因为一个R包让我不得不对电脑的R进行升级，正好整理下整个升级的过程。我们是在Rstudio中进行的升级操作。用到了包installr。 install.MikTeX, install.git,install.git, install.GraphicsMagick,install.ImageMagick, check.for.updates.R, 我们不在此一一介绍，今天主要介绍updateR这个函数： updateR()主要要来升级R软件，升级过程中会遇到下面的一些选项： 会提示当前版本已经后面最新的升级版本： ? 我们设置好后关闭Rstudio，再次打开Rstudio新版本的R就可以用了。 ? 当然，我们如果需要安装github的包的时候，Rtools软件老版本也不再适用，需要下载新版本的Rtools。 下载链接：https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/。 ? 当然这个包有一个缺陷，暂时还不能完成Linux系统下的R升级。
R的版本升级比较频繁，很多R包对R版本的要求也比较高，我的R还停留到3.4版本，完全跟不上了。 又懒得卸载原来的R再下载新的，搜了一下，以下方法实测好用（来自https://zhuanlan.zhihu.com/p/39349696）： # install.packages('devtools')
之前的R版本是4.1，而且很多R包版本也不够新，有一些小瑕疵一直懒得解决，比如seurat的热图一直有莫名其妙的乱码，最近又遇到了两个高频包它们共用的一个依赖包出现了版本冲突，忍无可忍了，就卸载了4.1 版本的R，并且删除了一千多个R包，节省了10G的硬盘空间。 然后重新安装了最新版R，并且重新一次性安装了一千多个包，这次居然有意外收获，莫名其妙的我可以在线直接安装GitHub包啦： > remotes::install_github(repo = 'genecell skip updates: 3 Installing 2 packages: RcppParallel, proxyC 将程序包安装入‘C:/Users/win10/AppData/Local/R/ empty or unneeded directories ─ building 'COSG_0.9.0.tar.gz' 将程序包安装入‘C:/Users/win10/AppData/Local/R/
升级R一直是一件比较痛苦的事情，你需要先安装新的R，然后在逐一安装以前装过的包。最快的办法也是把以前的包文件夹拷到新的R中，然后在新的版本中运行包更新。 由于官方的源一般都提供最新R版本的二进制文件，所以为了更好的稳定性一般也要跟着升级。所以这是一件相对痛苦又不得不做的事情。 现在installr程序包提供了自动化升级的途径，你只需要回答几个问题就可以将R升级至最新版本，同时相应的程序包也会及时的得到更新。 下面是升级之后RStudio的启动提示 R version 3.1.2 (2014-10-31) -- "Pumpkin Helmet" Copyright (C) 2014 The R Foundation 总的来看，R的升级还是很成功的，使用起来也很方面。
在3.6.2版本的R上跌跌撞撞根据甲方要求、全靠自学完成任务一段时间之后，因为一些原因，实验室的R重装了，变成了4.0.5版本，之前一切的配置都要重来，没做完的分析都要重做。 总算切实地懂了为什么当初死活安装不上Seurat的时候，希望当时的服务器管理员师兄升级一下R或者把我加入sudo list之后他为什么没同意了。升级换代要慎重。 packageXXX was installed before R4.0.0问题 # 从R3.6.2更新成R4新版本（4.0.5）的R、并重新安装Rstudio后 # 调用R包会遇到package XXX "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/local/lib/R/library" # 分别查看两个system library里的旧包名称 old_packages 上安装时遇到的相同解决方案解决：点击此处跳转 而且在R3.6.2上安装得很艰难的Seurat在R4上安转得很顺利，但是风水轮流转，在R3上安装没问题的monocle3这次又出了问题： # monocel3
image 介绍 在移动开发过程中，应用升级是必不可少的一个环节，所以，r_upgrade应用升级插件就出现了，这里先鼓掌欢迎?? ，下面是使用介绍 r_upgrade Android和IOS的升级应用插件==Flutter应用升级插件 网页链接形式升级 apk下载形式升级使用Service或者DownloadManager 跳转到应用商店升级 Android热更新 开始吧 1.使用插件: 在pubspec.yaml文件添加下面代码 dependencies: r_upgrade: last version 2.使用打开链接的方式进行更新 > <resources> <string name="<em>r</em>_upgrade_download_speech">%.2fkb/s</string> <string name="<em>r</em>_upgrade_download_planTime ">预计%.0f秒后完成</string> <string name="<em>r</em>_upgrade_download_finish">下载完成</string> <string name="<em>r</em>_upgrade_download_paused
在Windows环境下，我们可以使用installr包自动将R升级到最新版本。并且可以安装软件。下面主要演示如何在Windows环境下升级R，并将旧版本安装的R包复制到更新版本的R。 3、installr将会检测是否发布了新版本的R，如果检查到有单击“确定”即可更新R。 ? 4、如果想了解新版本R的相关特性介绍，单击“是”，可在浏览器中打开这个信息。 ? 5、下载并安装最新版本R，单击“是”。 ? 6、等待R的下载 ? 7、单击安装向导中的“下一步”按钮 ? 8、等待完成R的安装 ? 13、在RStudio中更换使用的R版本 ? 至此，我们就将R升级到了最新的版本。 ##R版本升级之后，可以将原来版本的包复制到如今，然后执行下面的命令 update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)
前天，arxiv上新出一篇论文《Cascade R-CNN: High Quality Object Detection and Instance Segmentation》，目标检测算法Cascade R-CNN 原作者对其进行扩展应用于实例分割。 Cascade R-CNN 是什么？ Cascade R-CNN 是2017年末出的目标检测算法，它的核心思想是： 使用不同的IOU阈值，训练多个级联的检测器。 Cascade R-CNN 网络结构 网络结构如下图b， ? 公式表示就是这样的： ? Cascade Mask R-CNN 网络结构 受Mask R-CNN发，作者将Cascade R-CNN推广到实例分割很简单，作者提供了三种策略，分别对应下图中b、c、d中将分割头S放在不同的位置。
GraphPad Prism是一款高效易用的科研绘图工具，集生物统计、曲线拟合和科技绘图于一体，还可用于Windows和Mac操作系统，在生物学以及社会和物理科...
关于R语言本身的升级与降级我们多次写教程阐述了，其实在Windows和MAC都是可以多个R版本共存的，linux那就更不用说了，一切皆文件，想存放多少就可以多少。 在Ubuntu下安装单细胞3大R包 （这里面有R软件升级教程） 它们只不过是把谁放在环境变量罢了的问题，优先使用哪个的问题。 一个R包，三篇文章，可以说是很牛了，因为它跨越了单细胞最火热的十年，所以不同文章使用的是不同版本的它，这样为了重复文章的某些分析图表，就需要使用指定版本的R包了。 在R包的CRAN可以看到：https://cran.r-project.org/web/packages/Seurat/index.html ? ，所以需要相应的升级或者降级： ?
> 因为公司现有生产环境还在使用windows server 2008 R2，考虑到版本太老和后续可能遇到的兼容性问题，再加上微软已经停止了对windows server 2008的支持，于是着手升级现有环境到 然后迁移FSMO角色，使其成为PDC 第二种是直接本地升级，但是2008 R2 不能直接升级到2019，升级步骤为2008R2 -2012R2 -2019 相对来说第一种的方式比较安全和高效，只需要切换以下 官方也不建议把域控制器的操作系统就地升级为2019，所以本教程采取第一种方式升级。 该域还必须使用DFS-R作为复制SYSVOL的引擎。 R2 升级FRS为DFS复制 确保所有域控在线（虽然不在线的可以单独升级，但是增加复杂度……），最好在PDC进行所有操作，PDC可以链接到所有域控，使用以下命令检查域控在线和复制情况 Repadmin.exe
在这项工作中提出了2个动态设计来改进Sparse R-CNN。 首先，Sparse R-CNN采用一对一标签分配方案，其中匈牙利算法对每个Ground truth只匹配一个正样本。 实验表明，Dynamic Sparse R-CNN可以增强具有不同Backbone的强Sparse R-CNN Baseline。 下相对Sparse R-CNN提升了2.2% AP。 Sparse R-CNN提出R-CNN中可学习的建议框和建议特征，并将特征图上提取的RoI特征和相关的建议特征传递到迭代结构（即动态头）进行预测。 3Dynamic Sparse R-CNN 3.1 回顾Sparse R-CNN Sparse R-CNN是一个比较强的目标检测Baseline，通过对稀疏可学习目标建议进行预测，然后再使用一个迭代结构
数据库升级的时候有一个很重要的环节就是数据库参数审核，对于数据库参数还是有很多的门道，其中一种就是对于过期参数的处理。我们可以使用如下的SQL来得到一个基本的过期参数列表。 SELECT name FROM v$parameter WHERE isdeprecated = TRUE;当然内容也比较多，在10g升级11g的时候，还是有一些参数需要格外注意，在之前也写了一篇这些参数的介绍和说明
前面的内容可以参见：迁移式升级的一点思考 （r10笔记第27天）、迁移式升级的新方案测试 (r10笔记第30天)、迁移式升级的测试（二）(r10笔记第35天) 今天会把剩下的工作都做完，给个交代。 然后惊讶的是11g的库迁移完之后，停掉11g的库，重新打开10g的库，竟然还可以打开，这是不是一种更加平滑的数据库升级，降级。
在之前写的一篇博文中，自己是打算对一台数据库使用Data Guard+TTS的方式来完成数据迁移和升级的工作，迁移式升级的新方案测试 (r10笔记第30天) 整体的思路如下。 ? 从而达到快速迁移升级的目的。 具体的操作步骤如下所示： 1.在备库端需要开启闪回 这个也是为了能够在迁移失败的情况下，能够迅速回退，马上重构主备库的环境。
最近测试了使用datapump来迁移百G数据的场景，因为实际需要，需要把Unix下10gR2的库迁移到Linux下11gR2，所以这个过程相对来说牵制也较多。考...
今天继续学习R语言基础的R包使用，以R包：dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”) #务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号 部分人可能会因为镜像的问题失败，解决方法https://mp.weixin.qq.com /s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw 03 R包及数据准备 install.packages("dplyr") library(dplyr) test <- iris[c(1:2,51:52,101 经过这几期的R语言基础，你应该能够入门R了，渐渐的也要自己去学会看帮助文档，去搜报错，还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗？ ? +命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档 如果你能独立处理这些问题，那么恭喜你，你的R应该没问题啦！ 应该没问题了！！！！吧？
.1.1 /usr/lib64/libssl.so.1.1 ln -s /usr/local/lib64/libcrypto.so.1.1 /usr/lib64/libcrypto.so.1.1 如上升级 openssl版本后, 导致某些服务编译安装失败的坑, 如果短时间解决不来, 最好回滚到之前的默认版本: openssl由默认的OpenSSL 1.0.1e升级到OpenSSL 1.1.1e后, 编译安装 openssh 出现下面报错: 由于openssl升级后, 可能会导致一个应用编译安装失败, 遇到的有nginx, keepalived等, 不得已的办法就是将openssl回滚到之前默认的版本状态 , 操作方法如下: 查看openssl, 然后删除升级后的openssl [root@localhost ~]# find / -name openssl [root@localhost ~]# rm
解压文件然后升级 Confluence 停止 Confluence. 如果你使用 Jira 或者 LDAP 来对用户进行管理，从老的 Confluence 安装实例中拷贝下面的文件到新的 Confluence 升级安装实例中。 <Installation-Directory>/confluence/WEB-INF/classes/atlassian-user.xml （如果你从 Confluence 2.2 或者后续版本进行升级
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