学习
实践
活动
工具
TVP
写文章

CircleBase|eccDNA综合分析数据库

而关于eccDNA相关的数据库,目前一共也才有两个在线数据库。 进一步,对注释到的基因进行了使用多个数据库进行了综合分析,其中包括调控的基因,转录调控分析,基因eQTL,染色质相互作用等等。 ---- 数据库使用 CircleBase可以直接输入想要检索的的内容即可。这里我们可以输入:基因名、染色体位置以及ecDNA_id。这里我们输入EGFR。 首先可以看到关于这个eccDNA的基本调控特征 CircleBase每一个调控信息融合了多个数据库的结果。点击具体的某一个调控信息,也可以看到不同数据库的结果。 相关的数据库也不多。如果想要研究eccDNA的话可以尝试使用这个数据库分析一下。

19430

MySQL 数据库的高可用分析

作者介绍:易固武,腾讯高级工程师,参与腾讯账号安全建设,腾讯数据仓库(TDW)优化改造,腾讯云数据库等项目,对大规模分布式存储和计算系统有浓厚的兴趣和经历 MySQL数据库是目前开源应用最大的关系型数据库 ,有海量的应用将数据存储在MySQL数据库中。 存储数据的安全和可靠是生产数据库的关注重点。本文分析了目前采用较多的保障MySQL可用方案。 同时,由MHA保证在切换过程中的数据一致。MHA对MySQL的主从复制集群非常友好,没有对集群做任何侵入的修改。 小结 本文分析了目前MySQL使用较多的几种MySQL数据复制和高可用方案,从使用来看,MySQL Replication是使用最为广泛的数据复制方案,因为是MySQL原生支持,针对其在不同场景下的一些缺陷

10.3K43
  • 广告
    关闭

    2022腾讯全球数字生态大会

    11月30-12月1日,邀您一起“数实创新,产业共进”!

  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    MySQL 数据库的高可用分析

    MySQL数据库是目前开源应用最大的关系型数据库,有海量的应用将数据存储在MySQL数据库中。存储数据的安全和可靠是生产数据库的关注重点。本文分析了目前采用较多的保障MySQL可用方案。 同步复制不不仅是要求Slave收到数据,还要求Slave将数据commit到数据库中,从而保证每次的数据写入,主从数据都是一致的。 同时,Master宕机后,应用程序切换到任何一个Slave都可以保证读写数据的一致。但是,同步复制带来了重大的性能下降,这里需要做一个折衷。 同时,由MHA保证在切换过程中的数据一致。MHA对MySQL的主从复制集群非常友好,没有对集群做任何侵入的修改。 小结 本文分析了目前MySQL使用较多的几种MySQL数据复制和高可用方案,从使用来看,MySQL Replication是使用最为广泛的数据复制方案,因为是MySQL原生支持,针对其在不同场景下的一些缺陷

    30330

    肿瘤细胞系综合分析数据库

    同时也提到了一个用来分析 CCLE 的在线的数据库:DepMap Portal (https://depmap.org/portal/)。 所以今天就来介绍一下 DepMap Portal 这个数据库具体是怎么使用的。 DepMap DepMap分析了数百个癌细胞系模型,以获取各个细胞系基因组信息以及对遗传和小分子扰动的敏感性。 通过对肿瘤细胞的多重分析和研究试图来识别肿瘤的遗传和药理学依赖以及预测它们的生物标志物。 进一步的,可以在扰动效应( Perturbation Effects ) 查看 TP53 在基因组 CRISPR 当中的重要。 总的来说 以上就是 DepMap 数据库的基本使用方法了。通过 DepMap 我们不止来分析 CCLE 的数据也可以分析其他和肿瘤细胞系有关的一些数据。有需要的可以去检索一下哈。

    2K30

    故障分析数据库一致关闭缓慢问题诊断

    想必我们大家都知道,Shutdown immediate即一致关闭数据库数据库下次启动不需要做实例恢复即可open数据库。那么当数据库一致关闭出现缓慢等状况时,该怎么办呢? 那我们就来一起分析一下,数据库一致关闭缓慢问题。 ? shutdown immediate在数据库中会做哪些操作? ? ? >>>> Uncommitted transactions are beingrolled back >>>> 当数据库需要以一致关闭数据库时,如果此刻数据库中正好存在运行的大事物,这时候数据库需要对大事物进行回滚 那当数据库出现hanging或者slowly时,我们应该如何做? ? 当数据库需要进行一致关闭时,建议首先去检查下一些视图用来进行确认。 abort来关闭数据库,下次启动数据库很容易就会达到一致的状态。

    38550

    故障分析数据库一致关闭缓慢问题诊断

    想必我们大家都知道,Shutdown immediate即一致关闭数据库数据库下次启动不需要做实例恢复即可open数据库。那么当数据库一致关闭出现缓慢等状况时,该怎么办呢? 那我们就来一起分析一下,数据库一致关闭缓慢问题。 shutdown immediate在数据库中会做哪些操作? Uncommitted transactions are beingrolled back 当数据库需要以一致关闭数据库时,如果此刻数据库中正好存在运行的大事物,这时候数据库需要对大事物进行回滚(请不要误解之前提到的知识点 当数据库需要进行一致关闭时,建议首先去检查下一些视图用来进行确认。 abort来关闭数据库,下次启动数据库很容易就会达到一致的状态。

    30480

    相关分析方法怎么选择_多个因素相关分析

    有时候我们根据需要要研究数据集中某些属性和指定属性的相关,显然我们可以使用一般的统计学方法解决这个问题,下面简单介绍两种相关分析方法,不细说具体的方法的过程和原理,只是简单的做个介绍,由于理解可能不是很深刻 1、Pearson相关系数   最常用的相关系数,又称积差相关系数,取值-1到1,绝对值越大,说明相关越强。 该系数的计算和检验为参数方法,适用条件如下: (适合做连续变量的相关分析) (1)两变量呈直线相关关系,如果是曲线相关可能不准确。 (适合含有等级 变量或者全部是等级变量的相关分析) 3、无序分类变量相关   最常用的为卡方检验,用于评价两个无序分类变量的相关。 卡方检验用于检验两组数据是否具有统计学差异,从而分析因素之间的相关

    13630

    机场安全分析

    互操作的要求带来了一些安全挑战:在远程机场中存在访问通行证发行权限,但是安全控制措施较少。它还会导致“legacy drag”,因为升级一个系统需要同时升级所有系统。 因此,为了确保互操作,安全控制通常会采取竞争的方式,磁条PIN仍然很常见。通行证也需要跨多个航空公司运营,这进一步增加了复杂,克隆机组通行证也变得十分困难。 因此,研究团队从eBay购买了相同的控制器,并进行了深入的分析。 BMS可以控制电子门锁,HVAC,工业过程控制器等。研究发现某些BMS具有可绕过的身份验证和远程利用。

    39830

    Eureka可用分析

    :eureka怎么保证可用. 从而达到同步数据的目的 那么这就涉及到如下的方面 * eureka client和eureka server之间如何进行通信 * eureka注册在客户端和服务端分别怎么操作实现可用的 * eureka 续约/心跳在客户端和服务端分别怎么操作实现可用的 * eureka下线是怎么操作的 ### eureka client和eureka server之间如何进行通信 通过查询各种资料并追踪自动配置类发现 并将服务的信息配置等传递到application中,等待后续使用 分析完这一段之后,我对addInstance如何接收请求的还是有疑问,经过断点调试发现,这个过程实际上是通过EurekaServerAutoConfiguration ### eureka续约在客户端和服务端分别怎么操作实现可用的 从上面注册中可推测出续约/心跳接口可能也是在DiscoveryClient中完成的。

    17610

    如何分析功能优先

    如何根据用户需求,科学地确定功能优先? 【分析思路】 1. 理解业务场景 日常业务中,由于公司资源、开发人员的时间和精力有限,需求优先性问题十分常见。 举几个例子,普通二维分析模型(功能的重要+紧急性) image.png WSJF模型(老板+战略+业绩+需求评分+上线所需时间) image.png Kano模型(用户需求与接受度) image.png 这里的面试题要求根据用户需求确定优先,因此选择使用kano模型。 因此,以用户需求为导向确定优先时,可以将kano分析结果与产品用户画像结合分析,确定最终结论。 (用户画像包含目标用户的基本信息、使用场景、痛点和关键区分点。这些内容有助于确定用户的内在诉求。) 【结论】 回归前面的面试题,如何根据用户需求,科学地确定功能优先

    25430

    保守分析并作图

    基因组的保守常常与功能有关,保守强的序列可能在细胞的发育和调控等方面发挥着至关重要的作用。 首先要下载保守分值的文件,可以在UCSC中选择对应的物种的文件,比如小鼠mm10的phyloP conservation文件(http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenpath

    1.2K30

    R 相关分析

    R 相关分析 1. 相关矩阵计算: 加载mtcars数据 > setwd("E:\\Rwork") > data("mtcars") > head(mtcars) mpg cyl disp 相关系数的显著水平 使用Hmisc 包,计算矩阵相关系数及其对应的显著水平 > library(Hmisc) > res <- rcorr(as.matrix(mtcars)) > res 可视化相关分析 1. symnum() function > cor_matr <- cor(mtcars) > symnum(cor_matr) m cy ds h dr w q v a

    87940

    数据分析之描述分析

    SPSS的模块按功能可以分为三部分:描述分析、推断分析、探索性分析。 1.描述分析主要是对所收集的数据进行分析,得出反映客观现象的各种数量特征的一种分析方法,它包括数据的集中趋势分析、数据离散程度分析、数据的频数分布分析等,描述分析是对数据进一步分析的基础。 2.推断分析是研究如何根据样本数据来推断总体样本数量特征,它是在对样本数据进行描述统计分析的基础上,对研究总体的数量特征做出推断。常见的分析方法有假设检验、相关分析、回归分析、时间序列分析等方法。 3.探索性分析主要是通过一些分析方法从大量的数据中发现未知且有价值信息的过程,它不受研究假设和分析模型的限制,尽可能地寻找变量之间的关联。常见的分析方法有聚类分析、因子分析、对应分析等方法。 ? 但在描述分析里可以进行Z标准化。 交叉表分析 交叉表示一种行列交叉的分类汇总表格,行和列上至少各有一个分类变量,行和列的交叉处可以对数据进行多种汇总计算,如求和、平均值、计数等。

    2.5K20

    生信分析网站(相关分析

    生信论文的套路 ONCOMINE从全景、亚型两个维度做表达差异分析; 临床标本从蛋白水平确认(或HPA数据库),很重要; Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要; cBio-portal 数据库做基因组学的分析(机制一); STRING互作和GO/KEGG分析探讨可能的信号通路(机制二); TISIDB/TIMER分析肿瘤免疫特征(机制三)。 在差异分析的前提下,表型分析成为重点内容,也是可以玩出花样的地方。生存分析是非常常见的表型分析。与生存分析相比,相关分析是另外一个常见的表型分析。 相关分析数据库 Kaplan-Meier Plotter(临床相关分析权威数据库,推荐) http://kmplot.com/analysis/ GEPIA(病理分期相关分析) http://gepia.cancer-pku.cn 生存分析数据库 Kaplan-Meier Plotter数据库(生存分析经典数据库,首选) http://kmplot.com/analysis/ PrognoScan数据库(生存分析信息最全面的数据库

    2.6K20

    数据库完整总结

    完整和安全 数据库完整是指数据库的正确、有效和相容,防止错误数据进入数据库数据库安全是指保护数据库,防止不合法的引用,以免数据的泄密、更改或破坏。 安全和完整常常混淆。 安全是指保护数据以防止非法用户故意造成破坏;完整是保护数据以防止合法用户无意中造成破坏。 完整约束 SQL中把完整约束分为三大类:域约束、基本表约束和断言。 方法是在关系定义中任何需要的地方加上关键字CHECK和约束的条件: CHECK (<条件表达式>) 比如在教学数据库中,要求学生关系中存储的学生信息满足:男同学年龄在15~35之间,女同学年龄在15~30

    34540

    数据库的完整

    导读: 本文深入的介绍了数据库的完整. O、 数据库的完整(总体概述) 一、实体完整 二、参照完整 三、用户定义完整 O、数据库的完整 数据的正确 是指数据是符合现实世界语义,反映了当前实际情况。 数据的完整和安全是两个不同概念 数据的完整 防止数据库中存在不符合语义的数据,也就是防止数据库中存在不正确的数据 防范对象:不合语义、不正确的数据 数据的安全 保护数据库 防止恶意的破坏和非法的存取 防范对象:非法用户和非法操作 为维护数据库的完整数据库管理系统必须: 1. 提供定义完整约束条件的机制 完整约束条件也称为完整规则, 是数据库中的数据必须满足的语义约束条件。

    36190

    相关分析和相关分析可视化常用方法汇总

    本次,介绍一下相关分析以及相关分析可视化常用方法。 0. 相关分析 1.1 R语言默认函数cor cor(dd) 这里,原始数据中有缺失值,所以有NA,所以我们需要考虑缺失值,修改的代码如下: cor(dd,use = "complete.obs") 函数 Hmisc包中的rcorr函数可以对多个变量进行相关计算,并且计算显著。 注意,需要将变量转化为矩阵,才可以进行分析。 相关系数可视化 R包进行相关系数可视化时,会将相关系数和显著也输出到图片中,一步到位。

    94810

    扫码关注腾讯云开发者

    领取腾讯云代金券