很多人刚开始在 WordPress 处理时间相关的功能或者问题的时候，经常碰到一些意外的情况，这是因为对 WordPress 的一些设置和处理逻辑不熟悉造成的。...下面讲解下在 WordPress 中使用 Date 和 Time 的经验和坑： UTC 时区 在 PHP 中，我们可以使用 date 函数格式化一个时间戳，比如： echo date('Y-m-d H:...i:s', 1669043745); // 2022-11-21 23:15:45 如果我们在 WordPress 也这么使用，将会输出：2022-11-21 15:15:45，将会相差8小时，这是为什么呢...date_default_timezone_set( 'UTC' ); wp_date 那么在 WordPress 要正确基于时间戳显示当地的时间怎么办呢？...总结 一句话总结，我们在 WordPress 中可以使用 Date 和 Time 做很多事情，但是一定使用 WordPress 方式，WordPress 方式，我也总结为两条规则： 进行格式化时间戳操作的时候
Class 6#本文引用自生信技能树【知识拓展】【1.当不确定自己输入的代码是否正确时，可以用attach（）括号内填入你想使用的数据，这样当你想用a数据里面的某列名字时，可以直接用Tab打出他的名字并且不会出错如图片...】【2.当写代码时，大小写要保持一致，比如一部分要大写其他部分就一定要大写】图片【打开文件的正确方式是在Rstudio的界面的右下角工作目录里面的文件】【课堂内容】一、画图的目的是展示自己的数据！...区分color和fill两个属性都是颜色，但用法不同需要看设置颜色的形状1）空心形状和实心形状都用color设置颜色#实心的例子--一种颜色ggplot(data = iris)+ geom_point...在点图上叠加！用加号叠加函数！...()相同的部分可以放在全局的ggplot函数中，不相同的部分可以放在各自局部的函数中没有不一致的地方，可空着【局部与全局的区别，局部设置只对当前图层有效；全局设置，对所有图层有效】9. .波浪号连接！
生信技能树学习之画图 一、ggplot2与ggpubr作图时的代码之间的差异 ## ggplot2 library(ggplot2) ###用某一个包之前，最好先library()加载一下...统计变换使用场景 场景1: 使用表中数据直接做图，而不统计。...fill = Species)) + geom_boxplot()+ geom_point() ###出现的点都集中在中间，需要换函数 ggplot(data = iris...##3个函数，谁在前面，谁先出现，在最底层，就是说，先出现小提琴图，再出现箱线图，最后点图 ##这里设置的坐标如果和图片中的横纵坐标一样后边就不用翻转，coord_flip() ggplot(data...，但是保存时可以设置长宽比例及像素。
中坚力量，语法有个性，扩展性强，推荐使用library(ggplot2)ggplot(data = iris)+ geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length,...属性设置（颜色、大小、透明度、点的形状，线型等）#2.1 手动设置，需要设置为有意义的值ggplot(data = iris) + geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length...几何对象# geom_开头的函数是画图函数，画出的是一个几何对象，一个图层，图层可以叠加#局部设置和全局设置## 局部设置ggplot(data = iris) + geom_smooth(mapping...fill = Species)) + geom_boxplot()+ geom_jitter()+ theme_bw() ## 改主题，去掉灰色格子 theme_函数ggplot2语法好用的学习绘图网站...导出为ppt,全部元素都是可编辑模式library(eoffice)topptx(p,"iris_box_ggpubr.pptx")拼图画图部分的扩展学习画图代码+你的数据+你解决问题的能力=你的图画图的正确思维
ggplot2可以通过coord_flip()切换x和y轴。例如，如果你想要水平箱形图。 这对长标签也很有用：很难让它们在x轴上不重叠的情况下适合。...ggplot(data = mpg, mapping = aes(x = class, y = hwy)) + geom_boxplot() ggplot(data = mpg, mapping...= aes(x = class, y = hwy)) + geom_boxplot() + coord_flip() ?...coord_quickmap（）为地图正确设置宽高比。...coord_polar（）使用极坐标。
还是以ggplot2包内置的数据集为例进行案例演示： ggplot(mpg,aes(class,displ))+geom_boxplot() 以上是最简单的形式，一个分类变量，一个连续性数值型；我们通过添加分类变量...ggplot(diamonds,aes(cut,price,fill=color))+geom_boxplot() 接下来我们还像往常一样，通过position参数的切换来验证boxplot图表的position...参数使用规则： ggplot(diamonds,aes(cut,price,fill=color,alpha=1/30))+geom_boxplot(position="identity") #当将位置设置为不做任何变换时...ggplot(diamonds,aes(cut,price,fill=color))+geom_boxplot(position="stack") 根据经验我们就可以猜到，估计使用堆积方式来呈现多维箱线图肯定会失败...ggplot(diamonds,aes(cut,price,fill=color))+geom_boxplot(position="dodge") 果然在添加有多分类变量时，箱线图默认使用的position
绘制基本的箱线图 使用ToothGrowth数据集，dose变量为分类横坐标，对len变量做箱线图 ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot...旋转箱线图方向并设置notch ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot(notch=TRUE) + coord_flip() ?...2）修改异常点的属性 设置outlier的 color, shape and size ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot(...二 颜色设置 aes(color=)函数为每个箱线图设置一个颜色，划分箱线图之后，可以使用scale_color_*()函数自定义颜色。...三 图例，标题设置 1）设置legeng Legend是对箱线图的解释性描述，默认的位置是在画布的右侧中间位置，可以通过theme()函数修改Legend的位置 p + theme(legend.position
, y = Petal.Length))2.属性设置（颜色、大小、透明度、点的形状，线型等） 2.1 映射：按照数据框的某一列来定义图的某个属性ggplot...: mapping =在不同的geom中仅对单个图层有效ggplot(data = iris) + geom_smooth(mapping = aes(x = Sepal.Length,...: mapping =在ggplot中对所有图层有效ggplot(data = iris,mapping = aes(x = Sepal.Length,...) + stat_count(mapping = aes(x = cut))5.1 使用表中数据直接做图,不统计(统计变化使用场景1)fre = as.data.frame(table(diamonds...为统计比例6.位置关系6.1 boxplot图加散点ggplot(data = iris,mapping = aes(x = Species,
一、手动设置和映射以及区别1、手动设置：需要设置有意义的值#1）设置颜色ggplot(data = iris) + geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length..., y = Petal.Length), color = "blue")#2）十六进制颜色设置：使用snipaste软件可以直接得到颜色指标...), color = "#8dd3c7")#3）其他指标设置ggplot(data = iris) + geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length...y = Species)) + geom_violin (aes(fill=Species))+ geom_boxplot()+ geom_jitter(aes(shape=Species))ggsave...set.seed(12)#随便一个数sample(1:24,3,replace=T)3、拼图包4、代码可以运行但是不出图的原因5、找现成的代码：画图合辑（小洁老师/其他）；学习资料工作目录中6、画图的正确思维生信技能树
#2.1 手动设置，需要设置为有意义的值#手动设置颜色和点的参数，手动设置需要设为有意义的值。...不要修改内置数据，因为会忘记改过，此时重置R可以恢复，但最好还是赋值dat$Group = sample(letters[1:5],150,replace = T)##新增一列Group,replace=T时，...y = Petal.Length))#两个图用两个函数+，不想代码写两次，可以在全局写映射，把mapping=aes写进ggplot里，全局设置ggplot(data = iris,mapping =...stat_count(mapping = aes(x = cut))#统计变量函数#统计变换使用场景#5.1.不统计，数据直接做图fre = as.data.frame(table(diamonds$cut...my_comparisons#组间比较Add pairwise comparisons p-value stat_compare_means(label.y = 9) #图片保存的三种方法，后缀需要正确
ggtext的geom_richtext可以使用Markdown或者html语法来拓展ggplot2的文字图层geom_label用法。...最近在使用ggtext时，有一个需要geom_text的效果的需求，但是ggtext的图层效果都是类似于geom_label的，要想使用geom_text效果可以通过参数设置来实现。...fill、color还可以映射变量，和普通的ggplot2的geom_label类似，如果需要可以在aes函数中定义它。但是如果是映射的常量，则需要在aes函数外定义。...比如我们想实现一个label在右上角的布局，那么就可以设置x和y均是Inf，则label会出现在x和y的最大值处，在图中也就是右上角的位置，再通过hjust和vjust控制此label的中心点，即可实现注释文本永远在右上角对齐的效果...iris %>% ggplot(aes(x = Species, y = Sepal.Width, color = Species)) + geom_boxplot() ?
先后顺序 但也正和图层的叠加一样，R中ggplot 的叠加也有先后顺序，后来的图层会覆盖在原来的图层上。...))+ geom_boxplot(aes(color=Species))+ geom_point() image.png 全局与局部映射 我们可以设定整个图像中图层的参数，依靠设置 ggplot...，也可以对不同的图层进行局部设定 geom_xxx() ，这样也就实现了局部和全局的映射设置。...在使用labs 属性定义图像时，还可以使用expression 语句，生成绘图中的希腊字母、特殊符号或公式，但该包的语法比较奇怪，比如： expression(paste("Temperature ("...点图覆盖在箱线图上。后设定的图层在更靠近顶层的位置。
·映射根据数据的某一列的内容分配颜色 ·手动设置：把图形设置为1个或者n个颜色，于数据内容无关 #映射 aes() >ggplot(data = iris)+ + geom_point(mapping...)) #这两个函数效果一样geom开头是画图函数，stat开头是统计变换函数 #x=cut是将cut作为横坐标，默认统计数为纵坐标，不用写y= 统计变换使用场景 #5.1.不统计，是用表里的数据直接做图...fill = Species)) + #color=换成fill=空心变实心 geom_boxplot()+ geom_point() 图片 图片 #图一正确函数 geom_jitter() 图片...7.坐标系 #翻转coord_flip() ggplot(data = mpg, mapping = aes(x = class, y = hwy)) + geom_boxplot() +...my_comparisons)+ # Add pairwise comparisons p-value + stat_compare_means(label.y = 9) #指定标签显示的Y轴位置，可使用参数
y = Petal.Length))2.属性设置（颜色、大小、透明度、点的形状，线型等）2.1 手动设置，需要设置为有意义的值颜色：library(ggplot2)ggplot(data = iris)...aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length), color = "blue")#输入参数时，...Group ~ Species) 图片#sample(x, size, replace = FALSE, prob = NULL) #size是取几个数，replace是是否能重复取4.几何对象 ——局部设置和全局设置...ggplot内是全局设置，geom里是局部设置5.统计变换-直方图View(diamonds)table(diamonds$cut)## ## Fair Good Very Good...坐标系7.1 翻转coord_flip()ggplot(data = mpg, mapping = aes(x = class, y = hwy)) + geom_boxplot() + coord_flip
(mapping = aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length))ggplot2的特殊语法:列名不带引号,行末写加号2.2属性设置（颜色、大小、透明度、点的形状、线型等...位置ggplot(data = iris,mapping = aes(x = Species, y = Sepal.Width,fill = Species)) + geom_boxplot()+geom_point...()ggplot(data = iris,mapping = aes(x = Species, y = Sepal.Width,fill = Species)) + geom_boxplot()+geom_jitter...,fill = Species)) + geom_boxplot()+geom_jitter()+ coord_flip()theme_bw()ggplot语法总结图层的叠放顺序先写现放3.ggpubr..."iris_box_ggpubr.png")eoffice包 导出为ppt,全部元素都是可编辑模式library(eoffice)topptx(p,"iris_box_ggpubr.pptx")画图的正确思维
设置为true以绘制与样本大小成比例的框的宽度 #names：将打印在每个箱线图下的组标签 #main：用于给图表标题 2.2 简单箱线图 #内置数据集 ToothGrowth$dose <- as.factor...（） ： 使用自定义颜色 scale_color_brewer（） ： 使用 RColorBrewer 包中的调色板 scale_color_grey（） ： 使用灰色调色板 #自定义调色板 p<-ggplot...上色” #使用单色 ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot(fill='#A4A4A4', color="black")+ theme_classic...（） ： 使用灰色调色板 p<-ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len, color=dose)) + geom_boxplot() p+scale_fill_manual...+ geom_boxplot() p + scale_color_grey() + theme_classic() #使用黑白色填充 p<-ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose,
,y = Petal.Length))+ geom_smooth()+ geom_point()#这个代码和上一句代码运行结果一致，简化写法，ggplot()中设置是全局设置，对于代码中所有的geom...函数都有效，自定义可以在局部的函数中设置1.2 练习题搜索引擎搜索箱线图-boxplotggplot(iris)+ geom_boxplot(mapping = aes(x = Species,y =...怎么改变歧义：使用如下代码作图ggplot(iris,mapping = aes(x = Species,y = Sepal.Width,fill = Species))+ geom_boxplot(...「时间紧迫时使用eoffice的R包」可以用ppt编辑图片，使用门槛比ps/ai低一些。图片的每一个点、线、字都可以成为可编辑元素。...彩虹括号设置：同一对括号同一个颜色;option > code > disply > use rainbow...搭配嵌套函数使用2.5 条件和循环if条件语句if(一个逻辑值，不可以是多个逻辑值组成的向量
手动设置，需要设置为有意义的值 ggplot(data = iris) + geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length,...() ###全局设置 #5.统计变换-条形图 View(diamonds) table(diamonds$cut) ggplot(data = diamonds) + geom_bar(mapping...= aes(x = cut)) ggplot(data = diamonds) + stat_count(mapping = aes(x = cut)) #统计变换使用场景 #5.1.不统计...) p = ggplot(pdat,aes(gene,count))+ geom_boxplot(aes(fill = group))+ theme_bw() p p + facet_wrap(...~gene,scales = "free") 一些函数 # 1.match----- load("matchtest.Rdata") x y ## 如何把y的列名正确替换为x里面的ID？
本期推文就推出箱线图(boxplot)的R-ggplot2 绘制方法，大家可以和 Python-matplotlib 箱线图绘制 这篇文章对比下。 02....（2）数据可视化 R-ggplot2 绘制箱线图很简单，主要为 geom_boxplot() ,先采用默认的参数绘制 ，代码如下： plot_pir <- ggplot(data = box_data,...ggplot2 自身带有多个优秀的 主题风格(theme),下面我们结合主题并设置自定义较利于出版的灰色系颜色，代码如下： plot <- ggplot(data = box_data,aes(x...使用 theme_classic() 主题，效果如下： ? 更多主题设置，大家可以查看官网哦 。(以自己经验来说，还是直接查官网 或者 Google) 03....欢迎在文末 读者讨论 或 进群进行交流讨论
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