y4 <- filter(deg, a>1 & b < 0.05);table(y4)
则表达式是一个查询的字符串，它包含一般的字符和一些特殊的字符，特殊字符可以扩展查找字符串的能力，正则表达式在查找和替换字符串的作用不可忽视，它 能很好提高工作效率。
step1 对matrix进行转置：使gene名变为列名，将样本名转化为data.frame中的第一列
semi_join anti_join实际上没有发生过两个数据框的连接，其实是对左边的数据框取子集
哈喽，我是学习生物信息学的阿榜！非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。让我们一起加油，一起学习进步鸭? 这份学习目录可以
{ #!/bin/sh # 在脚本第一行脚本头 # sh为当前系统默认shell,可指定为bash等shell shopt # 显示和设置shell中的行为选项 sh -x # 执行过程 sh -n # 检查语法 set -
能够手不离键盘快速的书写，代码，文件等，但是要练熟了才能形成战斗力，否则几乎寸步难行。。
数据根据结构可以分为结构化数据、非结构化数据和半结构化数据，前面介绍的数据处理函数针对于结构化数据，而字符串通常包含非结构化或者半结构化数据，这一部分介绍一下R和Python中的字符串函数。
在前面两篇博客中我们分别实现了在dao层的博客类别的增删改查已经分页，以及在后台管理系统界面中的博客类别的分页显示，那么现在我就要准备实现了在后台管理界面的博客类别的添加，修改，删除操作了。
============================================================================= a.txt c:\abc\a.txt windows写法（反斜杠） /abc/a.txt linux写法（斜杠） ----------------------------------------------------------------------------- 相对路径表达方法 cat a.txt 如果不加任何路径说明，默认是当前目录下的文件。 cat ./a.txt 明确的指明，a.txt在当前目录下，这是一种相对路径的写法。 cat ../a.txt 明确的指明，a.txt在上一级目录下，这也是一种相对路径的写法。 cat ./../a.txt 明确的指明，a.txt在上一级目录下，这也是一种相对路径的写法(与上一种等同)。 cat ../2/a.txt a.txt 在上一级目录的2子目录下。 ----------------------------------------------------------------------------- 绝对路径，绝对路径总是从根目录开始的。 /home/zhujy/2/a.txt
代码审计对于小白来说可能比较陌生，但实际上也就是拿到某网站的源码进行审计，从而发现漏 洞。但是在审计的过程中不可能一行一行的去看，不仅浪费时间，看的久了也可能有些遗漏点，所以使用工具进行协助，就会快很多，比如“Seay源代码审计系统2.1”就很方便，可以查找定位代码，但误报很高。
eg: 数字：A（1，2，3）/字符串：A("hi","hello","ha")
豆花寄语：学生信，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。
一、玩转字符串 stringr包 图片 1.str_length() 检测字符串长度 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x ### 1.检测字符串长度 str_length(x) #计算字符串中有多少字符 length(x) #计算向量中元素的个数 图片 图片 2. str_split 字符串拆分 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x ### 2.字符串拆分 str_sp
计算机语言的学习并不困难，关键是一定要由浅入深的实际操作练习。也许最开始的比较简单，学习者一带而过没有实际操作，之后的进一步学习很可能会陷入不知所云的困境，实际操作所带来的感觉是无法替代的，其价值也是非常重要的。
（补充：一个向量是一排有序排列的元素，以后会用到把一个向量作为数据框中的一列的情况。c（）意思是combine（），将不同元素组合为一个向量）
1系统简介 1.1功能简述 在软件开发过程中,我们需要经常对字符串、文件、数据库操作。有时需要浏览Json格式串，有时需要浏览Xml格式串，有时需要读取txt或excel文件，有时需要对数据库访问。本
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
请在作业中回答一个问题：save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？
> （7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，可用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。
鉴于内存的非持久性和容量限制，一个有效的数据处理工具必须能够使用外部数据：能够从外部获取大量的数据，也能够将处理结果保存。R中提供了一系列的函数进行外部数据处理，从外部数据的类型可以分为文件、数据库、网络等；其中文件操作还可以区分为导入/导出操作和流式操作。
sep='\s+': 指代\f\n\t\r\v这些，分别为换页符，换行符，制表符，回车符，垂直制表符。
type() #查看类型 dir() help() len() open() #文本文件的输入输出 range() enumerate() zip() #循环相关 iter() #循环对象 map() filter() reduce() #函数对象 abs(-2) #取绝对值 round(2.3) #取整 pow(3,2) #乘方 cmp(3.1, 3.2) #比较大小 divmod(9, 7) #返回除法的结果和余数 max([2, 4, 6, 8]) #求最大值 min([1, 2, -1, -2]) #求最小值 sum([-1, 1, 5, 7]) #求和 int(“10”) #字符转为整数 float(4) #转为浮点数 long(“17”) # 转为长整数 str(3.5) #转为字符串 complex(2, 5) #返回复数2 + 5i ord(“A”) #A对应的ascii码 chr(65) #ascii码对应的字符 unichr(65) #数值65对应的unicode字符 bool(0) #转换为相应的真假值，0相当于False btw:”空” 值相当于False：[],(),{},0,None,0.0 all([True, 2, “wow!”]) #是否所有元素相当于True，全为True则为True any([0, “”, False, [], None]) #是否有元素相当于True sorted([1, 7, 4]) #序列升序排序 reversed([1, 5, 3]) #序列降序排序 list((1, 2, 3)) #tuple转换为表list tuple([4, 5, 4]) #list转换为tuple dict(a=3, b=”hi”, c=[1,2,3]) #构建字典 d = dict(a=3, b=”hi”, c=[1,2,3]) #d则为字典，字典的引用方式d[“a”]的值为3 input(‘input something’) #等待用户输入 globals() #返回全局变量名，函数名 locals() #返回局部命名空间
例如 y=c("nihaoa 11","niyehaoa 22","zhangsongwen 33")
R是一种语法非常简单的表达式语言(expression language),大小写敏感。可以在R环境下使用的命名字符集依赖于R所运行的系统和国家(系统的locale 设置)、允许数字、字母、“.”和“_”
摘自【生信星球】的总结，我觉得对于我这种生信小白来说很有帮助，包括一些易错点，以及需要注意的地方。
（1）R的规范赋值符号是<-，也可以用=代替 （2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行 （3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。 （4）显示工作路径 getwd() （5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。 （6）表格在R语言中称为数据框^_^ （7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。 （8）数据类型（重点只有两个）
ctrl+shift+m，把上一个运算的结果输入为下一个函数的第一个参数，可以省略很多中间变量
将数据输入或加载到R工作空间中，是使用R进行数据分析的第一步。R语言支持读取众多格式的数据文件，excel文件，csv文件，txt文件和数据库（MYSQL数据库）等；其中，excel和csv是我们最常遇到的数据文件格式。
将c(1, 2, 3)赋值给变量x时，实际上是将数值向量绑定到x上的过程，变量x称为引用。
（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。
ls -al -a是显示所有档案及目录 (ls内定将档案名或目录名称开头为"."的视为隐藏档，不会列出)
[1] "The birch canoe slid on the smooth planks."
这一节话不多说，这一期直接进入主题，开始介绍R中的数据结构。这是学习R语言强大的统计分析功能的基础。R中自带了大量的数据集供大家在学习中联系。在开始介绍数据结构之前，先简单介绍以下如何查看及使用这些数据集，之后在介绍数据结构时，也会大量使用到这些数据集。
read.csv，用于读取“comma separated value”文件。它以 DataFrame 的形式导入数据。相关参数：
数据类型：向量（vector）；数据框（Data Frame）；矩阵（Matrix）；数组（Array）；List。
-（3）注意：之前提到过，矩阵的某一列不能单独转换数据类型，需要把矩阵转换成数据框再转换某列的数据类型；或者把这列单独提取出来再转换其数据类型；
请注意，本文编写于 398 天前，最后修改于 378 天前，其中某些信息可能已经过时。
重启session(重新打开RStudio、重启R，打开新的session)时需要重新加载R包
作业问题：save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？检查X大小写格式以及是否给X赋值
打开GUI可以在Matlab命令窗口输入：guide，就可以打开GUIDE的界面，也可以从主页窗口新建菜单中找到GUIDE，同时发现，还有个App Designer的选项，这个是R2016A版本开始推出的一个GUIDE的替代品，有新的组件，也更容易上手，不过只支持有限的2D图形，所以相对GUIDE还是有些不足，但是学了GUIDE再去操作App Designer显然是更轻松的一件事。
R语言 控制流：for、while、ifelse和自定义函数function|第5讲
一个向量是一排有序排列的元素。使用时，一般都会直接给变量定义，也就是“赋值”即赋予变量一个数值 <-
新手攻略： （1）R的赋值符号不是等号，而是<- （2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行 （3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。 （4）显示工作路径 getwd(
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)
一、控件风格和外观 （1）BackgroundColor：设置控件背景颜色，使用[R G B]或颜色定义。 （2）CData：在控件上显示的真彩色图像，使用矩阵表示。 （3）ForegroundColor：文本颜色。 （4）String属性：控件上的文本，以及列表框和弹出菜单的选项。 （5）Visible：控件是否可见。
read.table(file"mingzi",sep="\t",header=T)
我们经常用到替换，最常用的命令是sub或者gsub，这两个命令相当强大，但是也有缺点，比如每次只能操作1个替换对象，如果需要批量替换，则需要替换很多次，而且不能作用于数据框和矩阵。
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