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R语言随机森林模型中具有相关特征的变量重要性

p=13546 ---- 变量重要性图是查看模型中哪些变量有趣的好工具。由于我们通常在随机森林中使用它,因此它看起来非常适合非常大的数据集。...红线是的变量重要性函数,    蓝线是的变量重要性函数   。例如,具有两个高度相关变量的重要性函数为 看起来  比其他两个  要  重要得多,但事实并非如此。...我想我发现图形混乱,因为我可能会想到的  重要性 的    恒定。考虑到其他变量的存在,我们已经掌握了每个变量的重要性。...实际上,我想到的是当我们考虑逐步过程时以及从集合中删除每个变量时得到的结果, apply(IMP,1,mean)} 在这里,如果我们使用与以前相同的代码, 我们得到以下图 plot(C,VI[2,],type...关联度接近1时,与具有相同   ,并且与蓝线相同。 然而,当我们拥有很多相关特征时,讨论特征的重要性并不是那么直观。

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R语言随机森林模型中具有相关特征的变量重要性

p=13546 ---- 变量重要性图是查看模型中哪些变量有趣的好工具。由于我们通常在随机森林中使用它,因此它看起来非常适合非常大的数据集。...大型数据集的问题在于许多特征是“相关的”,在这种情况下,很难比较可变重要性图的值的解释。 为了获得更可靠的结果,我生成了100个大小为1,000的数据集。...顶部的紫色线是的可变重要性值 ,该值相当稳定(作为一阶近似值,几乎恒定)。红线是的变量重要性函数, 蓝线是的变量重要性函数 。例如,具有两个高度相关变量的重要性函数为 ?...实际上,我想到的是当我们考虑逐步过程时以及从集合中删除每个变量时得到的结果, apply(IMP,1,mean)} 在这里,如果我们使用与以前相同的代码, 我们得到以下图 plot(C,VI[2,]...然而,当我们拥有很多相关特征时,讨论特征的重要性并不是那么直观。

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    Conda管理多个版本的R, python

    image.png Conda是一个非常好用的工具,既可以管理packages,也可以管理和下载软件,还可以建立多个虚拟环境来独立运行多个版本的软件。...做生信常常用的一些包只支持老版本的R,一些新开发的包又只支持最新的R,这里我们用conda建立多个版本的R环境。...conda,从终端输入 conda --version #或者 which conda 如果安装了的话,会显示现在所用的版本等信息,没有的话,可以下载安装,安装好了别忘记配置环境变量。...: conda create -n r36 r=3.6 安装特定版本R conda install -c r r=3.6 #或 conda install r=3.6 conda来安装R的packages...https://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/ conda install -c r r-dplyr 查看已创建的环境

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    R语言中的因子型变量

    因子与因子水平 R语言的数据类型中,因子(Factor)型比较特殊,也让许多初学者感到难以理解。...eg:五个用户月均通话次数分别是(15, 1, 63, 19, 122),存储在变量calls_num中。此时calls_num是一个数值型变量,有五个值,且理论上每个值的取值范围是0到+∞。...R语言实现 创建因子 R语言中,通过factor()函数建立因子型变量。...这里还需要注意的一点是,R默认创建数据框时,将文本类型存储为因子型。如果想取消此操作,可在data.frame函数或read.csv函数中设置stringAsFactors=F参数。...随硬件能力的提升,人们现在不太关注用因子型来提高存储效率,但R保留了这个方式。 2、因子型变量为离散变量,可通过定义因子型变量区分离散变量。

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    R语言多个样本均数的多重比较

    对于多个样本均数的多重比较,比较常用的是LSD-t,SNK,Dunnett,Tukey等,这些方法在之前的推文中介绍过。...R语言和医学统计学系列(9):多重检验 但是之前介绍的是用不同的R包完成的,整洁一致性不够,其实这些都是可以通过多重比较的全能R包:PMCMRplus完成的。...2.81,1.98,1.74,2.16,3.37,2.97,1.69,1.19,2.17,2.28,1.72,2.47,1.02, 2.52,2.10,3.71) data1<-data.frame(trt,weight) # 分类变量因子化...完全随机设计的多样本均数比较是用的one-way anova: fit <- aov(weight ~ trt, data = data1) summary(fit) ## Df...下次继续介绍非参数检验的多重比较,主要是kruskal-Wallis H检验后的多重比较,Friedman M检验后的多重比较。

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    Python|如何对比多个实例的变量值

    一 前言 前文说如何对比文件中的差异并举例几个方法,读者朋友也留言提出其他的解决方法比如 :ide,beyond compare 。本文继续说另外一个需求多个配置文件如何对比。...二 需求描述 有多个mysql实例,存在各个实例的my.cnf 和 数据库实时状态的 variables 值不一样的情况,所以需要对多个实例之间进行参数值的比较,一个个登陆到具体实例上查询又比较麻烦,直接无法通过文本对比...三 代码实现 3.1 先说一下伪代码逻辑: 1 编写配置文件记录多个db实例的连接信息 2 通过配置文件连接db 获取 show variables 命令,并存储多个结果集 3 将结果集 [{},{},...{}] 转化为 dict[section]={k1:v1,k2:v2,k3:v3...kn:vn} 4 利用 pandas 的DataFrame.to_html 将处理过的集合输出为 html 文件...3.3 具体的用法 instances.cnf的内容如下,如果有多个实例 可以配置多个section [dbN] [db1] host = xxx user = xx pass = xxyz port

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    R语言入门之创建新的变量

    ‍‍‍‍‍ ‍‍今天,米老鼠想和大家聊聊如何在R中创建新的变量。‍‍一般‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍我们可以使用赋值符号 的变量。...下面我主要介绍三种创建新变量的基本方法 ‍ # 方法一 # 我们在R中使用符号$来提取数据框里的变量 mydata$sum 的变量,...它是由原来的两个变量(x1和x2)相加所得 mydata$mean 的变量,它是由原来的两个变量(x1和x2)取平均值后所得...# 方法二 # 我们先将要操作的数据框用attach()函数固定 # 这种方法就不比使用$来提取数据框里的变量了 # 但在数据框中新建的变量,应使用$符号来指定该变量需添加到数据框中 attach...# 新建名称为mean的变量,它是由原来的两个变量(x1和x2)取平均值后所得 detach(mydata) # 解除数据的固定 # 方法三 # 主要使用transform() # 第一个参数是要操作的数据框名称

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    配置r语言的环境变量文件

    但是,在中国大陆,R编程语言下载和安装r包镜像地址反而是应该是大家的首选哦。...而且很讨厌设置r语言的环境变量文件,文件蛮多的, 包括: .Rprofile, .Renviron, Rprofile.site, Renviron.site, rsession.conf, and...的一个总结,如下所示: r语言的环境变量文件 在R编程语言中,这些文件都有不同的作用和使用场景: .Rprofile: 用户级别的配置文件,用于定义用户的个性化配置和启动设置。...每个用户都可以拥有自己的.Rprofile文件,它在R启动时被加载。 .Renviron: 用于设置环境变量的文件。在这里可以定义系统和用户级别的环境变量,对所有R会话都有效。...系统管理员可以在这里设置一些全局性的配置。 Renviron.site: 系统级别的环境变量文件,类似于.Renviron,用于设置系统级别的环境变量。

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    经验总结 | 最有效的R学习路径(一)

    写 在前面 在小伙伴问大猫的所有关于R的问题中,“如何最快学R”应该是呼声最高的话题了。以前大猫曾经把自己的经验总结成一篇万字长文发在人大经济论坛中,但是由于篇幅太长,很少有小伙伴有时间看完。...学 习路径:数据处理部分(data manipulation) 对于学习任何新知识而言,学习路径远比选择某一本特定教材要来得重要。...因为任何教材永远只能教你一部分内容,而明确了学习路径,你就能知道如何针对自己的需求选择教材。那么,大猫建议的R学习路径是什么呢?...datacamp上关于R的课程有很多,如果对R一点都不知道,可以从introduction或者intermediate开始看。...本 期总结 本期大猫主要向大家介绍了R学习路径的第一部分:数据处理(data manipulation)的常用包data.table。

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    经验总结 | 最有效的R学习路径(二)

    写 在前面 在上一期中,大猫向大家强调了R学习路径中非常重要的一环:数据处理,也就是data.table包的作用。在本期,大猫将向大家介绍数据分析的另外一面:数据可视化的学习路径。...学 习路径:数据可视化(data manipulation) 大家在读文献的过程中一定有这样的体验:一张漂亮、美观的图对于文章绝不仅仅是“画龙点睛”的作用,它还反映了作者的态度、对数据的理解程度以及technical...] jQuery Foundation 作者Winston Chang,R绘图领域的大神,其写的“R Graphics Cookbook”和Hadley写的“The Advanced R"一样在R社区中享有崇高地位...学习R的同学肯定知道RStudio,它是目前使用最广泛的R集成开发环境(IDE)。用RStudio写R代码不知比原生的RGui要快上多少,如果小伙伴们还在用RGui,赶紧鸟枪换炮吧。...本 期总结 本期大猫主要向大家介绍了R学习路径的第二部分:数据可视化(data visualization)的常用包ggvis。

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