基因组选择在育种中的应用, 其基础是常规的系谱动物模型, 动物模型也可以很复杂, 看一下asreml的说明书就知道了, 有300多页, 据我了解, 其厚度可以用这个公式表示:
?...这个教程是asreml在基因组选择和分子育种中的应用, 下面是我的读书笔记....在本文档中, 不对统计和模型做过多的介绍.
1, 单标记分析
示例数据:
ID,effect,SNP_1,SNP_100,SNP_1000,SNP_101,SNP_102,SNP_103,SNP_104...PEV会给出标记的标准误, 结果不可靠
基因型的GBLUP在.sln中, mark的效应在.mef中, 标记的权重(weight)在.mef中, 大效应的标记在.res文件中.
6, asreml基因组选择考虑...GWAS和QTL显著性位点
如果已经鉴定出大效应的SNP, 可以放在模型中, 这样模型就可以利用GWAS和QTL的信息, 提高预测的准确性.
snp(ID, 954) snp(ID,4480)
可以作为固定因子