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笔记 | GWAS 操作流程4-4:LM模型+数值+因子变量

数值类型的协变量(比如初生重数值变量,PCA的值)直接加进去,因子变量(比如不同的年份,不同的地点,场等)需要转化为虚拟变量。...如果一个分析中,既有数字协变量,又有因子变量,需要将因子变量转化为虚拟变量后再与数字协变量合并,作为最终的协变量文件进行分析。本次用实际数据进行一下演示。 1....协变量文件整理 第一列为FID 第二列为ID 第三列以后为协变量(注意,只能是数字,不能是字符!)...「注意:」这里的性别虽然是因子,但是其只有两个水平,也可以将作为连续的变量,计算方法是一样的。如果是三个水平的因子,就不能直接转化为变量了。...COV2_5,geno[,7:20]) head(dd) mod_M7 = lm(phe ~ cov1+cov2+cov3 + M7_1,data=dd);summary(mod_M7) 「M7加上因子变量结果

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笔记 | GWAS 操作流程4-5:LM模型+数值+因子+PCA协变量

变量文件整理 第一列为FID 第二列为ID 第三列以后为协变量(注意,只能是数字,不能是字符!)...(数字) 然后,将世代变为虚拟变量 最后,将两个协变量整合到一起 sed 's/F/1/g' cov.txt >cov2.txt sed -i 's/M/2/g' cov2.txt ?...由日志可知,共有六个协变量加入了分析中。 「结果文件:」re.assoc.linear 「结果预览:」 ? 4....) head(dd) mod_M7 = lm(phe ~ cov1+cov2+cov3+pca1+pca2+pca3 + M7_1,data=dd);summary(mod_M7) 「M7加上因子变量结果...结论 plink中一般线性模型(LM),linear可以支持数值变量因子变量(经过转化),pca等等,这些过程都可以通过R语言的lm函数复现结果。 6.

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ADRC自抗扰控制,有手就行「建议收藏」

输出则为z1、z2、z3;z1和z2是被称为系统的两个状态,z1的数值是跟随着输出y的,假若系统闭环成功的话,z1,、y、v1三个数值应该是一样的。...TD的参数定是最简单的,观测v1的输出和输入v0的线性,其跟随的快慢并没有规定一定要多快多慢,取决于你想要的效果。TD参数只有两个:快速因子r 和滤波因子h 。...参数定可以先将b定下来,比如取1或者2(最好还是能够知道你的二阶系统系数),然后先后调整belta01、belta02、belta03,观测z1能不能够很好的跟随反馈y,如果是,那么大概参数就调好了;...如果懂得自己在输出中加入随机数(白噪声),注意幅值不能过大,观测一下z3是不是能够很好的观测到随机扰动。若以上两个条件都成立,那么ADRC就几乎被定好了。   ...以上是本人的一次电机闭环ADRC的经历,其中曲曲折折,自动化专业的我,跟着论文也推不出ADRC算法,只好这样先用着,效果也显著。

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R语言入门系列之一

(x, 2)将数值对象x四舍五入法保留小数点后2位trunc()四舍五入去,floor()向下取,ceiling()向上取signif()取有效数字sqrt()返回标量或向量元素的平方根log(...=”,逻辑连接符有与“&”、或“|”、“!”。...类别(名义型)变量和有序变量在R中称为因子(factor)。...有时候按照字母顺序排序的因子向量不能满足现实需要,需要指定顺序,则可以通过设定levels参数来实现: 可以看到这时的顺序发生了变化。...可以看到对于数值变量age会计算最大值、最小值、平均值等,但是对于因子变量,只会计算频数。变量类型不同,在统计中其处理方法也不同(例如RDA、CCA等),结果也不相同。

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刷题问题集合

输入描述: 一行字符串,空,长度小于5000。 输出描述: 整数N,最后一个单词的长度。...多个变量赋值 a,res=int(input()),set() Python允许你同时为多个变量赋值。...例如: a = b = c = 1 以上实例,创建一个整型对象,值为1,三个变量被分配到相同的内存空间上。也可以为多个对象指定多个变量。...取近似值 Q: 题目描述 写出一个程序,接受一个正浮点数值,输出该数值的近似整数值。如果小数点后数值大于等于5,向上取;小于5,则向下取。...round(a);round(b) 输出: 3.0 4.0 合并表记录 Q: 题目描述 数据表记录包含表索引和数值,请对表索引相同的记录进行合并,即将相同索引的数值进行求和运算,输出按照key值升序进行输出

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算法题1

(注:字符串末尾不以空格为结尾) 输入描述: 输入一行,代表要计算的字符串,空,长度小于5000。 输出描述: 输出一个整数,表示输入字符串最后一个单词的长度。...(没啥好办法,遍历除(1,Math.sqrt(n)) 描述 功能:输入一个正整数,按照从小到大的顺序输出它的所有质因子(重复的也要列举)(如180的质因子为2 2 3 3 5 ) 数据范围: 1≤�≤2...如果小数点后数值大于等于 0.5 ,向上取;小于 0.5 ,则向下取。...数据范围:保证输入的数字在 32 位浮点数范围内 输入描述: 输入一个正浮点数值 输出描述: 输出该数值的近似整数值 输入:5.5 输出:6 说明:0.5>=0.5,所以5.5需要向上取为6 输入...:2.499 输出:2 说明:0.499<0.5,2.499向下取为2 7.合并表记录(hashmap) 描述 数据表记录包含表索引index和数值value(int范围的正整数),请对表索引相同的记录进行合并

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【算法竞赛】错误&技巧

在特别情况下.size()和int整型变量比较时会出错,所以尽量保证式子的运算结果是正数,因为如果是负数,unsigned int类型的变量会变成超大的正数。...线段树要开4倍N 二分注意二分的数值的大小可能要开LL, mid同理 dfs or ... if 先判断数组的下标会不会越界再判数组的值 字符串不要memset &的优先级比==高 尽量不要相似的代码复制粘贴...(没事多加括号(( 树状数组配上离散化,离散化下标要从1开始...不然死循环 c++20好像不能cin >> str+1; (char*)可能还是要用scanf("%s",str+1); cout <<...sqrt在自动下取时候,因为是浮点数有误差,建议如果要求下取等整数情况,自己手搓二分求解!!...例子 需要对分别找多个数的因子进行计算,可以用线性筛的方式,找到每个数的最小的质因子,然后通过,边求因子,边除掉对应的最小质因子

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R语言 常见函数知识点梳理与解析 | 精选分析

) 5、complete.cases( ) 判断对象中是否数据完全 6、grep()找出所数据框中元素所在的列值(仅数据框中) 7、assign()通过变量名的字符串来赋值 8、 split()根据因子变量拆分数据框...> assign("x",c(1:10)) > x [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 8、 split()根据因子变量拆分数据框/向量 split(x,f);x...9 10 3 5 > unique(x) [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 10、round(),floor()和ceiling() round()四舍五入取;...floor()向下取;ceiling()向上取 > round(3.5) [1] 4 > floor(3.5) [1] 3 > ceiling(3.5) [1] 4 11、sign() 符号函数 sign...factor:因子 codes:因子的编码 levels:因子的各水平的名字 nlevels:因子的水平个数 cut:把数值型对象分区间转换为因子 table:交叉频数表 split:按因子分组 aggregate

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生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素|附代码数据

length(fitted) 返回的结果包含 fitted - 来自最终树的拟合值,fitted.vars - 拟合值的方差, residuals - 拟合值的残差,contribution - 变量的相对重要性...左右滑动查看更多 01 02 03 04 step(  x= pred.list[[1]], ) 现在这已经形成了一个新的模型,但是考虑到我们并不特别想要一个更简单的模型(因为在这种规模的数据集中,包含变量贡献很小是可以接受的...根据环境空间内观测值的分布,拟合函数可以给出与每个预测因子有关的拟合值分布。  fits( lr005) 每张图上方的数值表示与每个因素预测因子有关的拟合值的加权平均值。...列需要转换为一个因子变量,其水平与建模数据中的水平一致。使用predict对BRT模型中的站点进行预测,预测结果在一个名为preds的向量中。...> for (i in 1:50) {  calc.devi(obs, + pred[,i]) + } > plot(tree.list,deviance 空间预测 这里我们展示了如何对张地图进行预测

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生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素|附代码数据

length(fitted) 返回的结果包含 fitted - 来自最终树的拟合值,fitted.vars - 拟合值的方差, residuals - 拟合值的残差,contribution - 变量的相对重要性...分类和动态 01 02 03 04 step(  x= pred.list[[1]], ) 现在这已经形成了一个新的模型,但是考虑到我们并不特别想要一个更简单的模型(因为在这种规模的数据集中,包含变量贡献很小是可以接受的...根据环境空间内观测值的分布,拟合函数可以给出与每个预测因子有关的拟合值分布。  fits( lr005) 每张图上方的数值表示与每个因素预测因子有关的拟合值的加权平均值。...列需要转换为一个因子变量,其水平与建模数据中的水平一致。使用predict对BRT模型中的站点进行预测,预测结果在一个名为preds的向量中。...> for (i in 1:50) {  calc.devi(obs, + pred[,i]) + } > plot(tree.list,deviance 空间预测 这里我们展示了如何对张地图进行预测

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生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素

length(fitted) 返回的结果包含 fitted - 来自最终树的拟合值,fitted.vars - 拟合值的方差, residuals - 拟合值的残差,contribution - 变量的相对重要性...step( x= pred.list\[\[1\]\], ) 现在这已经形成了一个新的模型,但是考虑到我们并不特别想要一个更简单的模型(因为在这种规模的数据集中,包含变量贡献很小是可以接受的),...根据环境空间内观测值的分布,拟合函数可以给出与每个预测因子有关的拟合值分布。 fits( lr005) 每张图上方的数值表示与每个因素预测因子有关的拟合值的加权平均值。...列需要转换为一个因子变量,其水平与建模数据中的水平一致。使用predict对BRT模型中的站点进行预测,预测结果在一个名为preds的向量中。...> for (i in 1:50) { calc.devi(obs, + pred\[,i\]) + } > plot(tree.list,deviance 空间预测 这里我们展示了如何对张地图进行预测

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生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素|附代码数据

length(fitted) 返回的结果包含 fitted - 来自最终树的拟合值,fitted.vars - 拟合值的方差, residuals - 拟合值的残差,contribution - 变量的相对重要性...---- step(  x= pred.list[[1]], ) 现在这已经形成了一个新的模型,但是考虑到我们并不特别想要一个更简单的模型(因为在这种规模的数据集中,包含变量贡献很小是可以接受的...根据环境空间内观测值的分布,拟合函数可以给出与每个预测因子有关的拟合值分布。  fits( lr005) 每张图上方的数值表示与每个因素预测因子有关的拟合值的加权平均值。...列需要转换为一个因子变量,其水平与建模数据中的水平一致。使用predict对BRT模型中的站点进行预测,预测结果在一个名为preds的向量中。...> for (i in 1:50) {  calc.devi(obs, + pred[,i]) + } > plot(tree.list,deviance 空间预测 这里我们展示了如何对张地图进行预测

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生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素|附代码数据

length(fitted) 返回的结果包含 fitted - 来自最终树的拟合值,fitted.vars - 拟合值的方差, residuals - 拟合值的残差,contribution - 变量的相对重要性...左右滑动查看更多 01 02 03 04 step(  x= pred.list[[1]], ) 现在这已经形成了一个新的模型,但是考虑到我们并不特别想要一个更简单的模型(因为在这种规模的数据集中,包含变量贡献很小是可以接受的...根据环境空间内观测值的分布,拟合函数可以给出与每个预测因子有关的拟合值分布。  fits( lr005) 每张图上方的数值表示与每个因素预测因子有关的拟合值的加权平均值。...列需要转换为一个因子变量,其水平与建模数据中的水平一致。使用predict对BRT模型中的站点进行预测,预测结果在一个名为preds的向量中。...> for (i in 1:50) {  calc.devi(obs, + pred[,i]) + } > plot(tree.list,deviance 空间预测 这里我们展示了如何对张地图进行预测

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面试必备:HashMap、Hashtable、ConcurrentHashMap的原理与区别

HashMap和Hashtable都是用hash算法来决定其元素的存储,因此HashMap和Hashtable的hash表包含如下属性: 容量(capacity):hash表中桶的数量 初始化容量(initial...轻负载的散列表具有冲突少、适宜插入与查询的特点(但是使用Iterator迭代元素时比较慢) 除此之外,hash表里还有一个“负载极限”,“负载极限”是一个0~1的数值,“负载极限”决定了hash表的最大填满程度...(读操作不加锁,由于HashEntry的value变量是 volatile的,也能保证读取到最新的值。)...Hashtable的synchronized是针对张Hash表的,即每次锁住张表让线程独占,ConcurrentHashMap允许多个修改操作并发进行,其关键在于使用了锁分离技术 有些方法需要跨段,...因此,在HashMap中不能由get()方法来判断HashMap中是否存在某个key,应该用containsKey()方法来判断。

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HashMap、Hashtable、ConcurrentHashMap的原理与区别

HashMap和Hashtable都是用hash算法来决定其元素的存储,因此HashMap和Hashtable的hash表包含如下属性: 容量(capacity):hash表中桶的数量 初始化容量(initial...轻负载的散列表具有冲突少、适宜插入与查询的特点(但是使用Iterator迭代元素时比较慢) 除此之外,hash表里还有一个“负载极限”,“负载极限”是一个0~1的数值,“负载极限”决定了hash表的最大填满程度...(读操作不加锁,由于HashEntry的value变量是 volatile的,也能保证读取到最新的值。)...Hashtable的synchronized是针对张Hash表的,即每次锁住张表让线程独占,ConcurrentHashMap允许多个修改操作并发进行,其关键在于使用了锁分离技术 有些方法需要跨段,...因此,在HashMap中不能由get()方法来判断HashMap中是否存在某个key,应该用containsKey()方法来判断。

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tableone包详解

tableone包的详细使用介绍 现在我想要看看整个数据集的描述性分析,那么我就可以: CreateTableOne(data = pbc) 输出如下: R数据分析:tableone包的详细使用介绍 看到没,所有的数值变量都给你以均值标准差的形式描述好了...,因子变量频数百分比也描述好了,不用你再用什么SPSS一个一个来描述统计了。...等等,问题还是有滴,比如: 数据库中其实有很多变量应该是因子类型的,但是都给成整数型了 连ID都给描述了,这玩意我不需要 我们来调整一下,比如我论文中只需要描述如下的变量: myVars <- c("...summary(tab2) R数据分析:tableone包的详细使用介绍 R数据分析:tableone包的详细使用介绍 看看看,这个时候对于数值变量,缺失值数量,占比,均值标准差,四分位间距,偏度峰度全部给你...;对于因子变量,缺失值数量,占比,水平数,频率和累计频率都在,要啥有啥。

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c-3

其值用来表示某个变量在内存储器中的地址。) 空类型 : (调用后并不需要向调用者返回函数值,这种函数可以定义为“空类型”。其类型说明符为void。)...以下各数是合法的八进制数: 015(十进制为13)、0101(十进制为65)、0177777(十进制为65535); 以下各数不是合法的八进制数: 256(无前缀0)、03A2(包含八进制数码)、-...以下各数是合法的十六进制常数: 0X2A(十进制为42)、0XA0 (十进制为160)、0XFFFF (十进制为65535); 以下各数不是合法的十六进制常数: 5A (无前缀0X)、0X3H (含有十六进制数码...长整数158L和基本常数158 在数值上并无区别。但对158L,因为是长整型量,C编译系统将为它分配4个字节存储空间。而对158,因为是基本整型,只分配2 个字节的存储空间。...p,q; (p,q为无符号整型变量)

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从零开始学 Web 之 JavaScript(二)变量

变量名长度不能超过 255 个字符。 变量名中不允许使用空格,首个字不能为数字。 不用使用脚本语言中保留的关键字及保留符号作为变量名。 变量名区分大小写。 汉语可以作为变量名。但是不建议使用!...3、isNaN(); 任何不能被转换为数值的值都会导致这个函数返回 true。 ---- 5、String 使用单引号或者双引号均可。...Number(变量);(有数字字符会出现NaN) Number("11"); Number(""); // 空字符串返回 0 3. parseInt() 和 parseFloat()(译为取和取浮点数...parseInt(变量):如果变量中首字符为字母则结果为 NaN。否则取出现首个数字前的整数。...(如果没有小数的话取) 123.123 = parseFloat(“123.123aaaa”); PS: true 数值为 1;false 为0; null 的数值类型为 0; undefined

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