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    DataTrove:一款针对大规模文本数据的处理、过滤和消除重复数据工具

    DataTrove是一款针对大规模文本数据的处理、过滤和消除重复数据工具,该工具可以通过提供一组平台无关的可定制管道处理块,帮助广大研究人员从各种复杂脚本中解放出来,同时还允许我们轻松添加自定义功能。...,可读取常见的warc文件,并提取文件内容,然后过滤并存储至S3; tokenize_c4.py:直接将数据读取至tokenize; minhash_deduplication.py:完整管道读取并消除重复数据...; sentence_deduplication.py:精确消除重复数据; exact_substrings.py:ExactSubstr的运行样例; 工具使用 读取数据 一般来说,管道会以一个...output_filename="${language}/" + DUMP + "/${rank}.jsonl.gz", # folder structure: language/dump/file ) 消除重复数据...关于消除重复数据的使用,可以参考项目提供的minhash_deduplication.py、sentence_deduplication.py和exact_substrings.py脚本。

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    MySQL数据库的默认隔离级别为什么是可重复读

    要知道,越高的隔离级别,能解决的数据一致性问题越多,理论上性能损耗更大,可并发性越低。...隔离级别依次为>:串行化 > RR > RC >读未提交 在SQL标准中,前三种隔离级别分别解决了幻象读、不可重复读和脏读的问题。那么,为什么MySQL使用可重复读作为默认隔离级别呢?...statement:记录的是修改SQL语句 row:记录的是每行实际数据的变更 mixed:statement和row模式的混合 那Mysql在5.0这个版本以前,binlog只支持STATEMENT这种格式...而这种格式在读已提交(Read Commited)这个隔离级别下主从复制是有bug的,因此Mysql将可重复读(Repeatable Read)作为默认的隔离级别!...因此由于历史原因,mysql将默认的隔离级别设为可重复读(Repeatable Read),保证主从复制不出问题。

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    MySQL的可重复读级别能解决幻读吗

    关于脏读和不可重复读在相应的隔离级别下都很容易的复现了。但是对于幻读,我发现在可重复读的隔离级别下没有出现,当时想到难道是MySQL对幻读做了什么处理?...可重复读取(Repeatable Read):禁止不可重复读取和脏读取,但是有时可能出现幻读数据。读取数据的事务将会禁止写事务(但允许读事务),写事务则禁止任何其他事务。Mysql默认使用该隔离级别。...这种结果告诉我们其实在MySQL可重复读的隔离级别中并不是完全解决了幻读的问题,而是解决了读数据情况下的幻读问题。而对于修改的操作依旧存在幻读问题,就是说MVCC对于幻读的解决时不彻底的。...在查阅了一些资料后发现在RR级别中,通过MVCC机制,虽然让数据变得可重复读,但我们读到的数据可能是历史数据,不是数据库最新的数据。...如何解决幻读 很明显可重复读的隔离级别没有办法彻底的解决幻读的问题,如果我们的项目中需要解决幻读的话也有两个办法: 使用串行化读的隔离级别 MVCC+next-key locks:next-key locks

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    MySQL的可重复读级别能解决幻读吗

    引言 之前在深入了解数据库理论的时候,了解到事物的不同隔离级别可能存在的问题。为了更好的理解所以在MySQL数据库中测试复现这些问题。关于脏读和不可重复读在相应的隔离级别下都很容易的复现了。...但是对于幻读,我发现在可重复读的隔离级别下没有出现,当时想到难道是MySQL对幻读做了什么处理?...可重复读取(Repeatable Read):禁止不可重复读取和脏读取,但是有时可能出现幻读数据。读取数据的事务将会禁止写事务(但允许读事务),写事务则禁止任何其他事务。Mysql默认使用该隔离级别。...这种结果告诉我们其实在MySQL可重复读的隔离级别中并不是完全解决了幻读的问题,而是解决了读数据情况下的幻读问题。而对于修改的操作依旧存在幻读问题,就是说MVCC对于幻读的解决时不彻底的。...在查阅了一些资料后发现在RR级别中,通过MVCC机制,虽然让数据变得可重复读,但我们读到的数据可能是历史数据,不是数据库最新的数据。

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    MySQL 乱七八糟的可重复读隔离级别实现

    什么是事务 事务的实现方式 不同机制下的不同隔离级别 幻读(P3/A3)和写偏斜(A5B) mysql中的可重复度 幻读 写偏斜 mysql中可重复读的实现 postgresql中的可重复读 无幻读 写偏斜...什么是事务 事务是数据库一组读写操作的集合,事务具有ACID四个特性,原子性,一致性,隔离性和持久性。 事务有四个隔离级别,分别是读未提交,读已提交,可重复读和串行化。...很明显,越低隔离级别的事务并发行更好,但是一致性更低,严格来说,低隔离级别的事务是不符合A和I的,常用的隔离级别多为读已提交和可重复度。...但是隔离级别的定义是基于锁并发控制实现的,基于MVCC机制实现的数据库事务表现行为会稍有不同。 jim gray曾经有一篇论文讨论不同机制实现的数据库隔离级别的不同表现,并将隔离级别扩展到7个。...postgresql中的可重复读 无幻读 pg实现的隔离级别是比较标准的,可重复度级别(实际是SI)没有幻读,这里举两个例子 第一个例子 ?

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    mysql隔离级别为什么设置为可重复读_隔离性的4个级别

    知识点总结 1.数据库默认隔离级别: mysql —可重复读; oracle,postgres —已提交读 2.mysql binlog的格式三种:statement,row,mixed 3.为什么mysql...原因有三:repeatable存在间隙锁会使死锁的概率增大;在可重复读隔离级别下,条件列未命中索引会锁表!...更重要的是不可重复读问题在开发中是可以接收的,毕竟你数据都已经提交了,读出来本身就没有太大问题 2.在已提交读级别下,主从复制用什么binlog格式:row格式,是基于行的复制!...默认是可重复读” 面试官:“为什么mysql选可重复读作为默认的隔离级别?” (你面露苦色,不知如何回答!) 面试官:"你们项目中选了哪个隔离级别?为什么?" 你:“当然是默认的可重复读,至于原因。。...不用解决,这个问题是可以接受的!毕竟你数据都已经提交了,读出来本身就没有太大问题!Oracle和Postgressql的默认隔离级别就是RC,你们改过他们的默认隔离级别么?

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    事务隔离级别中的可重复读能防幻读吗?

    前言 每次谈到数据库的事务隔离级别,大家一定会看到这张表. 其中,可重复读这个隔离级别,有效地防止了脏读和不可重复读,但仍然可能发生幻读,可能发生幻读就表示可重复读这个隔离级别防不住幻读吗?...可重复度 在可重复读(REPEATABLE READS)是介于已提交读和可串行化之间的一种隔离级别(废话?)...悲观锁与乐观锁 我们前面说的在对象上加锁,是一种悲观锁机制,有很多文章说可重复读的隔离级别防不了幻读, 是认为可重复读会对读的行加锁,导致他事务修改不了这条数据,直到事务结束,但是这种方案只能锁住数据行...而在可重复度的隔离级别下,情况就完全不同了.事务1在update后,对该数据加锁,事务B无法插入新的数据,这样事务A在update前后数据保持一致,避免了幻读,可以明确的是,update锁的肯定不只是已查询到的几条数据...那是因为你心里没点b树 Innodb中的事务隔离级别和锁的关系 MySQL InnoDB中的行锁 Next-Key Lock消除幻读

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    6种 数据库隔离级别中的SNAPSHOT隔离级别

    实际上之前的一段时间,我的认知也是4种隔离级别,这是通过我们的ANSI SQL 表中中定义的 isolation level。...ISOLATION的定义一直与数据库系统的性能有关,隔离的级别越低,那么性能就会越好。...而后随着研究的进步,隔离级别进行了分化,延展出另外两种隔离级别 其中一种就是今天要说的 Snapshot lsolation 今天主要来去重新理解一直在用但其实个人概念并不清楚的 snapshot isolation...2 避免了 脏读,非一致性读,以及丢失更新,和不可重复读等多个问题 以上是PG 对于SNAPSHOT 部分的代码。...总结: SNAPSHOT LEVEL 解决了锁解决了的事务隔离级别和性能之间的矛盾问题,有效的提高了数据库并发的性能问题。

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    查询mysql的隔离级别_怎么查看数据库隔离级别

    大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 CPUQuota=value 该参数表示服务可以获取的最大 CPU 时间,value 为百分数形式,高于 100% 表示可使用 1 核以上的 CPU。...事务的4种隔离级别 READ UNCOMMITTED 未提交读,可以读取未提交的数据。...Gap locking 仅用于外键约束检查和重复键检查。 REPEATABLE READ 可重复读,事务中的一致性读取读取的是事务第一次读取所建立的快照。...SERIALIZABLE 序列化在了解了 4 种隔离级别的需求后,在采用锁控制隔离级别的基础上,我们需要了解加锁的对象(数据本身&间隙),以及了解整个数据范围的全集组成。...数据范围全集组成 SQL 语句根据条件判断不需要扫描的数据范围(不加锁); SQL 语句根据条件扫描到的可能需要加锁的数据范围; 以单个数据范围为例,数据范围全集包含:(数据范围不一定是连续的值,也可能是间隔的值组成

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    【事务隔离级别】——深度探索数据库的事务隔离级别

    我们都知道,每启动一下MySQL,就会获得一个数据库连接,每个数据库连接有一个全局变量@@tx_isolation,表示当前连接中事务的隔离级别。...read committed测试   针对上面的问题,把客户端A的事务隔离级别设置为read committed,再重复上面的步骤,会发现B在事务结束之前,A并不能查询到B所做的操作。   ...但是正如上文所说,这种隔离级别下可能导致前事务中多次读取特定记录的结果不相同,比如客户端A事务隔离级别为read committed,在A的一个事务中,执行两次相同的查询,在这两次查询的中间,客户端B对数据进行更改并提交事务...,那么会导致客户端A的两次查询结果不一致,导致“不可重复读”的麻烦。   ...repeatable read测试   同理,如果设置了repeatable read隔离级别,就可以保证在当前事务中多次执行相同查询的结果集相同,实现“可重复读”。

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    数据库事务的隔离级别

    不可重复读 、幻读这几类问题 1.1 Read UnCommitted(读未提交) 最低的隔离级别。...一个事务可以读取另一个事务并未提交的更新结果。 1.2 Read Committed(读提交) 大部分数据库采用的默认隔离级别。...一个事务的更新操作结果只有在该事务提交之后,另一个事务才可以的读取到同一笔数据更新后的结果。 1.3 Repeatable Read(重复读) mysql的默认级别。...通常会用其他并发级别加上相应的并发锁机制来取代它。 2.1 脏读 脏读发生在一个事务A读取了被另一个事务B修改,但是还未提交的数据。假如B回退,则事务A读取的是无效的数据。...2.2 不可重复读 不可重复读的重点是修改: 同样的条件, 你读取过的数据, 再次读取出来发现值不一样了 2.3 幻读 幻读发生在当两个完全相同的查询执行时,第二次查询所返回的结果集跟第一个查询不相同。

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    不同数据库的转录因子差异如何

    这个数据库能够预测结合特定DNA位点或基序的转录因子,以及可能被特定DNA结合蛋白识别的DNA基序或位点。...不仅可以查看转录因子调控的基因,详细的数据注释、分析结果和单个数据集的详细信息(数据的QC情况、motif分析结果、潜在的靶基因预测)、同时还可以在基因组浏览器中查看数据的分布及下载分析的结果文件。...数据库为例,为大家展示一下这三个数据集所含转录因子的信息差异: ****读取不同数据库下载得到的TFs列表 #1_来源于AnimalTFDB3,下载链接:http://bioinfo.life.hust.edu.cn.../ 这两个数据库关于转录因子的收录,都是接近于2000个基因。...human_factor_full_QC.txt 文件,然后统计了一下,在人类这个研究领域,有chip-seq数据的转录因子是1359个,略低于上面的两个网页数据库里面的1600~2000的数量。

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    处理MySQL 重复的数据记录

    有些 MySQL 数据表中可能存在重复的记录,有些情况我们允许重复数据的存在,但有时候我们也需要删除这些重复的数据。 本章节我们将为大家介绍如何防止数据表出现重复数据及如何删除数据表中的重复数据。...---- 防止表中出现重复数据 你可以在 MySQL 数据表中设置指定的字段为 PRIMARY KEY(主键) 或者 UNIQUE(唯一) 索引来保证数据的唯一性。...,在设置了记录的唯一性后,如果插入重复数据,将不返回错误,只以警告形式返回。...HAVING子句设置重复数大于1。 ---- 过滤重复数据 如果你需要读取不重复的数据可以在 SELECT 语句中使用 DISTINCT 关键字来过滤重复数据。...如果你想删除数据表中的重复数据,你可以使用以下的SQL语句: mysql> CREATE TABLE tmp SELECT last_name, first_name, sex FROM person_tbl

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    Navicat 环境测试 innodb 的事务隔离级别 产生的幻读 和 不可重复读

    运行结果: image.png 当前事务的隔离级别为 可重复读 二: 然后准备一张表: 随便你自己正在用的一张表就行,没有什么特殊的要求,毕竟隔离级别对什么样结构的表都是适用的。...相反如果数据不一致就导致了不可重复读,查询到的是更新后的视图。...SELECT * FROM content where ip_address = '0:0:0:0:0:0:0:1'; 结果返回: 和开始查询到的数据是一致的,因此隔离事务是对的没有产生我们怀疑的不可重复读...// 修改为读提交 重复上面的步骤:就可以看到,当seesion1 最后一次查询时,原本在可重复读的条件下的数据和开始时一样,但此时发生了变化。...说明隔离级别发生了变化。 踩坑提示,修改完数据库的隔离级别后,重新打开连接一下数据库,再测试更佳。

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    数据库的隔离级别和 MVCC

    数据库实现并发访问请求,就是基于 MVCC 实现的。 首先了解下数据库事物的隔离级别。...隔离级别 Read Uncommiteed 读未提交 读取未提交的数据,即其他事物已经修改但还未提交的数据,这是最低的隔离级别。 Read committed 读已提交 读取已提交的数据。...在一个事物中,对同一条数据,可能会出现读取不一致现象。 Repeatable Read 可重复读 可重复读取,在一个事物中,对同一条数据,确保多次读取的结果一样。...隔离级别主要是为了实现读操作不需要加锁, 从而提高数据库的性能。...不同隔离级别出现的问题 隔离级别 脏读 幻读 不可重复读 读未提交 ✅ ✅ ✅ 读已提交 ✅ ✅ 可重复度 ✅ 序列化 Read Uncommiteed 和 Serializable 不需要使用多版本控制技术就可实现

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    数据库的事务隔离级别总结

    幻读和不可重复读都是读取了另一条已经提交的事务(这点就与脏读不同),所不同的是不可重复读查询的都是同一个数据项,而幻读针对的是一批数据整体(比如数据的个数)。...如果使用锁机制来实现这两种隔离级别,在可重复读中,该sql第一次读取到数据后,就将这些数据加锁,其它事务无法修改这些数据,就可以实现可重复读了。...Serializable隔离级别 ,读用读锁,写用写锁,读锁和写锁互斥,这么做可以有效的避免幻读、不可重复读、脏读等问题,但会极大的降低数据库的并发能力。...而选择可重复读(Repeatable Read)作为默认的隔离级别呢?...因为MySQL的RR需要间隙锁来解决幻读问题。而RC隔离级别则是允许存在不可重复读和幻读的。

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