该软件包具有定义明确的文档，其中解释了挂钩的用法以及测试方法。...它是React钩子库（14.8k）中GitHub启动数量最多的平台之一。...，与上面的钩子一样。...为此编写的文档非常好，其中显示了许多示例，这些示例对于开始使用库/自己做钩子来说绰绰有余。...它提供的主要功能是： useHistory useLocation useParams useRouteMatch 它的名字很不言自明。
目前虽然已有基于数据库和反应规则的生物合成路径预测工具，但由于本身已知的酶反应数量不足，且由于不同酶的催化杂泛性和专一性也不同，导致现有反应规则（模板）无法很好地反映酶的催化功能。...因此，对于以酶催化反应为主的生物合成来说，现有基于模板的方法给出的反应路径在实际中常常无法通过相应的酶来催化，并且对于许多生源合成步骤较长，结构较复杂的天然产物，并没有相似度较高的反应模板与之匹配。...给定目标天然产物，BioNavi-NP可在几分钟内给出其到指定分子砌块（building block）的多条路径，并根据已知反应或酶对路径进行打分排序。...预测的反应途径将按照计算成本、长度和生物体特定的酶进行分类。 图3：BioNavi-NP网站输出结果示意图。...实验评估表明，BioNavi-NP模型在内部测试集及多个外部独立公共测试集上都显示出了优异的性能。网站工具的搭建以及酶预测工具的嵌入，使得研究者们能够便利地使用该工具进行合成生物学的研究。
目前虽然已有基于数据库和反应规则的生物合成路径预测工具，但由于本身已知的酶反应数量不足，且由于不同酶的催化杂泛性和专一性也不同，导致现有反应规则（模板）无法很好地反映酶的催化功能。...因此，对于以酶催化反应为主的生物合成来说，现有基于模板的方法给出的反应路径在实际中常常无法通过相应的酶来催化，并且对于许多生源合成步骤较长，结构较复杂的天然产物，并没有相似度较高的反应模板与之匹配。...给定目标天然产物，BioNavi-NP可在几分钟内给出其到指定分子砌块（building block）的多条路径，并根据已知反应或酶对路径进行打分排序。...预测的反应途径将按照计算成本、长度和生物体特定的酶进行分类。 图3....实验评估表明，BioNavi-NP模型在内部测试集及多个外部独立公共测试集上都显示出了优异的性能。网站工具的搭建以及酶预测工具的嵌入，使得研究者们能够便利地使用该工具进行合成生物学的研究。
但在生物体内，新陈代谢反应却可以在极为温和的条件下高效进行，这主要归功于重要的有机催化剂——酶。...一直以来，人们在深入研究酶分子结构与功能的同时，也在持续探究酶促反应的影响因素。...研究酶促反应速率以及各种因素对酶促反应速率影响机制的科学，被称为「酶促反应动力学」，在研究中，酶在特定反应中的催化效率通常通过酶动力学参数 (enzyme kinetic parameters) 来衡量...酶促反应动力学参数包括了酶周转数 kcat、米氏常数 Km 和催化效率 kcat / Km 等，目前主要依赖湿实验来进行参数测量，但这一过程耗时且成本高，使得实验测得的酶动力学参数数据库规模相对较小，而数据的稀缺则会限制下游系统生物学和代谢工程领域的发展...数据集按照 8:2 的比例划分为训练集和测试集。 第四是 kcat/Km 数据集，包含 910 个由酶序列、底物结构及其相应的 kcat/Km 值组成的样本。
同传统电池的原理一样，电池内材料的化学反应是电池电力的来源，这里微生物细胞内的酶所带来的酶促反应（生物体内的化学反应）就决定着电力的稳定供应问题。...对此，主要研究者Seokheun Choi解释道：“微生物细菌细胞内的酶作为生物催化剂，会发生酶促反应，而活的细菌细胞环境可以保持稳定的酶活性。...这里，Choi又进一步指出：因为人体内细菌比正常的细胞还要多，所以可穿戴电子设备就可以直接使用细菌作为电池的电力来源，并且，实验中，研究人员测试了材料在扭曲、拉伸情况下的电力供应能力，结果发现这一材料的电力供应能力始终是稳定的...但仅仅有持续不断的电力供应是不够的，电池的性能取决于功率、容量、比能量和电阻等因素，所以该技术还需进一步的测试。
梦晨 发自 凹非寺 量子位 | 公众号 QbitAI 如果你试过让ChatGPT随便讲个笑话（英语），那你大概率见过这个： 两位德国学者对GPT3.5做了个大型测试，发现它其实只会讲25个笑话。...等10种，总共测试了1008次。 在生成笑话试验后，还让ChatGPT解释这25个笑话，进一步检测AI是否理解了这些笑话，还是只是复述出来。...比如让ChatGPT一个物理系学生的笑话，就比较成功 ： 为什么物理系学生和他的实验室搭档闹掰了？因为他们之间没有化学反应。...用英文提示词要求ChatGPT讲个中文笑话会如何呢？经多次测试，GPT3.5和GPT-4出现完全不同的反应。 GPT-3.5还是会讲一个不好笑的故事。...在中文上这个技巧同样有效，下面这个笑话在网络上确实没有搜到类似的。 最后我们测试发现，使用思维链提示同样可以引导ChatGPT讲出一个原创的笑话。
在对40个突变体的验证测试中,该平台展现出92.5%的预测准确率，计算预测结果与实验结果高度一致。使用NAC4ED自动确定单个酶突变体所需的时间仅为实验方法的1/764。...NAC4ED设计策略 酶具有高度的化学选择性、空间选择性和底物/产物选择性，能显著提高反应速率，高效完成催化反应。...该平台利用NAC状态来增强酶设计效率，实现针对特定酶反应的突变体的高通量自动化设计和筛选。...本研究提出高精度三维蛋白质结构，根据酶与底物的结合催化机理，推导稳定的近攻击活性构象，建立活性构象模型参数，并以此构象作为起点，设定分子动力学模拟条件，测试氨基酸突变和底物变异对近攻击态稳定性的影响，最后以轨迹中活性构象种群作为相关系数进行突变体评估...在实际应用中，研究人员建议用户针对特定系统进行定制的基准测试，以优化模拟设置。 图4：NAC4ED的准确性和效率验证。（A）里氏木霉(TrEH)环氧化物水解酶活性构象比的计算。
该研究结合生成式扩散模型RFdiffusion与反应路径预组织评估工具PLACER，突破了传统酶设计在多步反应机制中的瓶颈，开发出催化效率接近天然酶的合成酶。...其催化循环涉及四步反应：底物结合、酰基化（形成酰基-酶中间体AEI）、水解（水分子攻击AEI）和产物释放。...PLACER在PDB基准测试中达到1.1 Å的平均RMSD精度，显著优于传统分子动力学模拟效率。...该研究为设计复杂多步反应酶提供了通用框架，标志着计算酶设计从单一过渡态优化迈向全反应路径工程的新阶段。...这将使我们能够从头设计更复杂的酶，这是以前难以实现的。” 未来，该方法可扩展至其他催化系统（如PET酶、酰胺酶等），并为设计全新反应机制的酶提供框架。
荧光素酶可以催化luciferin被氧化成oxyluciferin的反应，在luciferin被氧化的过程中会发出生物荧光，然后可以通过仪器测定luciferin氧化过程中释放的生物荧光。...3️⃣加入特定的荧光素酶底物，荧光素酶与底物反应，产生荧光，通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性，从而判断转录因子是否能与此靶启动子片段有作用。...，提供转录活力的内对照，使测试结果不受实验条件变化的干扰。...✅荧光素酶报告基因的优点 蛋白不需要翻译后加工，所以一旦翻译立即产生报告活性。 在所有的化学发光反应中，它的光产物具有最高的量子效率，因而非常灵敏。另外，在宿主细胞及检测试剂中均检测不到背景发光。...与绿色荧光蛋白（GFP）不同，它们的发光检测不需要激发光激发，且发光穿透力更强，这使其具备可定量、高灵敏度及低背景等特点 海肾荧光素酶催化的发光反应需要腔肠素和O2的参与，发光颜色为蓝色。
许多酶，包括线粒体电子传递链中的酶、黄嘌呤氧化酶、环氧化酶、脂氧化酶、髓过氧化物酶、细胞色素 P450 单加氧酶、解偶联 NOS、血红素加氧酶、过氧化物酶和 NAD(P)H 氧化酶，都能产生 ROS。...ROS：H2O2检测试剂：HKPerox-1，HKPerox-2H2O2 主要由 NADPH 氧化酶与超氧化物歧化酶、线粒体电子传递链和许多其他酶共同产生，是一种强双电子氧化剂，但其高活化能限制了其对少数生物靶标的反应性...它与谷胱甘肽、半胱氨酸和蛋氨酸的反应非常缓慢，但根据特定的蛋白质结构和环境，其对特定蛋白质中半胱氨酸的反应活性可大大提高到 10 M-1S-1 (约为蛋白质中平均半胱氨酸的 106 倍)，为 H2O2 ...ROS：•OH检测试剂：HKPerox-1，HKPerox-2在所有活性氧 ROS 中，•OH 被认为是最具活性和最有害的一种。...ONOO- 通过触发一系列分子级联反应，在介导凋亡细胞死亡、炎症、梗死扩大和血脑屏障破坏中发挥关键作用。图 7.
(3) 发光测定：通过发光测定监测 CaMKII-δ 磷酸转移酶活性 （注意：如果激酶反应不是在室温下进行，在加入 ADP-Glo™ 试剂之前，将板平衡至室温） 。...在该测定中，CaMKII-δ 的肽底物 (Autocamtide-3 ) 的磷酸化与 ATP 到 ADP 的转变酶促偶联。ADP-Glo 试剂用于终止激酶反应并去除未反应的 ATP。...加入激酶检测试剂终止 ATP 消耗反应并将 ADP 转化为 ATP，然后通过荧光素酶反应将 ATP 进一步转化为光。 图 2. 发光检测酶活性原理图。 二、细胞毒活性试验的 IC50 值，如何测？...为了揭示吡啶和噻唑衍生物的抗癌活性，以阿霉素为对照药，使用 MTT 法测试噻唑基吡啶类化合物对肺癌 (A549) 细胞系的体外抗癌作用，对其进行了 IC50 值测定[2]。 图 3....▐ IC50 值的数据处理 实验设计：进行细胞或酶实验，将靶标 (如细胞系、酶等) 暴露于多个不同浓度的药物中。 记录数据：测量药物对靶标的抑制效果，例如细胞存活率、酶活性或代谢产物变化。
介绍 酶促和非酶促合成有机（“合成”）反应可以协同组合以利用各自的独特优势。酶可用于在其他合成过程的关键点引入立体化学。酶还可以催化具有优异区域选择性的反应。...从BKMS生化反应数据库中自动提取的反应模板 在作者的酶反应数据集中，近80%的反应模板只有一个先例（图2e）。在作者的酶促反应数据集中，近 80%的反应模板只有一个先例（图 2e）。...比较酶促转化和合成转化 合成有机化学比已知的酶促化学能够实现更广泛的转化。然而，酶是催化不同的反应还是仅仅催化具有提高的特异性和效率的反应并不明显。...为了估计唯一酶变换的数量的较低界限，作者确定了在反应物和产品之间没有添加或丢失重原子的3466酶反应，968个反应无法由Reaxys反应模板来描述，对应于824个唯一的酶反应模板。...作者证明了他的模型是这样，通过比较两个外部测试集的模型第1推荐分数：来自MOSES数据集的48869个小有机分子和45035分子注释为生物（天然产品）的ZINC目录，这些分子在训练中没有被任何模型看见。
细胞活力检测产品大 PK 常用的细胞活力检测试剂主要有 MTT、CCK8 等检测方法 (图 1)。MTT法：又称 MTT 比色法。...其检测原理为活细胞线粒体中的琥珀酸脱氢酶能使外源性 MTT 还原为不溶于水的蓝紫色结晶甲臜 (Formazan) 并沉积在细胞中，但死细胞无此功能，后经 DMSO 溶解，于 490 nm 处测定吸光值便可间接反应细胞活力...ATP 生物发光的原理为：荧光素酶以荧光素、ATP 和 O2 为底物，在 Mg2+ 存在时，可将化学能转化为光能；在荧光素酶催化的发光反应中，ATP 在一定的浓度范围内，其浓度与发光强度呈线性关系，即在光信号与酶反应体系中...使用 SYBR Green 或荧光素酶来测试对寄生虫生长的抑制，共检测了 456,817 种化合物。...若待测药物的溶剂含量较高，荧光素酶反应可能会被干扰，致化学发光信号受到影响，可设置含有溶剂的细胞培养液的对照孔以排除此干扰。4.
02 PCR扩增 PCR也即聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction），是利用DNA聚合酶通过控制温度梯度来实现的一种DNA分子的胞外扩增。...常见的PCR的反应循环如下所示（具体温度和时间因酶而异）： 由于DNA聚合酶只能在5'端缺口添加碱基，故需要引物的帮助来进行复制，引物一般设计在可变区两端的保守区，并通过简并碱基的使用来增强其通用性。...： 需要注意的是，实际的PCR反应不是一种指数扩增，扩增子的数目更趋近于S型曲线，随着反应进行，引物、dNTP不断被消耗，DNA聚合酶的活性也会降低，导致错配率升高等问题，因此PCR循环次数并不是越大越好...在传统的测序技术中，使用限制性内切酶对目标DNA上的限制性内切酶识别位点进行切割，从而形成小片段。...鸟枪法打断产生的小片段其序列长度服从正态分布，例如微生物基因组DNA经过90s超声波打断成约350bp的小片段，建库后的文库片段（加上接头为500bp左右）经Agilent 2100测试长度分布如下所示
——应用—— 作者将ChemNet在复合物构象系综预测上的能力，利用在酶设计领域，取得了较好的效果。 在从头设计酶中，除了靶标的主链结构，关键催化侧链和反应底物的结合构象也至关重要。...RA95系列的逆羟醛缩合酶（retro-aldolase），含有一系列天然版本和定向进化改造的版本（图8B，这些版本的酶都有高分辨率的晶体结构），其催化羟醛缩合逆反应的机理如图8A，核心催化残基是活性位点的...作者分析，中间体1和2涉及的基元反应活化能较高，是反应决速步，如果酶能稳定这些中间体，则可提高反应速率。...逆羟醛缩合酶的预组织性预测、活性及设计 此外，作者还前瞻性地测试了ChemNet在指导蛋白质设计中的使用，以深度学习生成的NTF2样折叠为骨架进行了一轮全新的逆醛缩酶设计。...选取侧链极性原子间距在2.0-3.3Å的酶设计，按照侧链重原子RMSD排序，筛选出RMSD最小的90个酶，对这些设计用体外转录翻译系统（IVTT）测试活性。
研究人员使用X-ray晶体学方法揭示了SARS-CoV-2主要蛋白酶的结构，设计了与该靶标结合并阻止病毒复制的抑制剂。该工作发表在2020年3月20日的《Science 》上。 ?...作为对由SARS-CoV-2病毒引起的COVID-19大流行作出反应持续努力的一部分，研究人员使用X-ray晶体学方法揭示了SARS-CoV-2主要蛋白酶(SARS-CoV-2,Mpro)的结构。...他们专注于这种蛋白酶，因为它在加工从病毒RNA翻译的多蛋白中起着重要作用。...在研究主要蛋白酶的结构的基础上，研究人员优化了现有冠状病毒的抑制剂，以开发化合物13b，后者是SARS-CoV-2主要蛋白酶的有效阻断剂。...他们进一步在小鼠中测试了其主要的抑制剂化合物，发现吸入耐受性良好，并且小鼠未显示任何不良反应。研究人员建议，由于尚不知道具有类似裂解特异性的人蛋白酶，因此这类抑制剂不太可能具有毒性。 ?
为了避免 Bug 导致的损失，上线前需要做好充分的测试，这也是公司时常教育我们的话：对上线持“敬畏之心”。...据俄罗斯通讯社塔斯社报道，在上周的莫斯科国际象棋公开赛上，一个国际象棋机器人折断了一名 7 岁男孩的手指。...事发现场的视频显示，机器人在拿走了男孩的一个棋子后，突然扑了上来，似乎是对男孩针对自己上一步落子动作的「快速反应」感到不安。...图片素材来源：Baza 「机器人折断了孩子的手指，这很糟糕。」莫斯科国际象棋联合会主席 Sergey Lazarev 表示。...在国际象棋机器人的案例中，设备似乎只是为了识别和移动棋子而设计的 —— 而不是对其游戏区域中出现的人手做出反应。 更准确的说法是机器人的设计者违反了安全规则，创造了一种可能无意中伤害人类的机器。
血糖测试纸与配套的仪器配合使用，是用于测量指尖或手掌毛细管全血中葡萄糖浓度的生化反应系统。 试纸采用虹吸原理，血样与测试条顶端进样口接触后自动吸入反应区。...血样中的葡萄糖与血糖试纸中的葡萄糖氧化酶混合后，会产生微电流，微电流的强度与血样中的葡萄糖浓度成线性关系，电流的强度取决于血样中的血糖浓度。...每片血糖测试纸包含:葡萄糖氧化酶>1U;其他成分(铁氰化钾、碳电极和PET塑料板);测试纸包装筒内有干燥剂。 葡萄糖氧化酶（GOD）能够消耗氧气催化葡萄糖氧化，产生过氧化氢和葡萄糖酸。...知道的可以告诉我 前面是一个四线的电化学测量系统，因为要构成恒电位系统，所以这些DAC都拉出来，方便测试。可以看到调试的串口就水灵灵的流出来了，这里先推测是个下载口。
每个图可以用来输出一个或一组反应规则（酶反应模板）。此外，它还可以计算出在给定酶的情况下该酶催化新底物的概率（预测其在非天然底物上的适用性）。...其中，酶反应的反应规则的生成尤其具有挑战性，因为酶之间的底物混杂性差别很大，这导致了规则特异性的最佳水平和包含的原子的最佳数量在不同酶之间差别巨大。...从另一方看，从数据库中自动提取酶反应的数据的困难促进了手工管理反应规则集的创建。 大多数酶在某种程度具有混杂性，换句话说，它们可以被改造以接受新底物。 在反应途径设计的实践中，适度混杂的酶是首选。...其中，最重要的是提高评分函数的准确度，从而正确地对预期可行的反应进行排序。然而，依赖于相似性或反应规则特异性的方法无法区分通用酶和专用酶，即它们缺少对酶的混杂性的描述。...2.5数据准备 作者从文献中手工提取了一系列关于各种酶的底物范围的实验研究，以及有机偶联反应的研究，来测试EHreact对有机、非酶促反应的性能。
：胶体聚集化合物、自荧光化合物、荧光酶抑制剂和化学易反应化合物（图1）。...图2频繁命中化合物中（A）胶体聚集化合物、（B）荧光酶抑制剂、（C）自荧光化合物和（D）化学易反应化合物的主要干扰机制 3 荧光酶抑制剂 荧光酶检测技术，主要是利用生物荧光酶探测实验中ATP浓度从而判断酶的活性高低...图3常见频繁命中化合物或子结构（A）荧光酶抑制剂、（B）自荧光化合物和（C）化学易反应化合物 4 自荧光化合物 通过荧光基团检测相关生物分子浓度是高通量筛选中另一重要检测手段。...Yang等人发现一些FH具有相同或相似的骨架，例如2-氨基噻唑骨架化合物发现在测试的14个实验中均表现为阳性结果，之后其基于PubChem数据库中大量实验数据开发一种通过分子骨架预测化合物为FH可能性的方法...鉴于这类化合物的高度选择性，DCM常被用作频繁命中化合物建模中的负集或外部测试集。 另一方面，混乱化合物并不是一无是处。多药理机制（Polypharmacology）是老药新用以及药物拯救的基础。
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