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基因型填充前的质控条件简介

影响基因型填充准确率的因素有很多，比如分型结果的质量，填充软件的选择，reference panel的选择，样本量的大小， SNP的密度等等。 为了提高填充的准确率，我们需要在填充前进行质量过滤。...对于原始的分型结果，可以根据一些条件进行筛选和过滤，得到高质量的分型结果，用于后续的填充。...plink \ --noweb \ --file test \ --check-sex 0.2 0.8 \ --allow-no-sex \ --out gender 运行成功后输出一个后缀为genome...and inbreeding 在一个随机交配产生的符合哈温平衡的群体中， 样本是具有一定的杂合基因型的，近亲繁殖会导致纯合基因型的出现，产生的后代样本杂合度降低，导致群体哈温平衡的偏离，这样的样本需要被去除...对原始分型结果进行质控，可以提高基因型填充的准确率，进一步保证后续GWAS分析的准确性。

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tensorflow 中dataset.padded_batch函数的个人理解过程

参考链接： Python中的numpy.empty_like 今天继续啃Tensorflow实战Google深度学习框架这本书，在250P的Seq2Seq模型代码理解时候有点困难，其中padded_batch...  将此数据集的连续元素合并为填充的批处理. ...像 Dataset.dense_to_sparse_batch() 一样, 此方法将此数据集的多个连续元素 (可能具有不同的形状) 合并到单个元素中.结果元素中的张量有一个额外的外部维度, 并填充到 padded_shapes...tf. int64 向量张量样对象,表示每个输入元素的各自组件在批处理之前应填充的形状.任何未知的维度 (例如 tf.Dimension(None) 在一个 TensorShape 或-1 在一个类似张量的对象中...8], dtype=int64), 64) elem 10 : (array([9, 9, 9, 9, 9, 9, 9, 9, 9], dtype=int64), 81) end  当代码添加  加粗的哪一行代码后

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    在画图软件中，可以画出不同大小或颜色的圆形、矩形等几何图形。几何图形之间有许多共同的特征，如它们可以是用某种颜色画出来的，可以是填充的或者不填充的。

    (1)使用继承机制，分别设计实现抽象类 图形类，子类类圆形类、正方形类、长方形类，要求： ①抽象类图形类中有属性包括画笔颜色(String类型)、图形是否填充(boolean类型：true表示填充，false...表示不填充)， 有方法获取图形面积、获取图形周长等； ②使用构造方法为其属性赋初值； ③在每个子类中都重写toString()方法，返回所有属性的信息； ④根据文字描述合理设计子类的其他属性和方法...(2)设计实现画板类，要求： ①画一个红色、无填充、长和宽分别为10.0与5.0的长方形； ②画一个绿色、有填充、半径为3.0的圆形； ③画一个黄色、无填充、边长为4.0的正方形； ④分别求三个对象的面积和周长...，并将每个对象的所有属性信息打印到控制台。...：" +getColour() +"\t"+"有无填充:" +isFill()+ "半径为："+getR()+"的圆形面积为："+area()+"周长为："+perimeter() ; } }

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    数据管道Dataset

    通过tfrecords文件方式构建数据管道较为复杂，需要对样本构建tf.Example后压缩成字符串写到tfrecoreds文件，读取后再解析成tf.Example。...padded_batch: 构建批次，类似batch, 但可以填充到相同的形状。 window :构建滑动窗口，返回Dataset of Dataset. shuffle: 数据顺序洗牌。...take: 采样，从开始位置取前几个元素。 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 三，提升管道性能 训练深度学习模型常常会非常耗时。...4，使用 cache 方法让数据在第一个epoch后缓存到内存中，仅限于数据集不大情形。 5，使用 map转换时，先batch, 然后采用向量化的转换方法对每个batch进行转换。...4，使用 cache 方法让数据在第一个epoch后缓存到内存中，仅限于数据集不大情形。 ? ? 5，使用 map转换时，先batch, 然后采用向量化的转换方法对每个batch进行转换。 ?

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    excel常用操作大全

    例如，在excel中输入单位的人员信息后，如果需要在原出生年份的数字前再加两位数字，即在每个人的出生年份前再加两位数字19，如果逐个修改太麻烦，那么我们可以使用以下方法来节省时间和精力: 1)假设年份在...打开“工具”，选择“选项”，然后选择“常规”，并在“最近使用的文件列表”下的文件编号输入框中更改文件编号。如果菜单中未显示最近使用的文件名，请取消“最近使用的文件列表”前的复选框。...当使用具有易于记忆的名称和长系列参数的函数时，上述方法特别有用。 13.如何将一个或多个选定的格单元拖放到新位置？按住Shift键可以快速修改单元格格内容的顺序。...上下拖动时，鼠标会在格，单元的边界处变成一个水平的“工”字符号，左右拖动时，鼠标会变成一个垂直的“工”字符号。在释放鼠标按钮完成操作后，一个或多个选定的格单位将被拖放到一个新的位置。...工作簿(表)受保护后，还可以保护工作表中某些单元格区域的重要数据，具有双重保护功能。

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    CAD常用基本操作

    c 厚度（T）：用于指定需绘制三维长方体高度 e 宽度（W）：用于指定绘制矩形多段线的线宽 7 镜像命令：mirror（MI） 注意绘制完后的选项：是否删除源对象选项（默认否（N）） 8 修剪命令：...a 取消关联性的方法：1 取消关联性勾选 2 直接在图中移动一下填充 b 回复关联性的方法（使用重新创建边界选项）：围绕选定的图案填充或填充对象创建多段线或面域，并使其与图案填充对象相关联（可选） E...，并使用快捷菜单在“选择对象”和“拾取内部点”选项之间进行切换以创建边界 G 孤岛检测有缘学习更多+谓ygd3076考证资料或关注桃报：奉献教育（店铺） a 普通：在最外层和次外层中进行填充，随后一层隔一层填充...b 外部：仅在次外层和最外层之间填充 c 忽略：在最外层内部全部填充 H 保留边界：移动填充图案后，原图形边界仍存在 I 允许的间隙：图形在不闭合下填充时所允许的间隙 K 填充是二维操作，因此一直位于...（连续标注前应先有一个标注） G 选中标注，输入ED，可以直接编辑标注文字 36 标注样式管理器 dimstyle（D） 通过新建样式可以在同一幅图中具有不同的标注样式，命令较多可参照帮助文档 37 多线

    5.5K50

    Excel中如何实现粘贴或下拉填充时不改变单元格已设置线条及相关格式？

    Excel单元格中已设置有固定线条或相关背景、格式，怎么样能在粘贴或下拉填充时原来的线条或格式不变——针对这个问题，其实比较简单，以下分开两种情况逐一说明： 一、粘贴 其实，...要做到粘贴时不改变单元格的格式，非常简单，只要使用选择性粘贴即可，比如只要粘贴为数值，如下图所示： 1、粘贴前数据及格式如下： 2、选择要复制粘贴的数据，进行复制 3、在要粘贴的位置右键，直接单击粘贴为数值按钮即可...（如果版本低没有该智能选项的话可单击“选择性粘贴-数值”操作） 以上是粘贴值的情况，通过这种方式，目标单元格内的格式不会有任何改变。...二、填充 1、高版本Excel带智能填充标记选项的简单操作 这个也非常简单，在下拉时的智能选项中，可以直接选择“不带格式填充”，如下图所示： 单击后，填充结果自动恢复原来格式...，如下图所示： 2、较低版本Excel的填充 另外，如果是版本比较低的Excel，可能不带智能填充标记功能，这种情况下，要实现批量填充（公式或重复值等），可以结合编辑快捷键F2+填充快捷键

    7.1K10

    Excel 常用的九十九个技巧 Office 自学教程快速掌握办公技巧

    由于 Excel 具有十分友好的人机界面和强大的计算功能，它已成为国内外广大用户管理公司和个人财务、统计数据、绘制各种专业化表格的得力助手。...11、一次插入多行或多列在表格内同时选择多行或多列，在选取区域内点击右键，选择【插入】则在选取区域的左侧或上方会插入与选中行数或列数相同的区域。...35、在合并后保留所有单元格的内容选取单元格区域，并把列宽拉到可以容下所有单元格合并后的宽度，点击菜单栏中的【开始】选项卡，选择【两端对齐】把多个单元格的内容合并到一个单元格中，在分隔的空隔处按组合键【...68、合并单元格求和首先选中所有合并单元格，然后输入公式：=SUM(合并后的全部列)-SUM(合并前的全部列) ，输入完成后按 Ctrl+回车键 确认公式即可。...90、快速填充工作日日期先下拉填充日期，完成后在右下角出现一个【自动填充选项】按钮，点击后选择【填充工作日】即可。

    7.2K21

    Oracle 12.2 - 启用数据库对象的In-Memory转换填充

    只有具有In-Memory属性的对象才能够做转换填充。 启用对象的列式填充的目的 IM列存储不会自动将数据库中的所有对象加载到IM列存储中。...在对象上设置INMEMORY属性意味着此对象是IM列存储中的填充的候选项。 这并不意味着数据库会立即填充该对象。...c、等待从ALTER TABLE或ALTER MATERIALIZED VIEW语句返回，直到对象的更改记录在IM列存储中 在IM列存储中填充一个段后，数据库仅在段被删除或移动时才将其推离，或者使用NO...DBA_TABLES视图中的INMEMORY列指示哪些表具有INMEMORY属性设置（ENABLED）或未设置（DISABLED）。...列式填充的优先级选项 为IM列存储启用数据库对象时，可以启用Oracle数据库来控制对象在IM列存储中的填充（默认），也可以指定确定对象的优先级。

    1.5K40

    【12.2新特性】In-Memory列存储的FastStart管理

    如果数据库在关闭后重新打开，则数据库将从FastStart区域读取列数据，然后将其填充到IM列存储中，确保维护所有事务一致性。...每个PDB或非CDB只允许一个FastStart区域和一个指定的FastStart表空间。 指定的IM FastStart表空间后，不能更改或删除。...FastStart区域的管理 在启用FastStart区域后的第一次填充或重新填充期间，数据库将会创建FastStart区域。...Oracle建议您创建具有INMEMORY_SIZE设置大小的两倍的FastStart表空间。 3、必须具有管理员权限。...先决条件 要检索FastStart表空间的名称，必须具有管理员权限。 如何检索FastStart表空间的名称： 1、在SQL * Plus或SQL Developer中，使用必要的权限登录数据库。

    1.5K90

    Excel表格中最经典的36个小技巧，全在这儿了

    转换后 ? 技巧8、隐藏0值 表格中的0值如果不想显示，可以通过：文件 - excel选项 - 高级 - 在具有零值的单元格 ? 技巧9、隐藏单元格所有值。...技巧11、按月填充日期 日期所在单元格向下拖动复制后，打开粘贴列表，选取“以月填充” ?...技巧12、合并多个单元格内容 把列宽调整成能容易合并后字符，然后选取合并的区域 - 开始 - 填充 - 两端对齐 ? 合并后： ?...2 引用单元格的内容法。如果销售员在单元格B4:B8区域里，在“来源”后输入或点框最后的折叠按钮选这个区域。如下图所示。 ? 进行如上设置后，我们就可以在销售员一列看到下拉菜单了。...excel2010版审阅选项卡 - 保护工作表。 按上述步骤操作后，你试着修改黄色区域单元格：ok。你试着在黄色之外的区域修改或插入行/列，就会弹出如下图所示的提示。 ?

    8.1K21

    Azure 机器学习 - 使用无代码 AutoML 训练分类模型

    验证是否通过“架构”窗体正确设置了数据的格式。 应按如下所示填充数据。 验证确认数据准确后，选择“下一步”。...选择数据资产并查看填充的“预览”选项卡来查看数据，确保不包含 day_of_week，然后选择“关闭”。 选择“下一页”。 五、配置作业 加载并配置数据后，可以设置试验。...此状态随着试验的进行而更新。 通知也会显示在工作室的右上角，以告知你试验的状态。 六、浏览模型 导航到“模型”选项卡，以查看测试的算法（模型）。 默认情况下，这些模型在完成后按指标分数排序。...屏幕顶部会出现一条绿色的成功消息。 选择“说明(预览版)”按钮。 在模型说明运行完成后，此选项卡就会进行填充。 在左侧展开该窗格，然后在“特征”下选择显示了“原始”的行。...为此请选择屏幕顶部的“作业 1”导航回父作业页。 “已完成”状态将显示在屏幕的左上角。 试验运行完成后，“详细信息”页中会填充“最佳模型摘要”部分。

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    自学cad 零基础_零基础自学吉他的步骤

    9.多段线 是作为单个对象创建的相互连接的序列线段，可以创建直线段、弧线段或两者的组合线段。多线段中的线条可以设置成不同的线宽以及不同线型，具有很强的实用性。...图案填充选项卡用于设置实体填充，该选项卡包括6个选项组：类型、角度和比例、图案填充和比例、图案填充原点、边界、选项和继承特性。...选择删除命令后，此时屏幕上的十字光标将变为一个拾取框，选择需要删除的对象，按enter回车键。 删除最快办法，先选择物体，再调用删除命令或按delete键。...选择修改圆角命令，或单击圆角按钮，或在命令行中输入fillet来执行。激活圆角命令后，设定半径参数和指定角的两条边，就可以完成对这个角的圆角操作。...选择修改/倒角命令，或单击倒角按钮，或在命令行中输入chamfer来执行。 执行倒角命令后，需要依次指定角的两边、设定倒角在两条边上的距离。倒角尺寸就由两个距离来决定。

    3K20

    BOLT-LMM用户手册笔记

    版本 2.3.3（2019 年 8 月 3 日）： 添加了对 BGEN v1.2 数据中缺失值的支持。 完成模型拟合步骤后减少了内存使用量（通过在计算填充变异的关联测试期间释放不再需要的基因型）。...添加了 --bgenSampleFileList 选项，以允许具有不同示例文件的多个 bgen/示例文件对。...如果所有基因型都包含在具有相同文件前缀的单bed/bim/fam 文件三元组中，则只需使用命令行选项 --bfile=prefix 即可。...此选项可以分析不同BGEN文件具有不同样本集的数据集（例如，英国生物银行v3填充发布;部分9.1[26]). 警告：BGEN 格式包含几个子格式。...在不同样本集和/或SNP（例如，英国生物银行提供的样本）上计算的预先计算的主成分往往不能提供太多的加速。 模型拟合后，BOLT-LMM 计算填充 SNP 的关联统计信息。

    2.7K41

    第四章 为In-Memory 启用填充对象（IM-4.1 第一部分）

    只有具有 INMEMORY属性的对象才有资格进行填充。 启用和禁用IM列存储的表 通过在CREATE TABLE 或 ALTER TABLE 语句中包含 INMEMORY 子句来启用IM列存储的表。...DBA_TABLES 视图中的INMEMORY列指示哪些表具有INMEMORY属性集（ENABLED）或未设置（DISABLED）。...首先填充具有CRITICAL 优先级的数据库对象; 接下来填充具有HIGH优先级级别的数据库对象，等等。如果IM列存储中没有剩余空间，则不会在其中填充任何其他对象，直到有足够的空间可用。...而IM列存储可以压缩数据，并使用一套新的算法提高查询性能。如果使用 FOR DML 或 FOR QUERY 选项压缩列数据，则SQL查询直接对压缩数据执行。因此，扫描和过滤操作在小得多的数据量上执行。...因此，Oracle压缩顾问提供了一个表，在填充到IM列存储后，表实现的压缩结果的良好估计。

    3.7K10

    第一章 Oracle Database In-Memory 相关概念（续）(IM-1.2)

    IM列存储不会提高以下类型的查询的性能： 具有复杂谓词的查询 用于选择大量列的查询 返回大量行的查询 高可用支持 IM列存储完全集成到Oracle数据库中，支持所有高可用性功能。...DDL语句中的 INMEMORY 子句指定要填充到IM列存储中的对象或列。 通过配置IM列存储，您可以立即提高现有分析工作负载和即席查询的性能。...例如，策略可以在未访问10天后从IM列存储中驱逐 sales 表。 内存中ADO功能需要初始化参数设置 HEAT_MAP=ON ， INMEMORY_SIZE设置为非零值。...INMEMORY_EXPRESSIONS_USAGE 初始化参数控制数据库可填充的IM表达式的类型：静态、动态或两者。 请参见“INMEMORY_EXPRESSIONS_USAGE”。...使用此选项，Oracle 数据泵（Data Pump）会为具有一个的所有对象保留IM列存储子句。

    1.1K20

    利用PPT如何设计制作创意相框

    很多人都希望自己的PPT能够独具匠心，在展示图片或制作电子相册时，总想让图片有个新颖、独特的相框，而PPT自带的图片边框显得“力不从心”。...如果利用自选图形，再经过边线及内部填充等设置，就能够制作出具有创意效果的相框。下面iSlide就讲述微立体相框和水晶相框的制作技法。...复制这个正六边形，将它复制出的正六边形填充角度设置225度，并右击将它置于底层。选中原正六边形，利用“效果”选项卡中的“柔化边缘”柔化其边缘，设置为3磅。将两个正六边形进行完全重合。...接下来，再绘制一个大小适合的椭圆，使之与复制出的那个水晶边框有一定的重叠，将这两个都选中后，点击“格式”选项卡下“合并形状”中的“剪除”。...选定剪除后的图形，设置其填充颜色为白色，透明度为80%，这样反光就制作完成了。 　　然后制作下方阴影及展台。插入一个大小合适的椭圆，设置为无线条，内部填充为“渐变填充”，类型为“路径”。

    4.1K20

    第四章 为IM 启用填充对象之为IM列存储启用ADO（IM 4.8）

    您只能在段级别创建具有INMEMORY 子句的ADO策略。 数据库将ADO策略（如对象的属性）视为对象。ADO策略是在数据库级别，而不是实例级别。...INMEMORY策略的目的 在许多数据库中，段在创建后经历重大修改。为了最大限度地提高性能，当写活动下降时，ADO可以填充IM列存储中的这些段。...如果对象填充在IM列存储中，则ADO使用新的压缩级别重新填充该对象。如果段尚未具有INMEMORY 属性，则数据库将忽略策略。...DDL语句中的ILM子句 创建内存策略不需要新的SQL语句，但ILM子句有新的选项。下表描述了ADO和IM列存储的SQL选项。...· NO INMEMORY ...SEGMENT 当访问一个段随时间降低（它变成“冷”），并防止该段的随机接入结果的填充此选项是有用的。

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