包含独立列的matplotlib热图 - 腾讯云开发者社区

import collections import matplotlib.pyplot as plt import networkx as nx G = nx.gnp_random_graph(100...pos, node_size=20) nx.draw_networkx_edges(G, pos, alpha=0.4) plt.show() import collections import matplotlib.pyplot

4632 0

PyComplexHeatmap进阶教程：用python画热图的【行】【列】注释信息

在热图中添加【行】/【列】注释信息。...如何用python画热图上, 下, 左、右不同方向的【行】/【列】注释信息 # 导入示例数据 with open(os.path.join(os.path.dirname(PyComplexHeatmap...此外，在注释文字（比如Bovidae）与热图之间曲线的形状和颜色都会随着文字的旋转角度和颜色一起变化，会自动调整角度，使之与注释文字的角度相匹配。...如果想要把列注释信息放在热图下方，那就需要「改变HeatmapAnnotation的顺序」, anno_label 应该放在「最后」：anno_label(df_cols.Family) 应该是倒数第二个...值得注意的是，「热图与图例之间的间隙是自动调节」的，比如，当row_names_side='right'时，热图右边有了文字，图例就自动往右边挪了，不用我们额外设置。

1K1 0

您找到你想要的搜索结果了吗？

是的

没有找到

matplotlib的多图合并

前言本文是我在学习莫烦老师视频教程时候整理的笔记。Matplotlib是一个python的 2D绘图库，它以各种硬拷贝格式和跨平台的交互式环境生成出版质量级别的图形。...通过Matplotlib，开发者可以仅需要几行代码，便可以生成绘图，直方图，功率谱，条形图，散点图等。...plt.subplot(3,1,1) ax1.set_title("ax1 title") plt.plot([0,1],[0,1]) #这种情况下如果再数的话以334为标准了， #把上面的第一行看成是3个列...▲method3 result c 图中图 import matplotlib.pyplot as plt fig = plt.figure() x = [1,2,3,4,5,6,7] y = [1,3,4,2,5,8,6...▲画中画 d 次坐标轴 # 使用twinx是添加y轴的坐标轴 # 使用twiny是添加x轴的坐标轴 import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np

1.8K3 0

Python数据分析---matplotlib可视化(热图-污染物排放)

主要采用Pandas来做数据统计，matplotlib来做图表可视化。 image.png 下面图表数据来源于网络。...热图 2018年各地市氮氧化物月度排放量(省辖市).png 2018年各地市氮氧化物月度排放量(市辖区).png 2018年各地市二氧化硫月度排放量(省辖市).png 2018年各地市二氧化硫月度排放量...import matplotlib.pyplot as plt # sphinx_gallery_thumbnail_number = 2 colNames=["二氧化硫","氮氧化物","烟尘...ax A `matplotlib.axes.Axes` instance to which the heatmap is plotted....cbar_kw A dictionary with arguments to `matplotlib.Figure.colorbar`. Optional.

1.3K2 0

Python数据分析---matplotlib可视化(热图-空气质量)

主要采用Pandas来做数据统计，matplotlib来做图表可视化。 image.png 下面图表数据来源于网络。...热图 2018年各地市月度NO2平均值.png 2018年各地市月度PM10平均值.png 2018年各地市月度PM25平均值.png 2018年各地市月度SO2平均值.png 2018年各地市月度优良天数...import matplotlib.pyplot as plt # sphinx_gallery_thumbnail_number = 2 colNames=["优良天数","PM25","PM10...ax A `matplotlib.axes.Axes` instance to which the heatmap is plotted....cbar_kw A dictionary with arguments to `matplotlib.Figure.colorbar`. Optional.

1.4K2 0

Python数据可视化：Matplotlib 直方图、箱线图、条形图、热图、折线图、散点图。。。

参考链接： Python Matplotlib数据可视化 plot折线图介绍使用Python进行数据分析，数据的可视化是数据分析结果最好的展示方式，这里从Analytic Vidhya...中找到的相关数据，进行一系列图形的展示，从中得到更多的经验。 ...强烈推荐：Analytic Vidhya Python数据可视化库 Matplotlib:其能够支持所有的2D作图和部分3D作图。能通过交互环境做出印刷质量的图像。...Seaborn：基于Matplotlib，seaborn提供许多功能，比如：内置主题、颜色调色板、函数和提供可视化单变量、双变量、线性回归的工具。其能帮助我们构建复杂的可视化。 ...equal') plt.pie(x_list, labels=label_list, autopct='%1.1f%%') plt.title('expense') plt.show() # 10、热图

1.2K0 0

多张热图的排版技巧

当我们想要在一幅图中展示多个热图时，采用传统的一页多图的方式，会导致排版的混乱，第一个例子，同时展示两幅热图以及对应的图例，代码如下 >>> import matplotlib.pyplot as plt...可以看到，默认的宽高比情况下，图例的高度大大超过了热图的高度，这种情况相下，可以通过调节figure的宽高比来使得图形显示比例正常。...此时排版同样很混乱，而且无法通过简单的调整输出图像的宽高比来解决问题。对于多副热图的排版问题，在matplotlib中，可以通过ImageGrid方法来调节。...通过ImageGrid，不仅可以解决图例的排版问题，还可以排版多副大小不一的热图，代码如下 >>> data1 = np.random.rand(50).reshape(5, 10) >>> data2...对于多副热图的排版而言，通过ImageGrid可以大大提高处理的简便性。 ·end· —如果喜欢，快分享给你的朋友们吧— 原创不易，欢迎收藏，点赞，转发！

1.7K2 0

更为强大的复杂热图

目前基于热图的绘制需求越来越高，让我们想到的事情逐渐成熟，却已经有人开始实现了这个功能，并上传到了CRAN。...复杂热图的绘制长期以来都是基础包omplexHeatmap来实现，现在可以使用了tidyHeatmap了.但是这也不是基于ggplot的版本，所以差强一步。...treate~ Ant2 2575 treated paire~ Intracel~ 0.329 ## # ... with 494 more rows 复杂热图...首先一定要明白，R语言是以长格式的数据来绘图的；参数解释： .data “tbl”格式的数据框 .horizontal ：在热图中水平显示的列的名称 .vertical 在热图汇总垂直展示的列名称....abundance ：填充数的列 annotation: 分组信息 log_transform : 数据转化 tidyHeatmap::pasilla %>% heatmap(

1.2K2 0

包含列的索引：SQL Server索引进阶 Level 5

在这个级别中，我们检查选项以将其他列添加到非聚集索引（称为包含列）。在检查书签操作的级别6中，我们将看到SQL Server可能会单方面向您的索引添加一些列。...包括列在非聚集索引中但不属于索引键的列称为包含列。这些列不是键的一部分，因此不影响索引中条目的顺序。而且，正如我们将会看到的那样，它们比键列造成的开销更少。...创建非聚集索引时，我们指定了与键列分开的包含列; 如清单5.1所示。...确定索引列是否是索引键的一部分，或只是包含的列，不是您将要做的最重要的索引决定。也就是说，频繁出现在SELECT列表中但不在查询的WHERE子句中的列最好放在索引的包含列部分。...为了说明在索引中包含列的潜在好处，我们将查看两个针对SalesOrderDetailtable的查询，每个查询我们将执行三次，如下所示：运行1：没有非聚集索引运行2：使用不包含列的非聚簇索引（只有两个关键列

2.4K2 0

select count(*)、count(1)、count(主键列)和count(包含空值的列)有何区别？

下班路上看见网上有人问一个问题： oracle 10g以后count(*)和count(非空列)性能方面有什么区别？...首先，准备测试数据，11g库表bisal的id1列是主键(确保id1列为非空)，id2列包含空值， ?...前三个均为表数据总量，第四个SQL结果是99999，仅包含非空记录数据量，说明若使用count(允许空值的列)，则统计的是非空记录的总数，空值记录不会统计，这可能和业务上的用意不同。...其实这无论id2是否包含空值，使用count(id2)均会使用全表扫描，因此即使语义上使用count(id2)和前三个SQL一致，这种执行计划的效率也是最低的，这张测试表的字段设置和数据量不很夸张，因此不很明显...总结： 11g下，通过实验结论，说明了count()、count(1)和count(主键索引字段)其实都是执行的count()，而且会选择索引的FFS扫描方式，count(包含空值的列)这种方式一方面会使用全表扫描

3.4K3 0

10 种常用 Matplotlib 图的 Python 代码

棒棒糖图棒棒糖图表以一种视觉上令人愉悦的方式提供与有序条形图类似的目的。...散点图 Scatteplot是用于研究两个变量之间关系的经典和基本图。如果数据中有多个组，则可能需要以不同颜色可视化每个组。在Matplotlib，你可以方便地使用。...树状图树状图根据给定的距离度量将相似的点组合在一起，并根据该点的相似性将它们组织成树状链接。...饼图饼图是显示组组成的经典方法。但是，如今一般不建议使用它，因为馅饼部分的面积有时可能会引起误解。因此，如果要使用饼图，强烈建议明确写下饼图各部分的百分比或数字。...区域图未堆叠未堆积的面积图用于可视化两个或多个系列相对于彼此的进度（涨跌）。在下面的图表中，您可以清楚地看到随着失业时间的中位数增加，个人储蓄率如何下降。未堆积面积图很好地显示了这种现象。

6582 0

灵活的热图谁不喜欢？

导语 GUIDE ╲ 热图是一种流行的可视化高维数据的图形方法，其中一个数字表被编码为彩色单元格的网格。矩阵的行和列按顺序排列以突出显示模式，并且通常伴随有树状图。...R包--heatmaply，交互式热图允许通过将鼠标悬停在单元格上来检查特定值，以及通过在相关区域周围拖动矩形来放大热图的区域，使用起来非常灵活方便。...heatmaply 使用 seriation 包来找到行和列的最佳顺序。...用户可以使用 Rowv 和 Colv 参数为热图的行/列提供自己的树状图： x <- as.matrix(datasets::mtcars) library("dendextend") row_dend...R包中的一员，heatmaply可以绘制交互式的热图，其许多参数设置也和ggheatmap、pheatmap等常用的R包有联动，在色彩的美观度上也是非常优越，通过zoom in/zoom out也可以让我们方便的查看热图的细节

1.1K2 0

新版Pycharm中Matplotlib图像不在弹出独立的显示窗口「建议收藏」

大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。...intellij-support.jetbrains.com/hc/en-us/community/posts/115000736584-SciView-in-PyCharm-2017-3-reduces-functionality-of-Matplotlib...pycharm从2017.3版之后,将matplotlib的绘图的结果默认显示在SciView窗口中, 而不是弹出独立的窗口, 如图如果不喜欢这种设置,可以通过如下方式修改,弹出独立窗口 File...| Settings | Tools | Python Scientific | Show plots in toolwindow 如图, 取消勾选此时,在执行就会在独立的窗口中弹出Matplotlib...配置最新版PyCharm2019.1.1弹出matplotlib窗口时, 依赖的PyQt5,作者遇到了下面的错误 … File “D:\ProSoft\PyCharm2019.1.1\helpers

5.7K1 0

Matplotlib绘制的50类图，足够惊艳！

本文整理出matplotlib包绘制出的50幅图，分类逻辑参考作者zsx_yiyiyi翻译。绘图整理由下面公众号：「Python与算法社区」完成，转载此文请附二维码。...关联散点图带边界的气泡图带线性回归最佳拟合线的散点图抖动图计数图边缘直方图边缘箱形图相关图矩阵图偏差发散型条形图发散型文本发散型包点图...带标记的发散型棒棒糖图面积图排序有序条形图棒棒糖图包点图坡度图哑铃图分布连续变量的直方图类型变量的直方图密度图直方密度线图...带波峰波谷标记的时序图自相关和部分自相关图交叉相关图时间序列分解图多个时间序列使用辅助Y轴来绘制不同范围的图形带有误差带的时间序列堆积面积图...未堆积的面积图日历热力图季节图分组树状图簇状图安德鲁斯曲线平行坐标绘制以上50类图的代码请点击阅读原文

1.5K1 0

多分组的PCA图和top基因热图

多分组的PCA图和top基因热图在转录组和蛋白组的差异分析中，我们常常在质控阶段需要做一下样本的PCA图和标准差top 基因的表达，来评价组内差异和组间差异。...以前主要做的二分组的比较，要想把多个分组的信息放在一张PCA图或者热图上，只需修改下Group值就行。...= F)#不以因子变量读取options(scipen = 20)#不以科学计数法显示load("step1_input.Rdata")exp 图-...# 2.top 1000 sd 热图---- g = names(tail(sort(apply(exp,1,sd)),200)) #day7-apply的思考题n = exp[g,]library(pheatmap...：匹配最后一个点号之前的所有内容。替换为空，保留最后一个点号后的内容。sub("\\d+$", "", ...)\\d+$：匹配末尾的所有数字。替换为空，去除末尾的数字。P1P2

1071 0

解决新版Pycharm中Matplotlib图像不在弹出独立的显示窗口问题

intellij-support.jetbrains.com/hc/en-us/community/posts/115000736584-SciView-in-PyCharm-2017-3-reduces-functionality-of-Matplotlib...pycharm从2017.3版之后,将matplotlib的绘图的结果默认显示在SciView窗口中, 而不是弹出独立的窗口, 如图 ?...新版Pycharm Matplotlib图像不在弹出独立的显示窗口如果不喜欢这种设置,可以通过如下方式修改,弹出独立窗口 File | Settings | Tools | Python Scientific...新版Pycharm Matplotlib图像不在弹出独立的显示窗口此时,在执行就会在独立的窗口中弹出Matplotlib绘图 ?...新版Pycharm Matplotlib图像不在弹出独立的显示窗口以上这篇解决新版Pycharm中Matplotlib图像不在弹出独立的显示窗口问题就是小编分享给大家的全部内容了，希望能给大家一个参考

3.9K1 0

R语言复杂热图的绘制

大家对热图应该都不陌生，但是混合的复杂热图在我们的应用中并不是太多见。今天给大家介绍一个绘制复杂热图的R包ComplexHeatmap。...#下面是中间的热图提供数据，此处直接可以不绘制热图只绘制我们想要结合在一起的图。...其中主要的函数是： oncoPrint（）其为绘制热图的核心函数，其主要可以对热图的中的cell进行分割，更加细致显示数据的分布。其主要参数如下： ?...rownames(mat) = mat[, 1] mat = mat[, -1] mat= mat[, -ncol(mat)] mat = t(as.matrix(mat)) #下面部分主要是要和数据中所包含的类型对应...运行这个函数可以允许我们在绘制的图形中进行选择对应的区域以及此区域包含的值。 ?

3K2 1

Matlab绘制包含双Y轴的图

之前写硕士论文的时候需要同时对比相位图和幅值图，故需要绘制包含双Y轴的图绘制数据对左侧 y 轴的图创建左右两侧都有 y 轴的坐标区。yyaxis left 命令用于创建坐标区并激活左侧。...后续图形函数（例如 plot）的目标为活动侧。绘制数据对左侧 y 轴的图。...然后，绘制一组数据对右侧 y 轴的图。...新图与对应的 y 轴使用相同的颜色，并循环使用线型序列。hold on 命令同时影响左右两侧。...cla reset 现在，当您创建绘图时，绘图将仅包含一个 y 轴。例如，基于单个 y 轴绘制三条线条。

2.1K1 0

WGCNA的TOM矩阵热图配色问题

我在生信技能树多次写教程分享WGCNA的实战细节，见：一文看懂WGCNA 分析(2019更新版) 通过WGCNA作者的测试数据来学习重复一篇WGCNA分析的文章（代码版）重复一篇WGCNA分析的文章...（解读版）（逆向收费读文献2019-19）关键问题答疑：WGCNA的输入矩阵到底是什么格式其中有一个是“老米”投稿：手把手10分文章WGCNA复现：小胶质细胞亚群在脑发育时髓鞘形成的作用 , 里面是有...TOM矩阵热图，就是配色很奇怪。...奇怪的配色但是官网配色是： ? 官网配色首先，这个差异其实并不重要，当然了这个TOM矩阵热图本身就可有可无，仅仅是因为教程里提到了而已，大部分情况下，就是凑图。...或者说是搜索技巧： https://www.biostars.org/p/394615/#394743 简单的配色代码即可解决： TOMplot(plotTOM, geneTree, moduleColors

2.1K2 3

Seurat中小提琴图，热图顺序的调整

seurat.object_copy), levels= my_levels) VlnPlot(seurat.object_copy, features = c("some_gene")) 因为顺序变了，要是想保持原来每个样本对应的颜色的话...，也要改变小提琴的颜色.如：原始的样子 VlnPlot(=combined,features = T,log = F,slot = "data",pt.size = 0) ?...如果不知道原来的颜色： library(scales) show_col(hue_pal()(4)) Heatmap调整热图颜色为scale_fill_gradientn() DoHeatmap(object...image.png Heatmap调整上面bar的颜色 DoHeatmap(subset(combined_copy,downsample = 100), features = combined.markersTop50...image.png 如果要修改gene的顺序的话，修改level后重新运行FindAllMarkers.

6.3K2 0

点击加载更多

扫码

添加站长进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

用matplotlib绘制度直方图包含网络图。

PyComplexHeatmap进阶教程：用python画热图的【行】【列】注释信息

matplotlib的多图合并

Python数据分析---matplotlib可视化(热图-污染物排放)

Python数据分析---matplotlib可视化(热图-空气质量)

Python数据可视化：Matplotlib 直方图、箱线图、条形图、热图、折线图、散点图。。。

多张热图的排版技巧

更为强大的复杂热图

包含列的索引：SQL Server索引进阶 Level 5

select count(*)、count(1)、count(主键列)和count(包含空值的列)有何区别？

10 种常用 Matplotlib 图的 Python 代码

灵活的热图谁不喜欢？

新版Pycharm中Matplotlib图像不在弹出独立的显示窗口「建议收藏」

Matplotlib绘制的50类图，足够惊艳！

多分组的PCA图和top基因热图

解决新版Pycharm中Matplotlib图像不在弹出独立的显示窗口问题

R语言复杂热图的绘制

Matlab绘制包含双Y轴的图

WGCNA的TOM矩阵热图配色问题

Seurat中小提琴图，热图顺序的调整

扫码

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

社区

活动

资源

关于

腾讯云开发者

热门产品

热门推荐

更多推荐