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不同的GSE数据集有不同的临床信息，不同的分组技巧

最近，我发现学徒在学习GEO数据挖掘的过程中，遇到了第一个也是至关重要的一个难题就是对下载后的数据集进行合适的分组，因为只有对样本进行合适的分组，才有可能得到我们想要的信息。...但是不同的GSE数据集有不同的临床信息，那么我们应该挑选合适的临床信息来进行分组呢？...这里面涉及到两个问题，首先是能否看懂数据集配套的文章，从而达到正确的生物学意义的分组，其次能否通过R代码实现这个分组。同样的我也是安排学徒完成了部分任务并且总结出来了！...对数据框再用apply循环去查找文章作者是用哪一列来分组的 apply(pd1,2,table) ?...(group_list) #group_list #ccRCC normal #14 14 ---- 总结一下，我们可以根据自己的需求选取合适的代码去进行有效的分组，在不同的情况下选取最合适当下的方法

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手把手教你用Python画直方图：其实跟柱状图完全不同

导读：直方图和柱状图都是数据分析中非常常见、常用的图表，由于两者外观上看起来非常相似，也就难免造成一些混淆。此前我们曾在《柱状图、堆叠柱状图、瀑布图有什么区别？怎样用Python绘制？》...一文中带大家了解了柱状图，今天我们再来讲讲直方图。 作者：屈希峰，资深Python工程师，知乎多个专栏作者 来源：大数据DT（ID：hzdashuju） ?...01 概述 直方图（Histogram），形状类似柱状图却有着与柱状图完全不同的含义。直方图牵涉统计学概念，首先要对数据进行分组，然后统计每个分组内数据元的数量。...频数分布直方图需要经过频数乘以组距的计算过程才能得出每个分组的数量，同一个直方图的组距是一个固定不变的值，所以如果直接用纵轴表示数量，每个矩形的高代表对应的数据元数量，既能保持分布状态不变，又能直观地看出每个分组的数量...组数：在统计数据时，我们把数据按照不同的范围分成几个组，分成的组的个数称为组数。 组距：每一组两个端点的差。 频数：分组内数据元的数量除以组距。 02 实例 直方图代码示例如下所示。

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    上手即用，分组统计检验直方图的绘图脚本分享

    发文章，写论文，分组统计检验直方图是最常见和最实用的，你是否还在烦恼如果把图画好，帮你解决困难啦！这里分享下同事新鲜写就的绘图脚本，自带了示例数据，可以一键出图，助力你的科研和学习。...再来看下他的脚本： 三个函数组成，代码写的还是比较规范的，管道用的66的，虽然赋值符合和我不是一个风格，这个萝卜青菜啦！...ggsave(filename = path,plot = plot,width = width,height = height,device = 'tiff',dpi = dpi) } } # 分组条形图...'mean_ci', 'mean_range', 'median','mean', 'median_iqr')[1]){ # data是一个数据框，包含三列，第一列是样本名称(X轴坐标)，第二列是样本分组信息...bracket.nudge.y = -2) } } return(p) } df = readFlie(input = 'C:\\Users\\zd200\\Desktop\\不常用\\直方图实例文件

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    策略模式：处理不同策略具有不同参数的情况

    策略模式确实在处理不同策略需要不同参数的情况下会显得有些复杂。然而，这并不意味着策略模式不能在这种情况下使用。有几种可能的解决方案： 1....使用上下文来传递参数：你可以在上下文中存储需要的参数，并在需要的时候传递给策略对象。这通常需要在策略接口中添加一个接受上下文的方法。 2....将参数嵌入到策略中：如果某些参数是在策略创建时就已知的，你可以在创建策略对象时将这些参数嵌入到策略中。这通常需要在策略的构造函数中添加相应的参数。 5....这样，你可以为每个策略提供不同的参数。 以上都是处理这个问题的可能方法，选择哪种方法取决于你的具体需求和应用场景。...注意，无论选择哪种方法，都需要确保你的设计保持了足够的灵活性和可扩展性，以便在未来可以方便地添加新的策略或修改现有的策略。

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    如何让你绘制的柱状图格外与众不同？

    前些天有小伙伴在公众号里回复问如何绘制出五颜六色的柱状图，今天小编就来与大家说道说道。 柱状图绘制本身并不复杂，一个bar函数就可以轻松搞定，相信不少小伙伴都用过它。上一道开胃菜让大家尝尝先。...纯色条形图 % 生成绘图所需要的数据 N=25 x = linspace(0,10,N)'; y = gaussmf(x,[1.8,5]); % 生成不同的颜色 needcolor=rand(N,3);...'b' Blue 'r' Red 'g' Green 'c' Cyan 'm' Magenta 'y' Yellow 'k' Black 'w' White 如果想要画出五彩缤纷的柱状图，应该怎么做呢...随机颜色的柱状图 方法1:利用facecolor属性和for循环 figure(2) for i=1:N bar(x(i),y(i),8/N,'facecolor',needcolor(i,:)...不一样的烟火——渐变色柱状图绘制 生成渐变色 color_init=[1,0,0; 1,0.5,0; 1,1,0; 0 1 0; 0 0 1;0,1,1;1,0,1]; color_init=flipud

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    forestploter: 分组创建具有置信区间的多列森林图

    下面是因INFORnotes的分享 与其他绘制森林图的包相比，forestploter将森林图视为表格，元素按行和列对齐。可以调整森林图中显示的内容和方式，并且可以分组多列显示置信区间。...森林图的布局由所提供的数据集决定。 基本的森林图 森林图中的文本 数据的列名将绘制为表头，数据中的内容将显示在森林图中。应提供一个或多个不带任何内容的空白列以绘制置信区间（CI）。...绘制 CI 的空间由此列的宽度确定。...", theme = tm) # Print plot plot(pt) 编辑森林图 edit_plot可用于更改某些列或行的颜色或字体。...如果提供的est、lower和upper的数目大于绘制CI的列号，则est、lower和upper将被重用。如下例所示，est_gp1和est_gp2将画在第3列和第5列中。

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    matlab中直方图的定义_matlab绘制直方图

    说明:对于格式(1) ,显示图像I 的直方图,n 为灰度级 数目,灰度图像的缺省值为256 ,黑白图像缺省值为2 ;对于 格式(2) ,J 返回调色板为map 的图像I 的直方图;对格式(3) ,返回图像...I 的每个灰度上的像素点数目;格式(4) 对图 像I 均衡化处理,n 表示灰度级数目,缺省值为64 ;格式(5) 对调色板为map 的灰度图像均衡化处理,返回有n 级灰度 的图像;格式(6) 对图像I...( I ,256) ; %显示原始图像直方图, 灰度级为256 tit le(′原始图像直方图′) ; %直方图均衡化处理 J = histeq( I ,32) ; %均衡化处理为灰度级为32 的直方图...tit le(′规定化后图像′) ; figure , imhist ( L) ; tit le(′规定化后图像直方图′) ; 程序实现的图像如图1～7 所示,其中图1 和图2 为原 始图像及其直方图,...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容， 请发送邮件至 举报，一经查实，本站将立刻删除。

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    有这5小段代码在手，轻松实现数据可视化（Python+Matplotlib）

    （具有很高的协方差），为了清楚地看出变量间的关系，最好使用折线图。...下图为不同IQ人群所占比例的直方图。从中可以清楚地看出中心期望值和中位数，看出它遵循正态分布。使用直方图（而不是散点图）可以清楚地显示出不同组数据频率之间的相对差异。...叠加直方图 在实现叠加直方图的代码中需要设置以下几个参数： 设置水平范围，以适应两种可变分布； 根据这个范围和期望的分组数量，计算并设置组距； 设置其中一个变量具有更高透明度，以便在一张图上显示两个分布...柱状图适合于分类数据的原因，一是能根据柱体的高度（即长短）轻松地看出类别之间的差异，二是很容易将不同类别加以区分，甚至赋予不同颜色。以下介绍三种类型的柱状图：常规柱状图，分组柱状图和堆积柱状图。...对每个列表赋予x坐标，循环遍历其中的每个子列表，设置成不同颜色，绘制出分组柱状图。 堆积柱状图，适合可视化含有子分类的分类数据。下面这张图是用堆积柱状图展示的日常服务器负载情况统计。

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    使用 Unicorn 模拟器运行具有不同 CPU 架构的代码

    所以它可以是一个非常好的工具来帮助进行一些动态代码分析。您可以运行具有不同目标架构的代码并立即观察结果。 演示应用 这是我为这个演示制作的一个非常基本的应用程序。...但是在这里，我们正在分析不同目标架构的二进制文件，我们不能直接运行或调试它。 我们知道strcmp需要两个参数。根据arm64 调用 convetion前 8 个参数通过寄存器传递x0- x7。...在这里，我设置了我们将在仿真中使用的基本内存段的地址。BASE_ADDR- 我们的二进制文件将被加载的地址。BASE_SIZE- 应该足以容纳整个二进制文件。...HEAP_ADDR和STACK_ADDR- 具有任意大小的堆和堆栈地址0x21000。如果我们在仿真期间耗尽了堆或堆栈内存（并且可能崩溃），我们总是可以增加这些值并重新启动仿真。...创建我们的三个内存段：主二进制文件、堆和具有相应大小的堆栈。 读取我们编译的 arm64demo二进制文件并将其写入映射内存BASE_ADDR。 设置挂钩。

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    这5小段代码轻松实现数据可视化（Python+Matplotlib）

    （具有很高的协方差），为了清楚地看出变量间的关系，最好使用折线图。...下图为不同IQ人群所占比例的直方图。从中可以清楚地看出中心期望值和中位数，看出它遵循正态分布。使用直方图（而不是散点图）可以清楚地显示出不同组数据频率之间的相对差异。...叠加直方图 在实现叠加直方图的代码中需要设置以下几个参数： 设置水平范围，以适应两种可变分布； 根据这个范围和期望的分组数量，计算并设置组距； 设置其中一个变量具有更高透明度，以便在一张图上显示两个分布...柱状图适合于分类数据的原因，一是能根据柱体的高度（即长短）轻松地看出类别之间的差异，二是很容易将不同类别加以区分，甚至赋予不同颜色。以下介绍三种类型的柱状图：常规柱状图，分组柱状图和堆积柱状图。...对每个列表赋予x坐标，循环遍历其中的每个子列表，设置成不同颜色，绘制出分组柱状图。 ? 堆积柱状图，适合可视化含有子分类的分类数据。下面这张图是用堆积柱状图展示的日常服务器负载情况统计。

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    DC电源模块具有不同的安装方式和安全规范

    BOSHIDA DC电源模块具有不同的安装方式和安全规范DC电源模块是将低压直流电转换为需要的输出电压的装置。它们广泛应用于各种领域和行业，如通信、医疗、工业、家用电器等。...安装DC电源模块应严格按照相关的安全规范进行，以确保其正常运行和安全使用。DC电源模块的安装方式主要有固定式和可调式两种。固定式DC电源模块的输出电压和电流是固定的，不可调整。...所有电气设备都应接地，以保护使用者不受触电的伤害。2. 确保有效散热：DC电源模块在运行时会产生热量，因此应该安装在通风良好的位置上，以保证良好的散热和长期的稳定运行。3....安装正确的电源线：电源线应符合相关的标准，正确地连接到相应的端口上。避免使用虚假、低质量或不当的电源线，这样会导致电气火灾或电击事故。4....图片正确的安装和使用DC电源模块是至关重要的。遵守相关安全规范和标准可以确保设备的长期稳定性和安全性，从而保证电子设备和使用者的安全和健康。

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    图像的灰度直方图、直方图均衡化、直方图规定化（匹配）

    本文主要介绍了灰度直方图相关的处理，包括以下几个方面的内容： 利用OpenCV计算图像的灰度直方图，并绘制直方图曲线 直方图均衡化的原理及实现 直方图规定化（匹配）的原理及实现 图像的灰度直方图 一幅图像由不同灰度值的像素组成...图像的灰度直方图是灰度级的函数，描述的是图像中具有该灰度级的像素的个数：其中，横坐标是灰度级，纵坐标是该灰度级出现的频率。 ?...灰度直方图的计算公式如下： p(r_k)=\frac{n_k}{MN} 其中，rk是像素的灰度级，nk是具有灰度rk的像素的个数，MN是图像中总的像素个数。...要和输入图像具有相同的大小，在进行直方图计算的时候，只会统计该掩码不为0的对应像素 hist，输出的直方图 dims，直方图的维度 histSize，直方图每个维度的大小 ranges，直方图每个维度要统计的灰度级的范围...有时候，需要图像具有某一特定的直方图形状（也就是灰度分布），而不是均匀分布的直方图，这时候可以使用直方图规定化。

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    图像的直方图

    灰度直方图的定义 灰度直方图定义为数字图像中各灰度级与其出现的频数之间的统计关系，用公式表示为P(k)=\frac{n_k}{n}, \quad k=0,1,......,L-1且\sum_{k=0}^{L-1}P(k)=1式中，k为图像f(m,n)的第k级灰度值；n_k为f(m,n)中灰度值为k的像素个数；n为图像的总像素个数；L为灰度级数。...直方图与图像清晰度的关系 总的来说：直方图反映了图像的清晰程度，当直方图均匀分布时，图像最清晰。...具体说来： 暗图像对应的直方图组成成分集中在灰度值较小（暗）的左边一侧； 亮图像的直方图则倾向于灰度值较大（亮）的右边一侧； 对比度较低的图像对应的直方图窄而集中于灰度级的中部； 对比度高的图像对应的直方图分布范围宽而且分布均匀...直方图均衡化 直方图均衡化就是通过原始图像的灰度非线性变换，使其直方图变成均匀分布，以增加图像灰度值的动态范围，从而达到增强图像整体对比度，使图像达到清晰的效果。

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    灰度直方图及直方图均衡化的MATLAB实现

    文章目录 灰度直方图及直方图均衡化 目的 内容 1.直方图的显示 2.计算并绘制图像直方图 3.直方图均衡化 灰度直方图及直方图均衡化 目的 1.直方图的显示 2.计算并绘制图像直方图 3.直方图的均衡化...内容 灰度直方图用于显示图像的灰度值分布情况,是数字图像处理中最简单和最实用的工具。...MATLAB中提供了专门绘制直方图的函数 imhist() 。...') % 从得到的直方图可以看出，图像的对比度很低，灰度级集中在70-160 范围内，如果只取 % 这个范围内的灰度，并扩展到[0,255]，则会明显增强图像对比度 J=imadjust(I,[70/255...histeq 函数（自动直方图均衡化） K=histeq(I); figure; imshow(K),title('经直方图均衡化后的图') figure; imhist(K),title('直方图均衡化后的直方图

    90220

    《Learning ELK Stack》7 Kibana可视化和仪表盘

    分桶以将文档根据特定的条件进行分组，然后对分组后的文档计算度量 桶通常代表Kibana图表的X轴，也可以给桶添加子桶 Kibana的X轴支持如下的桶类型 日期直方图（Data Histogram） 直方图...举个例子，如果指定@timestamp字段作为桶，且时间区间为一周，那么文档将基于每周的数据分组，然后可以对分组后的文档计算度量，如计数、求平均值等 直方图 直方图与日期直方图相似，除了要求指定的字段和区间都是数字类型的...直方图将在选定的字段上按照指定的区间对文档进行分桶。这相当于以相等区间进行范围聚合 范围 类似于直方图，但可以根据需求手动配置不同的级别。...还可以在桶中定义子聚合，用来实现图表分割（Split Charts，分割成基于不同聚合的多个图表）或者区域分割（Split Area，分割成基于不同聚合的区域）的功能 ?...例如，下面的饼图可以用来显示应用程序的不同响应码的分布 ? 切片地图 切片地图用来根据geo坐标定位地理位置。这是基于Geohash桶聚合实现的，Geohash聚合会将多组坐标分组到一个桶中 ?

    2.9K31

    单细胞测序分析不同大小的伤口揭示出具有再生能力的fibroblast

    摘要： 伤口诱导的毛囊新生（WIHN）已成为研究伤口修复过程中毛囊再生的重要模型。小伤口会形成疤痕，大伤口形成再生毛囊。本文结合分析了几个不同伤口大小的样本，意在找到毛囊再生过程中的关键真皮细胞群。...方法 比较了不同大小伤口的单细胞测序，以期阐明成纤维细胞谱系在WIHN中的作用。主要是三个单细胞测序的数据。...upper fibro通常投射出不同于lower fibroblast轨迹。也就说明伤口愈合过程中成纤维细胞异质性的不同轨迹。 3....伤口周围的upper fibroblast 也有再生能力的竞争性 ? 主要看哪个细胞群具有转变为DP的可能性。...这种再生细胞类型与小鼠DP具有相似的基因标记，这对于支持毛囊形态发生和体内稳态是必需的。

    1.5K20

    70个精美图快速上手seaborn！

    以下是Seaborn库的一些主要特点： 美观的默认样式：Seaborn通过提供现成的样式和颜色主题，使得创建各种类型的图形变得更加简单。它的默认样式经过精心设计，使得图表具有更高的可读性和美观度。...内置的统计图形：Seaborn提供了一系列内置的统计图形，例如柱状图、箱线图、散点图、折线图等。这些图形不仅易于使用，还具有各种选项和参数，可以帮助你更好地展示和理解数据。...hue="smoker", orient="h" ) plt.show() 图片 计数柱状图sns.countplot 用于统计DataFrame中某个字段的不同取值数量。...In 28: # 写法1 # sns.countplot(tips["sex"]) # 写法2 sns.countplot(data=tips,x="sex") plt.show() 图片 也可以指定不同的分组...执行分组 sns.boxplot(data=tips, x="day",y="tip",hue="sex") plt.show() 图片 dodge参数表示在执行hue分组的时候，不同组别下的数据是否放在一个主体中

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