首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

Linux服务器里面安装GISTIC软件

五六年前我就写过GISTIC软件的安装及使用教程,不过那个时候针对的还是SNP6.0这样的拷贝数芯片。...GISTIC这个软件TCGA计划里面被频繁使用者,用这个软件的目的很简单,就是你研究了很多癌症样本,通过芯片或者肿瘤外显子测序+得到了每个样本的拷贝数变化信息,一般是segment结果,可以解释为CNV...GISTIC软件的使用有两个难点,一是linux下面安装matlab工作环境,二是如何制作输入文件。...但是考虑到大多研究者用不起matlab,或者不会用,所以就用linux系统里面安装matlab运行环境来解决这个问题,我们仍然可以把人家写的matlab程序,linux命令行下面,当做一个脚本来运行!...我们前面下载的GISTIC软件离线包里面是有一个 MCR_Installer 文件夹,里面就有 MCR_Installer压缩包可以解压然后安装。

1.8K51
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

Scala里面如何使用元组

元组Scala语言中是一种十分重要的数据结构,类似数据库里面的一行记录(row),它可以将不同类型的值组合成一个对象,实际应用中十分广泛。...www.cakesolutions.net/teamblogs/ways-to-pattern-match-generic-types-in-scala 例子(3): 变量绑定模式 注意普通的类不能直接使用上面的模式匹配...例子(4): for循环的使用元组进行的模式匹配 结果: 最后我们使用元组,来模拟一个类似下面的SQL的例子: 表(pet)结构: 统计SQL语句: Scala完整代码如下: 其实,核心代码只有中间的这一部分...对里面的valueList进行各种运算,得出来我们 需要的结果后,最终再以Map的数据结构返回,因为Map本身是没法排序的,所以我们得先需要转成Seq类型,最后再执行sortWith方法对value里面的最大次数进行降序排...总结: 本篇主要介绍了tuple几种常见的应用场景,通过使用tuple数据结构配合上scala强大的函数方法,我们可以轻松愉快的处理的各种数据集,感兴趣的小伙伴可以自己尝试一下。

79040

Scala里面如何使用正则处理数据

正则在任何一门编程语言中,都是必不可少的一个模块,使用它来处理文本是非常方便的,尤其处理使用Spark处理大数据的时候,做ETL需要各种清洗,判断,会了正则之后,我们可以非常轻松的面对各种复杂的处理...,Scala里面的正则也比Java简化了许多,使用起来也比较简单,下面通过几个例子来展示下其用法: /** * Created by QinDongLiang on 2017/1/5....var str2="foo123bar" println(letters.replaceAllIn(str2,"spark"))//spark123spark //例子七使用正则查询和替换使用一个函数...#123##bar println(exp.replaceAllIn(str8,m=>(m.group(1).toInt *2).toString))//foo246bar //例子九使用正则提取值进入一个变量里面...02" val pattern(year,month)=myString println(year)//2016 println(month)//02 //例子十case

90350

判断虚拟机服务器使用的是那些虚拟化技术

众所周知,常用的虚拟化技术有kvm、XEN,Openvz 还有VMware,如果想知道虚拟机采用的是那些技术,该如何判断呢 常规检测方法 1、通过系统上的相关目录或文件判断 执行:ls /proc/...2、执行:uname -a 有些xen的VPS里面会显示有xen。 3、free -m 看内存,openvz的没有swap,当然也有xen的没有swap,但是xen的是可以加的,openvz不行。...virt-what工具 使用专门的软件来判断:virt-what是一个判断当前环境所使用的虚拟技术的脚本,常见的虚拟技术基本上都能正常识别出来。.../configure make && make install 检测命令 # virt-what 就会判断出当前环境所使用的虚拟技术,我这里是本地vmware虚拟的!...实测,某里,腾讯,亚马逊都是kvm虚拟技术。

6.5K20

使用JCloudsJava中获取和发布服务器

本文中,我们举例来说明如何使用JClouds API 获取和发布服务器。...JClouds API 可以和大量服务提供商(包括Amazon EC2和Rackspace)协同工作并且允许使用Java代码执行大量操作。...下面我们以Rackspace所提供的服务为例进行说明。 首先为JClouds获取jar。如果您使用的是Maven,依赖关系如下所示。操作之前,请先检查版本是否需要更新。...接下来写一个获取服务的功能,其中主要的参数如下: groupName:如果要获取多个服务器,则所有服务器都需要以groupName作为前缀,以便识别和分类。...OS:操作系统的名称 osVersion:操作系统的版本 RAM:RAM的大小 count:所需的服务器数量 /** * 通过指定参数获取服务器 * @param groupName * @param

6.3K100

使用JCloudsJava中获取和发布服务器

本文中,我们举例来说明如何使用JClouds API 获取和发布服务器。...JClouds API 可以和大量服务提供商(包括Amazon EC2和Rackspace)协同工作并且允许使用Java代码执行大量操作。...下面我们以Rackspace所提供的服务为例进行说明。 首先为JClouds获取jar。如果您使用的是Maven,依赖关系如下所示。操作之前,请先检查版本是否需要更新。...接下来写一个获取服务的功能,其中主要的参数如下: groupName:如果要获取多个服务器,则所有服务器都需要以groupName作为前缀,以便识别和分类。...OS:操作系统的名称 osVersion:操作系统的版本 RAM:RAM的大小 count:所需的服务器数量 /** * 通过指定参数获取服务器 * @param groupName * @param

2.3K90

虚拟机上安装使用LoadRunner教程

记录一下我的安装LoadRunner11血泪史 1.LoadRunner11win10上使用总是出问题,后来看到只能在win7在用,还需要IE8,就在VMware 建了个win7镜像,msdn上下了...VMware Tools为灰色时,需要将设置下CD/DVD和软盘改为使用物体驱动器。...6.下载完之后解压,有个VMware-tools-windows-11.0.0-14549434.iso,还是虚拟机–>设置下把CD/DVD选择 使用ISO映像文件,浏览至解压好的VMware-tools-windows...PS:另附上LR录制时经常事件或action里面代码是空值的解决办法 如下: 1、修改录制设置Start Recording,选择Options 2、打开后,找到Network->Port...Mapping,修改Capture level选项,里面有3个选项: socket level data:VuGen将捕获HTTP、SMTP、POP3、IMAP、OracleNCA和WinSocket协议

1.1K30

硬盘挂载后怎么使用服务器挂载硬盘方法是怎样的?

硬盘指的是能够存储数据的设备,它可以进行弹性扩展,是一种分布式架构的设备,大家使用硬盘的时候,需要先进行挂载,下面就来具体介绍一下硬盘挂载后怎么使用以及服务器挂载硬盘方法是怎样的等问题。...硬盘可以挂载到同一个可用区里面的任何服务器上面,服务器一般支持挂载多个数据盘,硬盘挂载后的使用方法很简单,先选择需要挂载的电脑IP,挂载成功后,就可以连接电脑查看硬盘了, 但是要注意的是...,只有电脑和硬盘在同一个区域内才能挂载使用,如果不在同一个区域,是不能挂载使用的,大家可以直接上传需要的数据资料到硬盘里面就可以了,操作起来很方便。...服务器挂载硬盘方法是怎样的? 开启新的服务器的时候,可以指定对应的自定义数据盘快照和镜像。...硬盘挂载后怎么使用?以上就给大家介绍了关于硬盘挂载后的使用方法,大家具体操作的时候,就可以参考上面的方法去做,同时还可以了解下硬盘挂载的方法。

12.2K10

使用 Uno Islands 现有 WPF 里面嵌入 Uno 框架

通过 Uno Islands 技术,可以 WPF 里面划某个矩形范围,让这个范围内的内容使用 Uno 框架进行绘制和交互。...为了方便演示,接下来新建一个空白的 WPF 项目,在这个空白的 WPF 项目里面主窗口同时放一个 WPF 的控件和一个用来承载 Uno 框架的 UnoXamlHost 控件,以及新建一个共享项目,共享项目里面存放...TestUnoIslands/TestUnoIslands 从我的测试代码仓库里面拷贝代码文件的方式可以快速拷贝出一个使用 Uno 框架的项目,这些代码逻辑和官方的例子 代码接近相同。...这里的共享项目可以认为是一个现有的使用 Uno 框架的项目,接下来就是刚才创建的 WPF 项目里面,嵌入这个 Uno 项目的内容 刚才新建的 WPF 项目里面,添加共享项目的引用,引用刚才创建的共享项目..." 这是一句话的命名空间引用,官方的文档里面为了格式化,文档里面换了行 通过添加 Uno Island 即可进行对 Uno 项目的嵌入,添加的代码如下 <xamlHost:UnoXamlHost InitialTypeName

56230

服务器上部署Laravel

学习PHP和Laravel已经有一段时间了,但是所有的代码都是跑本地的虚拟主机上的,于是去腾讯申请了一个月的免费主机,想把项目部署到服务器上。...不得不说这里面的坑实在是有点多,让我这个初次接触服务器的小白摸不清头脑。配置好服务器之后,部署一个Laravel项目更是费劲心思,于是乎想记录下部署Laravel项目的过程。...Nginx之后,要重启nginx sudo service nginx start 执行完之后,浏览器输入服务器分配给你的公网ip,就可以看到welcome to nginx的界面了 2....下面一步一步服务器上部署Laravel 1.创建网站的根目录 sudo mkdir -p /var/www 2.配置nginx服务器 sudo vim /etc/nginx/sites-available...流程大概是这样: 本地代码---->Github---->服务器 既然要使用git,那么先在服务器上安装git: sudo apt-get install git 安装完成就可以使用git了,然后

8.5K80

将 Hexo 部署服务器

将 Hexo 部署服务器 前言 众所周知,使用 GitHub Page 的访问速度令人发指,当然也有很多人选择部署到 Vercel,这便是我之前的选择,免费,同时还有着更快的速度。...但说到底,服务器往往是更好的选择,只要钱到位 。 使用宝塔面板可以比较方便快速的进行部署,不过我更想自己实际动手操作,也一边学习 Linux,就不使用了。...阅读本文之前,你需要做好以下准备: 一台服务器 域名以及域名解析服务 服务器 推荐腾讯,作为服务的大厂还是非常靠谱的,唯一制约我们操作的就是昂贵的价格了。...SSH 连接到服务器 打开任意一个终端,使用 SSH 连接到服务器 ssh username@你的服务器公网ip 一般用户名是 root ,之后输入密码即可。...注意:这里用服务器的 80 端口,使用 http 访问,如果需要 https 访问,还需要 SSL 证书 参考资料 hexo 搭建在阿里服务器上(Ubuntu 20.04) 阿里 ECS 初体验(

5.1K30

使用 Vagrant VirtualBox 安装 Linux 虚拟机

GreatSQL社区原创内容未经授权不得随意使用,转载请联系小编并注明来源。 1. 导入 本文介绍如何使用 Vagrant VirtualBox 中快速安装 Linux 虚拟机。...开始是由德国Innotek 发,由Sun公司出品的软件,Sun被Oracle收购后正式更名成Oracle VM VirtualBox Vagrant:Vagrant是一个可以使用Oracle的开源VirtualBox...可以访问镜像仓库:(https://app.vagrantup.com/boxes/search),如下图: image.png 3.通过Vagrant为VirtualBox安装CentOS 7 使用工具之前...此外,启动虚拟环境的同时Vagrant为我们创建了SSH连接,因此我们不仅可以直接通过VirtualBox操作虚拟系统,也可以通过SSH连接来操作虚拟系统,默认使用的是Vagrant为我们提供的账号:...Vagrant,所以可以通过这种连接方式以Vagrant的账户连接虚拟系统,命令如下: vagrant ssh 4.总结 今天介绍了使用VagrantVirtualBox中快速安装Linux虚拟机

54640

虚拟机里面安装软件,一般使用的一些命令

18 查询是否存在表 19 查询oracle字符集编码 20 更改编码 21 当前情况 21 查看虚拟机内存状态 (DESCRIPTION_LIST = (DESCRIPTION =...查看当前数据库连接用户 5.2 Linux下Oracle表空间及用户创建 1、创建临时表空间 select name from v$tempfile;查出当前数据库临时表空间,下面创建临时表空间会使用里面的存放路径...unlimited; 出现以下这个就是创建成功 Tablespace created 2、创建表空间 select name from v$datafile;查询出当前数据库表空间,下面创建表空间会使用里面的路径...操作系统中要取得与数据库的联系,必须使用数据库实例名。...free -h 启动oracle 和 管理界面项目,使用内存情况 启动vnc 之后内存使用情况

1.6K30

服务器怎么备案 服务器选择时要注意什么

很多人在进行个人网站创立的时候,完成了前面很多复杂繁琐的工作,但是到了最后一步进行服务器备案的时候,不知道该如何操作,那么关于服务器怎么备案,这究竟应该怎么做呢?...同时挑选服务器时应该注意什么? 服务器怎么备案 服务器怎么备案?其实关于服务器的备案步骤也相对来讲不复杂。...用户登录服务器所租用或购买的官网,然后打开服务器的控制面板,里边会有备案功能的选项,点击备案功能选项之后,提交备案所需要的相关材料就可以完成资料的填写,最后检查无误之后直接提交等待审核就可以了,一般...服务器选择时要注意什么 关于服务器的选择,一定要去选择那些大型靠谱的服务器租赁运营商,因为很多小型的服务器租赁平台虽然价格有一定的优势,但是他们在后期服务以及质量保障上非常不好,同时他们的服务器质量也容易出现各种各样的问题...以上就是关于服务器怎么备案,以及选择服务器时要注意什么的相关内容,关于服务器要想了解更多也可以上网自行搜索。

8.8K20

如何连接服务器 使用服务器具有哪些好处

互联网的推动下,各行各业已经衍生了多种产品与技术。服务器的出现帮助人们解决了文件存储以及内存小等问题,但是服务器是一种新鲜事物。人们还不是很熟悉它的使用方法,接下来一起了解下如何连接服务器。...如何连接服务器 如何连接服务器是人们购买服务器之后肯定会咨询商家的高频率问题,服务器连接方式可以分为ssh协议、远程桌面连接以及控制台连接三种方式,人们只需要掌握其中的一种方法就可以。...对于ssh协议连接是应该注意用户创建新用户名并禁止使用root SSH登录,就可以轻松连接服务器。控制台连接方式是连接服务器比较好的方法,不需要浏览扩展与设置,操作方式简单。...使用服务器具有哪些好处 服务器具有灵活性、可控性、扩展性以及资源复用性的优势,灵活性是指用户不需要购买服务器可以选择租赁,价格相对便宜,而且不需要用户对计算的设备进行控制,但是这并不会影响服务器的正常使用...可控性就是用户对个人的服务器具有绝对的使用权,不受制于人何的限制。当发现服务器的内存不够使用的时候,可以随时升级内存,便于使用。人们也可以及时整理服务器的内容,便于空间地重复使用

21.5K20

腾讯服务器上搭建Discuz!

一.前提条件 1.需要一台服务器,可以是轻量可以是服务器 3.脑子(如果没有脑子下文有视频教程) Linux安装条件 1.ssh软件 如FinalShell 2.Discuz源码,Discuz...二.轻量应用服务器便捷安装 1打开腾讯控制台-选择轻量应用服务器-点击更多(如图) image.png 点击重装系统 image.png 按照下图操作 image.png 等待安装完成(强调一点如果是香港机器无视此话...后台地址和登录密码 用户名默认admin image.png 点击登录 image.png 输入管理员登录密码,即可看到DZ后台用户名和密码 image.png 进入后台即可 image.png 3.服务器...28615082 image.png 安装完成,获得信息,并进入宝塔面板管理网站 image.png 绑定手机号 image.png 2.配置宝塔 进入后选择LNMP,等待安装完成,这个期间可以下载源码,源码片头官网下载...视频内容 2.服务器安装DZ 视频内容

41K183

「R」showtext:R图里面更简单地使用字体

如何修改画图使用的字体[1]这篇文章中,我介绍了一种解决R图里字体的方案——extrafont包。今天意外看到另一个解决字体问题的包,再次推荐和介绍一番。...showtext帮助用户图中更好地使用多种类型字体,包括TrueType、OpenType等。...该包主要尝试做以下两件事情: 让R知道这些字体 让这些字体绘制文本 该包的动力在于R图中使用非标准字体不方便,比如中文字体。...用法 分为以下几步: 载入字体 打开绘图设备 声明你想要使用showtext画文本图 画图 关闭画图设备 If you want to use showtext globally, you can call...image 更多例子和用法查看说明文档https://github.com/yixuan/showtext ---- 从使用上看,我更喜欢这个包~ 参考资料 [1]如何修改画图使用的字体: https

2.4K10
领券