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. | GPU计算和深度学习药物发现领域中的变革作用

Stern 和Artem Cherkasov联合课题组的Mohit Pandey发表《nature machine intelligence》的评论文章《GPU计算和深度学习药物发现领域中的变革作用...DFT计算现在是研究蛋白质-配体相互作用的常规方法。例如,最好的计算结果是蛋白质-配体相互作用能量的平均绝对误差约为2千卡\摩尔。...除了通过低温电镜加速原蛋白结构的实验表征外,最近的DeepMind和AlphaFold2方法蛋白质结构预测关键评估(CASP)挑战中取得了突破性成功,表明了DL算法蛋白质结构表征和扩展可药用蛋白质组的未来影响力...2 计算机辅助药物发现(CADD)中深度学习的出现 DL的进步,特别是计算机视觉和语言处理方面,使CADD研究人员最近对神经网络重新产生了兴趣。...Hofmarcher等人也由超过10亿个化合物的ZINC数据库上进行了基于配体的病毒筛选。与暴力方法相比,这些基于DL的方法可能在使得学术研究组和小微型工业接触到化学空间方面发挥重要作用

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EninostatHER2阳性乳腺肿瘤微环境中作用

tumor microenvironment》 发表日期和杂志:2022年发表Cancer Immunol Research上 在线阅读链接:https://doi.org/10.1158%2F2326...HER2阳性乳腺肿瘤微环境中,Entinostat可以少免疫抑制,从而增强免疫系统对肿瘤的反应。...CAF(癌相关成纤维细胞):是一种存在于肿瘤微环境中的细胞类型,它们与癌细胞相互作用,促进肿瘤生长和转移。CAF通常表达一些特定的标志物,如Col12a1和Mmp2。...它们免疫应答中起着重要的作用,包括识别和杀伤肿瘤细胞。 单核细胞/巨噬细胞:单核细胞是一类免疫细胞,它们可以分化为巨噬细胞。巨噬细胞是一种具有吞噬和清除病原体、细胞垃圾和异常细胞的能力的细胞。...它们肿瘤微环境中起着重要的免疫调节作用。 MDSCs(髓系衍生抑制性细胞):是一类免疫抑制性细胞,存在于肿瘤微环境中。它们可以抑制免疫细胞的功能,从而减弱对肿瘤的免疫反应。

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SwiftUI-数据流

Text(model.title).font(.title) Text(model.info) } } } @State 前面已经使用过多次,作用是让被它标记的属性可以...@Binding 主要有两个作用不持有数据源的情况下,任意读取。 从 @State 中获取数据应用,并保持同步。...ObservableObject 应用开发过程中,很多数据其实并不是 View 内部产生的,这些数据有可能是一些本地存储的数据,也有可能是网络请求的数据,这些数据默认是与 SwiftUI 没有依赖关系的...使用@EnvironmentObject,SwiftUI 将立即在环境中搜索正确类型的对象。如果找不到这样的对象,则应用程序将立即崩溃。...最终再次呈现给用户,等待下次界面操作 注意 SwiftUI 中,开发者只需要构建一个视图可依赖的数据源,保持数据的单向有序流转即可,其他数据和视图的状态同步问题 SwiftUI 帮你管理,所以 ViewController

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SwiftUI 的动画机制

阅读本文前,读者最好已拥有 SwiftUI 中使用动画编程的经历,或对 SwiftUI 动画的基本使用方法有一定的了解。可以 此处获取本文的全部代码[2] SwiftUI 的动画是什么?... SwiftUI 中,我们不能命令某个视图从一个位置移动到另一个位置,为了实现上述效果,我们需要声明该视图状态 A 时所处的位置以及状态 B 时所处的位置,当由状态由 A 转到 B 时,SwiftUI...同所有 SwiftUI 的视图修饰符一样,代码中所处的位置决定了修饰符的作用对象和范围。 animation 的作用对象仅限于它所在视图层次及该层次的子节点。 上面两段代码没有对错之分。..., value: V) -> some View where V : Equatable 第一种方式 SwiftUI 3.0 中已被标注弃用,它是老版本 SwiftUI 中导致动画异常的元凶之一。...NavigationView、TabView、Sheet 等部件完全找不到原生的动画控制解决手段,即使调用 UIKit( AppKit ) 代码,也只能对动画做细微的调整(比如控制动画开启)。

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深入了解 SwiftUI 5 中 ScrollView 的新功能

可以 此处[1] 获取完整的演示代码 访问我的博客 www.fatbobman.com[2] 可以获得更好的阅读体验以及最新的更新内容。...适用于作用域内的所有可滚动容器。...使用 scrollIndicatorsFlash(trigger:) 可以提供的值更改时,修饰符作用域范围内的所有可滚动容器的滚动指示器短暂闪烁。...目前定义了三种阶段状态(Phase): topLeading: 视图滑入滚动容器的可见区域 identity: 表示视图目前可见区域中 bottomTrailing: 视图滑出滚动容器的可见区域 scrollTransition...总结 我完全没有想到, SwiftUI 5 中,苹果对 ScrollView 进行了全面增强。值得赞赏的是,他们不仅提供了一些一直期待的功能,而且 API 的设计和实现完成度上都非常出色。

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北鲲云超算平台AlphaFold2对蛋白质研究中有何作用

特别是国内已经有北鲲云这类的企业和一些高校以及科研机构进行合作,北鲲云超算平台的支持下,AlphaFold2的优越性会更好地发挥出来,甚至有很多人士认为,实验结构生物学会逐渐地成为过去式,最终退出历史舞台...AlphaFold2的独到之处在于,它采用全新算法设计,这种算法和之前的方式具有很大的区别,比如在生物物理层面,该技术所采用的神经网络架构,其序列信息和氨基酸残基相互作用图谱间实现了升级,和蛋白质折叠的物理机理可以更好地进行吻合...不过,AlphaFold2的实现必须要借助于强有力的算能,目前北鲲云已经具备了为众多科研机构提供此类算能的能力。据了解,北鲲云超算平台将云计算与科研相结合方面进行了持续的探索,并取得了实质性的成果。...AlphaFold2技术快速发展的背景下,北鲲云还开始全力布局Nvidia A100 、Nvidia V100 GPU卡,为AlphaFold2应用带来强有力的硬件支持,助力该技术更好地进行应用。...无论是从方法设计的角度还是从性能的角度而言,AlphaFold2都体现了人工智能技术与生物物理思维的完美融合,北鲲云超算平台的支撑下,它成为近年来最重要的科学突破之一就不难理解了。

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视图 Body 中生存的变量

不过 ViewBuilder 却允许开发者可以通过 let 或 var 视图声明中定义常量或变量,它们具体有什么作用呢?...但很少有人会在 body 中去使用 var 来定义变量,因为实在找不到使用 var 的理由和意义。本文将探讨 SwiftUI 的视图 body 中用 var 来创建变量的意义和可能的场景。...不过就和通过 let _ = print("update") 能够帮助我们了解视图的动态一样,掌握了 body 中通过 var 创建变量及应用的方法,也将有助于开发者更好地理解 SwiftUI 视图的求值逻辑并掌握其时机...同我们不要去推断一个视图的存续期内,SwiftUI 会创建多少个该视图的实例一样,我们也不应假设,渲染第一行数据之前,body 没有被调用过。... SwiftUI 所有的惰性容器中,都会出现计算两次的情况( 或许与惰性容器的视图值保存机制有关 ),这就要求我们为了得到正确的 offset 值必须进行除 2 的操作。

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掌握 SwiftUI 的 Safe Area

UIKit 中,开发者需要利用 safeAreaInsets 或 safeAreaLayoutGuide ,才能确保将视图放置界面中的可见部分。 SwiftUI 对上述过程进行了彻底的简化。...如果一个视图可以完整地放置父视图的安全区域中,该视图的 safeAreaInsets 为 0。当视图尚未在屏幕上可见时,该视图的 safeAreaInset 也为 0 。... SwiftUI 中,开发者通常只有需要获取 StatusBar + NavBar 的高度或 HomeIndeicator + TabBar 的高度时才会使用到 safeAreaInsets 。...使用 safeAreaInset 扩展安全区域 SwiftUI 中,所有基于 UIScrollView 的组件(ScrollView、List、Form),默认情况下都会充满整个屏幕,但仍可确保我们可以安全区域内看到所有的内容...safeAreaInsetList2 遗憾的是, iOS 15 之前,SwiftUI 并没有提供调整视图安全区的手段,如果我们想通过 SwiftUI 的手段创建一个自定义 Tabbar 时,列表中最后的内容将被

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ObservableObject研究

Redux架构 该书中结合作者之前Redux、RxSwift等开发经验,提供了一个SwiftUI化的范例程序。...,SwiftUI中进行单一数据源开发是非常便利的,多数情况下执行效率、响应速度都是有基本保证的。...恶化的原因主要有以下几点: 1.对于遵循ObservableObject对象的依赖注入时机2.View的精细化3.依赖通知接口唯一性。...如果能够合理的进行设计,这些状态信息自己的小区域中完全可以很好地自我管理,自我维持。没有必要统统汇总到State中。...区域范围内来创建被维持一个小的状态,主要可以使用以下几种手段: •善用@State @State研究 这篇文章中,我们讨论了SwiftUI对于@State的优化问题。

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Ctrip·Tech——架构师一席谈(2)Zookeeper分布式应用中的作用

是不是要在标题的“作用”之前加上“重要”两个字,我犹豫了一下,zookeeper提供的功能是如此的重要,以至于如果你应用中不使用它,早晚也会在你的应用中去实现zookeeper 的功能,所以,zookeeper...在任何互联网生产应用中,哪怕你的公司规模小,访问量用一台服务器足够应付,仍然不能容忍当服务器故障时,没有备用的服务器可切换,这个称为“防止单点故障”,因为你至少要用两台服务器来防止单点故障,所以你已经“...你也许听到过,这种应用场景叫做master/slave,或者我更喜欢称为主/备模式,在这种场景下,我有两台服务器(主和备),任何情况下,只有“主”工作,“备”是主出现故障时,接替“主”来提供服务。...我们为了消除单点故障而使用的主/备模式依赖zookeeper,那么zookeeper可不能有单点故障,所以zookeeper诞生的时候,就是用集群的模式工作,用多台服务器来消除自身的单点故障隐患,怎么样...总结,多核并行计算模式下,我认定基于消息传递的actor模型(源自erlang)是正确的编程方式,actor模型下,可以简单实现基于服务层的串行操作,保证“写”操作的完整和一致。

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用AsyncAwait重建SwiftU的Redux-like状态容器

SwiftUI的状态容器 我是从王巍的SwiftUI与Combine编程[1]一书中,第一次接触到Single souce of truth式的编程思想。...1.0版本 在编写健康笔记1.0[2]时,我采用了SwiftUI与Combine编程[3]一书中提出的解决方式。 对于副作用采用从Reducer中返回Command的方式来处理。...2.0版本 通过阅读、学习Majid的文章Redux-like state container in SwiftUI[4],健康笔记[5]2.0中,我重构了Store的代码。...•使用@MainActore保证State只能在主线程被修改•dispatch创建即发即弃的Task完成副作用生命周期管理•同2.0版本类似,作用方法中返回Task...引用链接 [1] SwiftUI与Combine编程: https://objccn.io/products/ [2] 健康笔记1.0: https://www.fatbobman.com/healthnotes

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SwiftUI 视图的生命周期研究

类型树在编译后就已经固定, app 的生命周期内都不会发生变化。 视图值树 SwiftUI 中,视图是状态的函数[2]。...1 和 2 之间切换时,SwiftUI 都会重新创建两个新的实例,并且将旧的实例销毁。...) .tag(2)} SwiftUI 将只最初创建两个 ShowMessage 的实例,无论如何切换 selection,TabView 将全程只使用这两个实例。...需要注意的是,onAppear 和 onDisappear 中闭包的作用范围并非为其包裹的视图,而是其父视图,这点尤为重要!...父视图恰恰是以该视图是否影响自身的布局为依据,来调用 onAppear 和 onDisappear 内的闭包,这也是为什么这两个修饰器的作用范围是父视图而不是视图本身。

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Android 工程师开发 iOS 是怎样的体验?

= User(id: "1", name: "2") if let user = user { print(user)} // Kotlinval user: User?...= User(id = "1", name = "2") user?.also { print(it)} 虽然几乎一样简洁,但是我是用 Kotlin 一个 ?...我们先说正常的使用体验,写代码的时候,不得不说 Xcode 真的经常会抽风,高亮时不时就没有了,点击详情查看 API 定义的时候,经常出现一个大大的问号,提示找不到, 变量跳转不够智能,经常会点击跳转到另一个相同变量名的类中...同时如果你用 Xcode 写 SwiftUI 有一个很致命的 bug,就是报错信息会提示错误行,这样导致我排查错误的时候很痛苦。...同时 SwiftUI 刚刚推出,很多最佳实践都没有,大部分人都在踩坑的阶段,bug 很多,而且是无法解决的 bug,我 Github 上面开一个叫:SwiftUIBug 的库,来记录目前为止我使用 SwiftUI

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SwiftUI:“看我展示52张扑克牌,很快啊!”

思路 使用 SwiftUI 创建 UI 结构; 使用 swift 的枚举和结构体实现数据生成,通过 viewModel 整合数据用于展示(交互暂时未做,因此不涉及 MVVM 设计模式中的数据绑定)。...类属性进行遍历即可 enum Rank:Int, CaseIterable { case ace = 1 //未指定确定值的类别,默认值是“依次”加1,因此,two 的 rawValue 为2,...private var model:GameM = generateGame() //数组的泛型不能直接声明为 Card 类型,会提示找不到。需要通过结构体名点出来!...感受 swift 语法构建数据类型时比 OC 方便太多了,枚举和结构体(值类型,copy-on-write)都很强大。...SwiftUI 使用声明式方法构建 UI,代码方面简洁了很多,一套代码,三端适用(iOS,iPadOS,macOS(M1))。而且支持实时预览,大大提高了 UI 开发效率!

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解析SwiftUI布局细节(一)

前言 ---- 在前面的文章中谈了谈对SwiftUI的基本的认识,以及用我们最常见的TB+NA的方式搭建了一个很基本的场景来帮助认识了一下SwiftUI,具体的文章可以SwiftUI分类部分查找...,这篇我准备写UI的时候从SwiftUI角度我们具体的应该怎样去做,或者说是用SwiftUI我们该从什么角度去解析一个页面。...函数的,那要是我们定义TestBuilder的时候要是不定义buildBlock是不是也可以,当然是不行的,这个具体的例子中可以试试,调用的时候就会报错,告诉你没有buildBlock函数,这个函数的具体的作用...那我们就明白了,它的作用感觉类似初始化的样子,要没有它就显然是不行的。 还有上面我们调用的时候为什么要写成列的形式,能不能写成"1" "2" "3" "4" 这种形式呢?...理解了之后我们也就能总结一下我们用SwiftUI写UI时候的一个简单逻辑 1、创建好你需要的SwiftUI文件 2、规划好你的视图层级,比如说是不是嵌套的NavigationView

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SwiftUI 中布局的工作原理

2. SwiftUI 中布局的工作原理 ---- 所有的 SwiftUI 布局都有三个简单的步骤,理解这些步骤是每次获得优秀布局的关键。步骤如下: 父视图提供一个大小并询问其子视图的大小。...幕后,SwiftUI 执行第四步:尽管它将位置和大小存储为浮点数,但在渲染时,SwiftUI 会将所有像素舍入到最接近的值,这样我们的图形仍然清晰。... Project3 为什么 SwiftUI 的修饰符顺序很重要?...这些布局规则带来了两个有趣的副作用。 首先,如果视图层次结构完全是布局中立的,那么它将自动占用所有可用空间。...第二个有趣的副作用是我们前面遇到的:如果我们一个不能调整大小的图像上使用 frame(),我们会得到一个更大的 Frame,而图像内部没有改变大小。

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