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【数据分析 R语言实战】学习笔记 第五章 数据描述性分析(下)

Y可以省略:use指定如何处理缺失样本:method给出计算i哪一种相关系数:默认皮尔逊(Pearson )系数度量线性相关性,如果数据呈现不是线性关系,而是单调,则可以用肯德尔(Kendall...)或斯皮尔曼( Spearman)相关系数,它们描述是秩相关性。...5.6.2多组数据图形分析 R中函数lowess()通过加权多项式回归对散点图进行平滑,拟合一条非线性曲线,但其只能适用于二维情况。与之类似的loess()用于处理多维情况。...(2)等高线图 有时候数据量很大,散点图上数据点就会非常集中,不容易看出变量关系或趋势,这就需要借助二维等高线图来描述。...首先利用程序包MASS中函数kde2d()来估计出二维数据密度函数,再利用函数contour()画出密度等高线图。如果不想画出图上数据标签,可以将参数drawlabels=FALSE去掉。

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Matplotlib绘图基础

---- 2.绘图基础 2.1 图表基本元素 图例和标题 x轴和y轴、刻度、刻度标签 绘图区域及边框 网格线 2.2 图表基本属性 多重绘图属性: 是否在同一个图上绘制多个系列线 多重子图属性: 是否生成多个子图...,并在每个子图上绘制多个系列线 ---- 3.绘图方式 3.1 Pyplot API[1] 3.1.1 属性设置函数 绘制图边框: box 为图表添加图例: figlegend 为轴系列添加图例:legend...为图添加标题:title 在图上添加文字: figtext 在轴系列上添加文字:text 设置网格: grid 设置多重绘图:hold 使用紧密布局:tight_layout 改变刻度和刻度标签样式...获取图表标签:get_figlabels 获取图表数目:get_fignums 3.1.3 辅助线函数 水平竖直线:axhline / axvline 水平竖直域:axhspan / axvspan 误差棒...---- 5.参考资料: [1] matplot.pyplot api documents[https://matplotlib.org/api/pyplot_summary.html] [2] matplot.axes

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图神经网络应用于时间序列异常检测

最近,图神经网络技术应用到时间序列分析,引起了学术界广泛研究兴趣。本次文章分享两篇最近阅读,图神经网络用于时间序列异常检测论文。 首先对于多变量时间序列,我们可以将其看作一个矩阵 ?...从变量角度,一条时间序列(单变量)可以对应图上一个节点 从时间角度,同一个时刻数据向量(多变量)可以对应图上一个节点 利用图注意力网络进行特征提取 ?...换个角度理解,其实就是从时间维度和变量维度对数据进行了滤波 得到这两种角度特征加上原始特征一起用于后续任务 预测误差:t时刻以前数据预测t时刻数据,预测值与实际值误差 重构误差:自编码器提取隐变量...,最小化编码前和解码后数据误差 目标函数综合考虑了预测预测和重构误差,训练得到模型用于infer时将两个支路预测(预测值和重构概率)进行整合得到一个score,当这个score超过一定阈值就判断为异常...来表示,这样就可以根据embedding之间相关性来判断两个节点是否存在连接,然后取Top K来构造邻接矩阵即可。 ?

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疾病研究资源 | 用于评估疾病相关性生物医学数据、计算方法和工具

浅浅总结一下:疾病关联研究资源 探索疾病之间潜在关系一直是一个活跃研究领域。...2022年《Briefings in Bioinformatics》发表了一篇综述文章,为当前疾病关联研究提供了一个系统概述:总结了用于评估疾病相关性可用生物医学数据和数据库、计算方法、软件工具/...,由于疾病相关基因在分子水平疾病研究中重要性,以基因为中心生物医学数据(如基因-基因网络和基因表达数据)也可以为揭示疾病与疾病关联提供有用信息。...> 基因 – 基因关联 > 基因表达谱 > GO注释 评估疾病相关性计算方法 到目前为止,已经提出了许多基于不同生物医学数据计算方法来计算疾病之间相似性分数,以定量评估疾病与疾病之间关联。...基于疾病语义方法 基于表型方法 基于函数方法 基于表征学习方法 基于文本挖掘方法 疾病关联研究工具/平台 为了促进评估疾病-疾病关联各种计算方法研究和应用,已经开发并在线发布了许多工具和平台

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疾病研究资源 | 用于评估疾病相关性生物医学数据、计算方法和工具

探索疾病之间潜在关系一直是一个活跃研究领域。...2022年《Briefings in Bioinformatics》发表了一篇综述文章,为当前疾病关联研究提供了一个系统概述:总结了用于评估疾病相关性可用生物医学数据和数据库、计算方法、软件工具/...,以基因为中心生物医学数据(如基因-基因网络和基因表达数据)也可以为揭示疾病与疾病关联提供有用信息。...> 基因 – 基因关联图片> 基因表达谱> GO注释评估疾病相关性计算方法到目前为止,已经提出了许多基于不同生物医学数据计算方法来计算疾病之间相似性分数,以定量评估疾病与疾病之间关联。...基于疾病语义方法基于表型方法基于函数方法基于表征学习方法基于文本挖掘方法疾病关联研究工具/平台为了促进评估疾病-疾病关联各种计算方法研究和应用,已经开发并在线发布了许多工具和平台。

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Diffusion Convolutional Recurrent Neural Network: Data-Driven Traffic Forecasting(论文阅读02)

我们建议将交通流建模为有向图上扩散过程,并引入扩散卷积递归神经网络(DCRNN),这是一种用于交通预测深度学习框架,在交通流中纳入了时空依赖性。...如何做: DCRNN使用图形上双向随机游走捕获空间相关性,并使用具有计划采样编码器-解码器体系结构捕获时间相关性。...另一方面,道路网络上传感器包含复杂而独特空间相关性 数据集介绍 我们在两个现实世界大规模数据集上进行了实验:(1)METR-LA此交通数据集包含从洛杉矶县高速公路上环路检测器收集交通信息(Jagadish...image.png 给出一张图和数据,来预测将来图上结点数据 ? X表示结点 2.2空间依赖性建模 交通流与扩散过程相关联来对空间依赖性进行建模,该扩散过程明确捕获了交通动力学随机性质。...image.png 模型表现 用了三种评估方法; 1)平均绝对误差(MAE), 2)平均绝对百分比误差(MAPE) 3)均方根误差(RMSE) ? image.png 预测结果可视化 ?

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R语言用多元ARMA,GARCH ,EWMA, ETS,随机波动率SV模型对金融时间序列数据建模|附代码数据

(T_sweep, estim_coeffs_vs_T,         main = "估计ARMA系数", xlab = "T", ylab = "值", matplot(T_sweep, 100...重要实际上是样本外误差:我们可以看到,增加模型复杂度可能会得出较差结果。就预测收益误差而言,似乎最简单iid模型已经足够了。...最后,让我们展示一些样本外误差图表: plot(error,     main = "不同模型收益预测样本外误差", 请注意,由于我们没有重新拟合模型,因此随着时间发展,误差越大(对于ARCH建模尤其明显...,σN,t)是标准化噪声向量C,协方差矩阵ηt=C-1wt(即,它包含等于1对角线元素)。 基本上,使用此模型,对角矩阵Dt包含一组单变量GARCH模型,然后矩阵C包含序列之间一些相关性。...与SPY相关性较小,在小于0区间波动。 ---- 本文选自《R语言用多元ARMA,GARCH ,EWMA, ETS,随机波动率SV模型对金融时间序列数据建模》

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逻辑回归、随机森林、SVM支持向量机预测心脏病风险数据和模型诊断可视化

(可以认为是连续,因为一个人可以拥有任意数量香烟,甚至半支香烟。)...ra_da <- map str(ra_da ) 数据预处理 查看和处理缺失值 # 这里我们使用mice包进行缺失值处理 aggr matplot 由上图可以看出,除了glucose变量,其它变量缺失比例都低于...is.na # 查看glce与其它变量线性相关性确定mice填充策略 gcog = glm(lcse ~ .) smry(glseg) 填充,排除不重要变量。...至于为什么不选diaBP,主要是后面的相关性分析中,这两个变量会造成多重共线性。...rfmdel <- randomForest # 误差 plot # 获取重要性 ggplot + geom_bar geom_text 这里有患病风险误差不降反升,需要探究其中原因

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数据分享|逻辑回归、随机森林、SVM支持向量机预测心脏病风险数据和模型诊断可视化|附代码数据

(可以认为是连续,因为一个人可以拥有任意数量香烟,甚至半支香烟。)...ra_da <- map str(ra_da ) 数据预处理 查看和处理缺失值 # 这里我们使用mice包进行缺失值处理 aggr matplot ---- R语言逻辑回归、Naive Bayes...is.na # 查看glce与其它变量线性相关性确定mice填充策略 gcog = glm(lcse ~ .) smry(glseg) 填充,排除不重要变量。...至于为什么不选diaBP,主要是后面的相关性分析中,这两个变量会造成多重共线性。...rfmdel <- randomForest # 误差 plot # 获取重要性 ggplot +    geom_bar    geom_text 这里有患病风险误差不降反升,需要探究其中原因

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SemanticSLAM:基于学习语义地图构建和稳健相机定位

通过计算每个前景对象中像素在地图上位置并根据其类别标签进行统计,得到地图上语义特征分布。最后,通过ConvLSTM网络对地图中错误进行校正。 B....接着,将前一时间步骤构建全局地图mt−1与每个候选观察图´ot进行2D卷积操作,计算它们之间相关性。...与惯性位姿估计交叉验证 在任务开始时,由于观测地图和全局地图之间相关性较差,导致视觉姿态估计性能较低。为了减轻这种不确定性,提出使用IMU传感器数据引导姿态估计。...地图更新 在地图更新过程中,首先需要将自我中心观测投影到估计分配全局地图上。通过将视觉和惯性姿态估计结合起来,选择姿态估计概率分布。...最后,我们还将 ORB-SLAM2 应用于我们数据集,然而,该算法无法生成任何姿态估计,因为它无法在帧之间找到足够数量匹配关键点。 图 3 展示了各种方法随时间定位误差

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Matplot3D for JAVA V5.0:一个纯JAVA开发数学科学数据可视化组件,JAVA 三维绘图(可视化图表)组件

Matplot3D for JAVA提供简洁明了API设计,这使得即使是没有太多数据可视化工经验开发者也可以快速上手构建出交互式可视化应用。可用于大数据可视化、科学数学数据分析可视化等领域。...样例展示C60分子结构网格映射曲面图Matplot3D for JAVA可用于绘制网格曲面,可以由两个独立自变量组成经纬网格,通过映射函数映射到空间而形成曲面莫比乌斯环曲面demo代码:public...(-1, 15, 0);}}数据阵列网格曲面Matplot3D for JAVA 可以用于生成以xy方向均匀分布高程点阵组成网格或连续曲面 ,可用于绘制高程图等。...三维散点图Matplot3D for JAVA 可用于绘制分组散点图或者显示点云。...);mgr.show();}}简单几何体组合图形Matplot3D for JAVA 用于绘制圆柱、长方体等简单几何体组合图形。

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数据分享|逻辑回归、随机森林、SVM支持向量机预测心脏病风险数据和模型诊断可视化

(可以认为是连续,因为一个人可以拥有任意数量香烟,甚至半支香烟。)...ra_da <- map str(ra_da ) 数据预处理 查看和处理缺失值 # 这里我们使用mice包进行缺失值处理 aggr matplot ---- 01 02 03 04 由上图可以看出...is.na # 查看glce与其它变量线性相关性确定mice填充策略 gcog = glm(lcse ~ .) smry(glseg) 填充,排除不重要变量。...至于为什么不选diaBP,主要是后面的相关性分析中,这两个变量会造成多重共线性。...rfmdel <- randomForest # 误差 plot # 获取重要性 ggplot + geom_bar geom_text 这里有患病风险误差不降反升,需要探究其中原因

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这个免费第三方工具汇总了常用学术图表类型,超实用!!

考虑到公众号一直强调工具多元化思想,我们今后也会不定期推荐其他语言优秀可视化工具,满足不同同学使用需求~~,今天,小编就介绍一款基于C++优质可视化工具-「Matplot++」,主要内容如下:...Matplot++简单介绍 Matplot++ 样例推荐 Matplot++简单介绍 Matplot++作为C++一个优秀可视化库,可绘制出高质量用于出版图表,同时也可以应用C++后端功能...更多详细内容可参考:Matplot++官网[1] Matplot++样例推荐 Matplot++提供绘图类型几乎包括了常见图表所有类型,如下: Line Plots Data Distribution...10副 Matplot++ 可视化作品,更多详细例子看参考文末链接。...总结 今天小编推荐基于C++可视化库Matplot++,主要看重其拥有以下特点: 丰富多样图表类型; 适合学术出版配色和绘图风格; 同时也能让小伙伴们使用工具更加丰富(不在局限于Python或者

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时间序列R语言实现

也就是说如果预测误差和预测结果间存在相关性,那所用简单指数平滑模型可以用其他预测方法优化。 R中提供了acf()方法可以查看样本预测误差相关性图。...若要定义我们想要查看最大滞后期数,可以定义acf()方法中lag.max参数。 例如,计算滞后期在1-20时样本预测误差相关性,如下操作: ? ?...图上能看出来,预测误差基本上是以0为中心,大致正态分布,与正态分布曲线相比可能有些向右偏,但右偏量相对小。所以,可以说预测误差是以0为中心呈正态分布。...从图上,可以看出,霍特季节性指数平滑方法在做这个时间序列季节性预测时很成功,预测结果与原始数据11月销售高峰很贴切。 接下来,对未来做预测,还是用forecast包。 ? ?...同样方法计算相关性和做Ljung-Box检验。过程及结果如下: ? ? 样本预测误差自相关结果,在1-20滞后期中,没有超出意义界限。

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Python语言和matplotlib库做数据可视化分析

matplot库是Python语言基础数据可视化库,可以设计和实现许多基础绘图类型。 ?...它功能强大,并提供了跨平台交互式环境。matplotlib可用于Python脚本,Python和IPython Shell、Jupyter notebook 和 Web 应用服务程序。...它是一个非常通用可视化库,只需要几行代码,就可以生成柱状图、直方图、功率谱图、散点图、误差图、饼图和许多其他类型图。关于matplotlib详细介绍和学习,可以查阅它官方网址。...1.6 误差图 代码片段 import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt x = np.arange(0.1, 4, 0.5) y = np.exp...(-x) plt.figure() plt.errorbar(x, y, xerr=0.2, yerr=0.4) plt.title(u'简单误差图', fontproperties='simHei

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Facebook@ICLR2021 比GNN快100倍标签传播

这里我们可以通过组合忽略图结构浅层模型和利用标签结构相关性两个简单后处理步骤,来获得GNN性能提升。...(1)“误差相关性”,它分散训练数据中残留错误以纠正测试数据中错误 (2)“预测相关性”,它使测试数据上预测变平滑。...我们提出了包含三个主要部分简单管道,如图1所示 (1)使用节点特征(忽略图结构)做出基本预测(例如MLP或线性模型) (2)校正步骤,其将训练数据中不确定性传播到整个图上,以校正基本预测 (3)平滑图上预测...通过对这些经典思想修改和应用,我们可以在多个节点分类任务上获得最先进性能,胜过了大型GNN模型。在我们框架中,图结构不用于学习参数,而是用作后处理。...虽然使用较少参数收益很大,但真正收益在于训练时间缩短,而且与具有相当准确性模型相比,我们训练模型通常要快几个数量级,因为我们没有将图结构用于基本预测。

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性能超越图神经网络,将标签传递和简单模型结合实现SOTA

本文展示了许多标准传导节点网络分类基准结果,作者通过将忽略图结构浅层模型与利用标签结构中相关性两个简单后处理步骤相结合,可以超越或匹配SOTAGNN性能,这里主要有两个相关性(i)将训练数据中残余误差带到测试数据中...,用于矫正错误误差相关性”(error correlation),以及(ii)一个“预测相关性”,它可以平滑测试数据上预测。...;以及(iii)对图上预测进行平滑处理。...此外,该图仅用于这些后处理步骤和增强特征前处理步骤。而一般基础预测方式不是这样。与标准GNN模型相比,这使得训练变得更快且可扩展。...然后,通过在训练数据上传递已知误差来估计误差,得到误差修正后预测Z(r)=Z+^E。最后,作者将这些作为未标记节点上得分向量,通过另一个LP步骤将其与已知标签相结合,得到平滑最终预测。

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计算与推断思维 十三、预测

我们将把这些步骤应用于x和y值简单表格。...基于聚合和均值相关性被称为生态相关性,并且经常用于报告。正如我们刚刚所看到,他们必须谨慎解读。 严重还是开玩笑?...但是 45 度线不是经过垂直条形中心线。你可以看到在下图中,1.5 个标准单位垂直线显示为黑色。蓝线附近散点图上高度都大致在 -2 到 3 范围内。红线太高,无法命中中心。...为了避免误差大小在测量时抵消,我们将采用误差平方均值而不是误差均值。 估计均方误差大概是误差平方有多大,但正如我们前面提到,它单位很难解释。...例如,如果运动员可以举起 100 公斤,预测距离是 16.33 米。 在散点图上,在 100 公斤左右垂直条形中心附近。

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图像 主轴 相关知识

/p-764752910.html 主轴定义: 1)从投影角度来说,沿着主轴方向做投影,物体所得到宽度最小; 2)从统计学角度来说,主轴方向就是该物体主分量方向,以该主分量为基础做线性变换可以去掉随机向量中各元素间相关性...; 3)从纹理分析和频谱分析角度来说,对规则狭长型物体,主轴方向就是垂直于频谱图上能量最集中纹理方向。...2.3 纹理分析法 离散傅里叶变换 各方法优缺点: 1)投影法误差主要来自于做投影时候步进角度,精度和计算时间矛盾 2)主分量分析法误差主要是和待求主轴物体几何形状或者说图像点分布有关系...实际对称性越差可能计算得到主轴方法越不准确 3)纹理分析法误差物体形状也有很大关系。...所以纹理分析法适合细长型物体,物体长宽比越大,计算物体主轴方向就会越准确,反之,物体越不规则,长宽比越小,频谱图像越杂乱无章,计算出主轴方向就会存在很大误差甚至根本就提不出来。

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鲁棒激光雷达与相机标定方法

法向量矩阵中线性相关性 为了避免位姿冗余,当我们需要计算NC时,能够识别法线矩阵中线性相关性是很重要,当我们解方程(1)中RCL时,当两行或更多行在法线矩阵中接近线性相关时,逆矩阵计算变得不稳定...图5:线性相关性图示。当目标平面的法线(蓝色箭头)有足够变化时,它会勾勒出一个具有较大行列式明显平行(稳定)点,即该平行点体积。...图4:我们计算了50个选定集合平均VOQ(左图上红线),并对这些集合产生结果进行高斯(中间)建模,以获得具有不确定性估计参数。...,左侧是VLP16与相机校准结果,右侧是Baraja光谱扫描与相机标定结果,随着50组平均VOQ分数增加,场景错位、重投影误差平均值和标准偏差也随之增加,这种相关性在VLP-16和Baraja光谱扫描中都可以观察到...,标准偏差为0.4-0.5cm,整个流程需要90秒,这种方法还带来了简化校准过程额外好处,适用于任标定人员,他们只需要专注于为算法提供大量不同数据,此外,我们使用户能够定量评估所提供数据,以及待估计校准参数质量

1.1K21
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