因为之前旁听过几节R语言的课程，再加上自己练习数据可视化的需要（特别是可视化包——“ggplot2”），学了些R语言的皮毛。...（不要问为啥没有xlsx,excel文件属于富文本数据文件格式，导入太麻烦，需要很多转换和专用包的支持，劳神费力） TXT文件导入： 文件路径在桌面，名为myfile.txt 文件需为很规则的一维表，最好第一行有名称...以下是小魔方总结的关于R语言包的下载，加载以及更新以及R语言软件更新的方法技巧，供大家参考： 关于包的安装、加载及更新、卸载: update.packages()#查看可更新包 install.packages...("ggplot2")#安装下载工具包 library(ggplot2)#加载下载工具包 detach("ggplot2")#分离包（从内存空间中移除） remove.packages("ggplot2...")#删除（相当于卸载） 关于R语言软件的更新： install.packages("installr")#下载安装工具包 library(installr) #加载安装工具包 check.for.updates.R
require(ggplot2))install.packages('BiocManager') 安装后需要加载才能用 一次安装，每次打开新的session都要加载。...加载：二选一，不加引号,library()或require() library() require() library(tidyr) require(tidyr) R包的使用逻辑及帮助 (1)安装包-加载包...（有时候可能不同的包中使用的函数命名了相同的名字） 帮助 (1)快速查看函数帮助文档 ?max或者help("max")，主要看描述/参数/实例。...原因1：包名写错 原因2：安装命令使用错误 原因3：本机的R语言版本与包所要求的版本不符(极少) (3)别更新 能不更新就不更新，除非一直报错。...就会自动加载BCD 实际上：常会因为一两个依赖包的安装失败，导致你想安装的那个包安装失败。
将ggplot2列入Depends会让你的包在被加载/测试的同时加载ggplot2。这会让其他想要使用你包的人通过::使用你的函数而无需加载它。...同样地，导入ggplot2全部450个导出对象到你的命名空间会让分离你的包和ggplot2包的责任变得困难，特别是读者会搞不清这些函数到底来自哪里。 我个人碰到过很多这种情况。...实际上，如上所说，这一方面会让使用者懵逼，另一方面会造成开发病毒式感染，既不方便调试错误， 想要使用你的包开发的人又不得不将你的包列入Depends。...特别的，不要使用aes_()或aes_string()，它们已经过时了，未来的版本中将不再支持。 这里有一些删减，没有特别的意义。...如果没有，则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中，而该字节码可能与安装的ggplot2不一致！
以安装ggplot2包为例： install.packages("ggplot2") 讨论： 如果想要同时安装多个包，可以使用一个包的向量进行参数传递。...install.packages(c("ggplot2","dplyr")) 2加载包 问题： 如何加载一个已经安装了的包？ 方法： 使用library()函数，括号中写上要加载的包名。...以加载ggplot2包为例： library(ggplot2) 3更新包 问题： 如何更新一个已经安装的包？ 方法： 运行update.packages()命令：该命令可以提示你哪些包可以被更新。...方法： 读取文件中逗号分隔组（CSV文件）数据的最常用的方法是： data <- read.csv("datafile.csv") 讨论： ①手动为列名赋值 如果一个数据文件的行首没有列名，那么得到的数据框的列名将是...data <- read_excel("datafile.xlsx", sheet = "CK") ②手动为列名赋值 如果不想第一行为列名，可以设置参数col_names = FALSE.相应地，各列会被命名为
在深入了解 __init__.py 文件的细节之前，了解 Python 中的包是什么非常重要。包是一种将相关模块（Python 文件）组织到一个易于使用的命名空间中的方式。...这允许你选择性地从包中导入符号，而不会弄乱命名空间。 为什么需要 __init__.py 文件？ __init__.py 文件出于几个原因是必需的。首先，它们允许你将代码组织成称为包的逻辑单元。...这允许我们选择性地从包中导入符号，而不会弄乱命名空间。...__init__.py 文件可用于执行设置操作：除了定义包级变量和函数之外，你还可以使用 __init__.py 文件来执行设置操作，例如，您可能希望初始化数据库连接或加载配置数据。...但是，如果设置操作失败，您可以在 __init__.py 文件中引发 ImportError 以防止使用该包。
但是在输出图形时出现错误： ? 显示字体类别错误 ? 那么这个问题怎么解决这个问题了？ 需要用到sysfonts和showtext两个包。...) # 加载包 library(sysfonts) # 加载包 2....pdf("out.pdf", width = 7, height = 5) # 打开图形设备 showtext_begin() library(ggplot2) # 加载包 ggplot(Bar,...font_add()函数 font_add(family, # 字符串，用来命名指定加载字体的名称，可以为任意字符串 regular, # "常规"字体的字体文件路径，必须为字符串且不能省略...") 说明: regular是字体文件的路径，如果字体在系统的标准位置（如Windows的C:\Windows\Fonts）或当前工作目录，则可以直接输入文件名。
简介 Complexheatmap是由DKFZ的顾祖光博士创建的绘制热图的R包，基于绘图系统grid，因此如果有相应grid的知识，学习起来应该更顺手。...install.packages("devtools")} devtools::install_github("jokergoo/ComplexHeatmap") 创建数据集 # pacman::p_load加载包...，若不存在会自动安装 # 用在这不太合适，因为这个包是bioconductor的包，自动安装是调用install.packages， # 具体没测试，可能会失败 pacman::p_load(ComplexHeatmap...这主要是通过circlize包中的colorRamp2()函数来实现的。...ComplexHeatmap提供了多种颜色空间选项，可以根据自身数据不断调整，选取合适的颜色空间。
A： #安装一个包 install.packages('ggplot2') #安装多个包 install.packages('ggplot2','tidyverse') #安装时，依赖的包也会被安装的...1.2加载包 Q: 如何加载已经安装好的包？...A: 使用library() 函数，在括号内直接添加加载包的名字。但是要注意包与库之间的区别，即库实际上是一个包含了若干包的目录。...每个人或者系统都可以由自己的库~ library(ggplot2) 1.3更新包 Q: 如何更新包？...#每只动物分别通过橙汁或抗坏血酸(维生素C的一种形式，代号为VC)两种给药方式中的一种，接受三种剂量水平的维生素C(每天0.5、1和2毫克)中的一种。
试安装命令搜索引擎查R包关键词查找存放位置，然后用特定命令安装。加载R包-library("R包")命令没有报错代表安装成功library()和require()命令都可以加载R包。...-day4的R脚本中清华镜像CRAN清华镜像bioconductor清华镜像中科大镜像CRAN中科大镜像bioconductor中科大镜像R包安装和使用逻辑安装-加载-使用包里的函数已经安装的包可以用:...【小洁老师语录】R包安装成功的唯一标准：library()没有error，除了error其他都是浮云安装包练习：if(!...，用到ggplot2别人代买自己数据套，报错不会改大多数包规律一致，不需要单独学习，用哪个函数学习哪个函数少部分包有自学语法，比如ggplot2，dplyr等R包如何使用查看帮助文档搜索引擎搜R包介绍页面...ls("package:包名")该命令可以列出R包里的函数或数据R语言里的符号()前是函数 []前是向量数据框或矩阵取子集[[]]列表取子集 $数据框取子集，列表取子集 <-赋值 = 赋值，或连接形式参数和实际参数
谷歌的回答是很快就会加入 SVG 导入的支持，然而现在是 2022 了，依然还没有此功能。...既然 Skia 没有这个功能，那也不能要求对 Skia 的封装 SkiaSharp 有这个功能吧，如 Matthew Leibowitz 大佬的回复 详细请看 https://github.com/mono...另一个库是 Svg.Skia 库，这是给 Skia 专用的库 接下来咱将使用这个 Svg.Skia 库，在 WPF 应用里，加载 SVG 文件，使用 Skia 渲染 按照惯例的第一步就是安装 NuGet..." Version="0.5.16" /> 开始写代码之前，引用命名空间 using SkiaSharp; using Svg.Skia; 解析 SVG 的方法是通过 SKSvg...这里的设计是转换失败返回空，以上的方法是不能支持所有的 SVG 格式的文件的，只对 SVG 1.1 版本支持比较好 var skBitmap = skSvgPicture.ToBitmap(SKColor.Empty
，子类有除零异常等 LookupError 使用映射的键或序列的索引无效时引发的异常的基类：IndexError，KeyError 模块化 ---- import ......找到制定的模块，加载和初始化它，生成模块对象 在import所在的作用域的局部命名空间中，增加名称和上一步创建的对象关联 导入顶级模块，其名称会加入到本地名词空间中（dir()），并绑定到其模块对象...，同name，否则可以设置为顶级模块的空字符串 包 Package 目录下有一个init.py文件，导入包时，此文件内容代表此包 子模块 包目录下的py文件、子目录都是其子模块 模块和包总结 导入子模块一定会加载父模块...，会导致程序启动很慢，如果用户需要时再加载，如果插件太大或依赖多，插件也会启动慢。...dict 如果给实例增加不在slot的属性会抛出Attribute异常 slot可以定义为元组或列表，通常用元组，省空间 slot不会继承给子类 未实现和未实现异常 NotImplemented是个值，
这个表就像是某种命名空间，其中定义的内容是模块中导出的东西，比如函数和常量。 例如，所有的标准库都是模块。...如果存在，该函数关闭这个文件，然后返回文件的名称；否则，该函数保存失败的文件名用于可能的错误提示（请注意字符串缓冲区在避免创建无用的长字符串时的作用）。...一个搜索器是一个以模块名为参数，以对应模块的加载器或nil为返回值的简单函数。 数组package.searchers列出了函数require使用的所有搜索器。...这种机制允许一个发行包将几个子模块组织为一个C标准库，每个子模块有各自的加载函数。 从Lua语言的视角看，同一个包中的子模块没有显式的关联。加载一个模块并不会自动加载它的任何子模块。...同样，加载子模块也不会自动地加载其父模块。当然，只要包的实现者愿意，也可以创造这种关联。例如，一个特定的模块可能一开始就显式地加载它的一个或全部子模块。
（默认加载了xml2包）解析库，所以我们在解析HTML/xml文件的时候感觉很顺手，但是它的请求功能极其有限，对于一些高级请求设置（比如cookie管理、身份验证、报头伪装、代理设置、进程管理）几乎无能为力...），同时默认加载了httr、selectr、magrittr，所以你可以只加载rvest包就很方面的完成简单网页请求、解析任务、同时支持管道操作符和css/XPtah表达式，但是如果涉及到复杂网页结构和异步加载...("atom.xml",encoding="UTF-8") （备注：这里为了加快读取速度，我将atom.xml文件下载到了本地，因为该xml文件含有命名空间，可能会影响解析效果，所以你必须删除首行的命名空间之后才能正常解析...，我会将删除命名空间后的atom.xml文件共享到GitHub上，如果你想要自己直接读取网页版的话，记得删除命名命名空间） xmlns="http://www.w3.org/2005/Atom" xmlParse...以上便是本次XPath的主要讲解内容，关于XPath的内容，可能是一本书的体量，但是对于网页解析而言，以上这些已经可以满足我们大部分需要，还有些涉及到根节点、子孙节点与父辈节点、兄弟节点甚至命名空间和DTD
接触过Python的朋友肯定对模块很熟悉，R的代码组织方式以包为主。但基于文件的模块形式也是可以实现的，modules[1] 包提供了这种支持。...安装和使用 直接从CRAN下载即可： 1install.packages("modules") 使用了解2个函数的使用就可以了。 一是import()，用于替换library()加载包。...，而是它可以将文件里写好的函数整体加载为模块对象。...use()将代码文件加载为模块 最近使用GitHub page的时候发现它的访问速度相当可观，哪怕GitHub主站点本身网络我们国内访问时好时坏。...... 6试开URL’https://codeload.github.com/tidyverse/ggplot2/zip/HEAD' 7downloaded 3.3 MB 8 9载入需要的名字空间
类加载器的隔离问题 每个类装载器都有一个自己的命名空间用来保存已装载的类。...当一个类装载器装载一个类时，它会通过保存在命名空间里的类全局限定名(Fully Qualified Class Name) 进行搜索来检测这个类是否已经被加载了。...导致原因有两方面：第一，的确没有引入该类；第二，由于Jar包冲突，Maven仲裁机制选择了错误的版本，导致加载的Jar包中没有该类。...抛出java.lang.NoSuchMethodError：找不到特定的方法。Jar包冲突，导致选择了错误的依赖版本，该依赖版本中的类对不存在该方法，或该方法已经被升级。...没有异常但预期结果不同：加载了错误的版本，不同的版本底层实现不同，导致预期结果不一致。
”vendor命名空间”. (2) 完全合规的类名可以（MAY）有一个或多个二级命名空间名称（sub-namespace names）. (3) 完全合规的类名必须（MUST）以类名来结尾。...1.2.3 当加载完全合规的类名对应的文件时… (1) 在完全合规的类名中, 不包含前面的命名空间分隔符，由一个顶级命名空间与一个或多个二级命名空间名称组成的命名空间前缀，对应于至少一个“base目录”...(4) 自动加载实现一定不能（MUST NOT）抛出异常，一定不能（MUST NOT）引发任何级别的错误, 并且不应当（SHOULD NOT）返回值。 1.3....“\Acme\Log\Writer\File_Writer”， 去掉前面的命名空间分隔符’\’, 则命名空间前缀为”Acme\Log\Writer”, 类名为”File_Writer”。...这个命名空间前缀对应的base目录为”./acme-log-writer/lib/”, 因此最终加载的文件名为：base目录+类名+”.php”， 即”.
（gganimate有两个包，本文用到的是老的版本。2019年诺贝尔化学奖揭晓 |八一八，那些年的诺贝尔化学奖中用到的是新版本，用法不太一致，还请注意。）...或服务器端的图形编辑软件，下载地址：https://imagemagick.org/script/index.php，选择适合自己电脑系统的一个版本进行安装。...推荐ImageMagick-6.9.10版本，最新版存在与此R包的兼容性问题。gganimate的新版本不依赖于该软件。 注意：安装路径不要有中文和空格。 数据加载 # 加载包，若缺失则安装。...同时为了使得可视化开始呈现的是空白，结尾能继续保留展示一段时间，又构建了两个空白图层，就是下面2个数据表。 这里用的日期做的时间轴，其它数值变量或因子变量也都可以，注意根据需要修改。...和cumulative不是ggplot2的标准美学参数，不被识别，会弹出warning，忽略就好。
当你需要执行特定的统计测试、可视化或其他任务时，你可能会发现相应的功能已经被封装在一个或多个R包中。然而，对于新手或需要一次性安装多个R包的用户来说，这个过程可能会有些繁琐。...以下是两种常见的方法：常用安装install.packages函数是我们常用的安装R包的方式，需要注意的是这些R包必须是在CRAN仓库中，否则安装将会失败。...该项目是存放了大量用于生物研究的R包，很多做生物信息分析的人都会使用里面提供的R包。它的安装包是通过BiocManager包提供的install函数实现的。...等审核过但存放在如github, gitlab等开源网站的R包，这类R包可以分别通过devtools或remote包的 install_github 或 install_gitlab等函数安装。...构建函数，使其具有如下功能：判断未安装R包；使用 install.packages或BiocManager::install函数安装来源你不同的R包；用lapply分别加载R包，并不输出加载过程中产生的信息
（gganimate有两个包，本文用到的是老的版本。2018美日科学家因免疫治疗得诺贝尔生理医学奖|动图展示历年生理学奖中用到的是新版本，用法不太一致，还请注意。）...或服务器端的图形编辑软件，下载地址：https://imagemagick.org/script/index.php，选择适合自己电脑系统的一个版本进行安装。...推荐ImageMagick-6.9.10版本，最新版存在与此R包的兼容性问题。gganimate的新版本不依赖于该软件。 注意：安装路径不要有中文和空格。 数据加载 # 加载包，若缺失则安装。...同时为了使得可视化开始呈现的是空白，结尾能继续保留展示一段时间，又构建了两个空白图层，就是下面2个数据表。 这里用的日期做的时间轴，其它数值变量或因子变量也都可以，注意根据需要修改。...和cumulative不是ggplot2的标准美学参数，不被识别，会弹出warning，忽略就好。
(%>%) 了解ggplot2用于绘图的语法 配置 创建一个新的项目目录 创建一个名为R_refresher项目 创建一个名为reviewing_R.R 项目目录中创建data和figures的文件夹...加载库并读入数据，同时并思考以下问题 加载tidyverse 库 使用read.csv()读取所下载的文件并保存为counts object/variable 函数的语法是什么？...为每列创建vectors/factors(提示：您可以键入每个vectors/factors，如果您希望更快速的创建，可以尝试使用rep()函数) 将它们放到一个数据框中，这个数据框命名为meta 使用...对象的tibble 并将其命名为meta_tb（确保不会丢失行名！）...+ 6 xlab("Genotype") + 7 theme(plot.title = element_text(hjust=0.5, size = rel(2))) 为下游分析做准备 许多不同的统计工具或分析包都希望作为输入的所有数据都在列表结构中
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