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CellChat 三部曲3:具有不同细胞类型成分的多个数据集的细胞通讯比较分析

分享是一种态度 此教程显示了如何将 CellChat 应用于具有不同细胞类型成分的多个数据集的比较分析。几乎所有的CellChat功能都可以应用。...笔记要点 加载所需的包 第一部分:比较分析具有略有不同细胞类型成分的多个数据集 第二部分:对具有截然不同的细胞类型成分的多个数据集的比较分析 加载所需的包 library(CellChat) library...(ggplot2) library(patchwork) library(igraph) 第一部分:比较分析具有略有不同细胞类型成分的多个数据集 对于具有稍微不同的细胞类型...(组)组成的数据集,CellChat 可以使用函数liftCellChat将细胞组提升到所有数据集的相同细胞标记,然后执行比较分析,作为对具有相同细胞类型成分的数据集的联合分析。...第二部分:对具有截然不同的细胞类型成分的多个数据集的比较分析 CellChat 可用于比较来自截然不同的生物背景的两个 scRNA-seq 数据集之间的细胞-细胞通信模式。

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    云、数、智“三江并流”,亚马逊云科技将把数字化航船带向何方?

    整体来看,“上云、用数、赋智”围绕企业数字化转型实现全链路数字化,吸收了云平台灵活性、便捷性等优势,同时通过云计算手段连接社会化资源、共享服务及能力,让中小企业可以运行多个设备,充分实现数据价值化基础上...例如,将机器学习与大数据深度融合的Amazon Quicksight Q新功能,就是今年re:Invent大会的一项重要发布。...,Amazon QuickSight Q将自动完成查询,并以亲切的语言返回精确的答案。...作为亚马逊云科技旗下在线数据库业务的其中一个分支,Amazon QuickSight Q服务上线于2021年9月,至今已运营了一年多的时间,并为包括纳斯达克、西门子、Capital One和日产汽车在内的多家大型企业提供了优质的运营数据分析体验...特别是针对数据量庞大的客户,可以计算客户数据集的统计数字,确保数据的即时性、准确性和完整性。

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    用于训练具有跨数据集弱监督的语义分段CNN的数据选择

    作者:Panagiotis Meletis,Rob Romijnders,Gijs Dubbelman 摘要:训练用于具有强(每像素)和弱(每边界框)监督的语义分割的卷积网络需要大量弱标记数据。...我们提出了两种在弱监督下选择最相关数据的方法。 第一种方法设计用于在不需要标签的情况下找到视觉上相似的图像,并且基于使用高斯混合模型(GMM)建模图像表示。...作为GMM建模的副产品,我们提供了有关表征数据生成分布的有用见解。 第二种方法旨在寻找具有高对象多样性的图像,并且仅需要边界框标签。...这两种方法都是在自动驾驶的背景下开发的,并且在Cityscapes和Open Images数据集上进行实验。...我们通过将开放图像使用的弱标签图像数量减少100倍,使城市景观最多减少20倍来证明性能提升。

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    亚马逊创建并开源数据集,用于理解不同语言中的名字

    亚马逊已经创建并开源了一个数据集,用于训练AI模型以识别不同语言和脚本类型的名称,因此Alexa可以例如在英语发音者发音时理解日本艺术家或人的名字,反之亦然。...这被称为音译多语言命名实体音译系统,用于识别不同语言名称的工具基于在亚马逊从维基数据制作数据集之后创建的AI模型,用于填充维基百科的内容。...总之,该数据集包含近400000个阿拉伯语,英语,希伯来语,日语片假名和俄语等语言的名称。 研究结果已发表在Arxiv上,将于本月晚些时候在新墨西哥州圣达菲举行的国际计算语言学会议上分享。...亚马逊AI在识别名称方面的表现因语言对而异。例如,根据亚马逊博客文章,英语到俄语比希伯来语更容易理解,因为虽然它们不同,但英语和俄语的字母表比英语更像希伯来语。...在亚马逊宣布计划将Echo智能扬声器带到墨西哥的同时,亚马逊的语言理解也在受到欢迎,这是第一个讲西班牙语的拉丁美洲Echo扬声器。

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    人们应该了解的20个亚马逊云服务

    不知人们是否了解AWS云服务,但很确定到目前为止,每个IT专业人士都听说过流行的亚马逊网络服务(AWS)产品,如弹性云计算(EC2)和简单存储服务(S3)。...亚马逊公司在2015年推出的具有颠覆性的低科技解决方案就是Snowball。这是AWS公司推出的一种客户直接发送数据的独立存储设备。客户在获得Snowball设备之后。...亚马逊现在正在为DeepLens预购。设备将于今年6月开始出货。 13. Amazon QuickSight 如今,每个企业都希望挖掘其大数据以获取有价值的业务洞察力,这将有助于它超越竞争对手。...最重要的是,任何AWS客户都可以免费使用AWS Organizations。 17. Amazon Pinpoint 现在大多数公司通过多个联系点与他们的客户进行交互。...亚马逊公司还提供了一个REST API,使开发人员能够将Pinpoint的功能嵌入到他们的应用程序中,并且该服务具有内置的客户细分和分析功能。

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    re:Invent 2022 全回顾:看见云计算的力量,透视未来的云计算

    如今,亚马逊云科技已领跑完成 Serverless 在云服务上的全面布局,从计算、存储、应用集成、数据库、数据分析、人工智能等多个服务领域全面推进 Serverless 进程。...亚马逊云科技也为其统一商业智能服务 Amazon QuickSight 添加了新功能,包括可以通过名为 “QuickSight Q”的新功能进行自然语言查询的能力。...添加到 QuickSight 的其他功能还包括生成分页、大型数据集的报告和快速分析。 如今,网络攻击不断激增,而数据又已成为企业的命脉,因此亚马逊云科技针对当前形势发布了其数据安全服务的更新。...它允许用户将空间模拟部署到具有许多数据点的模型系统,例如城市的交通模式、场地中的人群流动或工厂车间的布局中。...新的 Amazon Supply Chain 服务通过跨多个供应链系统组合和分析数据来帮助简化这一过程。亚马逊云科技称,借助这一新服务,企业可以实时观察运营,快速识别趋势,并生成更准确的需求预测。

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    多个单细胞数据集整合的另外一个选择conos

    但是现在基本上大家的单细胞转录组项目不太可能是单个样品啦,所以一定会触及到多个样品整合的问题,整合是为了尽可能的去除批次等不需要的差异但是尽可能的保留生物学差异,是一个两难问题,所以关于它的算法基本上都是发表在...但是如果你选择:单细胞降维聚类分群的另外一个工具选择Pagoda2,其实也有一个配套的单细胞数据集整合的算法选择conos,让我们来一起看看吧。...', repos='https://kharchenkolab.github.io/drat/', type='source') # install.packages("conos") 然后对测试数据集构建...实例数据演示conos的整合 前面的包的安装和加载是一样的,这个时候不选择示例数据,而是 读取pbmc3k和5k数据集 : ## 2.1 读取pbmc3k和5k数据集 ---- library(conosPanel...pbmc3k和5k数据集 ,需要的两个文件 在我自己的电脑,不过如果你看完了以前的单细胞系列教程,应该是很容易自己去制作它。

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    亚马逊工程师分享:如何抓取、创建和构造高质量的数据集

    对此,亚马逊工程师 Rishabh Misra 分享了他关于如何识别、抓取和构建一个高质量的机器学习数据集的心得,雷锋网 AI 科技评论编译整理如下。...本文的重点是通过真实的案例和代码片段解释如何构建高质量的数据集。 本文将参考作者收集的三个高质量数据集,即服装尺寸推荐数据集、新闻类别数据集和讽刺检测数据集来解释不同的点。...其他信息,如产品类别、客户测量等,有了更好但也不是必须的。 在网络上搜索一个提供所有必要信息的来源:在这里,你的谷歌搜索技巧会派上用场。使用它可以浏览多个网站,并查看它们是否提供必要的数据信息。...如果找不到单个数据源,请查看是否可以组合多个数据源的数据来构建数据集:讽刺检测数据集是将多个源的数据组合起来以构建完整且质量良好的数据集的完美示例。...例如,在上面的图像中,具有名为「pr-rd-content-block pr-accordion pr-accordion-collapsed」的类的元素折叠对应于尺寸反馈意见和与客户测量相关的数据

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    大家究竟需要怎样的“生成式 AI”?目前已达到 “临界点”?

    未来,所有亚马逊云科技的数据库都将具有向量功能,帮助客户简化运营,方便集成数据。...比如生成式 AI 的训练和推理过程非常耗时,尤其是再处理大规模的数据集时,速度是其限制因素之一;在实时性至关重要的自然语言处理等领域,如果生成式 AI 无法在短时间内生成结果,用户可能会感到沮丧甚至流失...为了能够满足生成式 AI 模型的大量训练数据、模型参数及中间结果的大量数据存储和加载需求,Amazon EC2 P5 实例还提供了大容量的本地存储空间,使得我们能够更高效地管理和处理大规模的数据集,在本地存储的支持下...AI 模型,使得开发者能够更轻松地进入生成式 AI 领域,并在图像、语音和文本生成方面得到更好的支持和指导;亚马逊云科技将 Amazon Bedrock 的大语言模型能力与 Amazon QuickSight...Q 的自然语言问答功能相结合,提供生成式 BI 功能,提高了数据分析的效率和易用性,同时结合数据可视化,Quicksight 将数据分析结果以更直观丰富的方式展现,让用户更好地理解和利用数据。

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    R语言指定列取交集然后合并多个数据集的简便方法

    我的思路是 先把5份数据的基因名取交集 用基因名给每份数据做行名 根据取交集的结果来提取数据 最后合并数据集 那期内容有人留言了简便方法,很短的代码就实现了这个目的。...我将代码记录在这篇推文里 因为5份数据集以csv格式存储,首先就是获得存储路径下所有的csv格式文件的文件名,用到的命令是 files的概念,这个一定要搞明白 pattern参数指定文件的后缀名 接下来批量将5份数据读入 需要借助tidyverse这个包,用到的是map()函数 library(tidyverse...) df<-map(files,read.csv) class(df) df是一个列表,5份数据分别以数据框的格式存储在其中 最后是合并数据 直接一行命令搞定 df1的时候他也提到了tidyverse整理数据,但是自己平时用到的数据格式还算整齐,基本上用数据框的一些基本操作就可以达到目的了。

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    测试自动化框架的重要性– iSAFE的优势

    iSAFE还支持基于云的服务提供商,例如Microsoft Azure,Sauce Labs,浏览器堆栈,跨浏览器测试和AWS(亚马逊网络服务)。这是一个提高生产率的框架。...使用iSAFE的优势 数据驱动:这是任何框架中最重要的功能之一,因为我们可以轻松地使测试脚本适用于不同的测试数据集。iSAFE基于数据驱动的测试方法,可以完成测试并更好地处理错误。...因此,可以将数据集从外部源中分离出来。无需修改代码即可修改测试。 并行执行:使用iSAFE,您可以跨不同的操作系统,移动设备和Web浏览器执行并行测试。...可重用性:可重用性具有成本效益,可提高投资回报率。iSAFE允许在多个级别上启动可重用性,从而可以有效地处理可重复功能。...这个基于Ai的测试自动化框架是DevOps,具有动态仪表板和“自动自动化”功能,可用于云环境。

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    GEO数据库的多个表达量数据集的整合分析方法(表达量芯片和转录组测序)

    这里,我们就来介绍一下面对多个GEO数据集,我们该怎么处理?...首先,我们要明确一点,符合我们实验目标的数据集能搜集多少,尽可能的都用上,因为单独数据集的分析存在部分实验误差,不具有代表性。...二、整合数据及分析 在数据挖掘过程中,我们同时会分析多个数据集的表达谱数据,这样就会都得到多个差异分析列表。那么,怎么样才能挑出一些更重要的或者更有生物学意义的基因进行后续实验呢?...常规做法就是将三个数据集的差异基因列表进行overlapping,但这种方法只考虑到了gene出现的次数,并没有考虑到基因在多个差异分列表中排序上的重要性。...总体上来说,就是挑选那些在多个数据集都表现差异的基因,并且每次差异都排名靠前的那些,他们的最终综合排名也会比较靠前。

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    首个官方气象数据集公开,已训练出20多个“青出于蓝”的AI

    气象部门首次公开天气数据集 本次AI Challenger天气预报赛道的比赛中,用到的是气象部门三年的真实数据,这也是首次有气象部门向同类赛事公布数据集。...其中训练集包含1188天的天气样本,验证集包含89天的样本,测试集则包含这个秋天从8月29日起到11月3日的天气数据。...所有数据来自中国气象局北京城市气象研究所,由“观测”和“睿图”两套系统的数据组成,时间跨度长、密度高,包含气象要素的实况和预报两部分,对提高天气预报准确性具有重要作用。...不过,由于受到版权限制,在决赛结束的11月3日之前,暂时没有办法下载该数据集。比赛结束后重新开放下载,没有参赛的研究人员也可以下载该数据集进行研究了。...AI Challenger 全球AI挑战赛 “AI Challenger 全球AI挑战赛”是面向全球人工智能人才的开源数据集和编程竞赛平台,由创新工场、搜狗、美团点评、美图联合举办,致力于满足AI人才成长对高质量丰富数据集的需求

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    没必要非得固守纯向量数据库!专访亚马逊云科技数据库负责人

    亚马逊云科技也在多种数据库服务上实现向量搜索功能,并且他们也认为这是任何数据库都应当具备的一项核心功能。那亚马逊云科技在数据库产品上有什么样的规划、他们如何看待纯向量数据库需求?...这样大家就能找到环境中的数据,我们也可以为数据创建权限组。用户可以为权限组指定成员,再把权限组分配给权限集。而且无论大家具体使用什么分析引擎,这些权限都能正确起效。...而改善客户体验的案例,就是我们本周发布的公告之一:Q。在本届 re:Invent 大会之前,亚马逊也有名叫 Q 的产品,就是 QuickSight Q,主要通过自然语言处理建立仪表板和报告。...整个所谓向量相似性搜索的过程,就是先提取数据、再立足多个维度创建数字,也就是说每个文档可能拥有 20、30 或者 40 个不同的维度。...但也有很多比较长远的问题,例如如何适应未来几年可能出现的趋势、提前做好准备。我们目前开发的项目可能要到一年、两年或者三年之后发布,当然希望它们在亮相时仍然具有变革性。

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    混合云的好处以及未来的云应用

    最早的“云”术语来自1996年的康柏商业计划,该计划将“互联网云”称为网络服务提供商向其客户提供增值服务的一种方式。...公共云供应商 如今,亚马逊网络服务(AWS)、Microsoft Azure和谷歌云主导着公共云市场,这些云计算供应商正在采取哪些措施来满足未来用户的需求?...这些好处包括按需付费定价以及在与公共Azure相同的Azure环境中内部开发应用程序的能力。 亚马逊网络服务(AWS) 2006年,亚马逊网络服务(AWS)开始向企业提供IT基础设施服务作为网络服务。...2018年,亚马逊公司发布了AWS Outposts,它将AWS服务、基础设施和运营模式引入几乎任何数据中心、托管或内部部署设施。...最近,谷歌公司宣布推出Anthos,这是一种混合云管理产品,允许企业使用单一仪表板管理所有应用程序,无论他们是在私有数据中心、谷歌云、AWS还是Azure中。

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