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【黄啊码】如何将制表符分隔文件转换为CSV

我有一个制表符分隔文件,有超过2亿行。 什么是最快方式在Linux中将其转换为CSV文件? 这个文件确实有多行标题信息,我需要在路上去除,但标题行数是已知。...我已经看到了sed和gawkbuild议,但是我想知道是否有“首选”select。 只是为了澄清,在这个文件没有embedded式标签。...这里空格是一个文字标签: $ echo "hello world" | tr "\t" "," hello,world 当然,如果你在文件embedded了string文字标签,这也会错误地翻译这些标签...是实际制表符。 \我没有为我工作。 在bash,使用^ V来input它。 @ ignacio-vazquez-abramspython解决scheme非常棒!...这里是我修改版本来处理pipe道分隔文件: import sys import csv pipein = csv.reader(sys.stdin, delimiter='|') commaout

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如何把Elasticsearch数据导出CSV格式文件

本文将重点介Kibana/Elasticsearch高效导出插件、工具集,通过本文你可以了解如下信息: 1,从kibana导出数据到csv文件 2,logstash导出数据到csv文件 3,es2csv...如下 image.png 总结:kibana导出数据到CSV文件图形化操作方便快捷,但是操作数据不能太大,适合操作一些小型数据导出。...二、使用logstash导出ES数据成CSV文件 步骤一:安装与ES对应版本logstash,一般安装完后,默认就集成了logstash-output-csv插件 image.png 显然logstash-ouput-csv...是在列表。...三、使用es2csv导出ES数据成CSV文件 可以去官网了解一下这个工具,https://pypi.org/project/es2csv/ 用python编写命令行数据导出程序,适合大量数据同步导出

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【生信技能树培训】R语言中文件读取

一、csv格式文件打开用Excel打开用记事本打开,打开后显示逗号分割每一列sublime打开(适用于大文件)**csv本质是纯文本文件。...**Tips:**关于文件后缀CSV = Comma Separated Values,即逗号分隔文件TSV = Tab Separated Values, 即制表符分隔文件对于纯文本文件来说,后缀没有意义...二、R语言读取文件函数read.csv() : 通常读取csv格式,但也可以读取其他纯文本文件read.table() : 通常用于读取txt格式文件三、 将数据框导出文件(一)导出为表格文件函数...#当指定fill参数为TRUE时,读取文件时,会自动将空行地方填充成NA。但是,当出现某些行间隔空缺时候,会将空行后一列内容补充到前一列空行来,从而造成数据错乱。见下图。...图片单独指定fill参数为TRUE时,E列826行开始内容会被移动到D列空行。见下图。**原因在于,用纯文本查看文件时会发现,在862行之后第4列与后面的内容之间有两个制表符分隔

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R语言入门之数据导入和导出

第一部分 导入数据(Importing Data) 在我们平时研究工作,经常使用是逗号分隔文件(.csv文件)、制表符分隔文件(.tsv文件)和空格分隔文件(.txt文件)。...id”这一列数据为行名 mydata <- read.table("c:/mydata.csv", header=TRUE, sep=",", row.names="id") (2)读取制表符分隔文件...#读取制表符分隔文件和读取逗号分隔文件方法很类似 #唯一不同可能就在与sep这个参数后边值是\t,实际上\t就是指制表符 mydata <- read.table("c:/mydata.tsv",...Exporting Data) 在R语言中有很多方法可以导出各种类型数据,但常用文件格式也就第一部分主要涉及三类,即逗号分割文件制表符分隔文件以及空格分隔文件。...导出数据为csv文件 #第一个参数是需要导出数据名称 #第二个参数是导出后新文件名称 #第三个参数是指文件分隔符 #导出数据和导入数据参数类似,只是所使用函数不同 write.table(mydata

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Elasticsearch:如何把 Elasticsearch 数据导出CSV 格式文件

集成X-Pack高级特性,适用日志分析/企业搜索/BI分析等场景 ---- 本教程向您展示如何将数据从 Elasticsearch 导出CSV 文件。...想象一下,您想要在 Excel 打开一些 Elasticsearch 数据,并根据这些数据创建数据透视表。...这只是一个用例,其中将数据从 Elasticsearch 导出CSV 文件将很有用。 方法一 其实这种方法最简单了。我们可以直接使用 Kibana 中提供功能实现这个需求。...Share 按钮: 7.png 这样我们就可以得到我们当前搜索结果csv文件。.../bin/logstash -f ~/data/convert_csv.conf 这样在我们定义文件路径 /Users/liuxg/tmp/csv-export.csv 可以看到一个输出 csv

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2023.4生信马拉松day5-文件读写

课前提示——解决问题正确姿势 图片 本节内容大纲 图片 1.认识csv格式和分隔符 -(1)认识csv文件及其打开方式 ① excel打开——csv默认打开方式 ② 记事本(txt文本阅读器)打开...,对数据框操作和修改是不会同步到表格文件; -(2)分隔符 逗号、空格、制表符\t 补充知识-文件后缀: csv文件全称是comma separated values,逗号分隔文件; tsv文件全称是...tab separated values,空格分隔文件; 但是:纯文本文件后缀只起提示作用,只是约定俗成,不决定其具体是什么样东西(实际输入了什么分隔符就是什么分隔符); 2.将表格文件读取到R语言里...#2.读取ex2.csv ex2 <- read.csv("ex2.csv") #默认-是特殊字符,所以会被R改成. ex2 <- read.csv("ex2.csv",row.names = 1...,把所有看不见东西都识别程一个制表符 3.将数据框导出成为表格文件 读取→编辑修改→导出 write.csv(test,file="example.csv") write.table(test,file

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关于Oracle导出csv文件脚本-spool方法

Oracle就是这么牛,从外部文件导入到Oracle中有N种方法,想把Oracle数据导出成通用文件方法却不多,梳理下来大致有三种办法: 1、spool方法 2、DBMS_SQL和UTL_FILE方法...3、python等程序方法 本文主要是第一种方法,使用spool命令实行将sql*plus输出结果复制到一个指定文件,直接使用spool off命令为止。...spool方法灵活性比较差,传递变量比较麻烦,好像也不能使用游标,循环和判断语句,但不啻为一种比较简单方法。 spool方法可以将文件导出到客户端主机目录下,获取比较容易一些。...spool 有很多常用set参数,这里设置 常用分隔符,标题,是否回显,pagesize和linesize,如下: set colsep' ';    //域输出分隔符 set echo off;    ...spool c:/oracle/test1.csv; select * from tablea t where statdate=:statdate; spool off ; --导出问题清单二

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Python统计汇总Grafana导出csv文件到Excel

背景: 定时每周把grafana导出csv文件进行统计汇总工作,需要处理csv文件比较多,干脆写个脚本,每周执行一遍脚本,既方便还不会出错。...需求分析 原始文件分析 原始文件是多个csv表格,第一列为时间戳,每10分钟统计生成一行,其余列为ip地址在该时间段内访问次数 ?...库将pandas处理后DataFrame数据写入excel文件,指定文件名作为sheet名 遍历指定目录下.csv文件 主要用到了os模块walk()函数,可以遍历文件夹下所有的文件名。...://www.pypandas.cn/[1] def summary_data(file): """ grafana导出csv文件处理汇总 :param file: csv文件路径...导出csv文件处理汇总 :param file: csv文件路径 :return: 处理完成后pandas对象 """ # 读取整个csv文件 csv_data

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20231220-简单文件格式读取

简单复习上一节内容 1认识csv格式 csv格式是以分割符(逗号,空格,制表符\t)分开内容纯文本文件,EXCLE打开csv文件是识别分隔符,把内容装进格子里,R语言打开csv文件,是把纯文本文件装进一个数据框...,在R语言中,对数据框进行操作,相应改动不会被同步到csv文件 如果想要对原本文件进行修改,把修改后内容重新写为csv文件 write.csv(x,file="x.csv") 一个文件本质是由生成它函数决定...x.csv") 导出csv文件 write.table(x,file="x.txt")导出txt文件 2R语言特有的文件格式 R.data 保存是变量,不是表格文件,支持保存多个文件 save(x,file...("x.txt",**header=T**)增加默认参数 (2)读取csv文件时,没有正确识别行名,并且更改列名不规范符号(例如将其他符号更改为句号) 修改办法 read.csv("x.csv",rownames...=T,fill=T) 把缺失值用NA来代替,但R语言读取TXT文件时,会把所有的空格识别为一个分隔符,直接把后一列数据识别为前一行数据,然后把后一列数据用NA来补充。

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跟小洁老师学习R语言第五天

文件读取和导出 图片 read.csv("ex3.csv.csv") csv可以用excel、记事本、sublime(适用大文件)、R语言打开 纯文本文件后缀只起提示作用,不起决定作用 read.csv...() #常用于读取csv文件 read.table() #常用于读取txt文件 将数据框导出 write.csv(test,file="example.csv") write.table(test,file...ex1 <- read.table("ex1.txt",header = T) #问题:列名没有正确识别 #解决:header:文件第一行要不要作为列名 #2.读取ex2.csv ex2 <- read.csv...("ex2.csv") ex2 <- read.csv("ex2.csv",row.names = 1,check.names = F) #问题:列名格式不对,R语言认为不该出现特殊字符 #解决:第一列作为行名...#解决:一个制表符分隔符 图片 小结 图片 图片 图片

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文件读写20230204

一、csv打开方式a)默认:excelb)记事本c)适用大文件:sublimed)R语言 >read.csv(" ") 注意文件位置,选择相对路径还是绝对路径二、文件读入与导出(1)文件读入1⃣️...默认有标题,分隔符是“\t”(制表符)(2)文件导出1⃣️ 导出csv格式: write.csv(要导出数据框变量名, file=" example.csv"). example是自己设置名称2⃣️...导出txt格式:write.table(要导出变量名,file="example.txt")⚠️注意事项:导出文件时命名最好不要与原文件相同,不然会覆盖,导致原始数据丢失(3)特殊文件保存和加载:...("rod.csv")> View(rod)图片四、不完整表格读入> soft <- read.table("soft.txt") #报错是表格有一列没有值Error in scan(file = file...";"图片图片⚠️⚠️发现原本分隔符确实可以原原本本展现,由此可得format参数可以为“,”(逗号),“|”(管道符),“;”(分号),“\t”(制表符)2) import_list() 可以读取一个带有多个工作簿表格文件

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python读写csv文件

文件读写经典操作方式如下,通过内置open函读取到每行内容,按照指定分隔符进行分隔,然后对每一列内容进行处理。...这样方式在处理制表符分隔文件时,没什么问题,但是在处理csv文件时,会非常头痛。 CSV文件格式简单理解,是逗号分隔纯文本,但是实际上非常灵活。...在excel导出csv文件,会遇到某个字段内部出现了逗号情况,这样字符在两端添加双引号来进行区分,示意如下 name,"jack,rose",26 传统读取方式,单纯用逗号分隔,会得到4个字段...为了正确处理csv格式,python内置了csv模块,专门用于读写csv格式文件。...f.writerow(line) ... 21 对于csv文件,用csv模块来处理,可以保证结果准确性,避免不必要错误。 ·end·

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从零开始异世界生信学习 R语言部分 04 文件读写与认知

文件读写 .csv 文件 打开方式,excel,记事本,sublime,vscode(适合大文本打开) 图片 .csv 逗号分隔文件 .tsv 制表符分隔文件 图片 文件读取 读取txt文件 #1....ex2 <- read.csv("ex2.csv",row.names = 1,check.names = F) #row.names= 表示第一列为行名,注意行名不能重复,如果行名有重复,需要处理处理数据...列名是什么 dim(soft) colnames(soft) 将数据框导出成表格文件 #5.将soft导出csv write.csv(soft,file = "soft.csv") #导出csv格式...将一个项目的不同结果数据存在不同文件夹 图片 将一个项目的不同部分分别存在不同文件夹 图片 图片 图片 # data.table包fread函数 soft = data.table::fread...export(b,"jimmyzhenbang.xlsx") #导出后也为多列表xlsx文件 export(b$Sheet1,"jimmyzhenbang.csv") #可以将列表一部分就可以导出

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在前端轻量化导出表格数据

序言 ---- 对于后台管理系统而言(这里指前端部分),可视化表格展现数据是必不可少部分,而将这些表格数据导出为 Excel 或 Number 等软件可打开文件这种需求也很常见,一般这个功能都是在服务器端如...答案是肯定,下面简单介绍一种轻量化导出方法。 CSV、Blob、a.download ---- CSV 名为逗号分隔值(也叫字符分隔值),是一种纯文本。...为了在前端实现对文件操作,我们需要用到 Web API Blob 对象, 一个 Blob 对象表示一个不可变、原始数据类似文件对象,利用此 Blob 对象即可将 CSV 原始数据封装。...如上图所示,我准备了一个 json 格式数组作为原始数据,首先我们定义每一列表头,然后根据表头顺序遍历 json 数组以逗号分隔依次拼接每一列内容,每一个 json 对象构成了表格一行,因此遍历完随即加上...,请使用制表符加逗号 ' \t,' 作为分隔符。

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R语言day5:文件读取

,对数据框修改不会对该表修改分隔符号 :逗号 空格 制表符(\t)纯文本文件后缀没有意义,不起决定性作用1.表格文件读入r语言,成为数据框1.1直接读取read.table() #通常读取txt格式read.csv..."2.将数据框导出#csv格式write.csv(test,file = "example.csv")#txt格式write.table()3.R特有的数据保存格式:Rdata#只能用R打开#保存是变量...T) #第一列设置为行名4.2读取ex2.csvex2 <- read.csv("ex2.csv")ex2 <- read.csv("ex2.csv",row.names = 1,check.names...= F) #第一列设置为行名 #不要检查文件列名特殊字符5.注意:数据框不允许重复行名rod = read.csv("rod.csv",row.names = 1)## Error in read.table...= rio::import_list("ls.xlsx")#导出为普通表格文件export(iris,file = "iris.csv")#导出列表ls = split(iris,iris$Species

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