可以在plyr ddply中获取空分组中的分组变量吗？_formattable在R中可以按变量对表进行分组吗？_可以在YANG中扩充分组中的容器吗？ - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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【R语言】因子在临床分组中的应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子（factor）今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。我们还是以TCGA数据中的CHOL（胆管癌）这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper...*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组的因子方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾的...gsub一样的结果参考资料： ☞【R语言】R中的因子（factor） ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper...☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub

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JSTL 和 JSP 中变量互相访问1）变量在jstl中获取的例子：2）jstl变量在中获取的例子：

1）变量在jstl中获取的例子： <% String username="zhangsan"; pageContext.setAttribute("username",username...); %> 即：jsp 页面中中的变量在定义后，需要放置到pageContext属性中，才能被获取（当然也可以放置到request和session...、 applicatio中，这要根据实际应用来做决定，一般只是在页面中使用的化，使用pageContext就可以了）。...2）jstl变量在中获取的例子： <% String username=(String)pageContext.getAttribute

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R语言分组计算，不止group_by

最近在研究excel透视图，想到好像自己在R-分组操作并不是很流畅，顺便学习分享一下。R自带数据集比较多，今天就选择一个我想对了解的mtcars数据集带大家学习一下R语言中的分组计算（操作）。...接触了Hadley Wickham神包tidyverse以后感觉数据操作那么简单，这里介绍一种可以实现分组计算/操作的方法，就是plyr包的split-apply-combine思想 2.1 ddply...语法 ddply(.data, .variables, ... ) .data为数据集 .variables分组变量一定要在“点+括号中”，例如"....(group, sex)" ...为计算函数，可以是一个也可以是多个， 2.2 ddply分组计算示例 > library(plyr); library(dplyr) > dfx <- data.frame...中分组变量一定要在“点+括号中”，例如".

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分组统计你只想到group_by操作吗？

最近在研究excel透视图，想到好像自己在R-分组操作并不是很流畅，顺便学习分享一下。R自带数据集比较多，今天就选择一个我想对了解的mtcars数据集带大家学习一下R语言中的分组计算（操作）。...接触了Hadley Wickham神包tidyverse以后感觉数据操作那么简单，这里介绍一种可以实现分组计算/操作的方法，就是plyr包的split-apply-combine思想 2.1 ddply...语法 ddply(.data, .variables, ... ) .data为数据集 .variables分组变量一定要在“点+括号中”，例如"....(group, sex)" ...为计算函数，可以是一个也可以是多个， 2.2 ddply分组计算示例 > library(plyr); library(dplyr) > dfx <- data.frame...中分组变量一定要在“点+括号中”，例如".

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左手用R右手Python系列6——变量计算与数据聚合

R语言： transform mutate aggregate grouy_by+summarize ddply Python: groupby pivot.table 在R语言中，新建变量最为快捷的方式是通过...transform与mutate两个函数都是新建变量，但是前者仅能基于所提供的数据框内变量进行新建，而后者则可以直接在新建变量基础上进行操作。...library(dplyr) 使用group_by函数结合summarize可以方便的完成分组聚合功能。...library(plyr) ddply(iris,.(Species),summarize,means=mean(Sepal.Length)) ddply(iris,....使用pandas中的groupby方法可以很快捷的进行分组数据聚合。

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【R语言】三种批量做T检验的方法

其实这里我们是做了16次t检验才得到每个基因的p值的。首先我们把16个m6a基因得表达谱读进来，最后一列为样本类型，也是我们待会做t检验时候的分组依据。...具体如何得到这个表达矩阵可以参考 ☞m6a甲基化相关基因boxplot并显示p值 #读取16个m6a甲基化相关基因在CHOL中的表达量 m6a_expr_type=read.table(file=...("reshape2") #加载plyr和reshape2包 library(plyr) library(reshape2) #melt对m6a_expr_type数据格式进行转换 ddply(melt...方法得到的结果是一样的再给大家分享两个小技巧，在计算原始p值的同时，我们还能计算校正之后的p值 #使用fdr方法对原始p值进行校正 result=melt(m6a_expr_type) %>%...***画在图上了，具体画图方法可以参考 ☞m6a甲基化相关基因boxplot并显示p值参考资料： ☞统计学中数据分析方法汇总！

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R可视乎|马赛克图

可以通过这两个变量来检测类别与其子类别之间的关系。主要优点马赛克图能按行或按列展示多个类别的比较关系。主要缺点难以阅读，特别是当含有大量分段的时候。...对于非均匀的马赛克图，关注的数据维度非常多，一般的用户很难直观理解，在多数情况下可以被拆解成多个不同的图表，以下我们会对其进行绘制。...计算出每行的最大，最小值，并计算每行各数的百分比。ddply()对data.frame分组计算，并利用join()函数进行两个表格连接。...()函数使用自定义统计函数，对data.frame分组计算 dfm1 <- ddply(dfm, ....(Delta,Gamma等)的占比情况，从横向来看，不同变量（A,B等）的宽度代表该变量占所有数据的占比情况，越宽说明该变量数据总和越大。

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R语言之可视化（22）绘制堆积条形图

问题描述：搜集患者信息时总是需要统计患者的情况分布，或者需要探讨变量之间的关系。 ? 比如我们遇到上图的数据时，想要知道性别是否于stage有关系？...经过这张图，我们可以初步得到的信息是：（1）T1到T4各个分期的患者总数（2）T1期男性患者的数目，T1女性患者的数目（3）其他分期男性或者女性的患者数目。...第二步：统计不同stage下，男性和女性的患者百分比 library(plyr) data <- ddply(data,'stage',transform,percent = 1/sum(number)...总结这里我用了两个个小技巧，（1）首先明确ggplot2绘制堆叠条形图时，对number这一列相加，所以我将number设置为1，刚好代表每一行就是一个样本/患者（2）在计算百分比时，用了ddply函数...，它首先将stage分组，然后计算stage=T1时，T1样本中男性的数目除以T1样本总数目，这样就得到了每一个样本在所属的stage的百分比，随后绘图相加即可得到百分比图。

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手把手教你画双基因生存曲线

科研芝士的小伙伴们你们好啊~前几天看文献的时候看到一个双基因联合分组的生存曲线的图，觉得挺有意思的。今天我就以TCGA库中的乳腺癌（BRCA）为例，教大家怎么画双基因的生存曲线~ ?...一、安装和加载所需的包 RTCGA是一系列根据数据类型分离的包，相当于要先下载这些离线数据R包之后再直接从离线数据包里面获取TCGA的所有数据。最新的版本可以加载下图所有的包，可谓是非常强大了。 ?...infoTCGA看到各种肿瘤的各种数据那是相当的丰富。 ? 二、从TCGA数据库上获取乳腺癌的临床数据 ? 至此便获得了乳腺癌的临床数据。从图可以看出该数据集一共有1098个样本。 ?...dplyr包是 Hadley Wickham （ggplot2包的作者，被称作“一个改变R的人”）的杰作,他将原本plyr 包中的ddply()等函数进一步分离强化,专注接受dataframe对象, 大幅提高了速度...可能小伙伴们也有别的方法，欢迎在评论区里留言提出你的看法和问题哦~ 后台回复关键词：双基因，领取代码。如果你有生信需求，也可以联系小编分析哦！

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R语言包_plyr

基础 R函数和plyr plyr包中一些有用的函数 R程序参考资料 plyr: The split-apply-combine strategy for R 不再是循环，而是向量操作，这个包的目的是简化...其相当于split和apply函数的整合。基础 ? R函数和plyr ?...each("min", "max")(1:10) each(c("min", "max"))(1:10) each(c(min, max))(1:10) # colwise 将原来只能计算vector的函数转化为可以计算...=row.names(mtcars), mtcars) arrange(myCars, cyl, disp) arrange(myCars, cyl, desc(disp)) # rename 可以根据变量名而不是变量位置重新命名...(count(baseball, "id"), freq > 25) bb_longterm <- match_df(baseball, longterm, on="id") # join 类似sql中的

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【DB笔试面试495】Oracle中哪个包可以获取环境变量的值？

题目部分在Oracle中，Oracle中哪个包可以获取环境变量的值？...答案部分可以通过DBMS_SYSTEM.GET_ENV来获取环境变量的当前生效值，示例如下所示： SYS@LHRDB1> VAR ENVOUT VARCHAR2(200); SYS@LHRDB1> SET

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我可以在不source脚本的情况下将变量从Bash脚本导出到环境中吗

echo $VAR 有没有一种方法可以通过只执行 export.bash 而不 source 它获取 $VAR？答：不可以。但是有几种可能的解决办法。...在调用 shell 的上下文中执行脚本: $ cat set-vars1.sh export FOO=BAR $ . set-vars1.sh $ echo $FOO BAR 另一种方法是在脚本中打印设置环境变量的命令.../set-vars2.sh)" $ echo "$FOO" BAR 在终端上执行 help export 可以查看 Bash 内置命令 export 的帮助文档： # help export export...-f 指 shell 函数 -n 从每个(变量)名称中删除 export 属性 -p 显示所有导出变量和函数的列表 ---- 参考： stackoverflow question 16618071...help eval 相关阅读：用和不用export定义变量的区别在shell编程中$(cmd) 和 `cmd` 之间有什么区别 ----

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「R」如何汇总数据

问题你想要按照组别总结你的数据（均值、标准差等等）。方案有三种方法描述基于一些特定变量的分组数据，然后对每一组使用总结函数（像均值、标准差等等）。...它可以干以下的事情：寻找均值、标准差和计数寻找均值的标准误（强调，如果你处理的是被试内变量这可能不是你想要的）寻找95%的置信区间（也可以指定其他值）重命令结果数据集的变量名，这样更方便后续处理...有时候总结的数据框中存在因子的空组合 - 这意思是，因子组合可能存在，但原始数据框里又没有实际出现。...处理缺失值如果数据中存在NA值，你需要添加na.rm=TRUE选项。通常你可以在summaryBy()函数中设置，但length()函数识别不了这个选项。...它可以干以下的事情：寻找均值、标准差和计数寻找均值的标准误（强调，如果你处理的是被试内变量这可能不是你想要的）寻找95%的置信区间（也可以指定其他值）重命令结果数据集的变量名，这样更方便后续处理

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在cuda的核函数中可以按地址调用普通变量么？

请问在cuda的核函数中可以按地址调用普通变量么？...但需要注意这个问题：（1）最终指向global memory地址空间的指针，可以在本次kernel启动，或者下次kernel启动的任何线程中都是有效的。...如果错误的在本次kernel启动的本block中的其他线程使用，则自动得到被替换成对应的线程的对应local memory位置的值。...另外两点需要注意的：（4）在部分平台支持P2P Access的情况下，则指向一张卡的global memory的指针，可以在另外一张卡上的kernel中被使用，类似情况（1）。...（例如可以参考Pascal具有的显存作为缓存的模式（可以看成GPU的L3 cache，或者看成GPU支持虚拟内存---例如一张3GB的卡可以使用“虚拟的“8GB的显存，并且在并非所有位置访问概率相同的情况下

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R语言学习笔记之——数据处理神器data.table

注意以上新建列时，如果只有一列，列名比较自由，写成字符串或者变量都可以，但是新建多列，必须严格按照左侧列名为字符串向量，右侧为列表的模式，当然你也可以使用第二种写法。...mydata[carrier %in% c("AA","AS"),.N] [1] 26876 .N是一个计数函数，相当于plyr中的count，或者基础函数中的length。...当整列和聚合的单值同时输出时，可以支持自动补齐操作。当聚合函数与data.table中的分组参数一起使用时，data.table的真正威力才逐渐显露。 mydata[,....如果想要运行的同时进行输出则可以在结尾加上[] setorder(mydata,carrier,-arr_delay)[] ? 这个功能有点儿类似于基础函数中，在语句外部加上圆括号。...左手用R右手Python系列——数据合并与追加长宽转换：长宽转换仍然支持plyr中的melt/dcast函数以及tidyr中的gather/spread函数。

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R语言ggplot2两个离散变量画热图的简单小例子

分别设置 check.names参数为T和F大家可以看下效果 ?...宽格式数据转换长格式 library(reshape2) df<-melt(abund_table) head(df) colnames(df)<-c("Samples","Species","Value") 分组求根...library(plyr) library(scales) # We are going to apply transformation to our data to make it # easier...on eyes #df<-ddply(df,....(Samples),transform,rescale=scale(Value)) df<-ddply(df,.

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10个令人相见恨晚的R语言包

plyr 给予你一些函数 (ddply, daply, dlply, adply, ldply)按照常见的蓝图：将数据结构分组拆分，对每个组应用一个函数，将结果返回到数据结构中。...("plyr")library(plyr)# 按照 Species 拆分数据库，汇总一下，然后转换结果# 到数据框ddply(iris, ....你现在准备在R中进行一些分析，因此你可以在SQL编辑器中运行查询，将结果复制到csv（或者……xlsx）并读入R，你并不需要这样做！ R对于几乎每一个可以想到的数据库都有好的驱动。...不仅可以避免生成数以百计的CSV文件，在R中运行查询还可以节省I/O和转换数据类型的时间。日期，时间等会自动设置为R中的等价表示。...它还使你的R脚本可重复，因此你或你团队中的其他人可以轻松获得相同的结果。 6. lubridate 在R中处理日期我从来没有幸运过。我从来没有完全掌握用POSIXs和R内建日期类型合作的方法。

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让Single cell UMAP注释支棱起来

分享是一种态度最近在画UMAP的时候发现有的时候细胞亚群的注释与点重合颜色上不是很搭配，同事提出让注释“支棱”起来，首先想到的是ggforce中的geom_mark_ellipse，实践中遇到一些问题...UMAP_2, label=cluster, col=cluster), inherit.aes = F) + NoLegend() 版本一非常难看不是吗？...因为有一些cluster（Naive CD4 T）存在异常值，ggforce中的函数会包含所有的点。所以应该将异常值去掉，这个方法有很多，我使用的是之前用到的置信椭圆的方法。...::ddply(points, "cluster", aux, one="UMAP_1", two="UMAP_2") DimPlot(pbmc3k.final) + geom_mark_ellipse...## 调整prob参数 ell <- plyr::ddply(points, "cluster", aux, one="UMAP_1", two="UMAP_2", prob=0.1) DimPlot

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JS基础测试: 在jQuery中，哪个方法可以解决$变量名冲突的问题？

考核内容: jQuery 核心 - noConflict() 方法题发散度: ★★★ 试题难度: ★★★ 解题思路: 使用 noConflict() 方法为 jQuery 变量规定新的名称： var...jq=$.noConflict(); 定义和用法 1.noConflict() 方法让渡变量 $ 的 jQuery 控制权。...2.该方法释放 jQuery 对 $ 变量的控制。 3.该方法也可用于为 jQuery 变量规定新的自定义名称。提示：在其他 JavaScript 库为其函数使用 $ 时，该方法很有用。...说明许多 JavaScript 库使用 $ 作为函数或变量名，jQuery 也一样。在 jQuery 中，$ 仅仅是 jQuery 的别名，因此即使不使用 $ 也能保证所有功能性。...假如我们需要使用 jQuery 之外的另一 JavaScript 库，我们可以通过调用 $.noConflict() 向该库返回控制权：例如：创建一个新的别名用以在接下来的库中使用 jQuery 对象

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业务用例的研究组织可以在同一个建设系统中可以变化吗

2013-02-08 9:44:15 上孙安俊(359***041) 请问大家一个问题，业务用例的研究组织可以在同一个建设系统中可以变化吗？...2013-02-08 9:44:51 潘加宇(3504847) 没有必要变化了 2013-02-08 9:46:55 潘加宇(3504847) 这个划定的范围，能把你要改进的场景被包在里头就可以。...2013-02-08 9:51:42 潘加宇(3504847) 部门就可以了，把这些场景组织到部门的用例下面 2013-02-08 9:54:44 潘加宇(3504847) 既然改进的范围波及整个部门，...2013-02-08 10:14:41 上李帅(958**7) 意味着缺少了资源 2013-02-08 10:25:47 上孙安俊(359***041) 请假与加班是相对的，可以进行调休 2013-02...2013-02-08 11:11:15 潘加宇(3504847) 请假本身不是部门的用例，但会影响部门的某些用例的实现，把请假作为一个场景放在这些用例下面。

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