首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

建立本地的Blast数据库

BLAST程序有以下几种: BLAST的在线版https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi可以方便的进行单一的同源性序列搜索,但是不方便进行大批量的数据操作,也不能建立自己的数据库...接下来小编就要教大家如何建立本地的BLAST数据库。 基于BLAST优秀的算法,BLAST程序可以轻松的普通的个人电脑中运行。...R 输入cmd命令,再通过cd 命令进入当前的bin 文件夹,或者直接在bin文件夹内按住shift和鼠标右键,选择在此文件夹打开命令提示符 我们通过makeblastad -help命令,查看创建本地数据库的帮助文件...可以发现需要输入文件,NCBI数据库,我们可以方便地下载我们需要的序列文件,下载后复制到bin文件夹内,方便操作。...-in 后面是空格加输入数据库文件的名称,-dbtype后面是空格加数据库类型(核苷酸是nucl,蛋白质是prot),-out后面是空格加输出数据库名称 接下来就可以拿目标序列来比对了,由于手头上没有相似的序列

6.5K91
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

MySQL数据库语法_mysql建立学生表数据库

mysql数据库基本语法 DDL操作 创建数据库 语法:create database 数据库名; 查看所有数据库 语法:show databases; 切换(使用)数据库 语法:use + 数据库名...drop database 库名; 注: (1)Delete 仅仅删除表中数据插入的记录并没有删除 (2)Truncate 删除数据和记录,相当于先drop这张表create这张表 约束 主键约束特点...:唯一性,非空性 设置主键和自动增长 主键:创建表时,在要设置为主键的字段后面 添加上主键(primary key) 自增长:创建表时,在要设置为自增长的字段后面 添加上 auto_increment...非空约束:不能为空 约束位置加上 not null 外键约束: 要基于主表的主键去创建 字段定义后 添加外键 Constraint (外键名称) foreign key(被约束的字段) references...Show tables in 数据库名 查看非当前数据库下表的数据 Select 列名 from bank.user; Where 查询条件 关系运算符:> < = !

15.2K30

本地安装并创建MySQL数据库

1.3 验证“开始”菜单打开“MySQL 8.0 Command Line Client - Unicode”,输入密码(即root),出现如下提示,即安装成功。...3 新建本地数据库首先将MySQL安装路径添加到环境变量中:右键点击“我的电脑”-“属性”-“高级”-“环境变量”-“系统 变量”-双击“Path”-添加路径-“确定”。...创建新数据库,命名为mydata:create database mydata;展示本地全部的数据库:show databases;可以看到新创建的mydata数据库。...4 连接本地数据库打开Dbeaver,文件——新建——数据库连接,数据库类型选择“MySQL”,服务器地址填localhost,端口号填3306,数据库填刚刚创建的mydata,用户名和密码均为root...“约束”中,通过新增约束建立主键:图片往该表中添加数据:图片5 启动数据库每次使用前需要启动数据库:net start MySQL88否则会出现以下报错:com.mysql.cj.jdbc.exceptions.CommunicationsException

5.6K42

MySQL数据库基础——本地文件交互

今天这一篇仅涉及MySQL本地文本文件的导入导出操作,暂不涉及主要查询语言以及MySQL与R语言和Python的交互。...平台使用Navicat Premium(当然你也可以使用MySQL自带的workbench或者MySQL Conmand line)。...以下仅涉及MySQL中使用命令行语句导入/导出本地磁盘的文本文件(csv\txt文件)。 文件导入(csv): 导入本地文件之前,请确保你的MySQL设置有本地文件导入导出权限。...导入MySQL之前,需要在指定数据库中先建立空表,以备之后导入。...是否允许为空值 自增列(可选) 默认值(可选), column2 类型(字符位数) 是否允许为空值 自增列(可选) 默认值(可选), PRIMARY KEY (column1) ); 此时MySQL

6.9K120

MySQL建立自己的哈希索引(书摘备查)

MySQL中,只有Memory存储引擎支持显式的哈希索引,但是可以按照InnoDB使用的方式模拟自己的哈希索引。这会让你得到某些哈希索引的特性,例如很大的键也只有很小的索引。...想法非常简单:标准B-Tree索引上创建一个伪哈希索引。它和真正的哈希索引不是一回事,因为它还是使用B-Tree索引进行查找。然而,它将会使用键的哈希值进行查找,而不是键自身。...你所要做的事情就是where子句中手动地定义哈希函数。 一个不错的例子就是URL查找。URL通常会导至B-Tree索引变大,因为它们非常长。...你可以手工进行维护,MySQL 5.0及以上版本中,可以使用触发器来进行维护。下面的例子显示了触发器如何在插入和更新值的时候维护url_crc列。...如果碰撞不是问题,不如进行统计并且不需要精确的结果,就可以通过where子句中使用crc32()值简化查询,并得到效率提升。

2.1K30

数据库建立

1, 我们写完计划表后开始建立数据库数据库建立不是说建立完了就可以了,到后面是需要不断地改善的,因为前期的数据我们可能列举出表时不够完整,或者表与表之间的关系链接错误,重复。...2, 随着项目的功能实现,渐渐的数据库的数据显示出不足,我们就要进行改善 1, 数据库建立要先对项目的功能有足够的理解,要熟悉项目,把项目的表列举出来,那些数据是属于那个表的,一个表里面需要获取到那些表的信息...1,把需要完成的表和表里面的信息连接出来后我们就开始建立模型,项目数据库建立之前需要在PowerDesigner把表建成物理模型, 2,物理模型的建立注意在建立的过程中,主键ID要把后面的主键和不可以为空勾上...8, 然后在数据库建立新的数据库,引入文件,执行。...9, 数据库SQL_Server执行代码时出错可以双击报错的代码,数据库就会自动帮你找到错误的代码,然后如果是dbo错误就可以删除掉错误的代码,然后再一次执行,执行成功就可以了

2.6K30

MySQL数据库建立数据库和表(命令行方式)

最近在学数据库系统概论,以前建表都是直接用workbeach,但是作为一个计算机专业的学生,我觉得能敲的时候就少点,所以分享一个自己用命令创建数据库和表的过程,希望对一些人有点用!...安装好数据库后,我们可以看到这些东西 可以这么简单的认识,划红线的是通过命令行来操作数据库,划绿线的是操作数据库的图形化界面,这里我分享的是通过命令行来操作,以《数据库系统概论》第五版第三章为例创建一个我们平时练习操作数据库所需的数据库...首先我们运行MySQL 8.0 Command,进入后需要输入密码,之后我先选择查看当前数据库中服务器中所有的数据库:show databases;(请别忘记了后面的分号) 如上这些都是系统自带的数据库...接下来创建我们需要的数据库,我创建一个存放学生-课程信息的数据库stu_cour:create database stu_cour; 接下来我们开始建表,建表前先确认我们是stu_cour数据库中建表...20) UNIQUE, /*Sname 取唯一值*/ Ssex CHAR(2), Sage SMALLINT, Sdept CHAR(20) ); 由此就完成了数据库表的建立

4.8K10

使用MySQL Workbench建立数据库建立新的表,向表中添加数据

初学数据库,记录一下所学的知识。我用的MySQL数据库,使用MySQL Workbench管理。下面简单介绍一下如何使用MySQL Workbench建立数据库建立新的表,为表添加数据。...点击上图中的“加号”图标,新建一个连接, 如上图,先输入数据库的账号密码,帐号默认为root,填好密码后 点击“OK”,连接就建立好了,建立完成后,会出现一个长方形的框框,双击它,出现下图所示页面...一下刚刚建立好的数据库mydatabase,然后再创建表,不然会出错,右键点击Tables 然后点击Create new tables ,填写表名,以及表列的信息,之后点击 apply ,一张表就建完了...Numeric Types”) 出现如下页面 接下来向建好的tb_student表中添加数据 右键点击tb_student,再点击select rows limit 1000 mysql workbench...中向数据库中的表中添加数据大致就是这个样子。

9.6K30

Python建立数据库

Python建立数据库 所谓数据库,即存储数据的仓库。每一个数据库可以存放若干个数据表,这里的数据表就是我们通常所说的二维表,分为行和列,每一行称为一条记录,每一列称为一个字段。...检查数据库是否存在 你可以通过使用“SHOW DATABASES”语句列出系统中所有数据库,检查数据库是否存在: 实例 返回系统中数据库列表: import mysql.connector mydb...= mysql.connector.connect( host = “local host”, user = “your user name”, passwd = “your pass word...mycursor = mydb.cursor( ) mycursor.execute(“SHOW DATABASES”) for x in mycursor: print(x) 或者你可以在建立连接时尝试访问数据库...: 实例 尝试连接数据库”mydatabase”: import mysql.connector mydb = mysql.connector.connect( host = “local host

2.4K20
领券