首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

TypeScript 原始数据类型

数据类型 概述 类型声明是 TS 非常重要的一个特点 通过类型声明可以指定 TS 中变量(参数、形参)的类型 指定类型后,当为变量赋值时,TS 编译器会自动检查值是否符合类型声明,符合则赋值,否则报错...简而言之,类型声明给变量设置了类型,使得变量只能存储某种类型的值 Snipaste_2021-05-18_14-09-22.jpg TypeScript 中的数据类型分为两大类 原始数据类型(基本数据类型...) 对象类型(复杂数据类型) 常用的基本数据类型:number / string / boolean / undefined / null 自动类型判断 TS 拥有自动的类型判断机制 当对变量的声明和赋值时同时进行的...array 1, 2, 3 任意的 js 数组 tuple 4, 5 元组,TS 新增类型,固定长度的数组 enum enum(A, B) 枚举,TS 中新增类型 在 ES6 和 ES10 中引入了新的基本数据类型...,分别是 Symbol 和 BigInt 原始数据类型 数字类型 使用关键字number定义数字类型 let decimal: number = 6.1; // 小数 let hex: number

77350

NGS基础:测序原始数据下载

生物或医学中涉及高通量测序的论文,一般会将原始测序数据上传到公开的数据库,上传方式见测序文章数据上传找哪里;并在文章末尾标明数据存储位置和登录号,如 The data from this study was...NCBI的SRA (Sequence Read Archive) 数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/) 是最常用的存储测序数据数据库。...在如此多的Runs中,假设我们想获取其中两个病人的化疗前和化疗后的外显子组测序数据,观察其化疗前后究竟有哪些基因突变以及突变的频率怎么样。...在Facets下拉框中先勾选Assay Type,等待页面相应后勾选wxs,即全外显子组数据,等待页面相应。...下载的数据集一般比较大,放入后台不中断下载 (nohup cmd &)。

1.4K21
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

aglient芯片原始数据处理

,下面看她的表演: 本文讲的是aglient芯片原始数据的处理,参考资料是limma 的userguide文档。...GEO数据库下载的表达矩阵不符合预期,比如是空的,或者是有负值的,那我们就处理一下它的原始数据。aglient的芯片应用也很广泛,举个OSCC的栗子:GSE23558,跟着学习学习。...1.下载和读取数据 1.1获取临床信息数据 从前,提到GEO数据下载,我们只有GEOquery,神功盖世,但是死于网速。后来就有了中国人寄几的GEO镜像,AnnoProbe包。...HealthyControl"),"normal","tumor") group_list <- factor(group_list, levels=c("normal","tumor")) 1.2 读取原始数据...这个原始数据下载,在GEO主页,可能对大家的网络有一点点要求,可以参考:下载GEO数据太慢?

3.3K32

原始数据到计数矩阵

因此,我们的材料将着重于基于液滴的方法(inDrops,Drop-seq,10X Genomics),详细介绍这3'方案的数据分析。...3'末端读取(包括所有基于液滴的方法) 了解每个reads中都包含哪些信息,以及我们如何在整个分析过程中使用它,对于scRNA-seq数据的分析是很有帮助的。...计数矩阵的生成 我们将首先讨论此工作流的第一部分,即从原始测序数据生成计数矩阵。我们将重点介绍基于液滴的方法所使用的3‘端测序,如inDrops、10X Genomics和Drop-Seq。 ?...对于许多scRNA-seq方法,从原始测序数据到生成计数矩阵都将经历相似的步骤。 ?...使用计数矩阵,我们可以浏览和筛选数据,只保留质量较高的细胞。 ---- 注:以上内容来自哈佛大学生物信息中心(HBC)的教学团队的生物信息学培训课程。

1.4K10

安捷伦芯片原始数据处理

双通道芯片有时候实验设计挺复杂的,agilent的原始数据数据处理在中文互联网上也不算常见。...本文借助limma的帮助文档,完成一篇使用agilent双色表达分析,研究肺鳞癌早期肿瘤发生和免疫逃避机制的nature的原始数据处理和文章复现。...RG <- read.maimages(txt, source="agilent",green.only = F) 原始数据读进来是一个「RGList」对象,由limma包产生。...小心使用大写或小写,不要插入任何多余的空格。剩下的列提供了要与不同类型的点关联的颜色。此代码假定探测注释data.frame包括列ID和列Name。.../no_normalize_MAplot") #可以看到读入原始数据和画MAplot是限速步骤,因为122个样本量太大了,把读好的数据存成.Rdata方便日后取用 save(RG,GSE_number,

37010

scRNA-seq原始数据的处理

目录 ⊙第一章:关于课程 ⊙第二章:单细胞RNA-seq简介 正文 处理原始scRNA-seq数据 3.1 FastQC 获得单细胞RNA-seq数据后,首先要做的就是检查已测序的读数的质量...FastQC是一种用于测序数据的质量控制工具,可用于bulk和单细胞RNA-seq数据。FastQC将测序数据作为输入,并返回有关读取质量的报告。...将网页向下滚动到“示例报告”,然后单击“良好的Illumina数据”。这给出了一个对于高质量Illumina的reads数据来说,理想的报告应该是什么样的例子。...今天,我们将使用由(Kolodziejczyk等人,2015)生成的mESC数据集中的单个细胞进行分析。使用SMART-seq2文库制备方案对细胞进行测序,并对reads进行配对。...鉴于我们注意到FastQC报告中存在一些adapters污染,最好从我们的数据中trim掉adapters。 任务2:我们的数据中使用了哪种类型的adapters?

1.4K10

illumina磁珠芯片原始数据处理

lumiR 通过智能读取所有版本的 Illumina BeadStudio 软件的原始数据来初始化 LumiBatch 对象,并且 lumiR.batch 方法旨在读取一批数据文件。...总之,lumi 包提供了LumiBatch类的基础框架和相关方法来构建 Illumina 从原始数据开始到功能分析的工作流程。...三、 以GSE67936为例的原始数据处理 可以看到是illumina磁珠的表达量芯片,一共有168个样品。...Supplementary files 中有一个RAW原始数据的压缩包和一个non-normalized为标准化数据的压缩包。这个示例数据中的RAW.tar不可用,存储的平台的注释信息。...lumiB调整芯片背景;lumiT 对数据进行方差固定;lumiN 对方差固定后的数据进行标准化,lumiQ 评估数据质量。

19210

MariaDB 插入数据

存储在系统中的数据数据库管理系统(DBMS)的核心,数据库被设计用来管理数据的存储、访问和维护数据的完整性,MariaDB中提供了功能丰富的数据库管理语句,包括有效地向数据库中插入数据的INSERT语句...,更新数据的UPDATE语句以及当数据不再使用时删除数据的DELETE语句,本小结将依次来介绍这些命令的使用方法和技巧.MariaDB 插入数据MariaDB中使用INSERT语句插入数据,可以插入的方式有...:插入完整记录,插入记录的部分,插入多条记录,插入另一个查询的结果,废话不多说,老样子先来看一下插入语句的写法吧:INSERT INTO 表名称(字段1,字段2,字段3,.....)..., -> info char(50) null, -> primary key(id) -> );Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)◆在所有字段插入数据...LyShark | 22 | Lawyer |+----+---------+-----+--------+1 row in set (0.00 sec) MariaDB [lyshark]>◆在指定字段插入数据

2.2K40

一行代码下载原始数据—Kingfisher

Woodcroft 教授开发的一款专门用于高通量测序数据下载的工具。...Github网址:https://github.com/wwood/kingfisher-download 1简要用途: 一行代码下载原始数据 Kingfisher 是一个快速灵活的程序,用于从公共数据库...(ENA、NCBI、SRA、Amazon AWS 和 Google Cloud)获取序列文件及其元数据注释。...它有两种主要模式:get 模式用于下载序列数据,annotate 模式用于下载元数据。 在 get 子命令中,Kingfisher 会从一系列冗余源下载数据,直到其中一个有效。...有时候一个数据集下载完成之后,但是发现仅有个别样本,数据完整性校验不通过,这时候就需要单个fastq文件重新下载,那么 Kingfisher 可以实现吗?

37920
领券