通过多区域全外显子组测序，利用肿瘤的生殖系杂合单核苷酸多态性，可以确定在肿瘤系统发育树的不同分枝上的不同亚克隆中是否获得或丢失相同或不同的亲本等位基因。...具体来说，如果母方等位基因在一个区域的一个亚克隆中得到或失去，而父方等位基因在另一个区域的另一个亚克隆中得到或失去，则会导致镜像亚克隆等位基因不平衡的图谱（图3A-B）。...约束和选择的例子是平行进化的出现，即单个肿瘤内不同分支的体细胞事件聚合在同一基因、蛋白复合物或通路上。本工作在突变水平上没有发现平行进化的证据。...本工作确定了795个driver事件，77个肿瘤中的219个driver为亚克隆，576个是克隆。多区域全外显子组测序比单例分析更能识别驱动因素的改变。...小编总结 本工作对100例肺癌患者进行多区域的肿瘤进行全外显子测序分析，首先发现肿瘤不同区域有瘤内异质性，然后通过构建系统发育树研究非小细胞肺癌的进化史，接下来对NSCLC瘤内异质性的起因进行分析，主要围绕突变过程是如何形成肿瘤的进化的和染色体的不稳定性可能在多大程度上驱动肿瘤内异质性进行研究分析
而单细胞基因组测序 scDNA-seq 是研究 ITH 的一种重要方法，过去在方法进行 WGS 可以用于拷贝数变异分析，但是对于突变分析需要较高的测序深度。...MPT panel 设计和测序：对外显子测序得到VAF在 0.1%~100% 的突变基因设计扩增子，最终确定 330 扩增子。然后在 Mission Bio 平台进行测序和分析。...对得到的结果进行降维聚类（UMAP）后，发现 TN4 肿瘤是多克隆的，其4141个单细胞主要分为 3个肿瘤亚克隆和1个二倍体细胞（正常细胞）（图3A），将突变的杂合性进行聚类和热图可视化后也可以明显看到每个亚克隆中的突变基因...然后基于单细胞测序得到的 SNV 和 CNV 结果构建进化树以推断时间顺序，发现肿瘤亚克隆中的躯干突变（早期）包括 TP53和NOTCH3拷贝数缺失、 DMKN 和GRIN3A染色体增加，TP53、GRIN3A...另一个局限的是，分析仅关注外显子突变位点设计 MPT panel 的，导致一定的偏差，如果能实现单细胞外显子或全基因组测序，得到的结果会更加准确。
例如，杂合性丢失的拷贝数中性事件（CNLOH）——其中一个亲本染色体区域被删除而另一个亲本染色体被扩增，使得该位点的总拷贝数不变——在癌症中很常见。...胰腺肿瘤以其这两种特征而闻名（例如，参考文献36），两名患有胰腺导管腺癌（HT270P1和HT288P1）的患者在全外显子组测序（WES）样本中的肿瘤纯度不足，无法识别CNAs。...例如，CalicoST在HT270P1的2号克隆中识别出一个独特的10号染色体（chr10）缺失，在HT288P1的1号克隆中识别出一个独特的4号染色体（chr4）缺失，以及在HT288P1的2号克隆中识别出一个独特的...例如，CalicoST 推断 HTAN 患者 HT260C1 的 13 号染色体在推断出的癌细胞克隆中总共有三个和四个拷贝，而通过 WES 数据由 HATCHet 推断的总拷贝数为五个。.../父源单倍型。
---- 角色 Prototype（抽象原型类）：它是声明克隆方法的接口，是所有具体原型类的公共父类，可以是抽象类也可以是接口，甚至还可以是具体实现类。...，即浅拷贝操作 ---- 深浅拷贝探讨 浅克隆： 在浅克隆中，如果原型对象的成员变量是值类型，将复制一份给克隆对象；如果原型对象的成员变量是引用类型，则将引用对象的地址复制一份给克隆对象，也就是说原型对象和克隆对象的成员变量指向相同的内存地址...简单来说，在浅克隆中，当对象被复制时只复制它本身和其中包含的值类型的成员变量，而引用类型的成员对象并没有复制。...在Java语言中，通过覆盖Object类的clone()方法可以实现浅克隆 深克隆： 在深克隆中，无论原型对象的成员变量是值类型还是引用类型，都将复制一份给克隆对象，深克隆将原型对象的所有引用对象也复制一份给克隆对象...简单来说，在深克隆中，除了对象本身被复制外，对象所包含的所有成员变量也将复制。 在Java语言中，如果需要实现深克隆，可以通过序列化(Serialization)等方式来实现。
在Java中原型模式非常简单，通用源码如下： public class PrototypeClass implements Cloneable{ //覆写父类Object方法 @Override...浅克隆 在浅克隆中，如果原型对象的成员变量是值类型，将复制一份给克隆对象；如果原型对象的 成员变量是引用类型，则将引用对象的地址复制一份给克隆对象，也就是说原型对象和克隆 对象的成员变量指向相同的内存地址...简单来说，在浅克隆中，当对象被复制时只复制它本 身和其中包含的值类型的成员变量，而引用类型的成员对象并没有复制。 ?...深克隆 在深克隆中，无论原型对象的成员变量是值类型还是引用类型，都将复制一份给克隆对象， 深克隆将原型对象的所有引用对象也复制一份给克隆对象。...简单来说，在深克隆中，除了对象本身被复制外，对象所包含的所有成员变量也将复制。 ?
浅拷贝和深度拷贝 为什么要克隆？ 克隆的对象可能包含一些已经修改过的属性，而new出来的对象的属性都还是初始化时候的值，所以当需要一个新的对象来保存当前对象的“状态”就靠clone方法了。...而通过clone方法赋值的对象跟原来的对象时同时独立存在的 ShallowClone 在浅克隆中，如果原型对象的成员变量是值类型，将复制一份给克隆对象；如果原型对象的成员变量是引用类型，则将引用对象的地址复制一份给克隆对象...简单来说，在浅克隆中，当对象被复制时只复制它本身和其中包含的值类型的成员变量，而引用类型的成员对象并没有复制。...System.out.println("学生2:" + stu2.getNumber() + ",地址:" + stu2.getAddr().getAdd()); } } deep copy 在深克隆中...简单来说，在深克隆中，除了对象本身被复制外，对象所包含的所有成员变量也将复制。
然后我冷静地向这个人解释说，我们可能可以在几分钟内恢复它，因为 git 中的“中央存储库”更像是一种共同协议，而不是唯一的真理来源。 那么，为什么 Google 要使用不同的东西呢？...工作副本上以“y”开头的第一个数字是变更 ID，以“3”开头的第二个数字是提交 ID，父提交有它自己的一对。我们还可以看到父提交上看起来像 master 的分支名称。...我们的工作副本没有设置描述，而父提交是一个 pull request。 如果我们开始我们自己的本地仓库并查看相同的信息，我们会在逻辑上学到更多。...这是一个稍微不同的重点——我们标记的是开始而不是结束： 所以你可以看到我们的工作副本变成了父副本，我们得到了一个新的工作副本。...我猜克隆中的波浪号表示“我们没有的历史记录”，留下圆圈表示“其他提交”。 结论 我们只看到了基本用法，但与 git 已经有很多不同之处——其中大多数是可以接受的，有些甚至很好。
背景介绍 肿瘤内异质性(ITH)和突变过程可能并不总是独立的，因为不同的突变过程可能涉及到肿瘤的不同阶段或区域，但现有的研究它们的计算方法在很大程度上忽略了这种潜在的依赖性。...PhylogicSim500 and SimClone1000数据集 结果解析 01 CloneSig联合估计ITH和突变过程 作者提出了CloneSig，一种从肿瘤样本的整体基因组测序数据中联合推断ITH和估计不同克隆中活跃的突变过程的方法...在“constant”场景下，看到CloneSig在所有分数和所有模拟器上都与最好的ITH方法(PhylogicNDT、DPClust和Ccube)相同或更好，而CciClone、TrackSig和TraccSigFreq...对于每个癌症类型至少100名患者，它显示了发现signature更改的样本比例，以及对最大亚克隆中相比克隆突变每个个体签名增加或减少的样本比例的可视化总结。...CloneSig应用于来自TCGA的8951个肿瘤的全外显子组测序数据的大队列，以及来自全基因组全癌症分析计划中的2632个全癌症肿瘤样本的泛基因组测序数据集上，获得的结果总体上与之前的研究一致。
限制性内切酶不仅在分子克隆中有着广泛应用，还可以应用于疫苗研发生产、基因测序、SNP 鉴定、ddPCR 等领域。...在往期的内容中，我们已经介绍了什么是限制性内切酶以及内切酶的分类，本期就来为大家盘点一下在使用内切酶过程中最容易出现的问题以及解决方法。...限制性内切酶的名称通常由其来源物种的分类决定，属名首字母 + 种名前两位字母 + 血清型/菌株 + 同菌株的多种限制酶流水号罗马数字。...为了方便大家理解，咱们以 Hind III 为例：▐ 问题 1：酶切不完全▐ 问题 2：酶切后 DNA 琼脂糖凝胶电泳呈弥散状▐ 问题 3：胶中条带与预期不符▐ 问题 4：克隆很少或没有▐ 问题...5：假阳性过多限制性内切酶在实验中的应用非常广泛，实验过程中会遇到的问题也多种多样。
此外，Delphi还尝试在用户的AI克隆中重新创建其大脑独特的思维过程，使AI克隆在某种程度上能够提供它认为是用户对给定提示的响应。...目前，该公司尚未限制用户在未经许可的情况下创建他们想要的任何人的克隆人的能力。...也就是说，如果有女生对前男友念念不忘，就可以利用从前的聊天记录等信息来克隆一个前任，至少还能和不在身边的「前任」进行语音沟通。...除此之外，如果从互联网中提取海量的相关数据，Delphi也允许用户克隆已故的史蒂夫·乔布斯或着仍然活着的埃隆·马斯克等名人。 据悉，Delphi甚至已经克隆了者沃伦·巴菲特供其内部使用。...而至于其他人克隆亲人、前任，或冒充名人进行欺骗或犯罪的行为，Delphi创始人承认：「我们对此没有任何防范措施，因此我们必须大规模解决这一问题。」
但当对象属性较多时，这样的克隆方式会比较麻烦，所以Object类中实现了clone方法，用于克隆对象，Java中的克隆分为浅克隆与深克隆。...Override protected Person clone() throws CloneNotSupportedException { return (Person)super.clone(); //调用父类的...值得一提的是，上文所说的浅拷贝只会克隆基本数据属性，而不会克隆引用其他对象的属性，但 String 对象又不属于基本属性，这又是为什么呢？...这是因为 String 对象是不可修改的对象，每次修改其实都是新建一个新的对象，而不是在原有的对象上修改，所以当修改 String 属性时其实是新开辟一个空间存储 String 对象，并把引用指向该内存...，而克隆出来的对象的 String 属性还是指向原有的内存地址，所以 String 对象在浅克隆中也表现得与基本属性一样。
角色 Prototype（抽象原型类）：它是声明克隆方法的接口，是所有具体原型类的公共父类，可以是抽象类也可以是接口，甚至还可以是具体实现类。...浅克隆： 在浅克隆中，如果原型对象的成员变量是值类型，将复制一份给克隆对象；如果原型对象的成员变量是引用类型，则将引用对象的地址复制一份给克隆对象，也就是说原型对象和克隆对象的成员变量指向相同的内存地址...简单来说，在浅克隆中，当对象被复制时只复制它本身和其中包含的值类型的成员变量，而引用类型的成员对象并没有复制。 在Java语言中，通过覆盖Object类的clone()方法可以实现浅克隆。...深克隆： 在深克隆中，无论原型对象的成员变量是值类型还是引用类型，都将复制一份给克隆对象，深克隆将原型对象的所有引用对象也复制一份给克隆对象。...简单来说，在深克隆中，除了对象本身被复制外，对象所包含的所有成员变量也将复制。 在Java语言中，如果需要实现深克隆，可以通过序列化(Serialization)等方式来实现。
接下来要学习的原型模式正为解决这类问题而诞生。 二、原型模式概述 在使用原型模式时，需要首先创建一个原型对象，然后再通过复制这个原型对象来创建更多同类型的对象。...原型模式的结构如图： 原型模式结构图中包含以下3个角色： Prototype（抽象原型类）：它是声明克隆方法的接口，是所有具体原型类的公共父类，可以是抽象类也可以是接口，甚至还可以是具体的实现类。...1、浅克隆 在浅克隆中，如果原型对象的成员变量是值类型，将复制一份给克隆对象；如果原型对象的成员变量是引用类型，则将引用对象的地址复制一份给克隆对象，也就是说原型对象和克隆对象的引用类型成员变量指向相同的内存地址...2、深克隆 在深克隆中无论原型对象的成员变量是值类型还是引用类型，都将复制一份都克隆对象，深克隆将原型对象的所有引用对象也复制一份给克隆对象。...序列化就是将对象写到流的过程，写到流中的对象是原有对象的一个复制品，而元对象仍然存在于内存中。 克隆流程：通过序列化将对象写到一个流中，再从流里将其 读出来，就是实现了深克隆。
因此，作者提出了一个问题：治疗后检测到的新突变是否是由于获得性抗性自发诱导的，或者，治疗前存在非常低的频率，但由于外显子测序的覆盖深度有限（平均180×）而未检测到。...对DAPI染色细胞的FACS分析显示，4个克隆持续患者在治疗前后的样本中均存在非整倍体分布，而4个克隆消失患者在治疗后存在低或无法检测到的非整倍体分布(图S1)。 ? ?...为了鉴定耐药相关克隆中的特异性CNAs，作者计算了单个细胞的一致性拷贝数分布。(4B-4E) ?...作者通过整合单细胞DNA和RNA数据集来研究化疗耐药基因的亚群是否在治疗前的单细胞中表达。 确定RNA拷贝数谱中是否存在单细胞DNA抗性克隆中的亚克隆CNAs，以将每个细胞分为抗性或敏感基因型。...该分析表明，仅在克隆消失患者的治疗前单细胞RNA数据中检测到表达突变，而克隆持续性患者在治疗前后单细胞RNA数据集中均显示表达突变。
例如，在“仪器数据采集器”的子类/对象“PDF文件数据采集器”和“Excel文件数据采集器”的创建过程中， 工厂模式下定义各子类，并由（抽象）工厂类Factory创建，因此各子类可在类定义中定义各自的属性...； 建造者模式下，通过不同的创建者类Builder创建不同的子对象，此时不再定义子类； 而原型模式下，则完全由调用者基于父对象克隆创建子对象，不在针对子对象创建类或者其相关的工厂、建造者类。...原型模式下，基于原型类对象，克隆创建新对象，因此为原型类对象赋予的属性值在新对象中可直接使用，免去了重复赋值； 例如仪器数据采集器的共同初始化工作可在原型类对象中完成，随后将其克隆出PDF文件数据采集器对象和...Excel文件数据采集器对象，并为两对象属性做后续的扩展，免去了公共属性的初始化工作； 克隆操作在内存中完成，由于对象类型的属性值存储为引用，因此克隆分浅克隆和深克隆，通过Serializable接口实现深克隆
而通过clone方法赋值的对象跟原来的对象时同时独立存在的。 如何实现克隆 先介绍一下两种不同的克隆方法，浅克隆(ShallowClone)和深克隆(DeepClone)。...浅克隆和深克隆 1、浅克隆 在浅克隆中，如果原型对象的成员变量是值类型，将复制一份给克隆对象；如果原型对象的成员变量是引用类型，则将引用对象的地址复制一份给克隆对象，也就是说原型对象和克隆对象的成员变量指向相同的内存地址...简单来说，在浅克隆中，当对象被复制时只复制它本身和其中包含的值类型的成员变量，而引用类型的成员对象并没有复制。 ? 在Java语言中，通过覆盖Object类的clone()方法可以实现浅克隆。...2、深克隆 在深克隆中，无论原型对象的成员变量是值类型还是引用类型，都将复制一份给克隆对象，深克隆将原型对象的所有引用对象也复制一份给克隆对象。...简单来说，在深克隆中，除了对象本身被复制外，对象所包含的所有成员变量也将复制。 ?
我想说的是，这并不是 Linux 上的工作原理。但是，我查阅了文档，确实有一个 posix_spawn 的系统调用基本上是这样做的，不过这不在本文的讨论范围内。...尽管在 OS X 上，人们使用 posix_spawn，而 fork 和 exec 是不提倡的，但我们将讨论的是 Linux。 Linux 中的每个进程都存在于“进程树”中。...我要做的是，创建一个子进程，这个子进程是我（me）本身的一个克隆，然后这个子进程的“脑子”被吃掉了，变成 ls。...开始是这样的： myparent |-me 然后运行 fork()，生成一个子进程，是我（me）自己的一份克隆： myparent |-me |--cloneofme 然后我让该子进程运行 exec("...可能是子进程也可能是父进程 if(pid==){ // 我现在是子进程 // “ls” 吃掉了我脑子，然后变成一个完全不一样的进程 exec(["ls"]) }elseif(pid== -1){ //
System.out.println("学生2:" + stu2.getNumber()); } } 结果： 学生1:12345 学生2:12345 学生1:12345 学生2:54321 在浅克隆中...简单来说，在浅克隆中，当对象被复制时只复制它本身和其中包含的值类型的成员变量，而引用类型的成员对象并没有复制。 ? 在Java语言中，通过覆盖Object类的clone()方法可以实现浅克隆。...).getAdd()); } } 结果： 学生1:123,地址:杭州市 学生2:123,地址:杭州市 学生1:123,地址:西湖区 学生2:123,地址:杭州市 在深克隆中...简单来说，在深克隆中，除了对象本身被复制外，对象所包含的所有成员变量也将复制。 ?...的工具类，它也提供copyProperties()方法，作用与BeanUtils的同名方法十分相似，主要的区别在于BeanUtils提供类型转换功能，即发现两个JavaBean的同名属性为不同类型时，在支持的数据类型范围内进行转换
而通过clone方法赋值的对象跟原来的对象时同时独立存在的。 如何实现克隆 先介绍一下两种不同的克隆方法，浅克隆(ShallowClone)和深克隆(DeepClone)。...参考文档：Java如何复制对象 浅克隆和深克隆 1、浅克隆 在浅克隆中，如果原型对象的成员变量是值类型，将复制一份给克隆对象；如果原型对象的成员变量是引用类型，则将引用对象的地址复制一份给克隆对象，也就是说原型对象和克隆对象的成员变量指向相同的内存地址...简单来说，在浅克隆中，当对象被复制时只复制它本身和其中包含的值类型的成员变量，而引用类型的成员对象并没有复制。 ? 在Java语言中，通过覆盖Object类的clone()方法可以实现浅克隆。...2、深克隆 在深克隆中，无论原型对象的成员变量是值类型还是引用类型，都将复制一份给克隆对象，深克隆将原型对象的所有引用对象也复制一份给克隆对象。...简单来说，在深克隆中，除了对象本身被复制外，对象所包含的所有成员变量也将复制。 ?
比如：某个工作中的项目需要包含并使用另一个项目。 也许是第三方库，或者你独立开发的，用于多个父项目的库。...子模块允许你将一个 Git 仓库作为另一个 Git 仓库的子目录。 它能让你将另一个仓库克隆到自己的项目中，同时还保持提交的独立。...而父项目以Submodule的形式包含子项目，父项目可以指定子项目header，父项目中会的提交信息包含Submodule的信息，再clone父项目的时候可以把Submodule初始化。...Git两种子仓库使用方案 git submodule git subtree git submodule(子模块) Git子模块允许我们将一个或者多个Git仓库作为另一个Git仓库的子目录，它能让你将另一个仓库克隆到自己的项目中...如果你仅仅引用了别人的子模块的游离分支,然后在主仓库修改了子仓库的代码,之后使用git submodule update拉取了最新代码,那么你在子仓库游离分支做出的修改会被覆盖掉。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
对象存储
腾讯会议
云直播
