这些试剂需要在适当的安全条件下处理，包括佩戴个人防护设备，操作在化学通风罩下，遵守安全操作规程。以下是一些常见的具有毒性的生物化学试剂：
今天为大家介绍的是来自Didier Rognan团队的一篇论文。超大型化学空间正在革新早期药物发现中的命中率识别。由于其庞大的规模，这些化学空间无法被完全枚举，因此需要特定的计算工具来导航这些空间，并挑选出可能有趣的命中目标。作者在这里提出一种基于结构的方法来筛选超大型化学空间，首先将商业化学试剂对感兴趣的目标进行对接，然后根据有机化学和拓扑规则以在目标的三维约束条件下枚举出类药化合物。
蛋白质的序列可以从编码它的基因序列中预测，这通常可以在基因组数据库中获得。质谱法也可以提供直接测序。传统蛋白质测序方案中使用的许多方法对于标记蛋白质或将其分解为用于功能和结构分析的部分仍然是有价值的。
Project 软件是微软旗下的一款专业项目管理工具，它具有许多独特的功能，可以帮助用户轻松规划、执行和监控项目。在本文中，我将使用举例讲解的方式来介绍 Project 软件的三个独特功能，并结合实际案例进行详细说明。
半导体行业的制造车间处处充满危机，特别是一些看不见的有毒气体或废液废水。本文也罗列一些自己所见所感，大家一起保护自己、保护环境。
2001 年，Sharpless 教授提出相较于碳-碳键 (C-C)，自然界更喜欢碳-杂原子。核酸、蛋白质和多糖是由碳-异原子键连接在一起的缩聚合物，Sharpless 教授由此得到启示，提出 “Click Chemistry” 的概念[2]。点击化学是通过以碳-杂原子键 (C-X-C) 连接为基础发生快速、高效地合成有用新分子的化学合成方法。
伊同学是2019级学生，今年读大四。而留校察看期为2022年11月7日到2023年11月6日，因此，伊同学拿到毕业证的时间会晚一年。
把DNA分子用超声波打断成在一定长度范围内的小DNA片段。目前除了一些特殊的需求之外，基本都是打断为300bp-800bp长的序列片段，并在这些小片段的两端添加上接头，构建出单链DNA文库，以备测序之用。
半个世纪前，化学家马克·莱文是一名博士后，正在寻找一个能够改变他领域的富有远见的项目。他在一组来自制药行业科学家的发布的心愿清单中找到了灵感，这些科学家希望找到一种能够通过删除、添加或交换分子核心中的单个原子来精确编辑分子的方法。这种分子手术可以极大地加快药物研发的速度，并可能彻底改变有机化学家设计分子的方式。2018年的一篇综述文章将其称为一个“登月”概念，莱文被深深吸引。
最近又一家半导体设备上成功上市科创板，叫盛美半导体。以前知道有这么一家公司，好像是做清洗槽的，一个做槽子的公司竟然能上市，而且市值接近600亿。
近期，国际知名黑客组织“匿名者”（Anonymous）伙同其他黑客组织发起了对俄罗斯政府机构组织的新一轮攻击。
本着“三百六十行，行行转生信”的崇高宗旨，基础科研、生物学出身的小编在今年成功进入生信圈，入坑的时候才发现贵圈真的是太乱了，不仅要敲的了代码，跑的了数据，而且跨行不太成功的我还要怒扛鱼饲料、单刀斩鲤鱼。忽然想起了那天在夕阳下拉网的我，那是我逝去的青春（本人海洋生物专业的偶）。
宏基因组研究涉及的样品广泛，因此样品提取比较困难，且有很强的针对性。这里面为大家推荐国内的 Bio-protocol 精选集。下面是引用里面的简介。
压缩空气是仅次于电力的第二大动力能源，又是具有多种用途的工艺气源，其应用范围遍及石油、化工、冶金、电力、机械、轻工、纺织、汽车制造、电子、空气压缩机食品、医药、生化、国防、科研等行业和部门。
场景描述：利用机器学习的方法，对病理学中的组织样本切片显微图像，进行虚拟染色，从而来避免传统染色方法的弊端。辅助医疗人员更便捷的进行诊断。
结果，不仅没有找到ID号，而且还看到了oligo包，很有趣，第一次看到oligo包可以处理agilent芯片的，不知道亲爱的读者你们觉得这个靠谱吗？
今天是高考第二天，不少家长都第一时间拿到了今年的考试真题，为明后年的考生做练习使用。尤其是数理化三科，考生向来采用题海战术。然而，随着科技的发展，你真的认为埋头做《5年高考3年模拟》还是最有效的学习方
计算流体力学是利用高速计算机求解流体流动的偏微分方程组，主要研究内容是通过计算机和数值方法来求解流体力学的控制方程，对流体力学问题进行模拟和分析。目的是为了更好的从定性上和定量上了解流体流动的物理现象，改进设计的一门学科。
虽然三代测序现在已经商用，但是目前的主流还是二代测序，尤其是Illumina公司的测序方式更是大行其道。那么，下面我们从四个方面来说说illumina家的二代测序是怎么得到的生物数据。
文 | 曾响铃 来源 | 科技向令说（xiangling0815） 我们正在呼吸的空气健康吗？ 自2020年疫情爆发后，该问题就一直萦绕在人们脑海中。由于造成疫情的冠状病毒，主要经呼吸道飞沫和密切接触传播，且在相对封闭、高浓度气溶胶下，也存在气溶胶传播的可能。于是戴好口罩，与“暗藏隐患”的空气作战，已成为人们的常规操作。 除了管住口，人们也在尽力管住“空气”。1月30日，据CCTV2《第一时间》报道，在重庆江北机场除了基础的防控要求之外，还在机场的T2和T3航站楼自助值机处、打包处以及候机厅休息室放置了
晶圆键合技术是指通过化学和物理作用将两块已镜面抛光的同质或异质的晶片紧密地结合起来，晶片接合后，界面的原子受到外力的作用而产生反应形成共价键结合成一体，并使接合界面达到特定的键合强度。
除草一直是农业生活中的耗时耗力的大工程，从古诗“锄禾日当午”的描述中，顶着烈日拔杂草的苦差事已经折磨了人类很多年。
illumina 测序最大的就是通量大，正是由于通量大，才可以做大价格低。由于其通量大且价格低，可以满足巨大部分测序的需要，因此，正式开启了高通量测序的时代。Illumina 测序有着非常广泛的应用，最早应用于基因组的组装，还可以用于变异检测，RNAseq，单细胞测序，产前筛查，肿瘤检测等。
昨天，正在四川大学读研的「Ruin-TY」在微博上公开举报，南开大学物理学院学生伊某发表在《当代化工研究》2022年第15期上的论文，抄袭了自己在2019年发表于英文SCI期刊《ChemNanoMat（纳米材料化学）》上的论文。
摘 要：随着全面深化改革工作的逐步实施，航天企业物资供应模式日趋完善。中国运载火箭技术研究院（简称航天一院）对航天通用物资安全库存、到货节奏、补库机制进行研究探索，提出了常备料物资供应的管理模式。本文以非金属为例进行常备料的管理实践，通过物资清单的确定、库存的维护补充以及与供应商联合库存管理等措施，优化和规范了常备料物资的供应。管理模式实行并优化以来，航天物资供应中的乱，多，烦，杂等情况有了明显改善，型号集采规模效应得到充分发挥，2021年全年通过常备料规模化采购降价1200余万元，库存周转率大幅提升，供应效率提升47%，降本增效成效显著。
组织病理学可以追溯到19世纪，它一直是病理学中使用的黄金标准诊断方法之一。如果在医学检查之后或在外科手术期间需要活组织检查，则需要从患者身上取出组织样本，然后将其切成微米薄片。这些病理学切片包含有关组织病理状态的微观信息；然而，这种薄的切片是透明的，并且在标准光学显微镜下不能提供足够的对比度。组织化学利用标本的细胞和亚细胞化学环境将特殊发色团与特定组织成分结合起来，在可见光显微镜下产生颜色对比，形成专家诊断医师和病理学家诊断组织标本异常的基础。
原理介绍视频：https://share.weiyun.com/5qojuBY 密码： 密码：bxsry4
2024年4月25日，David Baker教授团队在Science上发表最新研究Expansive discovery of chemically diverse structured macrocyclic oligoamides。
今天为大家介绍的是来自Bo Huang和Zhenming Liu团队的一篇论文。化学反应是制药和有机化学研究中非常重要的部分，但是目前的一些方法还不够完善，无法充分捕捉和利用化学反应的规律。为了解决这个问题，作者提出了一个全新的计算框架。这个框架的独特之处在于，它不仅可以学习和理解化学反应是如何进行的，还能基于这些理解生成新的分子结构，这对于发现新药物特别有用。
当前我国新冠疫情呈现散发趋势，局部地区感染人数快速提升，为进一步更早找出潜在感染者，2022年3月11日，国务院应对新型冠状病毒肺炎疫情联防联控机制综合组发文，为进一步优化新冠病毒检测策略，服务疫情防控需要，决定在核酸检测基础上，增加抗原检测作为补充。
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对于大于50mW CW模式的激光器我们就可以称之为大功率激光器。介绍一下边发射大功率激光器。现在常用的外延以及芯片结构如下，也有很多新奇的设计。
高通量染色体构象捕获技术（High-throughput chromosome conformation capture，Hi-C）是一种用于研究基因组中染色体的三维结构分子生物学技术。它通过对DNA进行特殊的修饰和捕获，然后对修饰后的DNA进行测序，来确定基因组中不同区域之间的相互作用。这种技术可以帮助研究人员了解基因的功能和调控，以及在染色体中的不同位置的基因之间相互作用。
你是否有过因为一种实验方法版本繁多而苦恼？是否有过抗体实验无法再现文献结果而困惑？你是否有过某些文献中实验步骤简单而气愤…？今天我将给大家分享一款解决这些烦恼的工具，让日常科研更有效率！
今天为大家介绍的是来自Roger M. Howard和Alpha A. Lee团队的一篇论文。高通量实验是一种可以系统地研究不同化学空间中反应活性的方法。目前该领域主要挑战是缺乏大规模的公开数据集，以及需要更简便的方法来解读这些数据中隐藏的化学洞见。为此作者提出了一个新开发的高通量实验分析器，这是一个健壮且统计上严谨的框架。它适用于任何规模和范围的HTE数据集，无论其目标反应结果如何。这个分析器能够揭示起始物料、试剂和反应结果之间的可解释相关性。
实验第一步，设计实验！不同的实验方法需要设计的实验分组也是不一样哒，常见的几种分组简单整理如下哦~
人工智能和机器学习已经证明了其在预测化学性质和小分子合成设计中的潜在作用。数据驱动的合成路线设计是由MLPDS(Machine Learning for Pharmaceutical Discovery and Synthesis)联盟开发和评估的一部分，该联盟包括MIT和13个化学和制药公司成员。他们一起写了“Current and Future Roles of Artificial Intelligence in Medicinal Chemistry Synthesis”刊登于2020年4月JMC，分享了如何将预测模型整合到药物合成工作流程中，如何在MLPDS成员公司中使用预测模型以及该领域的前景。
内容一览：材料检测在工程、科学及制造业中扮演着至关重要的角色。传统的材料检测方法，例如切割和化学试剂检测具有破坏性，同时较为耗费时间和资源。近期，MIT 科学家利用深度学习开发了一种技术，能够填补缺失信息，并进一步通过表面观察确定材料的内部结构。
我们可以这样简单地理解：疫苗其实就是去除或减弱毒性 (感染繁殖能力) 的病毒。在还未感染时，把它拿给 B 细胞、T 细胞“看”，让获得性免疫系统提前产生对抗它的武器 (记忆细胞)。而这 4 大类疫苗，其实就是四种不同形式的去除了毒性的病毒组分。
今天为大家介绍的是来自Xiangliang Zhang团队的一篇关于GPT能力讨论的论文。大型语言模型（LLMs）在自然语言处理任务中具有强大的能力，并迅速应用于科学、金融和软件工程等各种领域。然而，LLMs在推动化学领域的能力尚不清楚。作者建立了一个包含8个实际化学任务的全面基准，包括1）名称预测，2）属性预测，3）收率预测，4）反应预测，5）逆合成（从产物预测反应物），6）基于文本的分子设计，7）分子描述，和8）试剂选择。我们的分析基于广泛认可的数据集，包括BBBP、Tox21、PubChem、USPTO和ChEBI，有助于在实际化学背景下广泛探索LLMs的能力。作者评估了三个GPT模型（GPT-4、GPT-3.5和Davinci-003）在每个化学任务中以零样本和少样本上下文学习设置下的性能。作者的研究的主要结果是：1）在三个评估模型中，GPT-4的性能优于其他两个模型；2）在需要精确理解分子SMILES表示的任务（如反应预测和逆合成）中，GPT模型表现出较弱的竞争性能；3）GPT模型在与文本相关的解释任务（如分子描述）中展示出强大的能力；4）在可转化为分类或排序任务的化学问题（如属性预测和收率预测）中，GPT模型展现出与经典机器学习模型相当或更好的性能。
随着医药卫生体制改革不断深化、医疗机构自身的改革加速，整体医疗市场的复杂程度加深和成本压力上升。对于医药流通行业来说，两票制的推行让大企业将渠道下沉，中小型代理商则会面临被淘汰、被兼并或服务转型。但从另一方面来讲，医药流通行业商业模式及渠道变革创新背后，蕴藏的是新的机遇。医药企业亟须加强渠道管控，通过成熟高效的渠道商销售管理方案，缩减渠道流通环节和成本，进一步推进行业快速转型和发展，实现医药企业可持续发展。
2020年全球知名研究分析机构Gartner发布《RPA市场竞争格局》，列出全球RPA市场里最具代表性的厂商，其中云扩科技作为中国厂商首次进入国际视野。当年十月，国际知名研究咨询机构Forrester发布《Now Tech: Robotic Process Automation, Q4 2020》，云扩科技再次作为中国主流RPA厂商代表被推荐。
尽管全息相干成像显微镜存在着如无标记，无扫描3D成像等诸多优点，相对于其它的显微成像模式（如明场显微镜和荧光显微镜），全息显微成像仍旧存在一些问题，如复杂的相位重建迭代过程，噪音噪点，导致了它的使用范围并没有那么广泛。
今天解读的这篇文章发表在PLoS Medicine（最新影响因子11.048）上，题目为Patterns of Immune Infiltration in Breast Cancer and Their Clinical Implications: A Gene-Expression-Based Retrospective Study。虽然发表在2016年，但是这篇文章在免疫方面的研究十分细致和深入，很值得大家学习和借鉴。
Metagenomic sequencing allows researchers to investigate organisms sampled from their native environments by sequencing their DNA directly, and then quantifying the abundance and taxonomic composition of the organisms thus captured. However, these types of analyses are sensitive to contamination in public databases caused by incorrectly labeled reference sequences. (Nature综述：2万字带你系统入门鸟枪法宏基因组实验和分析) Here we describe Conterminator, an efficient method to detect and remove incorrectly labelled sequences by an exhaustive all-against-all sequence comparison. Our analysis reports contamination in 114,035 sequences and 2,767 species in the NCBI Reference Sequence Database (RefSeq), 2,161,746 sequences and 6795 species in the GenBank database, and 14,132 protein sequences in the NR non-redundant protein database. Conterminator uncovers contamination in sequences spanning the whole range from draft genomes to “complete” model organism genomes. Our method, which scales linearly with input size, was able to process 3.3 terabytes of genomic sequence data in 12 days on a single 32-core compute node. We believe that Conterminator can become an important tool to ensure the quality of reference databases with particular importance for downstream metagenomic analyses. Source code (GPLv3): https://github.com/martin-steinegger/conterminator.
作者：J Ellis Cameron-Perry博士，美国人，曾在苏格兰求学并在中国生活和工作多年。现为Adrealm智库执行总监兼首席编辑，同时也是哲学家，作家和企业战略顾问。曾在浙江广播电视集团担任国际顾问，并在华东多所大学有执教经历，长期从事原创学术研究和专栏写作。
Sanger-双脱氧链终止法原理：设置4个反应体系，分别加入DNA、引物、酶、4种dNTP，和其中1种带有标记ddNTP。在加入ddATP反应体系中，当ddATP和T碱基结合，反应终止，在这个反应体系中，ddATP会结合DNA上所有T位点，其余3种反应体系同上。
先是谷歌DeepMind的AI工具GNoME成功预测出200万种晶体结构，随后微软推出的MatterGen，大大加速了设计所需材料特性的速度。
这篇名为“压力表观遗传学与衰老：揭示复杂的交叉作用”的综述文章全面探讨了各种类型的压力与衰老过程的复杂关系，特别是通过表观遗传变化的视角。文章的主要内容包括： 1. 衰老与压力：强调衰老是涉及多种细胞和分子途径的复杂过程，受到氧化、基因毒性、炎症和代谢等压力的加剧。这些压力与表观组学相互作用，促进与年龄相关疾病的发展。 2. 压力类型与表观遗传调控：讨论与衰老相关的不同类型的压力及其底层的表观遗传调控。强调内部和外部刺激如何通过触发细胞损伤来塑造衰老，以及这些如何与表观遗传变化相互关联。 3. 氧化压力：探讨氧化压力在衰老中的作用，包括它如何诱导表观遗传改变，并促进衰老和相关疾病的发展。文章讨论了表观遗传调控ROS产生酶和抗氧化因子的作用。 4. 基因毒性压力：详细介绍基因毒性压力对衰老的影响，强调由氧化损伤和辐射等因素引起的基因组稳定性扰乱如何导致DNA损伤和遗传突变，这是衰老和与年龄相关疾病的关键因素。 5. 炎症压力：文章讨论了慢性低度炎症（即炎症衰老）与衰老的关联。探讨了表观遗传修饰在调控衰老相关炎症过程中基因表达的作用。 6. 代谢压力：审视营养和代谢信号失衡如何影响细胞功能并促进加速衰老。强调表观遗传修饰在介导代谢压力对衰老影响中的作用。 7. 其他类型的压力：还提到了其他类型的压力，如蛋白稳态和热应激，它们对衰老过程的影响，以及表观遗传学在这些过程中的作用。 8. 抗衰老干预：讨论了对抗衰老和与年龄相关的疾病的各种干预策略。这些包括生活方式改变、基于小分子的干预、基因疗法和细胞移植策略，每一种都可能对减轻压力和表观遗传更新产生影响。 这篇文献提供了详细的探讨，说明了不同类型的压力如何促进衰老过程，以及表观遗传学在这一交互作用中的角色，为潜在的干预和治疗方法提供了见解。
Mapping the space of chemical reactions using attention-based neural networks
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