot(cars)

在文本中引用图形：图@ref(fig:example)

1. 使用外部图像文件并引用：可以将图像保存为外部文件（如PNG、JPEG等格式），然后使用knitr::include_graphics()函数将图像插入到R Markdown文档中。为了引用图像，可以使用fig.cap参数为图像添加标题，并使用fig.cap参数为图像添加标签。在需要引用图像的地方，使用ref.label语法引用图像，例如图@ref(fig:example)。

knitr::include_graphics("path/to/image.png")

在文本中引用图像：图@ref(fig:example)

1. 使用knitr::include_graphics()函数直接引用R对象：如果已经在R代码块中生成了图形对象，可以使用knitr::include_graphics()函数直接引用该对象。在需要引用图形的地方，使用ref.label语法引用图形，例如图@ref(fig:example)。

plot_obj <- plot(cars)
knitr::include_graphics(plot_obj)

在文本中引用图形：图@ref(fig:example)

以上是在R Markdown中引用图形的几种常见方法。具体选择哪种方法取决于你的需求和偏好。对于更详细的R Markdown图形引用和设置，请参考R Markdown官方文档。