译者序 原文于2017年6月21日发布,时过半载,将这篇既不是教程,也不是新闻的产品发布稿做了一番翻译,为何?只因去年下半年的时候,用R语言的博哥和龙少有Shiny这样的框架可以开发交互式整合Web数据分析报告,让我这个成天鼓吹用Python做数据分析的人眼馋不已。当时找了很久,试用了包括Bokeh、mpld3、Highcharts,以及键冬同学(Python中文社区专栏作者,GitHub开源项目PyEcharts作者)基于百度Echarts开发的PyEcharts,但是这些都是基于Web的交互视图库,而
Shiny是R编程语言的库,允许您在本机R中创建交互式Web应用程序,而无需使用HTML,CSS或JavaScript等Web技术。将Shiny应用程序部署到Web上的方法有很多种; 本教程使用Shiny Server在Linode上托管示例Shiny应用程序。
这个直方图在左侧有一个可以调整bins个数的滑条,当用户滑动选择bins的数目时,图表也随即产生变化,这样实现了一个交互式的过程。
R是一种流行的开源编程语言,专门用于统计计算和图形。它被统计学家广泛用于开发统计软件和执行数据分析。R的优势之一是允许用户创作和提交自己的包,因此它具有高度且易于扩展的特点。众所周知,R社区非常活跃,并且因为不断为特定研究领域添加用户生成的统计软件包而着称,这使得R适用于许多研究领域。
Shiny可以将用户的数据上传到到你的应用程序里。用户可以通过浏览器进行数据的上传,并且服务器端可以访问这些数据。 一般情况下,shiny上传的数据有文件大小有限制,一般不能超过5M。可以通过shiny.maxRequestSize选项来修改这个限制。例如,在server.R的最前面加上 options(shiny.maxRequestSize=30*1024^2),可以把文件大小限制提高到30MB。
Shiny应用程序中控件选中的值可以通过生成响应式输出来显示。用户切换控件的值,输出的文本也随着控件的值自动响应。 如下是两个小控件,分别用来展示 variable to display和Range of interest,此时选中是没有响应式输出。
在R for data science这本书中,作者提出数据分析的一个流程,在数据转换、可视化以及建模之后,来到数据分析的新阶段:与别人分享我们的数据。之前我们分享了许多单细胞数据分析的教程cellranger拆库定量、seurat质控分析,monocle轨迹推断,R语言给单细胞数据分析带来更多可能。那么,在数据分析进入下游之后,如何给自己的研究增加更多可交付的内容呢?Shiny会是一个不错的选择。
shiny包内置了11个已经写好的应用,我们可以使用runExample命令来运行。
Shiny是一个R包,允许用户将R代码转换为交互式网页。Shiny server是RStudio提供的服务器,可用于托管和管理Web上的Shiny应用程序。除了托管Shiny应用程序,Shiny Server还可以托管交互式R降价文档。Shiny Server既有免费的开源版本,也有付费专业版,包含更多功能。
在实际工作中,每个数据科学项目各不相同,但基本都遵循一定的通用流程。具体如下: 数据科学工作流程: 1.数据导入 2.数据整理 3.反复理解数据 数据可视化 数据转换 统计建模 4.作出推断(比如
PivotalR:用于读取Pivitol(Greenplum)和HAWQ数据库中的数据
在实际工作中,每个数据科学项目各不相同,但基本都遵循一定的通用流程。具体如下: 数据科学工作流程 数据导入 数据整理 反复理解数据 数据可视化 数据转换 统计建模 作出推断(比如预测) 沟通交流 自动化分析 程序开发 下面列出每个步骤最有用的一些R包: 数据导入 以下R包主要用于数据导入和保存数据 feather:一种快速,轻量级的文件格式。在R和python上都可使用 readr:实现表格数据的快速导入。中文介绍可参考这里 readxl:读取Microsoft Excel电子表
R是一种流行的开源编程语言,专门研究统计计算和图形。它广泛用于开发统计软件和执行数据分析。R社区以不断为特定研究领域添加用户生成的包而闻名,这使其适用于许多领域。
由于R语言生态系统内容繁复并在不断发展,人们往往容易忽视一些切实有用的知识。这些技巧往往非常简单,但对于完成工作有很大的帮助。
1.表单控件 1.input标记 1.input标记 提供文本输入框,密码输入框,按钮,单选按钮,多选按钮,文件上传框,隐藏域 2.属性 type:类型 根据不同的type值,创建不同的输入框 value:输入框的值 name:给输入框起个名字(必须要写) disabled:禁止 3.具体的表单type值 1.文本框 <input type="text"/> 属性: value:输入框的值 maxlength:允许输入的最大长度 readonly:只读 2.密码框 <input type="password"/> 属性: value:输入框的值 maxlength:允许输入的最大长度 readonly:只读 3.单选框 <input type="radio"/> 属性 name属性的值必须一样(必须要加) checked:选中 4.多选框 <input type="checkbox"/> 5.按钮 1.普通按钮:button <input type="button" value="普通按钮"/> value属性 2.提交按钮:submit <input type="submit" value="提交按钮"/> 3.重置按钮:reset <input type="reset" value="重置按钮"/> 6.文件上传框:file <input type="file"/> 2.<textarea></textarea>标记 1.多行文本框 2.语法 <textarea></textarea> 3.属性 name:命名 cols:代表多少列 ----输入框显示做多显示列数 rows:代表多少行 ----输入框显示做多显示行数 readonly:只读 ---- 输入框的内容无法输入 3.select下拉标记 1.语法
Rmarkdown扩展了markdown的语法,所以markdown能写的,Rmarkdown能写,后者还提供了一些新的特性,特别是图表,很nice。
写在前面,这个教程真的有点长,是我早期翻译的,如果你完全不懂Cytoscape,那么你读这些,应该会做出非常漂亮的各种基于cytoscape及插件的图,因为这个教程真的很白。 原文地址
在前面的文章中,我们介绍了如何创建用户界面。现在我们将内容转向对于 Shiny 服务端的讨论,它会让我们在运行时中使用R代码让用户界面栩栩如生。
多学一招:maxlength属性可以限制最大输入长度,为了让服务器端接收到输入的数据,表单元素都需要加name属性
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