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多组学在线分析工具

对于这样有多组学数据的情况,除了基本的单一组学的分析,也可以尝试着融合多个组学一起分析。所以,今天就介绍一个多组学分析工具。...由于是从开开始分析工具,所以第一步也就是来上传原始数据。在 OmicsAnalyst 当中主要支持五种高通量测序的数据分析。...在数据上传的同时,OmicsAnalyst 还对上传的数据进行了一些简单的处理比如:缺失值处理,低表达数据过滤,组间分析 由于也是在线工具类的,不会特别的智能,所以也一定要满足这个工具的要求。...总的来说 以上就是这个工具的主要使用过程了,OmicsAnalyst 主要还是用于对多组学的数据联合分析的时候,寻找多组学之间的联系(相关分析)或者通过聚类来寻找相关的多组学基因分型的时候可以使用。...另外,如果是单一组学的常规分析的话,可以使用[[Quickomics-表达谱数据一站式分析工具]] 最后,如果是想要 TCGA的数据库进行聚类分析的话,则可以使用[[COMSUC-在线聚类分析工具]]这个工具直接进行

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在线网站技术分析工具

Wappalyzer:在线网站技术分析工具 Wappalyzer 网站是一个可以分析不同网站所使用的各种技术的工具,对于有自身经验的网站开发者而言可以通过代码开分析网站的构架和所采用的技术,不过现在你可以通过工具来获得网站技术的参数报告了...Wappalyzer 工具致支持分析目标网站所采用的平台构架、网站环境、服务器配置环境、JavaScript框架、编程语言等参数,同时还可以显示目标站点使用该技术的网站比例,例如有多少网站使用的是Wordpress...、有多少网站使用AddThis第三方服务,其他还有网页服务器、分析工具、CDN、留言系统、控制台、网络空间等等,可以让你从使用比例中得出目前最流行的技术。...,点选就能开启Wappalyzer的网站分析功能。...2.安装完Wappalyzer 后,浏览器网址列右侧会出现一个小图示,开启你要分析、检测的网页后,点选该图示即可看到网站使用的相关技术和服务。

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GEO数据库使用教程及在线数据分析工具

GDS记录代表了一系列具有生物学和统计学意义的GEO样本,构成了GEO数据显示和分析工具套件的基础。GDS中的样本指的是同一个平台,也就是说,它们共享一组共同的探测元素。...比如你只和癌症有关的数据。输入cancer,结果就只有151个。 ? 关于GEO数据库检索就介绍到这里,我们接下来就介绍GEO在线分析工具。...二.分析工具 我们再看看GDS号检索的结果页面 ? 1.Find gene工具工具用于直接查找该数据集中该基因的表达谱数据。 我们以检索brca1基因为例 ?...与GEO的其他数据分析工具不同,GEO2R不依赖于精心设计的数据集,而是直接查询原始的系列矩阵数据文件。这使得及时分析更多的地理数据成为可能。...然而,重要的是要认识到,无论数据类型和质量如何,这个工具几乎可以访问和分析任何GEO系列。 在GSE检索结果页面就可以看到这个工具,这里以GSE49382为例, ?

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微博话题在线分析工具

微博话题在线分析和评论在线分析类似,所不同的是,它支持从本地上传文件进行分析。 在上方 DataSelect 上传好文件后,下方 DataShow 实时展示分析结果。...下方 DataShow 第一个 Tab 是原始数据展示,后面的 Tab 就是分析的结果,包括趋势分析、情感分析、词云生成等诸多功能。基本和评论类似。...趋势分析可以按照月、天、小时、分钟维度进行实时可视化,除了发布微博数趋势,新加入了情感分析均值趋势。...属地分析 Tab 只对上传的 CSV 文件包括 location 字段有效,如果上传的 CSV 文件中不包含 location 字段,无法分析属地。...其他的 Tab 基本和 微博评论在线分析 类似,不再赘述~ 页面地址为: https://weibo-crawl-visual.buyixiao.xyz/topic-weibo-visual

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webgestalt:基因富集分析在线工具

在组学数据分析中,基因富集分析是最常用的方法之一,所有的基因数据分析最终都要落实到功能上去,富集分析作为一种最基础的功能研究方法,通过go, kegg pathway等不同的基因功能注释数据库,再结合对应的富集分析算法...富集分析的必要性和重要性不言而喻,有很多的成熟的软件可以来进行这样的分析,比如clusterProfiler, GSEA等等,然而这些工具的使用还是具备一定的门槛,对于没有编程经验的生物学家而言通过这些软件得到富集分析的结果并不是一件容易的事情...为了方便广大科研工作者进行富集分析,有很多的在线工具被开发出来,其操作简便,更易上手,最著名的当属DAVID这个网站了,有接近4000次的引用。...webgestalt是一个专注于富集分析在线网站,支持多种富集分析算法,而且涵盖的功能注释数据库较为全面,在今年5月份刚刚升级了版本,对数据库进行了更新。...不同富集算法和数据库,结果展示也不尽相同,但是基本的表格数据, 柱状图,GSEA的富集图片等结果都是有的,几种常见的结果示意如下 1. 富集分析的表格 ? 2. 富集分析的柱状图 ? 3.

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在线工具

图片 在线工具地址 之前学习的时候,都会看到网络上一些在线工具的网站,比如获取时间戳,编码转化,正则表达式等等,这些对于一些初学者在电脑上没有安装相对应的工具,往往就会百度搜索在线工具,然后就能实现自己所要完成的目的...这些工具很是方便,或多或少都会用到。但一些在线工具并不能满足我日常开发中的个别需求,于是乎我也准备自己写一个这样的在线工具网站。...不做代码分析与演示,可自行在网站上测试与 clone 源码进行查看。...网站实现​ 上面所介绍的都是作为一个工具库的功能,我只是将其封装成一个在线工具使用,并非主要重点。而主要是对一些网站的功能实现,例如复制与下载等等。...最主要还是希望能成为我日常开发中常用的在线工具类,而不是简简单单 Demo 学习。

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metascape: 最强大的基因富集分析在线工具

metascape是一个web工具,提供了基因富集分析,蛋白质互作网络分析等多种功能,对应的文章发表在nature communications上, 链接如下 https://www.nature.com...并且提供了多样化的可视化方式,对于生物学家而言,通过该网站可以轻松的对基因功能进行探索和分析,目前已有451篇文章引用了该工具,其可视化方式如下所示 1. circos plot ?...如上图所示,利用这些功能注释的数据库,主要进行以下几种分析 ID Conversion Gene Annotation Enrichment Analysis Interaction Network...富集分析的柱状图 默认使用GO, KEGG, Reactome, CORUM等多个数据库进行富集分析,结果如下所示 ? 用柱状图的形式展示top15个显著富集的terms, 示意如下 ?...metascape集成的数据库最多,而且更新的也非常及时。通过自定义分析,可以实现多个数据库的功能分析。该数据库目前支持人,小鼠,大鼠等10个物种的基因分析,是一个非常强大的基因功能分析工具

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数据在线导出工具:Adminer

数据在线导出工具:Adminer Adminer是一个类似PhpMyAdmin的MySQL客户端的“页面PHP”,它只有一个PHP文件,包括:数据库的普通和函数操作等功能,是一个强大的类似型webShell...工具 使用方法: GitHUB:https://www.github.com/vrana/adminer/releases 将文件下载上传到目标服务器,成功上传后可以通过URL直接访问~ 管理权限: 利用...adminer.php上传到目标服务器后,通过URL访问该页面即可获得服务器当前数据库用户登录权限~ ?...成功访问了但是没有数据库的用户密码,也是没啥大作用的 不过我们可以通过其它方式获得数据库的登录凭证等信息~ ? 由此~就进去了!...由此我们就可以将一个数据库进行导出操作了 如果你想,甚至可以利用php文件对数据库进行删库跑路的作死操作

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LinkedOmics在线工具

今天给大家介绍一个闻着伤心听着落泪的网站,分析TCGA数据工具这么多,我只服这一个,让人不得不感叹,做肿瘤真好!...注册后登录打开界面是这样的: 整个分析一共包括五步: (1)选择肿瘤类型,一共收录了32个癌种的各个类型的数据,比如我们选择肝癌LIHC: (2)选择数据类型,我们可以看到数据的类型有microRNA...,SNP,甲基化,临床数据和突变,我们先演示microRNA的,所以选第一个: 第二步里面还有一个可选项目:样本类型,可以进一步对样本根据分子分型、分期等数据进行分析,打开是这样的: 可以进一步选择...(5)选择统计方法,一般会给出几个选项,比如这个: 选好后接下来就是分析了, 我们看一下: 单击View按钮: 就可以看到hsa-mir-125a与临床信息的关系了,比如生存分析、TNM分期、种族等...: 当然,在第四步我们选择靶数据类型的时候,我们可以换成其它的数据,比如RNAseq的数据,我们来找一下hsa-mir-125a的靶基因: 统计方法我们选个spearman相关性分析: 提交后查看数据是这样的

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在线ps工具

随着互联网技术的发展,越来越多的工具可以在线使用,其中在线PS工具也受到了广泛欢迎。它不仅方便快捷,而且功能强大,让许多人在没有安装PS软件的情况下也能够进行图片处理。...在线使用:https://ps.gitapp.cn在线PS工具具有多种功能,可以满足用户不同的需求。首先,它可以进行照片修复,可以轻松消除照片中的瑕疪,使照片更加完美。...在线PS工具的实际应用价值也非常高。...总之,在线PS工具是一种非常实用的工具,它可以消除照片中的瑕疪、改变图像的颜色、亮度等,还可以添加水印、支持多人协作等。它具有多种功能、方便快捷、用户体验良好等优点,在实际应用中具有很高的价值。...如果你还没有使用过在线PS工具,不妨试试看,相信它会给你带来许多惊喜。

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分享一款JVM线程堆栈在线分析工具

如题所述,今天与大家分享的是如何分析JVM的线程堆栈以及如何从堆栈信息中找出问题。线程堆栈分析尽管不是初学者一门必备的技术,但是对于自身走向高程来说应该是必备的傍身技能。...java.lang.Thread.State: BLOCKED (on object monitor)可以快速的了解到线程状态极其当前阻塞的可能原因 – Java线程栈跟踪;这是目前为止你能从线程堆栈中找到的最重要的数据...这也是你花费最多分析时间的地方,因为Java栈跟踪向提供了你将会在稍后的练习环节了解到的导致诸多类型的问题的根本原因,所需要的90%的信息。...grep tomcat8_itstyle 导出堆栈信息,查询进程PID为8564 jstack -l 8564 > 8564.stack 下载8564.stack并打包为zip格式上传到GCeasy,生成分析报告如下...吃不吃精,喜不喜欢,界面话报告分析,总有一项让你喜欢。

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分享一款JVM线程堆栈在线分析工具

如题所述,今天与大家分享的是如何分析JVM的线程堆栈以及如何从堆栈信息中找出问题。线程堆栈分析尽管不是初学者一门必备的技术,但是对于自身走向高程来说应该是必备的傍身技能。...java.lang.Thread.State: BLOCKED (on object monitor)可以快速的了解到线程状态极其当前阻塞的可能原因 – Java线程栈跟踪;这是目前为止你能从线程堆栈中找到的最重要的数据...这也是你花费最多分析时间的地方,因为Java栈跟踪向提供了你将会在稍后的练习环节了解到的导致诸多类型的问题的根本原因,所需要的90%的信息。...grep tomcat8_itstyle 导出堆栈信息,查询进程PID为8564 jstack -l 8564 > 8564.stack 下载8564.stack并打包为zip格式上传到GCeasy,生成分析报告如下...: 1.png 吃不吃精,喜不喜欢,界面话报告分析,总有一项让你喜欢。

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【性能分析】大数据分析工具

数据是一个含义广泛的术语,是指数据集,如此庞大而复杂的,他们需要专门设计的硬件和软件工具进行处理。该数据集通常是万亿或EB的大小。...在大数据和大数据分析,他们对企业的影响有一个兴趣高涨。大数据分析是研究大量的数据的过程中寻找模式,相关性和其他有用的信息,可以帮助企业更好地适应变化,并做出更明智的决策。...Storm有许多应用领域:实时分析在线机器学习、不停顿的计算、分布式RPC(远过程调用协议,一种通过网络从远程计算机程序上请求服务)、 ETL(Extraction-Transformation-Loading...该项目将会创建出开源版本的谷歌Dremel Hadoop工具(谷歌使用该工具来为Hadoop数据分析工具的互联网应用提速)。...“Drill”项目其实也是从谷歌的Dremel项目中获得灵感:该项目帮助谷歌实现海量数据集的分析处理,包括分析抓取Web文档、跟踪安装在Android Market上的应用程序数据分析垃圾邮件、分析谷歌分布式构建系统上的测试结果等等

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不会编程的同学看过来:新的GEO数据在线分析工具——BART

尽管前期我们介绍GEO数据库的时候,讲解了一下在线分析工具(GEO数据库使用教程及在线数据分析工具),今天给大家带来的是一个专门针对GEO数据分析的综合在线工具(BART)的使用,此工具最近发表在BMC...Bioinformatics上,是一个从CELL或expression表达矩阵输入到可视化分析、富集分析的综合分析平台。...此平台有在线版和本地版两种 本地版:https://bitbucket.org/Luisa_amaral/bart 在线版:http://igc1.salk.edu:3838/bart/ 文章名:BART...该工具包括GEO数据分析的批次效应矫正、差异分析、火山图、聚类图、PCA图、富集分析分析速度快:作者亲测过网页版分析速度,基本10s内出结果操作简单,交互逻辑清楚,容易上手。...该工作平台的总流程图如下图所示,依次流程为: 数据输入→分组和批次→标准化→差异分析→富集分析。 ? ? ? ? ?

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Python工具分析风险数据

小安前言 随着网络安全信息数据大规模的增长,应用数据分析技术进行网络安全分析成为业界研究热点,小安在这次小讲堂中带大家用Python工具对风险数据作简单分析,主要是分析蜜罐日志数据,来看看一般大家都使用代理...数据分析工具介绍 工欲善其事,必先利其器,在此小安向大家介绍一些Python数据分析的“神兵利器“。...Python中著名的数据分析库Panda Pandas库是基于NumPy 的一种工具,该工具是为了解决数据分析任务而创建,也是围绕着 Series 和 DataFrame 两个核心数据结构展开的,其中Series...我们有了这些“神兵利器“在手,下面小安将带大家用Python这些工具对蜜罐代理数据作一个走马观花式的分析介绍。 1 引入工具–加载数据分析包 启动IPython notebook,加载运行环境: ?...当然了用Pandas提供的IO工具你也可以将大文件分块读取,再此小安测试了一下性能,完整加载约21530000万条数据也大概只需要90秒左右,性能还是相当不错。

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在线 Python运行工具

摘要 昨天心血来潮,做了一个在线的PHP编辑工具 http://blog.csdn.net/marksinoberg/article/details/53869637 ,可以方便的练习PHP的基本语法...,以及数据库的操作。...结尾说可能会做一个Python版的在线编辑工具,那么说到做到。今天就写了个Python版的,供身边的同学以及初学者练习和使用。 准备 看过昨天的那篇博客的应该不难理解,这个工具背后的工作原理。...DOCTYPE html> 郭璞 的在线Python工具 <link rel="shortcut...简要测试 此<em>在线</em>编辑<em>工具</em>可以方便的进行Python脚本的编写。只要是符合正规的Python语法的,都是可以的。 运行等待 当编写的Python脚本比较的耗时的时候,前台需要给出提示信息,并进行等待。

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