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Briefings in Bioinformatics:具有不同杂合性水平基因组实用组装指南

虽然已开发了具有不同视角各种组装程序,但尚未对具有不同杂合性二倍体基因组长读长组装程序进行系统评估。...研究团队使用六个具有不同杂合性水平基因组,根据计算机资源使用情况(执行时间和内存使用情况)、连续性和完整性来评估组装程序(5个长读长组装程序Canu、Flye、miniasm、NextDenovo、Redbean...输入数据集概要 具有不同杂合性水平基因组实用组装指南 首先,为了了解样本特性,如基因组大小,使用GenomeScope等工具评估杂合性和重复率。...对于任何杂合性基因组,首先推荐组装程序是Redbean,这是一个轻量级工具,无论杂合性如何,它在连续性和BUSCO完整性方面都具有稳定性能。...基因组杂合性≥1,MaSuRCA_C应该作为第二个试验组装器备选方案,因为它是一个重量级工具,在连续性和BUSCO完整性方面都被归类为“高”,并且在任何杂合性基因组中都具有稳定性能。

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超越现有科技水平乃至具有划时代意义高科技产品

人类“脑洞”已无法阻挡 今时今日,所有具有隐藏性、突破性和开拓性,超越现有科技水平乃至具有划时代意义高科技产品——都叫做“黑科技”。...通过人机交互系统,未来机器人可以根据我们语气、语境等,给以符合情感交谈,而不仅是冰冷问答。 镜头拉回现实,当出门无需现金,签到只需刷脸时,你我都已经感觉到,科技正悄然改变着我们生活方式。...来自华盛顿大学团队研发出一种名为“BiliScreen”应用,只要利用智能手机摄像头,再配合计算机视觉算法,便可通过眼白探测胆红素水平,帮助人们了解自己是否患上胰腺癌。...柔性显示屏诞生,让我们看到了未来手机更多可能性——轻薄、卷曲、可折叠、便携、不易碎,超薄厚度几乎是头发丝5分之1,弯折半径可以小到1毫米,在弯折5至10万次后,依然可以实现高质量显示效果。...当人类用自己智慧全部赋能于一个没有智慧物体上、让它变得更聪明时候,人类本身智慧就会发生适应性加速进化。(记者 黄岚)

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新型芯片极大提高移动、小型设备智能水平

据美国麻省理工学院网站2016年2月3日报道,该校与英伟达公司科研人员在美国国防部高级研究计划局支持下研制出了一种新型芯片,极大提高移动、小型设备智能水平。...该款名为Eyeriss芯片具有168个内核,适用于运行神经网络算法,其效率为当前智能手机常用GPU(通常具有200个内核)10倍,可在设备端运行强大的人工智能算法来分析数据,而目前大多数智能设备则需要将数据发送给云端来处理...目前,大多数神经网络算法非常复杂,并且依赖于大功率GPU上运行,而在传统GPU中,所有计算内核都共享一个内存,内核与内存之间数据通信则消耗了大量时间与电力。...此次科研人员采用了三项创新方案以大幅提高运行效率和减少能耗:(1)为Eyeriss中每一个计算内核配备了相应内存,每个内核可直接与其相邻内核通信并共享数据;(2)设计了专用电路,可先将数据压缩后再发送给内核处理...;(3)设计了专用电路,可以最高效方式将任务分配给众多内核,并且针对不同类型神经网络进行重构。

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实时视频上神经风格迁移(具有完整实现代码)

虽然像Prisma这样应用程序可以为从手机拍摄照片生成艺术风格,本文目的是了解这个看似困难概念背后科学和艺术。这里共享实时实现代码。...因此将加载预先训练CNN -VGG-16权重(从着名' ImageNet。'挑战图像训练)来实现神经样式迁移。将使用Keras应用程序加载具有预训练重量VGG-16。...然而,作为实验选择了VGG-16(具有高分类精度和对特征良好内在理解)。...Gram矩阵,希望两个图像具有相同样式(但不一定是相同内容)。...2)先进CNN架构:对于NST应用,通常具有非常先进连接更深入神经网络可以更准确地捕获高水平(空间)和详细纹理特征。

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具有证明性能保证协同循环闭包检测资源感知方法

在现实世界场景中,这个过程是资源密集型,因为它涉及交换许多观察并几何验证大量潜在匹配。这对具有各种操作和资源限制小尺寸和低成本机器人提出了严峻挑战,这限制了例如能量消耗,通信带宽和计算能力。...本文提出了一个框架,其中机器人首先交换紧凑查询以识别一组潜在循环闭包。...然后,我们寻求选择用于几何验证潜在机器人间闭环子集,其最大化单调子模块性能度量,而不超过计算预算(几何验证数量)和通信(用于几何验证交换数据量)。...我们证明了这个问题通常是NP难,并且提出了具有证明性能保证有效近似算法。所提出框架在实际和合成数据集上进行了广泛评估。...还提出了一种自然凸松弛方案,以证明所提出框架在实践中近乎最佳性能。

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初识Bluemix-基于Bluemix快速开发具有Watson认知能力IOT应用

在体验时候,Bluemix 集成NODE-RED服务,集成了IBM Watson一些能力,使得开发可直接使用watson一些独有的能力,这些能力可以方便开发者快速将端使用范围扩大。...Bluemix是基于Cloud Foundry一种开放云架构,提供了企业级服务,包括IBM软件能力、第三方服务及开源技术。这些服务轻松地与用户云应用程序相集成,用户无需知道如何安装或配置它们。...也就是说,有了Bluemix,开发者不用关心底层IT基础架构运维,也不用关心开发语言、数据库部署和配置,在几秒内就能上线,从零到生产只需一个命令;Bluemix还具有IBM、第三方和开源 API服务目录...如果接入硬件的话,在IOT设备中,添加设备类型,再添加设备即可,更多功能,需要大家更多发掘。之前没有从事过IOT行业开发工作,在这一个小时中,还是学到了挺多东西。...bm还是有集成很多watson功能在里边,可以更方便大家来使用,但是也意味着硬件设备,需要针对它做一些软件适配开发工作。

2.4K80

首个公开访问 3D 全脑图,具有前所未有的细节

现在,由阿姆斯特丹大学(UvA)科学家领导一个团队将 MRI 和显微镜相结合,生成了两个完整大脑 3D 图像,具有前所未有的细节水平。...捐赠给科学两个人脑被放置在 MRI 扫描仪中 21 小时,然后在显微镜下检查。然后将 MRI 与显微镜载玻片相结合,产生大脑图像,可以在 200 毫米细节水平上进行探索。...研究人员使用了超高场 7-T MRI 系统,该系统具有比医院常规使用 MRI 系统更强大磁铁。研究人员专门为这些研究编写了 MRI 软件,以适应活组织和保存组织之间差异。...将单独脑切片放置在特别订购载玻片上,并使用定制实验室设备进行处理。 图示:从重建的人脑中获得解剖细节。...研究人员表示:「我们展示了第一个公开访问 3D 全脑图,其中包含多个显微镜对比和 7-T 定量多参数 MRI 在 200 μm 处重建。」

36010

IBM | 提出具有「情景记忆」大模型:Larimar,无需训练,快速更新模型知识!

这种记忆系统支持动态、一次性知识更新,无需进行计算成本高昂重训练或微调。...「模型编辑(LLM Editing)」应该从LLMs“记忆”中移除那些不想要、错误、过时信息,并可以选择想要结果进行替换。...但这种方法有过度拟合、灾难性遗忘风险,因为知识是隐式地、分布式地编码在LLM参数。 当前,其实研究人员们已经提出了一些有效LLM编辑方法。...如下表所示, 这两种方法都面临着扩展性问题,主要是因为过度拟合以及需要对新状态进行再训练,这会降低模型编辑速度,除此之外,存储大量编辑所需中间数据对内存提出了较高要求。...此外,即使是目前最先进模型编辑方法,在同一框架进行事实编辑、选择性事实遗忘也是相当困难,而在人类大脑中,新信息学习和旧信息遗忘本质上是相互关联

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利用大规模数据标注和深度学习对组织图像进行具有人类水平表现全细胞分割

:细胞分割--识别图像中每个细胞精确边界任务。...为了解决这个问题,作者构建了TissueNet,这是一个用于训练分割模型数据集,它包含了超过100万个手动标记细胞,比之前发布所有分割训练数据集多了一个数量级。...作者证明了Mesmer比以前方法更准确,能够适用于TissueNet中所有的组织类型和成像平台,并且达到了人类水平表现。...Mesmer能够自动提取关键细胞特征,如蛋白质信号亚细胞定位,这在以前方法中是具有挑战性。...然后,作者对Mesmer进行了调整,以利用高度复用数据集中细胞信息,并量化人类妊娠期细胞形态变化。

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Android:RecyclerView滑动到边缘时光晕效果

相信大家对于RecyclerView 都已经不再陌生,我们都知道RecyclerView等滑动控件默认是会有滚动条以及滑动到边缘时阴影(光晕)效果,那么怎样去掉这两个默认属性呢,在这里简单记录一下...1、通过xml文件设置 android:scrollbars=""有三个属性 none:去掉滚动条 horizontal:设置水平滚动条 vertical:设置垂直滚动条 2、...,为false时无相应滚动条 滚动到边缘光晕效果 1、通过xml文件设置 android:overScrollMode=""同样有三个属性 never:去掉光晕效果 always...:设置总是出现光晕效果 ifContentScrolls:设置此模式,如果recycleview里面的内容可以滑动,那么滑到边界后继续滑动会出现弧形光晕;如果recycleview里面的内容不可以滑动...c.RecyclerView.setOverScrollMode(View.OVER_SCROLL_IF_CONTENT_SCROLLS)同xml设置为ifContentScrolls 同时去掉滚动条和默认光晕效果完整

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【SLAM】开源 | OpenVSLAM:具有高可用性和扩展性可视化SLAM框架

论文名称:OpenVSLAM: A Versatile Visual SLAM Framework 原文作者:Shinya Sumikura 在这个项目中,我们视觉SLAM系统对于AR设备、机器人和无人机自主控制等都是必不可少...然而,传统开源可视化SLAM框架设计并不适合作为供第三方程序调用库。为了克服这种情况,我们开发了开发了一个具有高可用性和扩展性可视化SLAM框架OpenVSLAM。...该软件易用于各种应用场景视觉SLAM。它为研究和开发整合了几个有用功能。本文利用基准数据集对其进行了定量性能评估。...以下哪些是对: A.1 B.2 C.2和3 D.2, 3和4 每日面试题,答案: 号主答案:D   解析:解决多重公线性, 可以使用相关矩阵去去除相关性高于75%变量 (有主观成分)....我们也可以用 岭回归和lasso回归带有惩罚正则项方法。我们也可以在一些变量上加随机噪声, 使得变量之间变得不同, 但是这个方法要小心使用, 可能会影响预测效果。

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简单探讨牛影像软件中具有肤质保留功能磨皮算法及其实现细节。

在几年前写一篇关于BEEP文章时,我曾经说过Beep去噪作用可以用于磨皮,并且给出了结论BEEP比牛和美图等效果要更为好,现在看来,那个结论确实是太为夸张和固定了。...不同的人审美观不同,同一个人在不同时段审美观也会有所差异,现在看来,我到时觉得牛影像带有肤质保留效果磨皮更加自然,也更加符合实际情况。      ...那么这个教程一个最关键效果就是磨皮同时保留了肤质,很类似于牛影像效果,而多次实践证明,牛软件100%也是采用了类似的过程。      ...这个算法可以选择:表面模糊、导向滤波、双边滤波、各向异性扩散、BEEP、局部均方差、Domain transfer、 Adaptive Manifolds、 Local Laplacian Filters等任何具有保边效果...本文磨皮效果    可以看出,本文效果和非常接近,可以说明牛也采用该算法。      附上一个按照所谓平湖法流程一个测试程序:   仿牛磨皮特效.rar ?

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Android ListView与RecycleView对比使用解析

ListView,就如其名,是用来显示列表一种View,而RecycleView,是其加强版,今天带来是这两个几乎具有相同功能对比使用 先从ListView说起吧 ListView: 1.在布局文件中使用...RecycleView: 由于这个是Android团队新推出,需要我们添加依赖才可以使用,记得点击sync now ?...5.创建一个布局管理器LayoutManager,便于RecycleView设置布局,这里布局管理器有几种 一种像LIstView垂直排列,LinearlayoutManager ?...我们也可以将其改为水平排列,只需调用linearLayoutMangersetOrientation,设置为LinearLayoutManager.HORIZONTAL ?...总结 以上所述是小编给大家介绍Android ListView与RecycleView对比使用解析,希望对大家有所帮助,如果大家有任何疑问欢迎给我留言,小编会及时回复大家

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. | 基于大规模数据标注和深度学习对组织图像进行具有人类水平性能全细胞分割

通过实验表明,Mesmer比以往方法更加准确,它能够概括TissueNet中组织类型和成像平台全部多样性,并且达到了人类水平表现。...在这篇文章中,作者试图为细胞核和全细胞分割创建一个自动化、简单且扩展算法,该算法可以在各种组织类型和成像平台上精确执行。...作者认为开发这种算法需要两个创新: (1)能生成大量像素级别训练数据扩展方法。 (2)一个集成深度学习算法,它使用这些数据来达到人类水平性能。...由于作者 “人在环路” 数据标注方法扩展性,TissueNet大于以前所有发布数据集总和(图1b),具有130万个全细胞注释和120万个细胞核注释。...综上所述,前面的分析表明,Mesmer执行全细胞分割具有人类水平性能,并且以前细胞分割算法在组织数据方面没有达到与人类性能相当水平

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