解决 Git 重命名时遇到的大小写不敏感的问题 发布于 2017-11-23 08:51 更新于 2018...Linux 操作系统文件的大小写却是敏感的，不同大小写意味着不同的路径。...让人困扰的大小写问题 让我对此问题产生困扰的是下面这张图，Docs 和 docs 两个文件夹分开了： ?.../docs -f 执行……推送后最终效果居然和第一种方法一样！依然是有 Docs 和 docs 两份文件夹。 尝试出的可行的方法 这是堆栈网那位只有 70+ 赞的方法的改进版本。...直接能生成一个仅修改文件夹名称大小写的新提交。 如果你在执行以上命令时出现了问题，请移步至 Windows 10 四月更新，文件夹名称也能区分大小写？ 统一寻找解决方法。
一、问题 今天用脚本更新MySQL的一个触发器时，出现了极为奇怪的现象： mysql> source crt_xxx_trigger.sql ERROR 1360 (HY000): Trigger does...回想起来，脚本在从Oracle移植到mysql的过程中，由最初的全大写（初次创建时）改成了后来的全小写，因而出现了这个问题。...三、讨论 问题虽然得以解决，但觉得其中有问题：为什么drop trigger时大小写敏感，但create时又不再区分大小写。区别对待的原因究竟是什么？...顺便说说其他数据库的情况： Oracle： 默认是大小写不敏感，表名、字段名等不区分大小写，小写字母会自动转换为大写字母，需要用小写字母时需要使用双引号。...PostgreSQL： 默认是大小写不敏感，表名、字段名等不区分大小写，大写字母会自动转换为小写字母（正好与Oracle相反）， 需要用大写字母时需要使用双引号。
接下来，我就为大家分享几个我在工作当中最常用来做数据分析用到的包，dplyr和data.table，我保证你get到这两个包后，就再也不想用R里面自带的基础包函数进行数据分析了！！...dplyr很庆幸，都提供了关于常用方法的一些函数。...data.table包 dplyr已经可以满足我们数据分析工作中大部分的需求，后来该包的作者又开发了一个炫酷吊炸天的包“data.table” 如果你的日常处理数据在几万到十几万行，那么用dplyr...官网上面有关于data.table包对于dplyr的提升和改进： ?...data.table把我们刚刚用group_by和summarise组合才能实现的功能，直接在一句代码里面就实现了，而且代码的可读性和可扩展运用性非常强！
“体细胞的”和“致病性的”分类策略是否适用于肿瘤DNA的大规模测序？...让我们看看复旦大学的这个乳腺癌生殖突变和体细胞突变相互作用。...且则只关心 78 个基因，这 78 个易感基因的筛选条件是： 得到突变结果之后，再确定候选的基因列表， 最后使用R包 maftools 的 somaticInteractions 函数预测生殖突变和体细胞突变的相互作用...值得注意的是高频突变基因 TP53 (49.9%), PIK3CA (30.1%), GATA3 (10.0%), NF1 (6.0%), and MAP3K1 (5.4%) 和对应的热点突变 hotspot...：如 germline BRCA1 / BRCA2突变 (gBRCA1/2 ) 和PIK3CA体细胞突变之间的相互排斥性，以及 gBRCA1和TP53体细胞突变的共现。
之前介绍了使用maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot（瀑布图） R-maftools包绘制组学突变结果（MAF）的oncoplot或者叫“瀑布图”，以及一些细节的更改和注释。...本文继续介绍maftools对于MAF文件的其他应用，为更易理解和重现，本次使用TCGA下载的LIHC数据。...8 Somatic 交互性 癌症中的许多引起疾病的基因共同发生或在其突变模式中显示出强烈的排他性。...9 两个队列比较(MAFs) 由于癌症的突变模式各不相同，因此可是 mafComapre参数比较两个不同队列的差异突变基因，检验方式为fisher检验。...result部分会有每个基因分别在两个队列中的个数以及P值和置信区间等信息。 SampleSummary 会有两个队列的样本数。
（样本来自多家医院） 2、从TCGA数据库中选择了4679例癌症患者的全外显子组测序数据，进行突变和生存分析 结果解析 01 POL家族变异的患者特征和患病率 作者分析了12266名不同实体肿瘤患者的测序数据...在驱动阳性肿瘤中，DNA损伤和修复(DDR)通路基因是最重要的突变基因之一，在超过90%的病例中检测到BRCA2、ATM和MSH6的改变(图2A)。...比较已知驱动因素和未知意义的变异(VUS)的临床特征，发现POL驱动因素突变与男性性别(图2C)和较年轻的疾病诊断年龄(图2D)强相关。...图3 04 POL VUS的突变特征 鉴于 POL VUS 在驱动与驱动突变相似的功能和临床方面的潜在附加价值，作者希望比较由于驱动突变、VUS 或 MSI 而显示高 TMB 的 POL + 患者的突变谱和突变特征...图4 05 POL和DDR通路基因突变的预后意义 研究结果显示，DDR通路基因突变与POL变异的外显率之间有很强的相关性。
❞ 在开发 UCSCXenaShiny 的基础上，我将其中支持的 UCSCXena TCGA/CCLE 单基因数据下载函数进行了整理，构建了一个单一的入口。...第 2 个是数据的类型，包括基因表达（gene），转录本表达（transcript）、突变（mutation）、拷贝数变异（cnv）和甲基化（methylation），默认是基因表达。...第 3 个是数据库，包括 toil（包括上面提到的 TCGA 等几个个体水平数据）和 ccle。 使用 了解函数参数后，使用就根据自己所需就行了。如果还不懂，可以不断试错。...我们再看下它的 CNV 和 突变情况。...::filter() masks stats::filter() #> x dplyr::lag() masks stats::lag() expr dplyr::tibble( sample
例如，当只关注直接参与ACE2结合的20个RBD残基中的一个子集时，理论序列空间远远超过了酵母文库所能筛选出的。...对于RBM-1库，大多数抗体在低ED时产生不平衡的分类数据（很少在≤ED5时产生逃逸变异体）。...当RF和RNN模型均得出P > 0.5时，预测给定的RBD序列与ACE2结合，否则预测它们是非结合剂。选择46个合成谱系变体来体现ACE2结合预测的多样性(图5a)。...2.5 确定抗体对SARS-CoV-2突变谱系的稳健性 在选择用于治疗的候选抗体时，抗体对潜在的SARS-CoV-2变异的稳健性（保持结合能力）可能是一个关键参数。...作者的DML库是基于原始的Wu-Hu-1 RBD序列，然而，全球几乎所有的循环变体都是Omicron或其亚系。Bloom等人表明不同的RBD变异时，单氨基酸突变(DMS)会导致突变轨迹的改变。
Hackread网站消息，Chrome和Excel解析库存在被利用的漏洞。...发现漏洞之后，美国网络安全和基础设施安全局（CISA）立即向联邦机构发布了紧急通知，要求机构在1月23日前完成风险缓解工作，并遵循供应商的指南迅速解决这些漏洞。...目前，美国网络安全和基础设施安全局（CISA）已经将两个识别出来的重大漏洞添加到被利用漏洞（KEV）目录中。...值得注意的是，该漏洞的影响范围扩展到了用Perl开发的各种应用程序和框架，因此也可能会影响整个系统。...Qualys威胁研究部门首席威胁情报分析师奥布雷·佩林表示，“CVE-2023-7101是一个Perl库的漏洞，它已经引起了广泛关注，这一点在网络和电子邮件安全公司Barracuda的设备中的使用可以看出
KRAS^{G12D}最近的一项研究表明，与TP53突变的其他KRAS等位基因相比， 和TP53共突变可提高总生存率。这些相互矛盾的发现提出了驱动基因的改变是否会影响生存的问题。...与晚期肿瘤患者相比，早期肿瘤患者更有可能在BRAF和TGFBR2中发生推定的致癌突变。在早期和晚期肿瘤之间的突变总数没有显著差异。...KRAS^{G12D}突变肿瘤在KRAS、CDKN2A和SMAD4的各种组合的频率上是不同的，两种或多种肿瘤抑制因子（TP53、SMAD4和CDKN2A）的改变比 突变更常见。...KRAS^{WT}在复发时间分析中，与 相比， 疾病、 疾病和其他KRAS突变的远处复发率较低。相反， 疾病的局部复发率升高。...没有肿瘤抑制基因突变的患者比那些至少有一个TP53、CDKN2A或SMAD4共突变的患者有更长的生存期KRAS^{G12D}结果7、空间分析鉴定 和 PDAC之间的等位基因特异性差异KRAS^{G12R
nvl NVL的概念 Oracle/PLSQL中的一个函数。 ...格式为： NVL( string1, replace_with) 功能：假设string1为NULL，则NVL函数返回replace_with的值，否则返回string1的值，假设两个參数的都为...注意事项：string1和replace_with必须为同一数据类型，除非显示的使用TO_CHAR函数。 ... i中，假设查询的值为null就把它的值设置为默认的1 orcale中: select nvl(rulescore,0) from zwjc_graderule where rulecode...nvl(rulescore,0),值为0的数据.
生信科技动态 1、Nature | 基因突变不是随机的 自20世纪上半叶起，突变的随机性就一直是生物演化理论的重要基础。...在一篇发表于《自然》杂志的论文中，一支国际研究团队通过对模式植物拟南芥的研究提出，突变的诞生不是完全随机的，相反，突变出现的区域有着明显的规律性。...2、Nature Communication｜基于2万余个肿瘤体细胞突变谱，揭示年龄对肿瘤突变数量及进化时间的影响 该研究通过分析来自TCGA、AACR GENIE和PCAWG三个项目中的数据，揭示了年龄对肿瘤中的突变数量...（每年每兆碱基0.077个突变）及其进化时间的影响，绘制了具有临床意义的与年龄相关癌症体细胞突变图谱。...)自动生成模型和数据框架的报告，确保结果报告的标准化和质量。
fuzzyjoin包是dplyr连接操作的变体，它可以支持模糊（匹配）连接，比如忽略单词之间的大小写，根据正则表达式进行连接，忽略单词的拼写错误等。...该包中的函数命名也很简单易懂，对于六个dplyr中join操作的每个变体，只要在前面加上统一的前缀即可，比如，根据正则表达式进行连接： regex_inner_join regex_left_join...默认的dplyr中的各种连接不支持忽略大小写的连接。...列和words中的word列进行连接，正常情况下，由于misspelling列中都是拼错的单词，它是不可能连接起来的，但是stringdist_inner_join可以根据单词之间的距离进行连接，达到忽略拼写错误的目的...beastiality bestiality bestiality 5 ## 3 affilate affiliate affiliate 4 其他功能 这个函数的功能都是和连接相关的
背景介绍 年龄、吸烟、病毒和辐射增加了遗传和自发突变的负荷，这些突变影响着癌症的开始和发展，在癌症基因组上留下了它们的标记。...图1a显示了12种癌症类型的突变频率分布。 比较12种癌症类型的突变谱(图1b)显示，肺肿瘤(LUSC和LUAD)中C→A转位的比例更高。这种突变是暴露在吸烟中的典型特征。...该工作分析了7,042种癌症中的4,938,362个突变，并提取了20多个不同的突变特征。 在96种可能的替代突变中，只有一种或两种特征显著的特征，表明突变类型和序列背景具有显著的特异性(特征10)。...全基因组和外显子组数据集中的突变簇符合APOBEC突变模式指示的严格标准。...小编总结 患者年龄、吸烟史、病毒感染和辐射等都能够增加遗传和自发突变的负荷，这些突变影响着癌症的开始和发展。所以分析以上因素与患者突变之间的关系十分重要。
FALSE, alpha = 0.8, add.lines = TRUE, ...) expressionsTCGA(BRCA.rnaseq, OV.rnaseq, LIHC.rnaseq) %>% dplyr...Rplot.jpeg 2 生存分析kmTCGA() Kaplan-Meier 生存曲线评估乳腺癌和卵巢癌病人中TP53基因突变与生存关系 library(RTCGA.mutations) # library...(dplyr) if did not load at start library(survminer) mutationsTCGA(BRCA.mutations, OV.mutations) %>%...RTCGA.clinical) survivalTCGA( BRCA.clinical, OV.clinical, extract.cols = "admin.disease_code" ) %>% dplyr...Rplot01.jpeg 更多的看这里
OpenAI 的核心志向是开发出算法和技术可以赋予计算机理解世界的能力....模型能够发现和有效地内化（internalize）数据的本质，从而才可以生成这些数据. 他们有着自动学习数据集的自然特征的潜力，包含类型、维度或者其他特征....InfoGAN 对该空间引入了额外的结构通过增加一个新的包含最大化表示向量和观测值的小的子集的互信息目标函数. 这个方法给出相当出色的结果....很明显从 5 个提供的例子中（每一行），代码的结果维度刻画了可解释的维度，并且模型在没有告诉这些重要特征存在的情形下可能已经理解到是存在摄像头角度、面部变化等等： ?...这项工作更深的启示是，在训练生成式模型的过程中，我们最终会赋予计算机对世界和世界构成的理解
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。
因为cnpm install安装时，是不会去从package-lock.json中读取依赖包的版本信息的。...npm 5版本，在延续npm 3扁平化依赖包安装方式的基础上，新增了一个package-lock.json文件。...package-lock.json的主要作用就是锁定依赖项的安装目录和依赖包的版本信息。...关于package.json和package-lock.json中的区别，可查看文章nodejs中package.json和package-lock.json文件的功能分析 当我们执行npm install...而cnpm install是不会去pack-lock.json中获取任何信息的，它只会根据各依赖包的配置下载对应版本的包。
无传参时，值为null empty: true isset: false 有传参，无传值，(xx=)，值为"" empty: true isset: true 有传参，传值为0，(xx=0)，
（2）突变基因预测：该研究的模型在冰冻组织、福尔马林固定的石蜡包埋组织和活组织检查的独立数据集上得到验证。此外，该训练网络预测腺癌中十个最常见的突变基因。...该深度学习程序还能够确定细胞中与肺癌相关的6种基因（STK11、EGFR、FAT1、SETBP1、KRAS和TP53）的突变情况，其准确度范围为73％-86％，具体取决于基因。...研究人员表示，确定每种肿瘤中哪些基因发生突变对于增加靶向治疗的使用至关重要，这些治疗仅对具有特定突变的癌细胞起作用。例如，已知大约20％的腺癌患者有EGFR有突变，可以用EGFR的靶向治疗药物。...纽约大学朗格尼尔森林癌症中心病理学系副教授Aristotelis Tsirigos博士说：癌症的早发现早治疗特别重要，该研究提供了强有力的证据，证明AI方法能够立即确定癌症亚型和基因突变谱，从而使患者能够尽早接受靶向治疗...数据和计算能力之间的协同作用正在创造前所未有的机会，以改善医学实践和科学。
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