不知道各位平常有没有过需要画地图的需求，有的时候需要在地图上标出特定位置的数据表现或者一些数值，然而怎么实现？ 这里主要介绍下在R语言中绘制地图的个人琢磨的思路。...绘制地图步骤有三： 你得需要绘制地图；（约等于废话） 你得有要绘制地图的地理信息，经纬度啊，边界啊等等； 你得利用2的数据在R中画出来。...以上步骤中，目前最关键的是2，一旦2的数据有了，在R中不就是把它们连起来嘛，这个对于R来说就是调戏它，就跟全民调戏小黄鸡一样。...第一种思路：有一些R包中存储着常见地图的数据，比如maps包中存有世界地图、美国地图、美国各州郡地图、法国地图以及加拿大城市地图等，加载了这个包，就可以轻松愉快地绘制上述地图。...，如果各个包中都没有梵蒂冈的信息，那咋办啊（其实可以通过绘制世界地图，然后限制区域把梵蒂冈画出来）。而且，如果我想画中国人民大学的地图怎么办？？？
今天的推文没有详细介绍代码，代码的介绍会以视频形式放到B站，欢迎大家关注我的B站 小明的数据分析笔记本 https://space.bilibili.com/355787260 image.png 首先是示例数据的格式...画热图的数据 image.png 用来添加文本的数据 image.png 如果还有其他文本需要添加，可以再准备一份数据 image.png 加载需要用到的R包 library(ggplot2...) library(tidyverse) #install.packages("see") library(see) ggplot2 是用来作图的 tidyverse 是用来做数据整理的 see 这个包里有很多配色函数...小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记...今天推文的示例数据和代码可以在后台留言20211007获取
前面一期的教程中，我们给大家讲解了中国地图的绘制方法【科研猫·绘图】中国地图绘制：R语言版，在我们发布这篇教程后，马上有同学反映想要学习世界地图的绘制，作为实力宠粉的科研猫团队，粉丝的要求岂能不去满足。...LEVEL 1 绘制地图之前，需要获取世界地图的数据，这个数据我们通过R包maptools可以进行读取。...不过我们细心的技术在使用这个R包的过程中发现了一个原则性问题，该R包中共有246个国家的名称，其中我国的Taiwan省被列为一个独立的国家。...提醒一下大家，世界地图中包含几个大洲？ 细心地同学可能发现了，在杂志中发表的世界地图是没有南极洲的，为什么呢？...或者，有没有可能我们自己定义图中的颜色，而不要采用ggplot2已经预定义好的颜色呢？当然也可以喽。
大数据文摘出品 编译：睡不着的iris、陈同学、YYY 不知道如何在地图上可视化网络图？下面这篇博客将使用R中的igraph、ggplot2或ggraph包来介绍三种在地图上可视化网络图的方法。...除了世界地图（country_shapes）中的国家多边形以外，我们还需创建三个几何对象：使用geom_point将节点绘制为点，使用geom_text为节点添加标签；使用geom_curve将节点之间的边绘制成曲线...据我所知在ggplot2中控制线宽只能通过“size“来实现。 使用ggplot2，我们只需决定要调整哪一个几何对象的大小。...，ggplot2有一个名为ggraph的扩展包，里面包含专门用于绘制网络图的几何对象和图形属性。...在仅显示地图的某些细节，或者对边的定位点添加一些抖动时，这种方法可能会很有用。 完整的R脚本可参阅github上的gist。
作者：严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生（生物信息学方向）伪码农，R语言爱好者，爱开源 地理网络图与传统的网络图不同，当引用地理位置进行节点网络可视化时，需要将这些节点放置在地图上，然后绘制他们之间的连结...首先准备需要的R包，当需要一次性加载多个R包时，我们可以利用pacman，它整合了library包中的一些相关函数，利用pacman包中的p_load函数可以自动加载需要的R包，如果没有找到则会自动安装缺失的...))%>% rename(xend=lon,yend=lat) assert_that(nrow(edges_for_plot)==nrow(edges))# 给每个节点一个权重（weight）值，在之后的绘图中将反应在节点的大小上...mapcoords <- coord_fixed(xlim=c(-150,180), ylim=c(-55,80)) 方法一：ggplot2 除了需要世界地图（country_shape）中国家边界外...方法二：ggplot2+ggraph ggplot2有一个名叫gggraph的扩展包（点我了解更多的ggplot2扩展包）专门为网络图的绘制添加了geoms美学，它可以帮助我们对节点和连线使用单独的标度
R和ggplot可视化功能非常强大，了解了一下其中的地图做法，发现R做世界地图、美国地图非常容易，但做中国地图就太麻烦了，需要自己DIY。...DIY也有多种方式，但网络上各种帖子教程的出图效果都不太理想，达不到工作用要求。下面是我的摸索过程，记录如下备忘，也请教于R老师们。.../ 0、引子 R里有个绘制地图的maps包，加载后即可绘制地图，试一下以下命令： library(maps) map()...下面开始进入正题，如何用R绘制中国分省热力地图。 1、准备地图数据 先要找到中国地图数据文件。...加载ggplot2包，用ggplot绘制，并使用polyconic投影方式，显示正常。
今天我们来学习一下刘永鑫老师2019年发表在Nature Biotechnology上的文章NRT1.1B is associated with root microbiota composition...源代码 在作图之前我们需要准备「包含样本地理位置信息的表」，至少包含品种和经纬度。 首先我放上经过我详细注释后的代码。...函数详解 map_data() map_data()[2]是ggplot2的一个函数，用于将map包中的数据转换为适合ggplot2绘图的框架。...data：同ggplot2 stat：使用的统计转换 position：位置调整 rule：可选evenodd或winding，如果要绘制带孔的多边形，这个参数定义了如何解释孔的坐标，示例[5]。...na.rm：默认情况下（False），缺失值会被移除并警告；选择True，缺失值会被悄无声息的移除。 show.legend：默认不展示。
读取地图绘制所需的包 以下软件包均是绘制地图相关的 。...本文使用了航线频数来计算地图航线绘制的亮度。读者根据需要可以自行关联所需数据，例如成本，平均成本，旅客人次等，以达到不同的研究目的。...找到曲线数据中不连续的数据即为没有闭合的曲线 , 然后 , 将断点数据重新赋值 , 进行连接 , 得到闭合的航线曲线 . g <- rep(1, length(df[, longcol])) if...1.R语言动态图可视化：如何、创建具有精美动画的图 2.R语言生存分析可视化分析 3.Python数据可视化-seaborn Iris鸢尾花数据 4.r语言对布丰投针（蒲丰投针）实验进行模拟和动态 5....R语言生存分析数据分析可视化案例 6.r语言数据可视化分析案例：探索brfss数据数据分析 7.R语言动态可视化：制作历史全球平均温度的累积动态折线图动画gif视频图 8.R语言高维数据的主成分pca
User's Guide Algorithm Theoretical Basis Document (ATBD) General Documentation MODIS表面反射率产品提供了在没有大气散射或吸收的情况下在地面测量的表面光谱反射率的估计...低层数据经过了大气气体和气溶胶的校正。MYD09GA第6版在正弦投影的每日网格化L2G产品中提供了波段1-7，包括500米反射值和1公里观测和地理位置统计。
引言 由于最近开始使用R-ggplot2绘制一些可视化作品，也慢慢发现ggplot2绘图的方便之处，但毕竟开始于Python绘图，我们也不能落下 ? 。所以尽量实现两种语言绘制同一幅可视化作品。...本期推文也不例外，涉及的内容为地图数据，下面我们直接开始。 02. Python-matplotlib 绘制 我们使用的数据如下(部分)： ? 我们主要使用上述四个特征列进行可视化绘制。...R-ggplot2 绘制 数据为同样数据(格式符合ggplot2 绘制要求)，这里主要使用 geom_tile()和geom_text() 函数。这里我们主要解释下 geom_tile() 函数。...强大的绘图功能，省去了matplotlib 循环绘制的麻烦，直接 映射 即可。...总结 这篇推文也算是同时使用Python-matplotlib 和R-ggplot2 绘制同一幅可视化作品。至于这副图的具体用处，大家可以放置在一些世界地图上，做为另类"图例"。
在matplotlib中，bar命令用于绘制柱状图，基本用法如下在matplotlib中，bar命令用于绘制柱状图，基本用法如下在matplotlib中，bar命令用于绘制柱状图，基本用法如下在matplotlib...中，bar命令用于绘制柱状图，基本用法如下在matplotlib中，bar命令用于绘制柱状图，基本用法如下 欢迎关注”生信修炼手册”!...4. linewidth, 柱子边框的宽度，默认为0，表示没有边框 5. yerr,指定误差值的大小， 用于在柱子上添加误差线 6. ecolor, 表示errorbar color, 误差线的颜色...在单一柱状图的基础上，通过叠加可以实现以下两种柱状图 1....matplotlib并不像R包ggplot2那样，提供了一步到位的接口，而是通过叠加组合最大程度的保留了灵活性，通过一行行绘图代码的叠加来实现复杂图表。
约翰·霍普金斯大学提供了一份数据集，使用这份数据集我们可以绘制一幅气泡地图展示这些确诊患者的分布，代码比较简单： 首先导入我们需要的几个 R 包： library(ggplot2) library(sf...) library(readr) library(dplyr) 导入世界地图并把 crs 转换成 4326（其实这份数据的 crs 就是 4326）： worldmap % st_as_sf(coords = c("long", "lat"), crs = 4326) -> con_df 最后绘制地图...Novel Coronavirus (COVID-19) Cases, provided by JHU CSSE\nhttps://github.com/CSSEGISandData/COVID-19\n绘制...❝本文的附件和代码可以从知识星球下载：https://t.zsxq.com/iEYVjqr ❞
figshare.com/articles/dataset/Dueholm2021a_data_zip/16566408/1 代码链接 https://github.com/msdueholm/MiDAS4 今天的推文我们重复一下论文中的...Figure1a 世界地图 image.png 之前的推文介绍过世界地图添加采样地点 跟着Nature Communication学作图：R语言ggplot2画世界地图展示采样地点 首先是地图 我这里就不画国家的边界了...，本来是想添加每个洲的边界的，但是暂时没有找到办法，想到了再来介绍吧 library(ggplot2) world<-map_data("world") ggplot() + geom_polygon
之前在学习ggplot2中的geom_polygon()图层制作地图图形时，从来没有苦恼过投影的问题，因为coord_map()中直接给出投影转换的参数，如果要制作基于国家的地图，直接赋值为polyconic...R语言中支持GIS数据模型的包一共有两个：sp包和sf包，在旧版的ggplot2中，geom_polygon高度依赖从sp导入的数据对象（虽然也可以从sf中获取）。...但是这种情况马上会随着sf包的逐步完善以及ggplot2和sf包的进一步融合而大有改观。 最新版的ggplot2（github上面的开发版）已经内置了geom_sf()图层。...因为地图是一个不规则的椭球体，所以地理坐标系会应为观察地球的视角不同的多种多样，首先一个规范的地理坐标系是定义在一个特征椭球模型上的经纬度点，不同视角的椭球模型构成不同的地理坐标系，即在不同的视角地理坐标系下...世界地图如果需要得到椭球三维投影，需要惊醒如下几步： World_region <- st_read("D:/R/rstudy/wold_map/World_region.shp") world2 <
在这篇博客中，我将一些优秀的用户内核变成迷你教程，作为在Kaggle上发布的数据集进行绘制地图的开始。...这里，还有一些更好的资源用于使用地图、mapsdata和ggplot2： 在R中绘制地图 http://eriqande.github.io/rep-res-web/lectures/making-maps-with-R.html...使用ggplot2软件包在R中绘制地图 http://zevross.com/blog/2014/07/16/mapping-in-r-using-the-ggplot2-package/ 请注意，你目前无法在内核中使用...在大多数情况下，你不能做诸如从我们的环境中调用API的事情。 Python 地图 对于Python用户来说， matplotlib底图工具包是绘制2D地图一个好的起始。...你可以将你在这里学到的很多内容，包括地图制作、互动和动画，转移到足球场甚至是星际上。我会给你留下这些几个奖金的绘制坐标数据地图的例子： 利用martijn探索事件数据（R）。
之前联系过程中遇到的一个小技术问题，就是在ggplot2制作数据地图时，使用标度调整参数进行范围限定时，总是出现错误，版面上出现交错的线条和条带。...这样看起来必须对世界地图进行切割，而且需要切割的是美学映射参数x，y的范围（也就是坐标系统的范围）。...我们都知道在ggplot2系统中，调整X，Y的标度范围拥有布置一个的可选参数： xlim/ylim expand_limits() scale_x/y_continuous() 其实坐标轴系统中也可以嵌入标度调整参数...这次结果又失败了，不仅没有完成目标，底部还出现了一条莫名其妙的线条。...在ggplot2版面中制作数据对图，想要对版面进行有效的控制，需将标度范围的调整参数在坐标系内进行限定，否则会出现错乱，而是在限定范围的同时可能需要放弃使用空间投影（有没有更好的解决方案，目前还未知，留待以后解决
这个周末刷微信的时候，偶然看到一篇关于R语言12月更新包的介绍，翻到底部看了一眼，刚好看到一个关于ggplot2的一个图层插件——geom_scatterpie。...library(ggplot2) library(plyr) library("maptools") library(scatterpie) world_map <-readShapePoly("c:/...))) 匹配目标国家行政区划中心点： mapdata<-merge(centres,mydata,by.x="COUNTRY",by.y="FULLName",all.y=TRUE) 利用ggplot2...point, x=-160, y=-55)+ scale_fill_wsj()+ theme_nothing(legend=TRUE) 除此之外，你可以可以使用maps包内置的世界地图...两幅图带图没有太大差别，导入的shp全球地图是不带南极洲的，但是maps中的世界地图是带有的。
介绍 "fishualize"软件包提供基于自然界最令人惊叹和最丰富多彩的生物：各自美丽的鱼的颜色，以便在R中进行绘制。...对于基本R图，请使用fish（）函数生成一个调色板： pal <- fish(256, option = "Trimma_lantana") image(volcano, col = pal) pal...<- fish(10, option = "Ostracion_cubicus") image(volcano, col = pal) 该软件包还包含用于ggplot2 **绘图的色阶函数：scale_color_fish...library(ggplot2) library(rfishbase) # load data for plotting # 1\....这是世界地图上离散和连续配色方案的几个示例。
ECharts图表的零代码绘制 一般作地图可视化分析，需要懂python、R或JavaScript的网页技术，才能完成一份地图可视化，就算使用更平民化的PowerBI、Tableau，为了得到一份合格的地图可视化...一个小小的灵感，最终在EasyShu上也实现了部分自定义地图功能，且将最刚需的自定义组合和合并地图，在Excel环境上轻松能完成。...有了地图数据包的准备，普通用户也可以开展世界地图的可视化，同样的技能从中国地图平滑过渡到世界地图的绘制。...在EasyShu上，已经为这些个性化需求所考虑到，让所做出的地图可视化，没有半点的程序化生成，乃是与用户实际需求息息相关。...而一般性的数据分析汇报工作是在PPT上完成的，所以多数情况只能通过截图的方式，截取静态的图表，无法再看到更多的图表细节。
整个过程以及代码并没有太大差别，只要拿到世界地图素材，根据之前的代码，自己修改参数和指标名称以及引用路径，完全可以做出来（尽管并不一定理解每句代码的含义）。...R语言环境: R x64 3.31/Rstudio 0.99.903/ggplot2 2.1.0 代码过程： 加载功能所需支持的工具包： library(ggplot2) library(plyr)...以上的语法有几点需要提示一下： 第一、代码中带#号后的文本是R语言认可的注释语句，带运行代码的时候不必清除，可以直接跑。...第二、由于全球地图呈现的信息比较丰富，所有的海岛和群岛信息全部都会上色，特别是北欧、北美（加拿大）、大洋洲这些多岛屿、群岛低于会有大量的密集分布的小岛，而填色代码在填充时，多边形线条填充为灰色，造成很多地区边界以及岛链出现大面积黑灰色...但是通常来讲根据数据地图的填色规范： 指标都是正值，应该使用单色系连续渐变填充，只有在存在正负值类型的数据时，双色渐变才比较有意义。
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