学习了ggplot2的基本绘图元素ggplot2|详解八大基本绘图要素，可以初步绘制出需要展示的图形，legend可以对图例进行细节的修改ggplot2 |legend参数设置，图形精雕细琢，那theme...face，设置字体（“plain”，“italic”，“bold”，“bold.italic”） 2 修改图例 设置图例标题，文本和键的样式 图例的关键是像元素一样的图形，因此使用element_rect...删除图例和更改图例位置 图例是主题的一个方面，因此可以使用theme()功能进行修改。...其中legend.justification参数可以将图例设置在图中，legend.position参数用来将图例设置在图表区域，其中x和y轴的位置(0,0)是在图表的左下和(1,1)是右上角。...学习ggplot2的八大基本元素，了解legend的基本设置后，现在也清楚了主题的相关设置，就可以画出一张出色的图了?
❝本节来继续进行论文图表复现，主要还是基于「ggplot2」来进行数据可视化 ❞ ❝近期系统整理了一下公众号所写过的一些经典文档，如果需要获取全部代码的欢迎加入小编的VIP交流群，「付费99元，周期一年...」群内同步上传代码， 公众号右下角添加微信咨询即可 ❞ 以往案例 本节来复现文章中的Fig3-h 安装并加载R包 package.list=c("tidyverse","ggrepel"，"factoextra...,scale. = TRUE) 每个主成分解释的总方差 var_explained <- pca$sdev^2/sum(pca$sdev^2) 数据可视化 fviz_pca_biplot(pca,...0.5,face = "bold"), legend.title = element_blank(), legend.key=element_blank(), # 图例键为空...=element_rect(colour="black"), # 图例绘制边框 legend.position=c(1,0),legend.justification=c(1,0))
），出现图形元素。...，默认时使用16号形状。...在这里我们首先在aes()外使用shape指定使用21号形状（该点内部为空，可以使用颜色进行填充）；通过alpha指定点的透明度； 再在aes()内部将drat映射给size；通过factor()将连续变量...可以同时修改x和y轴标签属性，legend.position可以修改图例位置。...需要注意的是，这部分代码需要放在theme_bw()后，否则则无法生效。
image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现，这个是箱线图和热图的拼接，右侧的热图可以借助geom_point()函数实现，将点的形状改为正方块，数值按照正负来映射颜色，按照一定的数值来映射大小...基本的思路有了。今天的推文记录一个小知识点是 如何将图例远离主图并且给放到右上角去 首先是构造一份数据 df<-data.frame(x=LETTERS[1:4],y=1:4) df ?...image.png 将图例放到右上角 通过 legend.justification 参数来实现 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes(fill=x)...image.png 还有另外两个知识点是调节图例的标题和图例的距离以及图例的文本和图例的距离 分别需要用到legend.spacing.y和legend.spacing.x参数 ggplot(data=...image.png 欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记
Date : [[2022-01-06_Thu]] Tags : #R/index/02 #R/R可视化 #R/R数据科学 #其他/答粉丝问题 前言 感觉ggplot 绘图中的图例/legend，完全可以作为一个单独的内容讲很久...2-移除图例标题 theme(legend.title = element_blank())，我们也可以在labs 中，按照aes 定义的对应内容，直接创建空白的名称： ggplot(chic, aes...，可以指定图例背景为透明，好看一些： 4.3-调整图例方向 默认下，图例显示是竖直的（自上而下），我们可以将其改变为水平horizontal ： ggplot(chic, aes(x = date,...override.aes = list(size = 6))) 其中aes 中设置了分类变量，R 会默认设置为guide_legend() ： 而连续变量则使用guide_colorbar() : 我们也可以将连续变量修改为分类的样子...比如我同时设置了图例的color 与fill 元素，制造图标具有背景的效果： 然而图例显示也加了一层外框： 如何去掉这个外框呢？
当使用ggplot2作图的时候如果多个图拼接到一起，图例互相之间有一样的时候，比如如下的情况（我们用R语言内置的鸢尾花的数据集做三个散点图） ?...) ggarrange(p1,p2,p3,ncol = 3) 因为三个图的图例是一样的，我们完全可以只显示一个图例就够了。...image.png 图例放到顶部，默认的布局是3行3列，如果要改成1行6列呢？ggplot2里应该有对应的参数可以修改吧？...如果将ggplot2的图例设置为顶部，默认结果如下 p4<-ggplot(df,aes(x=V1,y=V2))+ geom_point(aes(color=V6))+ theme_bw()+...image.png 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、
head(ht) unique(ht$V1) head()函数是查看数据集的前六行 image.png unique()函数是查看一组数据中有多少中元素，可以用来去重复 比如一个向量c(1,1,2,2,2,3,3,3,3...，但是这个图和论文中实际用到的图还是有很多不一样的地方的，可能是出图后用其他软件编辑的吧 这里有一个疑问是为啥用fill参数映射颜色图例却没有显示颜色呢？...大家有知道的吗？欢迎留言指出！...示例数据和代码可以直接到论文中提供的下载链接去下载，或者直接在公众号后台留言20210927获取（注意是精确匹配开头结尾都不能有空格） 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本...欢迎大家关注我的同名视频号 小明的数据分析笔记本
答：是把图例隐藏了，默认参数是show.legend = TRUE. (4) geom_smooth() 函数中的 se 参数的作用是什么？...答：可以绘制出区间，当se = TRUE（默认）则会出现区间。 (5) 以下代码生成的两张图有什么区别吗？为什么？...第三个图： 散点图颜色的颜色根据drv变量进行变化，并且拟合曲线也是和散点图相同颜色（所以可以在最原始图层中加入color=drv），没有拟合曲线的区间，但是有图例（默认就是有的）。...所以这里不可以直接放在原始图层里，得放在geom_point()中。...第六幅图： 没有拟合曲线，直接将散点图的颜色区分开了，有点像第三幅图的简化版。
(aes(gear,fill=vs)) + facet_wrap(~cyl) + ggtitle('Plot 4') 1.左右拼接 p1是存储了ggplot的画图元素，只需要用+将两个ggplot...画图元素连接起来即可，也可以连接三个，四个 p1+p2 p1+p2+p3 [图片上传失败......(image-91e7e7-1653958828272)] 2.上下拼接 上下拼接，用到/将两个ggplot画图元素连接起来即可，也可以连接三个，四个， 如下 p1/p2 p1/p2/p3 [图片上传失败...(image-db3802-1653958828272)] 5.组合图片的共享图例 有时候会需要将两个一样的图例进行合并。 当然还有更多排列方式，见 ?...plot_layout ## 合并图例 p1+p4+ plot_layout(guides = "collect") ## 放在底部 p1+p4+ plot_layout(guides = "collect
向下平移1 使用angle参数对标签角度进行设置 p+geom_point(color='dodgerblue')+geom_text(nudge_x = 0.1,angle=45) geom_label可以使用...图例绘制 2.1 guide_legend函数（主要参数：color, shape, size） 图例调整函数也属于标度函数的一类，但不可以直接使用加号来连接，必须放在函数中，作为一个参数。...color='red',linetype = 2)) pt+scale_color_discrete(name='cyl')+ theme(legend.position = 'bottom', #将图例放置在图片底部...在theme函数中，与图例有关的主要参数有： 参数 用法 功能 legend.background 接受函数element_rect() 定义图例背景 legend.margin 接受数值 定义图例的边缘范围...接受字符串： “horizontal”或“vertical” 定义多个图例的排列方式 3.
标度控制着数据空间的值到图形属性空间的值的映射。一个连续型的y标度会将较大的数值映射至空间中纵向更高的位置。 引导元素向看图者展示了如何将视觉属性映射回数据空间。...最常见的元素是坐标轴上的刻度线和标签（还有图例）。 接下来以三个数据集解释ggplot2的使用。第一个是lattice包中的singer数据集，它包括纽约合唱团歌手的高度和语音变量。...选项可以通过不同的方式使用，这取决于它们发生在aes()函数的内部还是外部。通常来说，变量应该设在aes()函数内，分配常数应该在aes()函数外。...可能的值包括left, top, right(默认), bottom。我们也可以在图中给定的位置指定一个二元素向量。...将多个ggplot2包的图形放到单个图形中最简单的方式是使用gridExtra包中的grid.arrange()函数。我们需要事先安装这个包。 让我们创建3个ggplot2图并把它放在单个图形中。
自己都感觉过分了哈哈~ 今天赶紧找空写一篇~ 学过ggplot2的小伙伴儿们大概都了解过，ggplot2的语法系统将数据层和美化层分开，这种理念给了学习更多的选择，你可以只学习数据层，这样大可保证做出正确的图来...（虽然质量不敢恭维），也可以同时学习数据层和美化层(当然你要耗费双倍的精力，因为ggplot2理念几个美化的函数模块那是出了名的繁杂)。...今天只讲图例系统，这一块是大部分学习者非常容易忽视的东西（有木有学会ggplot()+geom_xxx就觉得超神了然后自我感慨，哇塞ggplot2原来这么简单，远远没有传说中的那么难耶）。...这么想就不对了，即便你深入掌握了ggplot() + geom_xxx()及其内部参数继承逻辑关系，那也只能保证你正确的做出图来，正确的做出来图并不带表可以把图做好，就像工作不出错并不代表工作出色一样，...，以上这些系统的所有内置参数全部罗列出来，没上千也有好几百了，所以学好ggplot2真的任重而道远呀哈哈 本篇只分享图例系统： guides() ggplot2的图例系统函数比较分散，在所有标度调整函数
简介 等高线图（contour map） 是可视化二维空间标量场的基本方法[1]，可以将三维数据使用二维的方法可视化，同时用颜色视觉特征表示第三维数据，如地图上的等高线、天气预报中的等压线和等温线等。...数值为c的等值线可以将二维空间标量场分为两部分：如果 函数大于c，则该点在等值线内；反之，则该点在等值线外。...这里使用geom_tile()进行演示，将三维数据(x,y,z)中(x,y)表示位置信息，z映射到颜色。这里的scale_fill_gradientn()将颜色填充呈n个梯度。...),(图例背景legend.background),图例位置(legend.position) Contour <- ggplot(map,aes(x=Var1,y=Var2,z=value))+ geom_tile...对应代码与相关数据，请在我的github中获取（文末原文）。喜欢请一键三连，创作不易，感恩不尽。
前面我们学习了 patchwork 包排版 ggplot2 图形的简单入门，今天来学习下 patchwork 包的复杂排版。 1....9宫格布局，图1为在第1和4格，图2在第2和3格，图3在第6和9格，图4在7和8格，第5格是空的，用#号表示。...除了设置排版布局外，还可以使用 guides 参数来设置图形的图例。 在4个示例数据集中，图3是有图例的，那就用图3来演示图例的设置。...p3 + p3 如上图所示，组合图形有两个图例，我们可以调整参数将其合并为1个图例。 设置参数 guides='collect' 即可。...p3 + p3 + plot_layout(guides='collect') 也可以设置参数调整图例的位置，比如说置于底部。
前面我们学习了ggplot2中组合图形的绘制，在科研论文中，组合图形每张子图通常需要加上ABCD等标签，如下图所示。 ? 这种ABCD标签既可以在PS或者AI中添加，也可以在R中直接添加。...组合图形的标签添加可以使用ggpubr包的ggarrange()函数或annotate_figure()函数。 1....大多数论文都是将标签放在左上角。...如有需要，可以设置label.x、label.y的数值来调整标签位置。...widths # 相对列宽度的数值向量；如widths = c(2, 1)表示第1列宽度是第2列宽度的两倍 heights # 同上 legend # 指定图例位置的字符；允许值为"top", "bottom
静态热图 01 ggplot2包的ggplot函数 library(ggplot2) ####建立模拟数据集 set.seed(123) Year <- rep(2006:2015, each = 4)...breaks=full$breaks ) #将x分割成不同颜色的分界点 ?...)对齐的2个元素向量 srtCol=45, adjCol=c(1,1) ) ?...05 ComplexHeatmap包 ComplexHeatmap包擅长绘制复杂的热图，有很多功能，大家在实操的时候可以多多尝试。...小编总结 其实上述工具包的功能都很强大，有些小编只是针对热图方面进行简单介绍，大家可以去安装学习，借鉴到符合自己数据可视化的方法~ 科研菌学术讨论群，在群内可以用自己的昵称，广告一律踢；其他公众号的宣传也不发
ggplot2的主题系统可以让我们更好的控制图形 非数据元素 的细节，通过更加精细的修改来提升图像的美感，ggplot2 的主题系统自带多个 element_ 功能 element_text( ) element_line...( ) element_rect( ) element_blank( ) 本节来介绍主题元素element_text() ,使用它控制绘图中文本元素的许多部分，如字体大小、颜色和字体类型。...ggplot2的element_text()剖析 element_text() 控制的元素列表 axis.title.x: 自定义 x 轴标签/标题 axis.title.y : 自定义 y 轴标签/标题...axis.text.x : 自定义 x 轴刻度标签 axis.text.y : 自定义 y 轴刻度标签 legend.title: 自定义图例标题文本 legend.text：自定义图例文本 plot.title...library(palmerpenguins) 依旧还是使用企鹅的数据集，接下来使用element_text() 函数来调整图像的文本元素 p% drop_na() %>
的元素对象 这些元素对象并不都是必须的，但都对应着不同的元素：但一般来说，data 和Geometries 是必须的，我们必须告诉ggplot 用什么数据，画什么图。...主题 文本属性 通过theme 函数，我们可以修改一些主题中的元素。...= NULL, y = "") 但并不是所有文本都可以在labs 中被定义，比如图例的标题： ggplot(chic, aes(x = date, y = temp, color = season...和图例较劲 参见： 背景与画布 我们可以用ggplot 提供的自带主题来修改背景，比如我个人最喜欢的theme_classic 就直接呈现一个白板，特别简洁。 当然我们也可以自定义背景。...，可以使用图例对应的aes 属性修改，比如创建的是在aes 中定义了color，则可以在labs 中指定： ggplot(chic, aes(x = date, y = temp, color = season
最早是在 小丫画图 公众号发现的这个推文 这套代码，完全复现这篇Nature Communications，当时点了收藏，然后就让他去吃灰色了。最近又给想起来了。...论文里一共有11幅图，4幅图放在正文里，7幅图放在了补充材料里。...今天的推文算是立个小旗。后面如果没有做到欢迎大家催更哈。 下面是来自论文中的图 ? image.png 图一是用基础绘图函数画的，重复完原始代码争取使用ggplot2来画一下。 ?...image.png 图三和图四和图二差不多，但是更改了图例的位置 ? image.png 补充材料图一 散点图，分组添加拟合曲线，然后组图，共享图例。 ? 补充材料图二 ? 补充材料图三 ?...公众号二维码.jpg
，有两点需要说明，一方面，在ggplot2绘图过程中均采用图层思想，将多个图形进行叠加和设置；另一方面，图层思想是通过代码中的加号（+）表现出来的。...；如果设置为FALSE，则不显示任何图例；如果设置为TRUE，则显示图例； inherit.aes：bool类型的参数，绘图时是否延用ggplot函数中的数据和轴属性，默认为TRUE；根据作者的经验，如果...如上图所示，可以查看组间的绝对值差异以及组内的分布特征（如2017上海天气质量为良好等级的天数最多，其次是优等级，重度污染等级的天数最少；但不管哪种空气质量等级下，1~2级的风力天数是最多的）。...如上图所示，该图形的最大的好处是既可以实现数据的组内比较（如相同空气质量等级下不同风力的比较），也可以实现数据的组间比较（如相同风力下不同空气质量的比较）。...本文中的代码和数据可以从百度云盘中下载，只需关注“数据分析1480”公众号，并回复“条形图”即可。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
即时通信 IM
ICP备案
对象存储
实时音视频
