首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

ggplot2--R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

数据、几何映射、统计变换、几何对象、位置调整形成一个图层,一个图可以有多个图层。 data 用于构造一个具体图形,由变量组成,这些变量作为存储在数据框中。...例如,对于位置,用线性比例变换连续值,并将分类值映射到整数;对于颜色,将连续变量映射到HCL颜色空间中平滑路径,将离散变量映射到具有相等亮度色度均匀间隔色调,例如,对于位置,连续值被映射到整数;...通常,我们可以省略data=mapping=,而不是在gglot()调用中指定默认数据映射,还可以在AES(x变量,y变量)中使用基于位置匹配。我们也可以省略这一层。...ggplot2第二个显著特性是它使用数据,而不是单独向量。因此,在使用该包创建绘图之前,如果数据是矢量,则需要将数据转换为数据。...函数按行拆分具有方向绘图。公式也可以是.~y,用于按拆分绘图;实现facet_grid(.~y)函数可以按拆分具有方向绘图。我们举例说明了facet_grid(x~.)。

5K20

合并多个Excel文件,Python相当轻松

每个Excel文件都有不同保险单数据字段,如保单编号、年龄、性别、投保金额等。这些文件有一个共同,即保单ID。...注意:本文讨论合并具有公共ID但不同数据字段Excel文件。 Excel文件 下面是一些模拟电子表格,这些数据集非常小,仅用于演示。...这里,df_1称为左数据框架,df_2称为右数据框架,将df_2与df_1合并基本上意味着我们将两个数据框架所有数据合并在一起,使用一个公共唯一键匹配df_2到df_1中每条记录。...df_1df_2中记录数相同,因此我们可以进行一对一匹配并将两个数据框架合并在一起。...图6:合并数据框架,共21行8 第二次合并 我们获取第一次合并操作结果,然后与另一个df_3合并

3.8K20

python数据分析——数据选择运算

数据获取 ①索引取值 使用单个值或序列,可以从DataFrame中索引出一个或多个。...merge()是Python最常用函数之一,类似于Excel中vlookup函数,它作用是可以根据一个或多个键将不同数据集链接起来。...True表示按连结主键(on 对应列名)进行升序排列。 【例】创建两个不同数据,并使用merge()对其执行合并操作。 关键技术:merge()函数 首先创建两个DataFrame对象。...代码输出结果如下所示: (2)使用多个合并两个数据: 关键技术:使用’ id’键及’subject_id’键合并两个数据,并使用merge()对其执行合并操作。...代码输出结果如下所示: (3)使用“how”参数合并 关键技术:how参数指定如何确定结果表中包含哪些键。如果左表或右表中都没有出现组合键,则联接表中值将为NA

14910

gggibbous带你绘制月亮散点图

(detector, kind, `.pred_class`, native), .N] # 对数据再次聚合,按'detector'、'kind'、'.pred_class'组合,并计算每个组合频率总计数...) df = df |> split(df$class) # 根据'class'将'df'数据框分割成多个数据框 # 对每个子数据框进行操作 packing <- lapply(df, function...(x) { # 按'detector'对子数据框进行排序 x = x[order(detector)] # 从子数据框中提取'detector''N2',并保留唯一行 radius...radius$detector) # 通过'detector'匹配'x'数据框中位置索引 x$x0 = out[index]$x + x$kind |> as.numeric() #...(packing) # 数据合并 数据可视化 ggplot() + # 添加散点图图层,其中数据来自packing数据框中具有缺失'native'行 geom_point( data

16920

使用R中merge()函数合并数据

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 使用R中merge()函数合并数据 在R中可以使用merge()函数去合并数据框,其强大之处在于在两个不同数据框中标识共同或行。...如何使用merge()获取数据集中交叉部分 merge()最简单形式为获取两个不同数据框中交叉部分。举例,获取cold.stateslarge.states完全匹配数据。...如何理解不同类型合并 merge() 函数支持4种类型数据合并: Natural join: 仅返回两数据框中匹配数据框行,参数为:all=FALSE....Left outer join: 返回x数据框中所有行以及y数据框中匹配行,参数为: all.x=TRUE....Frost来自cold.states数据框,Area来自large.states. 上面代码执行了完整合并,填充未匹配值为NA。 总结 本文详细介绍R中merge()函数参数及合并数据类型。

4.7K10

R语言数据合并数据增减、不等长合并

sort 升序排列元素 rev 反转所有元素 order 获取排序后索引 table 返回频数表 cut 将数据分割为几部分 split 按照指定条件分割数据 rbind 行合并 cbind 合并...,没有沟通a、b数据by,这样出现数据很多,相当于a*b条数据; 2、merge函数是匹配到a,b数据并,都有的才匹配出来,如果a、b数据集ID不同,要用all=T(下面有all用法代码)。...2、dplyr包 dplyr包数据合并, 一般用left_join(x,y,by="name") 以x为主,y中匹配都放进来, 但,y中没有的则不放过来。...#不同向量合并在一起,但是变成一个向量 mode(b) #变量类型 mode(c) 4、cbindrbind函数 cbind()rbind(),cbind()按照纵向方向,或者说按方式将矩阵连接到一起...四、不等长合并 1、plyr包 rbind.fill函数可以很好将数据进行合并,并且补齐没有匹配缺失值为NA

13.2K12

R数据科学|第九章内容介绍

使用dplyr处理关系数据 在实际应用中,我们常会涉及到多个数据表,必须综合使用它们才能找到关键信息。存在于多个表中这种数据统称为关系数据。...本章中很多概念都SQL中相似,只是在dplyr中表达形式略微不同。一般来说,dplyr 要比 SQL 更容易使用。...处理关系数据有三类操作: 合并连接:向数据框中加入新变量,新变量值是另一个数据框中匹配观测。 筛选连接:根据是否匹配另一个数据框中观测,筛选数据框中观测。...下面借助图形来帮助理解连接原理: ? 有颜色列表示作为“键”变量:它们用于在表间匹配行。灰色列表示“值”,是与键对应值。...anti_join(x,y):丢弃x表中与y表中观测相匹配所有观测。 ? 集合操作 集合操作都是作用于整行,比较是每个变量值。集合操作需要xy具有相同变量,并将观测按照集合来处理。

1.5K30

R语言使用特征工程泰坦尼克号数据分析应用案例

通过人类直觉创造力,您对数据了解程度可以带来不同。 那么什么是特征工程?...在R中我们可以使用rbind,它代表行绑定,只要两个数据具有彼此相同。...所以在这里我们将两个标题“Mme”“Mlle”组合成一个新临时向量,使用c()运算符并查看整个Title任何现有标题是否与它们中任何一个匹配。然后我们用“Mlle”替换任何一场比赛。...因为我们在单个数据上构建了因子,然后在构建它们之后将它们拆分,R将为所有新数据提供所有因子级别,即使该因子不存在于一个数据中也是如此。它仍然具有因子水平,但在集合中没有实际观察。整洁把戏对吗?...我们已根据原始列车测试集大小隔离了组合数据某些行范围。之后逗号后面没有数字表示我们想要使用此子集获取所有并将其存储到指定数据

6.6K30

R语言第二章数据处理(9)数据合并

dplyr包中join函数进行数据合并,它们数据合并原理同样是数据合并原理是这样:首先在A数据框某一指定每一行内容在B数据框表指定进逐行匹配,直到A中所有行匹配完为止。...这里数据仍使用merge函数中两个数据(略有修改):作者信息数据和书籍信息数据。依照下面介绍合并条件,这两个数据既有相同内容,又有彼此中不存在内容。...要求必须有相同列名 type为合并方式 inner,行:显示x,y中共有的行; :显示x,y中所有 left,行:显示x中所有的行; :显示x,y中所有,未匹配值,不论字符数字,全显示为...NA right,行:显示y中所有的行; :显示x,y中所有,未匹配值,不论字符数字,全显示为NA full,先显示x中所有的行在y中匹配结果,接着显示y中未匹配内容 match匹配规则...join函数: join(x, y, by = , copy = FALSE, ) x,y 为合并数据框,不要求x,y中排序列唯一 by 为排序依据,默认值Null时按名字相同匹配,此时,要求必须有相同列名

2.4K20

Tidyverse| XX_join :多个数据表(文件)之间各种连接

前面分享了单个文件中select,filter行,拆分等,实际中经常是多个数据表,综合使用才能回答你所感兴趣问题。 本次简单介绍多个表(文件)连接方法。...y <- tribble( ~key, ~val_y, 1, "y1", 2, "y2", 4, "y3" ) 二 join 数据数据框中加入新变量,新变量值是另一个数据框中匹配观测...> 4 4 y3 2 重复键 以上均假设键具有唯一性,但情况并非总是如此。...> 2) 定义匹配键 by = c("a" = "b") 匹配 x 表中 a 变量 y 表中 b 变量,输出结果中使用是 x 表中变量。...tibble: 1 x 4 key key1 val_x val_y 1 1 2018 x1 y1 三 筛选连接 筛选连接匹配观测方式与合并连接相同

1.5K20

快速掌握R语言中类SQL数据库操作技巧

: xts() 1.5 因子Factor:factor(补充) 2.查看数据概况 summary()str() 3.修改/替换/重定义数据 4.数据合并 3.1 向量合并 3.2 cbind合并(等长...例如:合并来源不同,结构相似的两个表格 3.1 向量合并 #一维向量合并直接将要合并变量以","分割放到c()中即可。...参考→《R语言 数据(集)合并与连接/匹配 | 专题2》 4.过滤/筛选 过滤,是对数据集按照某种规则进行筛选,去掉不符合条件数据,保留符合条件数据。...B NA 4 2 B NA 4.2 数据增减 常见如以下不同方法 #方法一:减行数或数 x=x[,-1] #代表删除x数据集中第一数据 #方法二:dplyr::mutate...=5) 8 数据分裂 分裂计算,是把一个向量按照一规则,拆分成多个向量操作。

5.7K20

RNA-seq 详细教程:注释(15)

学习内容了解可用基因组注释数据存储信息不同类型比较对比可用于基因组注释数据工具应用各种 R 包检索基因组注释基因组注释对二代测序结果分析需要将基因、转录本、蛋白质等与功能或调控信息相关联...注释工具在 R 中,有许多流行包用于基因/转录本级别的注释。这些软件包提供工具可以获取您提供基因列表,并使用上面列出一个或多个数据库检索每个基因信息。...在线工具 R 包版本 所有可用 Ensembl 数据库信息,Ensembl 上所有生物,信息丰富查询工具接口工具:用于访问/查询来自多个不同注释源注释...数据库之间差异(我们可以预期观察到)是由于每个数据库都实现了自己不同计算方法来生成基因构建。...使用 AnnotationHub 创建我们 tx2gene 文件要创建我们 tx2gene 文件,我们需要结合使用上述方法并将两个数据合并在一起。

1.2K20

手把手教你做一个“渣”数据师,用Python代替老情人Excel

请按照以下链接下载数据并将其放在与存储Python文件同一文件夹中。...5、略过行 默认read_excel参数假定第一行是列表名称,会自动合并为DataFrame中标签。...8、筛选不在列表或Excel中值 ? 9、用多个条件筛选多数据 输入应为一个表,此方法相当于excel中高级过滤器功能: ? 10、根据数字条件过滤 ?...五、数据计算 1、计算某一特定值 输出结果是一个系列。称为单列数据透视表: ? 2、计数 统计每或每行NA单元格数量: ? 3、求和 按行或求和数据: ? 为每行添加总: ?...有四种合并选项: left——使用左侧DataFrame中共享匹配右侧DataFrame,N/A为NaN; right——使用右侧DataFrame中共享匹配左侧DataFrame,N/A为

8.3K30

RNA-seq 详细教程:注释(15)

学习内容 了解可用基因组注释数据存储信息不同类型 比较对比可用于基因组注释数据工具 应用各种 R 包检索基因组注释 基因组注释 对二代测序结果分析需要将基因、转录本、蛋白质等与功能或调控信息相关联...注释工具 在 R 中,有许多流行包用于基因/转录本级别的注释。这些软件包提供工具可以获取您提供基因列表,并使用上面列出一个或多个数据库检索每个基因信息。...在线工具 R 包版本 所有可用 Ensembl 数据库信息,Ensembl 上所有生物,信息丰富 查询工具 接口工具:用于访问/查询来自多个不同注释源注释 AnnotationDbi:查询...数据库之间差异(我们可以预期观察到)是由于每个数据库都实现了自己不同计算方法来生成基因构建。...使用 AnnotationHub 创建我们 tx2gene 文件 要创建我们 tx2gene 文件,我们需要结合使用上述方法并将两个数据合并在一起。

1K10

不用SQL,也可以实现数据合并和连接

数据(集)处理是数据分析过程中重要环节,今天特别整理数据(集)合并、增减与连接相关内容,并逐一作出示例。...目 录 1 数据合并 1.1 cbind合并(等长) 1.2 rbind行合并 2 数据连接/匹配 2.1 内连接 2.2 外连接 2.3 左连接 2.4 右连接 2.5 双(多)字段内连接 3 数据增减...4 4 D 5 6 1.2 rbind行合并 总结:按行合并,需要注意数据集需要有相同字段名 > #生成测试数据student1 > ID <- c(1:4) > score...55 8 D 3 2 数据连接/匹配 数据连接主要涉及到merge函数dplyr包中*_join等函数,另外sqldf函数(SQL)亦可以实现数据连接功能。...常见如以下不同方法 #方法一:减行数或数 x=x[,-1] #代表删除x数据集中第一数据 #方法二:dplyr::mutate #数值重定义赋值 #将Ozone取负数赋值给new,然后Temp

1.2K30
领券