加载R包 library(tidyverse) library(ggsci) 导入数据 df <- read_tsv("data.txt") 数据可视化 df %>% ggplot(aes(case_control...函数 aes() 指定数据帧中哪些列应用于图表美学。...❞ geom_jitter(aes(fill=case_control,color=case_control), pch=21, width=0.1, size=2) ❝向图表添加了一个抖动散点图。...fill 和 color 美学设置为 case_control，这意味着点的填充和颜色将基于该列的值。参数 pch 指定点的形状，width 指定点的宽度，size 指定点的大小。...❞ stat_boxplot(geom="errorbar", width=0.1, linetype="solid") ❝使用函数 stat_boxplot 向图表添加了误差条。
role of the Arabidopsis leaf microbiota against a bacterial pathogen image.png 今天的推文来重复一下论文中的figure3c 散点图添加拟合曲线...读取数据集 library(readxl) df<-read_excel("41564_2021_997_MOESM10_ESM.xlsx") head(df) colnames(df) 最基本的散点图...ggsave(filename = "fig3c.pdf", width = 6, height = 4, family="serif") 添加拟合曲线...P值 df.lm<-lm(`mean Colonization [log10(CFU/mg)]`~ `mean Protection Score [a.u.]`, data=df) summary...filename = "fig3c.pdf", width = 6, height = 4, family="serif") image.png 添加虚线注释框
今天给大家分享三种在ggplot2包画的图形上添加拟合的线性回归方程和R^2的值的方法。....% italic(x)*","~~italic(r)^2~"="~r2, list(a = format(unname(coef(m)[1]), digits...= 2), b = format(unname(coef(m)[2]), digits = 2), r2...= format(summary(m)$r.squared, digits = 3))) as.character(as.expression(eq)); } p1 <- p + geom_text
在 Seaborn 中，我们可以使用 "aspect" 设置来控制绘图的纵横比。但是，在 Altair 中，我们还可以通过传递 0 到 1 之间的值来控制点的不透明度值（1 表示完全不透明）。...要将 Seaborn 中的散点图转换为气泡图，只需为"sizes"传递一个值，该值表示图表中气泡的最小和最大尺寸。对于 Altair，我们只需通过 (filled=True) 来生成气泡图。...条形图和计数图 在下一组可视化中，我们将绘制一个基本的条形图和计数图。这一次，我们还将添加一个图表标题。我们将使用"cylinders"和"mpg"属性作为绘图的 x 和 y。...在这里，我们可以通过在"mark_bar"命令中传递一个值来自定义条形的大小，如下所示。...为了在 Altair 中设置交互式图表，我们定义了一个具有"interval"类型选择的选择，即在图表上的两个值之间。然后我们使用之前定义的选择定义列的活动点。
在某些情况下，可视化在传递信息方面也比普通数字好得多。 使用数据可视化技术可以很容易地发现变量之间的关系、变量的分布以及数据中的底层结构。 在本文中，我们将介绍数据分析中常用的5种基本数据可视化类型。...因此，在encode函数中写入的任何内容都必须链接到数据帧。 Altair提供了更多的函数和参数来生成更多信息或定制的绘图。我们将在下面的例子中看到它们。...2.散点图 散点图也是一种关系图。它通常用于显示两个数值变量的值。我们可以观察它们之间是否有关联。 我们可以创建“val”和“val2”列的散点图，如下所示。...我们还使用properties函数自定义大小并添加标题。 4.箱线图 箱线图提供了变量分布的概述。它显示了值是如何通过四分位数和离群值展开的。...A中的值范围小于其他两个类别。框内的白线表示中值。 5.条形图 条形图可用于可视化离散变量。每个类别都用一个大小与该类别的值成比例的条表示。
安装Altair库首先，我们需要安装Altair库。你可以使用pip来安装Altair：pip install altair示例代码散点图散点图是一种展示两个变量之间关系的常用图表类型。...properties( width=600, height=300).interactive()# 显示图表interactive_line.show()数据转换与聚合在实际的数据分析过程中，...Altair库提供了丰富的数据转换和聚合功能，使得我们可以在图表中直接使用这些操作。...我们还展示了如何通过Altair进行图表的自定义，包括自定义颜色和标记、添加标题和轴标签、添加数据标签等。这些自定义功能使得我们可以根据需求定制图表的外观和样式，以更好地呈现数据。...这些功能使得我们可以在图表中直接使用这些操作，而不必事先对数据进行处理，从而更方便地探索和理解数据的特征和趋势。
今天正在吃饭，一个朋友提出了一个他面试中遇到的问题，MySQL允许在唯一索引字段中添加多个NULL值。...字段为null的数据： INSERT INTO `test` VALUES (1, NULL); INSERT INTO `test` VALUES (2, NULL); 并没有报错，说明MySQL允许在唯一索引字段中添加多个...我们可以看出，此约束不适用于除BDB存储引擎之外的空值。对于其他引擎，唯一索引允许包含空值的列有多个空值。...网友给出的解释为： 在sql server中，唯一索引字段不能出现多个null值 在mysql 的innodb引擎中，是允许在唯一索引的字段中出现多个null值的。...**根据这个定义，多个NULL值的存在应该不违反唯一约束，所以是合理的，在oracel也是如此。 这个解释很形象，既不相等，也不不等，所以结果未知。
GGplot Ggplot是一个Python数据可视化库，它基于为编程语言R创建的ggplot2的实现为基础。Ggplot可以使用高级功能创建数据可视化，例如条形图，饼图，直方图，散点图，错误图等。...可在单个可视化中添加不同类型的数据可视化组件或层。Ggplot也与熊猫紧密相连，因此最好将数据保留在DataFrames中。 Altair Altair是Python中的统计数据可视化库。...Altair用最少的编码创建漂亮的图表数据可视化，例如条形图，饼图，直方图，散点图，误差图，功率谱，干图等。...打开Jupyter Notebook或JupyterLab并执行任何代码以在Altair中获得该数据可视化。...第一级专注于快速创建数据图，第二级控制图的基本构建块，而第三级则提供了完全自动的功能来创建没有预设默认值的图表。
图片通常，我们有以下 3 种方式进行 EDA：方式1：在 Python/R 中使用库/框架手动分析方式2：在 Python/R 中使用自动化 EDA 库方式3：使用 Microsoft Power BI...图片它提供了多达40+种图表类型，包括散点图、直方图、折线图、条形图、饼图、误差线、箱线图、多轴、迷你图、树状图和 3-D 图表（甚至包括等高线图，这在其他数据可视化库中并不常见）。大家可以通过 ?...对于数据集的每一列（字段），它会分析如下的内容并呈现在交互式 HTML 报告中：类型推断：字段列的类型要点：类型、唯一值、缺失值分位数统计：包括最小值、Q1、中位数、Q3、最大值、范围、四分位间距描述性统计...：包括均值、众数、标准差、总和、中值绝对差、变异系数、峰度、偏度等直方图：分类和数字相关性：Spearman、Pearson 和 Kendall 矩阵缺失值：矩阵、计数、热图和缺失值的树状图文本分析：了解文本数据的类别...Altair Notebook Examples: https://github.com/altair-viz/altair_notebooks?
参考： Seurat::LabelClusters 前言 回顾一下前面的内容： [[108-R可视化32-通过seurat包中的LabelClusters学习ggplot之一]] [[109-R可视化...33-通过seurat包中的LabelClusters学习ggplot之二]] 我们成功了解了seurat 包中关于ggplot 散点图label的操作。...开始操作 其实本质就是两个函数： 根据不同的cluster 获取其对应位置（坐标数据集的median值）； 绘图函数，包括散点图和label 图； 这里我们暂且不像seurat 绘图时考虑的如此周全，仅仅是提供输入一个数据框...格式如下： myLabelggPoint <- function(my_data, my_label, ifrepel){ NULL } 这里再额外安利一个seurat 中散点图用到的R包：exaexa...毕竟我们的重点还是在于给散点图的中心添加文本，因此其中代码的复杂逻辑并未深究。
2 常用API介绍 1).常用API介绍 下面我们来针对Altair中常用的API来做个简单的介绍吧，首先是散点图的绘制。我们利用的数据如下所示。 ?...上述的程序中，首先Altair调用了Chart类，然后在chart图表中根据我们传入的cars数据，创建散点图，其中x坐标是Horsepower，而纵坐标是Miles_per_Gallon。...上图的程序中，在进行x轴数据的处理时，Altair选择了Miles_per_Gallon进行处理，其中的bin参数是通过创建的BinParams对象来建立，其中maxbins参数的意思是最多创建10个条形柱...相比于上面的程序，这里的程序仅仅多添加了column='Origin'这一句程序而已。是不是非常简洁，比起matplotlib的用法要简单多了，而且图片还非常漂亮！...可以看到，通过交互来划定不同的区域时，下方的柱状图会显示出所选择区域中不同年龄数量的分布，可以看出： 在左上方的分布中，也即身高较高，体重较小的分布中，年龄在24岁的小姐姐分布最多； 而在右上角，也即体重和身高都较突出的区域中
Altair库作为Python中的一款强大工具，为用户提供了丰富的图表绘制功能。让我们从一个个例子入手，看看它能做到什么程度的图表。...青铜 创建一个简单的散点图： import altair as alt import pandas as pd # 创建示例数据 data = pd.DataFrame({'x': [1, 2, 3,...点的大小，代表不同的 size 列的值 tooltip 参数，使得当鼠标停在泡泡上面时，会出现提示信息 王者 接下来才是 altair 的核心，还是前面的泡泡图，不过可以缩放平移交互： import altair...alt.Chart(data).mark_point().encode( # 编码省略... ).properties( # 属性省略... ).add_selection( brush ) 在散点图的属性中...这样当我们在散点图中选择区域时，下方的柱状图会根据所选择的区域显示相应的数据。
如果您使用的是Jupyter Notebook，则在制作图表之前，将％matplotlib内联添加到文件的开头并运行它。 我们可以在一个图形中制作多个图形。...我们可以在图形中添加文本，并以与图形中看到的相同的单位指示文本的位置。在文本中，我们甚至可以按照TeX语言添加特殊字符 我们还可以添加指向图形上特定点的标记。...我们可以在同一张图中添加两个以上变量的信息。为此，我们使用颜色和大小。...如果需要可视化更多信息，可以使用在matplotlib中可以找到的简单图形作为散点图或直方图。...对于项目的高级阶段，我们可以在主库（Matplotlib，Seaborn，Bokeh，Altair）的图库中搜索我们喜欢并适合该项目的图形。
如果您使用的是Jupyter Notebook，则在制作图表之前，将％matplotlib内联添加到文件的开头并运行它。 我们可以在一个图形中制作多个图形。...在文本中，我们甚至可以按照TeX语言添加特殊字符。 我们还可以添加指向图形上特定点的标记。...： 我们可以在同一张图中添加两个以上变量的信息。...如果需要可视化更多信息，可以使用在matplotlib中可以找到的简单图形作为散点图或直方图。...对于项目的高级阶段，我们可以在主库（Matplotlib，Seaborn，Bokeh，Altair）的图库中搜索我们喜欢并适合该项目的图形。
很多情况下，我们需要使用工作表中的数据来填充组合框，但往往这些数据中含有许多重复值。如何去除重复值并得到唯一值，这是一个永恒的话题，大家也会用到各式各样的方法得到结果。...本文讲解一种技巧，使用Recordset（记录集）来获取唯一值并将其填充到组合框中。 示例数据如下图1所示。在工作表中有一个组合框，需要包含列A中的省份列表，但是列A中有很多重复的省份数据。 ?...单击功能区“开发工具”选项卡中“插入”按钮下ActiveX控件中的“组合框”，在工作表中插入一个组合框，可以看到Excel将其自动命名为“ComboBox1”，如下图2所示。 ?...可以在任何事件或过程中调用它们，例如工作簿打开事件、查询刷新事件或者按下按钮后。 运行或调用过程后，在工作表中单击组合框右侧下拉按钮，结果如下图3所示。 ?...3.可以使用如下所示的命名区域代替硬编码单元格区域： Myrecordset.Open “Select Distinct [省份] from [命名区域]” 4.可以编写VBA代码遍历数组来获取唯一值。
前者透过简单直接的视觉图形，更方便用户看懂原数据，后者主要用于与业务结合过程中展现总体分析结果。 探索式可视化库 探索式分析最大的优势在于，可以让业务人员在海量数据中“自由发挥”，不受数据模型的限制。...由于Seaborn是在Matplotlib基础上构建的，因此用户还需要了解Matplotlib以便调整Seaborn的默认值。...在使用plotnine绘图之前，首先需要理解绘图的基本概念。 10 Altair ? Altair是一个专为Python编写，它可以让数据科学家更多地关注数据本身和其内在的联系。...声明使Altair变得简单、友好和一致，用户使用Altair可以轻松设计出有效且美观的可视化代码。 11 ggplot ? ggplot是基于R语言的ggplot2包和Python的绘图系统。...在创建绘图后，用户可以在它的上面添加字段，以便对数据进行筛选和排序。
st.map 显示一张叠加了散点图的地图。 它是 st.pydeck_chart 的包装器，用于在地图上快速创建散点图表，并具有自动居中和自动缩放功能。...最后使用streamlit的altair_chart函数将这个图表展示在应用中，并设置了use_container_width=True以自适应容器宽度。...如果不存在，就创建一个包含20行3列随机数的DataFrame，并将其存储在会话状态中。然后，将数据存储在变量df中。...然后，代码使用Altair库创建了一个散点图。散点图的x轴和y轴分别对应DataFrame中的"a"和"b"列，点的大小和颜色分别对应DataFrame中的"c"列。...最后，代码使用Streamlit的altair_chart函数将图表显示在界面上，并添加了on_select参数来指定当用户进行选择操作时触发重新运行。最后一行代码将事件显示在界面上。
前者透过简单直接的视觉图形，更方便用户看懂原数据，后者主要用于与业务结合过程中展现总体分析结果。 探索式可视化库 探索式分析最大的优势在于，可以让业务人员在海量数据中“自由发挥”，不受数据模型的限制。...由于Seaborn是在Matplotlib基础上构建的，因此用户还需要了解Matplotlib以便调整Seaborn的默认值。...在使用plotnine绘图之前，首先需要理解绘图的基本概念。 6 Altair Altair是一个专为Python编写，它可以让数据科学家更多地关注数据本身和其内在的联系。...声明使Altair变得简单、友好和一致，用户使用Altair可以轻松设计出有效且美观的可视化代码。 7 ggplot ggplot是基于R语言的ggplot2包和Python的绘图系统。...在创建绘图后，用户可以在它的上面添加字段，以便对数据进行筛选和排序。
在P andas中 ，你使用 dataframe.plot （） ，在这里，您使用 dataframe.iplot（）。 这个 “ i ” 改变了可视化的整个定义。...Folium Folium建立在Python生态系统的数据优势和Leaflet.js库的映射优势之上。您可以在python中操作数据，然后通过folium在Leaflet地图中将其可视化。...： alt.renderers.enable(‘notebook’) Altair中的数据是围绕Pandas Dataframe构建的。...您还可以将绘图另存为图像或在vega编辑器中打开它以获得更多选项。Altair可能不是最好的，但绝对值得一试。...R提供D3可视化接口。使用 r2d3 ，您可以将数据从R绑定到D3可视化。使用 r2d3 创建的D3可视化就像RStudio，R Markdown文档和Shiny应用程序中的R图一样工作。
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