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R语言升级

因为一个R包让我不得不对电脑的R进行升级,正好整理下整个升级的过程。我们是在Rstudio中进行的升级操作。用到了包installr。...install.MikTeX, install.git,install.git, install.GraphicsMagick,install.ImageMagick, check.for.updates.R,...我们不在此一一介绍,今天主要介绍updateR这个函数: updateR()主要要来升级R软件,升级过程中会遇到下面的一些选项: 会提示当前版本已经后面最新的升级版本: ?...我们设置好后关闭Rstudio,再次打开Rstudio新版本的R就可以用了。 ? 当然,我们如果需要安装github的包的时候,Rtools软件老版本也不再适用,需要下载新版本的Rtools。...下载链接:https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/。 ? 当然这个包有一个缺陷,暂时还不能完成Linux系统下的R升级

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升级R4.2的好处

之前的R版本是4.1,而且很多R包版本也不够新,有一些小瑕疵一直懒得解决,比如seurat的热图一直有莫名其妙的乱码,最近又遇到了两个高频包它们共用的一个依赖包出现了版本冲突,忍无可忍了,就卸载了4.1...版本的R,并且删除了一千多个R包,节省了10G的硬盘空间。...然后重新安装了最新版R,并且重新一次性安装了一千多个包,这次居然有意外收获,莫名其妙的我可以在线直接安装GitHub包啦: > remotes::install_github(repo = 'genecell...skip updates: 3 Installing 2 packages: RcppParallel, proxyC 将程序包安装入‘C:/Users/win10/AppData/Local/R/...empty or unneeded directories ─ building 'COSG_0.9.0.tar.gz' 将程序包安装入‘C:/Users/win10/AppData/Local/R/

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升级R最简单最直接的方法

升级R一直是一件比较痛苦的事情,你需要先安装新的R,然后在逐一安装以前装过的包。最快的办法也是把以前的包文件夹拷到新的R中,然后在新的版本中运行包更新。...由于官方的源一般都提供最新R版本的二进制文件,所以为了更好的稳定性一般也要跟着升级。所以这是一件相对痛苦又不得不做的事情。...现在installr程序包提供了自动化升级的途径,你只需要回答几个问题就可以将R升级至最新版本,同时相应的程序包也会及时的得到更新。...下面是升级之后RStudio的启动提示 R version 3.1.2 (2014-10-31) -- "Pumpkin Helmet" Copyright (C) 2014 The R Foundation...总的来看,R升级还是很成功的,使用起来也很方面。

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升级R最简单最直接的方法

升级R一直是一件比较痛苦的事情,你需要先安装新的R,然后在逐一安装以前装过的包。最快的办法也是把以前的包文件夹拷到新的R中,然后在新的版本中运行包更新。...由于官方的源一般都提供最新R版本的二进制文件,所以为了更好的稳定性一般也要跟着升级。所以这是一件相对痛苦又不得不做的事情。...现在installr程序包提供了自动化升级的途径,你只需要回答几个问题就可以将R升级至最新版本,同时相应的程序包也会及时的得到更新。...下面是升级之后RStudio的启动提示 R version 3.1.2 (2014-10-31) -- "Pumpkin Helmet" Copyright (C) 2014 The R Foundation...总的来看,R升级还是很成功的,使用起来也很方面。

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手把手教你在Windows环境下升级R

在Windows环境下,我们可以使用installr包自动将R升级到最新版本。并且可以安装软件。下面主要演示如何在Windows环境下升级R,并将旧版本安装的R包复制到更新版本的R。...3、installr将会检测是否发布了新版本的R,如果检查到有单击“确定”即可更新R。 ? 4、如果想了解新版本R的相关特性介绍,单击“是”,可在浏览器中打开这个信息。 ?...5、下载并安装最新版本R,单击“是”。 ? 6、等待R的下载 ? 7、单击安装向导中的“下一步”按钮 ? 8、等待完成R的安装 ?...13、在RStudio中更换使用的R版本 ? 至此,我们就将R升级到了最新的版本。...##R版本升级之后,可以将原来版本的包复制到如今,然后执行下面的命令 update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)

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随心所欲对指定R包进行升级与降级

关于R语言本身的升级与降级我们多次写教程阐述了,其实在Windows和MAC都是可以多个R版本共存的,linux那就更不用说了,一切皆文件,想存放多少就可以多少。...在Ubuntu下安装单细胞3大R包 (这里面有R软件升级教程) 它们只不过是把谁放在环境变量罢了的问题,优先使用哪个的问题。...一个R包,三篇文章,可以说是很牛了,因为它跨越了单细胞最火热的十年,所以不同文章使用的是不同版本的它,这样为了重复文章的某些分析图表,就需要使用指定版本的R包了。...在R包的CRAN可以看到:https://cran.r-project.org/web/packages/Seurat/index.html ?...,所以需要相应的升级或者降级: ?

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Windows server 2008 R2 AD升级迁移到windows server 2019

> 因为公司现有生产环境还在使用windows server 2008 R2,考虑到版本太老和后续可能遇到的兼容性问题,再加上微软已经停止了对windows server 2008的支持,于是着手升级现有环境到...然后迁移FSMO角色,使其成为PDC 第二种是直接本地升级,但是2008 R2 不能直接升级到2019,升级步骤为2008R2 -2012R2 -2019 相对来说第一种的方式比较安全和高效,只需要切换以下...官方也不建议把域控制器的操作系统就地升级为2019,所以本教程采取第一种方式升级。...该域还必须使用DFS-R作为复制SYSVOL的引擎。...R2 升级FRS为DFS复制 确保所有域控在线(虽然不在线的可以单独升级,但是增加复杂度……),最好在PDC进行所有操作,PDC可以链接到所有域控,使用以下命令检查域控在线和复制情况 Repadmin.exe

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它想强迫我升级一系列seurat相关的单细胞R

之前写的很多单细胞笔记都是基于V4版本的Seurat系列包,其中SeuratData 是 R 语言中 Seurat 包提供的一个数据包,旨在为使用 Seurat 进行单细胞RNA测序分析的用户提供方便的测试数据...# InstallData("pbmc3k") data("pbmc3k") 但是最近发现自己的一个电脑里面是没有SeuratData ,就需要安装它,如下所示,就发现了它想强迫我升级一系列...seurat相关的单细胞R包: > devtools::install_github('satijalab/seurat-data') Downloading GitHub repo satijalab...(2.0-0 -> 2.1-2 ) [CRAN] 10: SeuratObject (4.1.3 -> 5.0.1 ) [CRAN] 虽然说我这个时候选择了3,默认不要升级如何东西...0.2.2.9001.tar.gz’ * installing *source* package ‘SeuratData’ ... ** using staged installation ** R

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