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序列比对序列比对与BLAST

今天首先为大家介绍序列比对,也即两条序列(或者多条序列两两之间)进行的比对,常用于同源分析、蛋白质结构推断、相似片段搜寻与数据库比对检索、基因注释等。...序列比对算法 ⑴基本算法(LCS算法) 序列比对实质上是一个路径寻找问题,若有序列v=ATGTTAT和w=ATCGTAC两个短序列,其比对过程可以用下图表示: 从(0,0)到(7,7),每穿过一个顶点相当于成功匹配一个碱基...序列比对所需要的计算时间和内存空间与这两个序列的长度有关,或者说正比于这两个序列长度的乘积,用O(mn)表示。 序列比对工具 常用的序列比对工具有BLAST、FASTA、diamond等。...9 = Seqalign (Binary ASN.1), 10 = Comma-separated values, 11 = BLAST archive (ASN.1), 12...,不适合outfmt大于4的情况,默认为500 -num_alignments:对于每个输入序列,在结果中显示的高分比对结果的详细比对情况数目,默认为250 -line_length:结果中详细比对情况的行的长度

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视频平台人脸识别比对控制比对时间间隔的代码设计

当前阶段我们也在积极开发AI人脸检测、人脸识别、车牌识别等项目,将AI智能检测识别与视频处理等技术互相融合、交互,并在线下场景中落地应用。今天和大家分享一个技术干货:如何控制人脸识别比对的时间间隔。...人脸智能分析项目在识别到人脸后,随即进行对比、入库。这里需要实现的是摄像头在识别到人脸后,控制对比的时间间隔。...在后台打开人脸识别的策略后,就会使用GO协程开启一个定时任务,在后台配置的时间间隔内,定时改变识别的状态,将人脸对比改为true可对比状态,如图:?...而在识别到人脸进行对比过后,再将状态改为false,那么下次回调I帧时,通过定时任务,人脸识别状态为true时再次对比。这样就能达到控制人脸识别比对的时间间隔了。?

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通过USB接入双目UVC协议人脸比对相机,外接AI相机实现1:1比对开发

标准UVC设备,兼容性强,自带人脸识别算法,支持活体识别,支持1:1比对,不借助外部设备即可进行人脸识别,输出人脸属性值。支持活体识别,有效防止照片、视频和面具等假体攻击。...双目USB1.jpg 可用于智能零售,人证对比,顾客分析,人脸跟踪抓拍,等应用领域开发,二次开发资料完善,帮助开发者和系统集成商快速实现产品的人脸识别相关功能,开发周期短,成本低。...双目USB2.jpg 工作流程: 1、后端管理系统对接相机的SDK,通过身份证读卡器读取证内人脸图片,然后推送到相机内,相机完成与现场人员进行人证照片比对,并输出比对结果与活体检测结果。...2、后端管理系统对接相机的SDK,通过调取已有的人脸库图片,推送到相机内,相机完成人脸图片与现场人员照片的比对,并输出比对结果与活体检测结果。

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最佳实践 | 使用WebSocket做个实时人脸活体比对服务

人脸核身使用了两种实时通信技术——WebSocket与WebRTC。本文将主要介绍一下,应用在人脸核身浮层活体中的WebSocket。...使用HTTP协议进行连接,连接建立成功后,端就可以主动地向对方发送信息。图片WebSocket是怎么建立连接的?...利用WebSocket实现一个简单的实时比对服务我们可以简单地使用人脸检测与分析接口与人脸比对接口做一个实时的人脸检测与比对服务。...图片AI能力方面,我们会使用到腾讯云提供的两个接口人脸检测与分析接口与人脸比对人脸检测与分析接口用于检测人脸位置与人脸遮挡,根据接口返回,提示用户调整姿态。...人脸比对接口用于对前端传入的截帧与服务端存储的比对照进行比对,得出一个相似度,用于判断是否同一人。

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使用python3.7和opencv4.1来实现人脸识别和人脸特征比对以及模型训练

OpenCV4.1已经发布将近一年了,其人脸识别速度和性能有了一定的提高,这里我们使用opencv来做一个实时活体面部识别的demo     首先安装一些依赖的库 pip install...     第二步,就是为模型训练收集训练数据,还是通过摄像头逐帧来收集,在脚本运行过程中,会提示输入用户id,请从0开始输入,即第一个人的脸的数据id为0,第二个人的脸的数据id为1,运行一次可收集一张人脸的数据...sucess, img = cap.read() # 转为灰度图片 gray = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY) # 检测人脸...Exiting Program".format(len(np.unique(ids))))     最后一步,人脸测试,我们将摄像头中的人脸和模型中的特征进行比对,用来判断是否为本人 import...最后,送上人脸识别项目地址: https://gitee.com/QiHanXiBei/face_get/tree/master

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2️⃣ 序列比对(2):BLAST详细操作:web版和linux版

序列比对和序列特征分析总目录 网址:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 运行方式:本地或web ---- 基本的BLAST工具包括: ?...也就是查询的蛋白和数据库中的DNA都翻译成蛋白进行比对。...可以详细查看该选择哪个 Organism可以限制物种 Expect threshold期望阈值,默认10 word size字长,默认3,还可以设置为10或2,数值小搜索的结果会增加,速度会变慢 matrix序列比对的打分矩阵...图4,查询的分子类型,比对的数据库,都有描述。 ? 图4 结果1 图形结果。查询序列含有的保守结构域,以及数据库中与查询序列匹配项的图形。不同彩色条带颜色代表得分的高低。...图6 结果3 查询序列与数据库中的匹配序列之间的序列比对情况。包括score,expect,identity同一性得分,positive相似性分值,gaps空位。

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视侦搜索超级搭档 人脸步态剑合璧

常规技术是视频浓缩、视频摘要和人脸识别,前两个仅能节约部分浏览时间,无法找出线索;人脸识别则对摄像头拍摄角度和清晰度要求高。...近年来,人脸识别技术的飞速发展,为警务视频侦查带来了颠覆式、跨越式的发展,其具体应用也已渗透进日常生活的各个领域,机场、火车站、地铁站、小区、公安等随处可见,人脸识别技术可以从海量视频中快速的刻画出嫌疑人的时空轨迹...人脸识别技术被称为“21世纪十大人类生活”的革命性技术。4月21日,涉嫌弑母的北大学子吴谢宇归案,也得益于人脸识别技术的精准识别。...步态识别技术成为继人脸识别技术之后一个新的生物识别技术热点,很好地弥补了人脸识别的应用盲点。 步态识别是一种新兴的生物特征识别技术,旨在通过人们走路的姿态对其进行身份识别。...人脸识别侧重于近距离精准识别,步态识别则可以包揽远距离无脸识别,如今天网恢恢,人脸识别、步态识别双管齐下,剑合璧,让视侦搜索如虎添翼,让犯罪嫌疑人无所遁形。

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首次揭秘1112背后的云数据库技术!| Q推荐

从 2009 年到 2021 年,从千万交易额到千亿交易额, 11 已经开展了 12 年。如今,每年的 11 以及一个月后的 12,已经成为真正意义上的全民购物狂欢节。...刚刚过去的 2021 年 11,就有超过 8 亿消费者参与。 与攀升的交易额和参与人数相反, 11 的主要阵地“淘宝 APP”、 12 的主要阵地“天猫 APP”的崩溃情况逐年减少近无。...是什么样的数据库撑起了 2021 年的 11 12 的稳定进行?...《数据 Cool 谈》第三期,阿里巴巴大淘宝技术部 12 队长朱成、阿里巴巴业务平台 11 队长徐培德、阿里巴巴数据库 11 队长陈锦赋与 InfoQ 主编王一鹏,一同揭秘了 11 12 背后的数据库技术...在 11 12,这种方式的弊端会被进一步放大。数据显示,在 11 秒杀系统中,秒杀峰值交易数据每秒超过 50 万笔,是一个非常典型的电商秒杀场景。

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身份采集、活体检测、人脸比对...旷视是如何做FaceID的? | 公开课笔记

从功能上来说呢,我们的产品包括身份证的质量检测、身份证 OCR 识别、活体检测、攻击检测以及人脸比对,整个解决方案可以看出是建立在云跟端两个基础上,我们在端上提供了 UI 解决方案,就提供 UI 界面可以方便集成...这样通过这三种方案去判断就是活体检测,除了刚才我们介绍的一些比较典型的方法之外,我们也在去尝试一些新的包括角度活体跟静默活体。...角度活体是用户拍一张正脸的自拍照与侧面自拍照,通过这种 3D 建模重建的方式来判断是不是真人,我们的角度活体,静默活体,为用户提供一种非常好的用户体验,相当于用户拍一个两秒钟的视频。...▌人脸比对 活体检验之后,我们就可以进行人脸比对的环节。...所以总结一下就是 Face ID 会为大家提供一整套的这种身份验证解决方案,整个方案涵盖了质量检测、身份证识别、活体检测、攻击检测和人脸比对等一系列的功能,其中在活体检测方面,我们采用了云加端的这种联合防范方式

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