❝本节来介绍如何使用ggplot2来给常见的气泡图添加一点新的元素,下面通过1个案例来进行展示； 加载R包 library(tidyverse) 数据清洗 df %>% read_csv('data.txt...is.na(gap_pr)) 定义文本与刻度条信息 由于需要绘制刻度条并添加文本因此在此我们需要定义两个数据集 seg_size <- 0.01 seg_cl <- tibble(x = seq(
之前有人在公众号留言问文章开头这幅图如何实现，下面的B图是折线图加柱形图，相对比较容易实现，上面的A图稍微有点复杂，我想到的办法是拼图，图A可以看成三个热图，然后加一个堆积柱形图，最后将四个图组合到一起...最初的想法是左侧的颜色条用堆积柱形图来实现，又看了一遍Y叔公众号关于aplot这个包的推文，发现他是用geom_tile()函数实现的，仔细想想还是geom_tile()函数实现起来比较方便。...首先解决昨天的遗留问题：ggplot2画图添加文字内容的时候如何添加下划线 非常感谢下面这位的留言 文本添加下划线的小例子 df<-data.frame(A=1:10, B...=1:10) library(ggplot2) ggplot(df,aes(A,B))+ geom_point(size=5)+ theme_minimal()+ ggtitle(expression...首先是准备热图的数据 如何画这个热图昨天的推文已经介绍过了，点击下方蓝色字可以直达昨天的推文 R语言ggplot2画带有空白格的热图简单小例子 接下来是准备分组颜色条的数据 下面是画这个颜色条
今天的推文没有详细介绍代码，代码的介绍会以视频形式放到B站，欢迎大家关注我的B站 小明的数据分析笔记本 https://space.bilibili.com/355787260 image.png 首先是示例数据的格式...画热图的数据 image.png 用来添加文本的数据 image.png 如果还有其他文本需要添加，可以再准备一份数据 image.png 加载需要用到的R包 library(ggplot2...) library(tidyverse) #install.packages("see") library(see) ggplot2 是用来作图的 tidyverse 是用来做数据整理的 see 这个包里有很多配色函数...读取热图的数据作图 dfa<-read.csv("20211007.csv") head(dfa) pivot_longer(dfa, !...X, names_to = "Y", values_to = "Value") -> dfa.1 head(dfa.1) 读取添加文本的数据 dfb
今天的推文介绍一下柱形图实现的代码 image.png 先介绍一个小知识点 ggplot2作图X轴默认坐标轴的刻度是朝下的，Y轴默认的刻度是朝左的，如果要改为朝上和朝右，该如何设置。...之前也有人问过这个问题 library(ggplot2) library(ggstar) ggplot()+ geom_star(aes(x=1,y=1), size=100...， 但是还遇到一个问题是 横坐标的文本和标题可以通过vjust参数上下调节，纵坐标的参数却不能够用hjust的参数左右调节，不知道是什么原因 下面开始重复开头提到的柱形图 首先是数据，用到的是dslabs...is.na(score)) -> new_df 最基本的柱形图 new_df %>% ggplot(aes(score, total)) + geom_bar(stat = "identity...", color = "black", fill = "#C4843C") image.png 指定位置添加背景 new_df %>% ggplot
条形图 GOBar(subset(circ, category == 'BP')) plot of chunk unnamed-chunk-9 分面条形图，可以更改标题、颜色等： GOBar(circ...把BP,CC,MF都画在一张图里，并添加条目信息表格： GOBubble(circ, labels = 3) plot of chunk unnamed-chunk-11 当然也可以分面画，可以更改标题...~ 和弦图 前面是大致展示下富集分析结果的总体情况，和弦图可以展示特定条目和基因之间的关系。...GOHeat(chord, nlfc = 1) # 1是用logfc，0是不用 plot of chunk unnamed-chunk-18 圆形聚类图 竟然也是用ggplot2画出来的...#条目圆环的宽度 lfc.width = 1, #logfc圆环的宽度 lfc.col = c('darkgoldenrod1', 'black', 'cyan1
最近有人在公众号后台留言问到这个问题，今天的推文介绍一下ggplot2做堆积柱形图并添加误差线的办法 完整代码 ''' 堆积柱形图添加误差线 ''' getwd() library(ggplot2)...，我将其写出到一个文件里，部分数据如下 image.png 我们只用到其中的三列 species 企鹅的种类 sex 企鹅的性别 bill_length_mm 企鹅嘴的长度 解释代码 用到的R语言包...ggplot2 画图 dplyr 整理数据 see 用来配色 读取数据,查看前六行 df<-read.csv("penguins.csv") head(df) 按照种类和性别分组计算平均值和标准差 df...summarise(mean_value=mean(bill_length_mm), sd_value=sd(bill_length_mm)) -> df1 df1 给数据集添加新的一列用来控制误差线的位置...，这里就不用文字来解释了 今天的推文完整示例数据和代码可以在第二条推文的留言区获取（第二条推文是一个广告） 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和
其实就是 4 个部分 每个颜色划出来的区域代表一个部分，所以最后是：1/4圆环 + 半圆 + 长条矩形 + 半径略大一些的1/4圆环 制作思路 回到本文标题，有人要说我标题党了，这 logo 都划分成四个部分了...: 1/1; /* 居中展示 */ } 画1/4圆环 如何画圆环？...： 怎么得到这样的 1/4圆环 的呢？...画半圆 原理都相似，就放一个半圆的生成以及位移过程图吧： 代码如下，也不过多解释各种数值的意义了，因为我全是微调的： .douyin::before, .douyin::after { content.../4圆环 再次略过讲解，直接看代码： .douyin::before, .douyin::after { content: ''; grid-area: 1/1; /* 居中展示 */
接下来做简单描述，然后进入圆环图的学习。 数据介绍 用一个非常简单的数据进行可视化，两个变量：group，value。...接下来介绍圆环图的各种方式绘制（圆环图和饼图的意义其实差不多，都是给出各数据的比重，只不过，圆环图中间少了一块，变成环状）。主要有两个包：ggpubr包（推荐使用）与ggplot2包。...ggpubr包绘制圆环图 ? 利用该包中的ggdonutchart(）可非常方便的绘制环状图，数据还是使用前面的数据。...ggplot2包绘制圆环图 在[R可视乎|饼图]中ggplot2包绘制饼图的基础上，只要再加一条代码即可完成：xlim(c(0, 5))，即将x轴范围控制在0-5。...可以看到：ggpubr包绘制圆环图十分方便，而ggplot2绘制则需要很多代码，这里不建议使用。 这是今天R可视化的学习笔记，我们下次再见。
圆环图与饼图类似，也是反映各个部分的占比情况，看各种类型的数据与整体之间的关系。下面将展示一下在R与python中的实现方法。...R的实现 (ggplot2) R中是没有封装好的包来直接实现的，我们将用ggplot2中的geom_bar进行极坐标变换得到。...image 现在还是不太好看，最后把xy轴的刻度和xy轴的的标题去掉： p + theme(axis.title.x=element_blank(), axis.title.y=element_blank...image 2. python的实现 (matplotlib.pyplot) python将用matplotlib中的pyplot画出两个pie图来实现。...ax.text(0.1, 2.1, 'test', fontsize=18, style='oblique', ha='center',va='top',wrap=True) # 画出每个pie图的边的颜色
今天我们继续来学习绘制其中另一幅的功能富集结果展示图，是一种很新的展示方法哦，且颜值高： 含义：三组 KRAS signatures 基因做 Reactome 数据库的功能富集，并挑选 top10进行展示...KRAS signatures 基因 这个数据在文章的附件：science.adk0775_data_s4.xlsx 中 开始绘图 这里依然是使用 ggplot2 进行绘制，ggplot2拥有强大的绘图系统...# 隐藏边框线 panel.border = element_blank(), plot.title = element_text(hjust = 0.5) # 标题居中...# 隐藏边框线 panel.border = element_blank(), plot.title = element_text(hjust = 0.5) # 标题居中...) 结果如下： 5、两个图片拼接在一起 第三个图就不绘制了，同样的技巧。
目录 一、基本绘图 二、精雕细琢 (1) 添加标题、横纵轴标签 (2) 图片标题字体、大小、样式设置 (3) 坐标轴标题及标签字体、大小及样式设置 (4) 颜色设置 (5) 图例样式设置 (6) 多图汇总...、fill、alpha、linetype 二、精雕细琢 以上做出来的图还是比较粗糙的，接下来将逐步对其进行微调 (1) 添加标题、横纵轴标签 ggplot(data=singer, aes...") 添加标题及横纵轴标签后，不难看出，还是有很多小问题的。...比如图片标题没有居中，横纵轴标题较小，字体样式不统一等。以下，将通过element_text函数继续进行调整。...它们均需要指定为一个类别型变量，而实际中数据排列方式通常如左图所示，ggplot2需要的是右图排列样式。
R语言中的ggplot2是最美的绘图包之一。但调整主题的细节需要写大量代码，而且还要反复修改、预览，很是费时费力。...标签 Lable Title：图表标题，直接输入即可，方便吧 x-Axis label: 添加X轴标签 y-Axis label: 添加y轴标签 Colour：图例标题 Fill label：填充色标签...，同上 子标题和图注 ?...可以修改子标题(Subtitle)和图注(Caption)中的内容。...想要添加中文信息的话可以在代码输出之后手动添加，重新运行。
它本质上修改了ggplot2的主题功能中的某些参数。例如，第一个参数是设置绘图标题元素的字体，大小，字体和颜色。...bbplot软件包的第二个功能finalise_plot（）将使标题和副标题左对齐，并在图的右下角添加带有源和图像的页脚。...添加轴标题 默认主题没有轴标题，但是可以通过修改theme（）来完成。...请注意，必须在bbc_style（）后之后执行此操作，否则更改将被覆盖： + theme(axis.title = element_text(size = 18)) 修改轴标题 如果添加轴标题，则默认情况下...它们的值可以在0到1之间，其中0左对齐，而1右对齐（或垂直对齐的底部和顶部对齐）。 根据数据添加标签 上面的向图表添加注释的方法使您可以精确地指定x和y坐标。
学习了ggplot2的基本绘图元素ggplot2|详解八大基本绘图要素，可以初步绘制出需要展示的图形，legend可以对图例进行细节的修改ggplot2 |legend参数设置，图形精雕细琢，那theme...theme是解决图是否美观的一个工具，其与scale最大的区别在于不受数据左右。先把scale做好，就是一张合格的图；再处理theme，则是一张出色的图。...可以看到上图的标题，轴标签和图例已经默认设置好了，是否可以个性化修改呢？当然可以！！！ R控制台输入?...以上示例涵盖了一些常用的主题修改，其中 vjust，控制标题（或标签）和绘图之间的垂直间距。 hjust，控制水平间距。将其设置为0.5将标题居中。...学习ggplot2的八大基本元素，了解legend的基本设置后，现在也清楚了主题的相关设置，就可以画出一张出色的图了?
本文是回答B站关注者的提问，他的问题如下 原始数据存储在一个excel文件里，这个excel文件里有三个子表格，每一个子表格的数据如下： 总的数据格式 现在的需要是做如下的图 接下来就介绍如何利用原始数据到最终的图的...ggplot2的代码 首先是将3个子表格的数据整理到一张表格里 比如这里我新建了一个子表格sheet4,数据最终的格式如下（原始数据里第一列的编号是没有用的，可以直接删掉） 接下来R语言里操作 首先是读取数据...var4) -> new_df new_df 定义误差线函数 这里用到的是标准误 ebtop<-function(x){ return(mean(x)+sd(x)/sqrt(length(x))...) } ebbottom<-function(x){ return(mean(x)-sd(x)/sqrt(length(x))) } ggplot2作图 library(ggplot2) ggplot...还有一个知识点是 expand.grid(x=c(1,2,3),y=c(4,5,6)) 可以生成两两配对的数据
用+运算符向图上添加geom ggplot(new_metadata) + geom_point() # note what happens here 即使添加一个图层geom_point，也会报错...ggscatter1 有了必须的映射，再为图片添加一些可选的映射，比如颜色。通过指定列标题来，按照基因型给点上色。自动使用一组默认颜色，不必指定。此外，ggplot2还自动绘制了图例！...但可以添加参数theme()手动改变它。由于我们将此图层添加到最上层（即代码的最后），因此更改的任何细节都会覆盖在theme_bw()中的设置的。...提供了不同的示例图和相关代码（geom或theme的代码）。 ---- 练习 当前坐标轴标签文本默认为geom_point的输入内容（即列标题）。...这些异常值表示意外的观察结果。 使用geom_boxplot()图来绘制Wt和KO基因型之间样本均值的差异。 给图添加标题。
stat可以向数据集添加新变量。将几何映射到这些新变量是可能的 几何体：是指绘制来表示数据的几何对象；每个geom控制我们创建的打印类型。...4.3.3 使用ggplot()绘图 4.3.3.1 创建一个层叠的图 ggplot2语法的第一个明显特性是分层，这意味着一个图至少由一个层创建，并通过使用gglot()函数向现有图添加更多玩家来增强。...4.3.3.4 添加标签图层以更改标题和轴标签 默认情况下，由ggplot2创建的绘图没有任何标题，并且带有与绘图中使用的变量名相对应的轴标签。...但是，在某些情况下，例如出版物，我们可能希望将标题添加到绘图中，也可能希望更改X轴和Y轴标签。...如果添加margin = TRUE的选项，会多一个所有数据的图。
5.无障碍访问(4.0+),支持自动根据图表配置项智能生成描述，使得盲人可 以在朗读设备的帮助下了解图表内容，让图表可以被更多人群访问 6.增加旭日图图表 旭日图尝鲜: 旭日图也称为太阳图（长得确很像太阳...，层级关系也很像地球的内部结构），层次结构中每个级别的比例通过1个圆环表示，离原点越近代表圆环级别越高，最内层的圆表示层次结构的顶级，然后一层一层去看数据的占比情况。...另外，有人说旭日图是圆环图的子集，其实可以这样理解，因为当数据不存在分层，这时旭日图=圆环图。 ?...; type(类型): 设置为'sunburst' type: 'sunburst' center(图的坐标): 默认是[50%,50%],居中显示 旭日图的中心（圆心）坐标，数组的第一项是横坐标，第二项是纵坐标...center: ['50%', '50%'] levels(多层配置): 多层配置(比如说旭日图最外层的阳光就得用到它,通过他配置每一层的样式); 例如，将最外层的扇形块的标签向外显示,形成阳光效果，可以这样设置
函数ggplot()虽然设置图形，但没有自己的视觉输出，而是使用一个或多个几何函数向图中添加了几何对象(简写为geom)，包括点、线、条、箱线图和阴影区域。...在散点图的例子中，函数geom_point()在图形中画点，创建了一个散点图。最后，函数labs()是可选的，可添加注释(包括轴标签和标题)。 图1，散点图 ?...图2与图1最大的区别在于添加了一条“平滑”曲线，这里用到了函数geom_smooth()。对于图3，ggplot2包提供了分组和小面化(faceting)的方法。...最后，将研究如何调整ggplot2图形的外观，包括修改坐标轴和图例、改变配色方案以及添加注释。...类似；参数se代表是否绘制置信区间；参数level代表使用的置信区间水平；参数fullrange指定拟合是否覆盖全图或仅仅是数据。
当我们通过 ggplot(data=example) 后，便相当于设定了默认的ggplot2 设定的背景图层，接着依靠 +geom_point() , +geom_bar() 等等，便可以实现图层的添加...也正因其代表不同的图层，因此也可以利用新的图层对旧的图层进行叠加（或覆盖）。 先后顺序 但也正和图层的叠加一样，R中ggplot 的叠加也有先后顺序，后来的图层会覆盖在原来的图层上。...散点图 jitter 通过为本来重叠在同一位置的点添加随机的“抖动”，使重叠的点产生错位，也因此能够完全地显示在图像里。 柱状图 dodge 可以让组中的直方图并列显示。...练习题 6-2 #练习6-2 # 1.尝试写出下图的代码 # 数据是iris # X轴是Species # y轴是Sepal.Width # 图是箱线图 library(ggplot2) test =...尝试在此图上叠加点图， # 能发现什么问题？ 点图覆盖在箱线图上。后设定的图层在更靠近顶层的位置。
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