R包安装方法有: 1. 自动安装(在线安装) 在R的控制台,输入install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra 若要指定安装目录 (e.g....中也会经常遇到R包安装错误的提示。...以Rstudio中的安装错误为例,给大家做一个本地安装示例。 最近安装tidyverse包遇到过类似的问题: 包找不到啦! 校验包的大小与下载的包大小不一样!...CRAN,如Github存放一些R包,所以偶尔也会遇到安装github上的R包 install.packages("devtools")library(devtools)install_github("...Github上的R包路径") 2.更新R包列表(Rstudio) 这里仅说明Rstudio中的一键更新功能。
ERROR: Registering runner... failed runner=R5udHcCx status=couldn't execute POST against
oconductor中包几乎都是安装下面代码安装。比如:miRBaseVersions.db包 if (!...但安装的时候会发生出错。提示需要3.5版本的R。你说要4.0。安装时提示要3.5。 ? 我也换成3.5版本的R,安装,结果显示:安装程序包****时退出的状态不是0。...我想很多人安装包都遇到这样的状况。如果你安装miRBaseVersions.db包时也出现这样的状况,你可以尝试我下面的解决方式,我这里的解决方法是下载安装包本地安装。 ?...下载后,在RStudio中。 ? 然后选择下载的包,安装就可以啦。 ?...我这里是在3.6版本的R中安装的,不是3.5,我这里安装成功了,可能你不一定能成功,那是因为有一些依赖包可能你没有安装,我这里是因为很多有关生信分析的R包我都安装过,所以不报错。 ?
在尝试安装spark R的过程中,老是碰到错误,原因就是在安装devtools过程中经常出错,找了找网上的相关资料,才发现需要额外下载几个库,因此将这个过程记录下来。...在执行:install.packages("devtools")之前,需要打开终端安装两个包。...apt-get install libcurl4-gnutls-dev sudo apt-get install libxml2-dev 其实这个原因应该很简单,主要是因为直接从网络下载的包,...自此,直接成功安装devtools. 在测试过程中,有些电脑还会出现一些错误,如gitr的错误。...其错误情况是: dependency ‘git2r’ is not available for package ‘devtools’ 这时候还要再下载安装个libssl-dev
作者:傲慢与偏见 原文标题:利用Inno Setup在VS编译时自动构建安装包 原文链接:https://www.cnblogs.com/chonglu/p/17566940.html 欢迎网友们投稿技术类文章...Setup为例简单演示下如何构建安装包,以及在Visual Studio中编译程序时自动去构建这个安装包。...填写应用安装目录 2.5. 在VS中右键项目属性,更改项目输出路径,有多个项目则都改为同一个 2.6....安装包语言选择 官方默认是不提供中文语言包的,但官网上有第三方用户提供和维护了中文包,有需要的可以在 Inno Setup Translations[3]下载,然后手动放进Inno Setup安装目录下的...如果在实际操作中遇到错误或有疑问,以及更好的建议可以在评论中交流.. 6.
Pycharm Available Package无法显示包的问题解决 使用Pycharm的时候需要导入解释器然后安装一些第三方库,讲道理都是project Interpreter里面直接install...设置镜像后出现Error loading package list:typypi.studutlinux.org 一开始没注意,还以为是python3的安装路径有问题,捣鼓了很久之后突然发现是镜像里面有一个不能用
目录: 判断式安装 向量保存包名再安装 安装包技巧 还是使用我的R 包 R studio 修改镜像 如果你是通过R studio 使用R,是可以直接通过偏好中的设置去修改镜像: R 默认提供了非常多的镜像来源...使用R 包 比如我的R 包,你可以在主界面了解详细信息:https://github.com/mugpeng/pengToolkit (也可以点击原文链接) # install devtools install.packages...("remotes") #安装官方包‘git2r’ install.packages("git2r") remotes::install_git("https://gitee.com/mugpeng/...requireNamespace("devtools", quietly = TRUE)) install.packages("devtools") 向量保存包名再安装 首先将需要的包保存在一个向量中...library 验证一下是否安装成功,如果还没有,可能你的网络环境出了问题,或者这个包需要通过源文件安装,或是在github 上,需要使用devtools 安装。
创建py 脚本 虽然我们可以在R studio 中直接创建python 脚本,但这样毕竟比较麻烦,这里可以直接使用我的R 包函数make_py_template(): > make_py_template...安装方法如下: # install devtools install.packages("devtools") devtools::install_github("mugpeng/pengToolkit...") # 如果是境内用户 #安装官方包‘remotes’ install.packages("remotes") #安装官方包‘git2r’ install.packages("git2r") remotes...R 类型对象: > tmp2 <- py$pandas$DataFrame(c(1:4)) > tmp2 0 1 1 2 2 3 3 4 4 我们也可以在载入py 模块时,显式的取消转型: > np...中使用py,比如np_array 等方便我们在R 中直接获得py 中的类型对象;但是,相比起熟练的掌握R 中的python 语法,倒不如直接去学习python 语法。
但是在执行更新pip指令:python -m pip install --upgrade pip后。 直接在cmd中输入指令后,显示:在anaconda中的pip版本已经是最高了。...此时应该进入python文件夹中执行更新pip的指令。 在指令执行前pip的版本: 执行指令: 执行后: 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。
http_proxy=http://127.0.0.1:7890;export all_proxy=socks5://127.0.0.1:7891 因此就引出今天的R包:r.proxy 使用 使用非常简单...: install.packages("r.proxy") # install.packages("devtools") devtools::install_github("xiayh17/r.proxy...> "latitude": 49.7498, #> "continent_code": "EU", #> "country_code": "LU" #> } 有点好奇这个字典中的数据是哪里来的...我一般设置代理其实也就是为了方便从github 上安装包呀。需要花钱配置一个代理吗? 比如你可以转到gitee 上再下载:可以直接将github上的项目先fork到自己的仓库,再复制到码云中。...#安装官方包‘remotes’ install.packages("remotes") #安装官方包‘git2r’ install.packages("git2r") remotes::
二、问题描述 在pyCharm中创建flask项目时,在建立好虚拟环境,开始自动用pip工具安装flask的时候,软件提示:Install flask failed。如图所示: ?...在PyCharm中创建项目时自动安装flask时的失败提示 我的PyCharm 版本为2019.2.3专业版(这就是用教育邮箱白嫖的,感谢JetBrains)。...并且,我在我常用的Python的全局解释器中从没遇到过pip失效的问题!...在PyCharm中的终端手动使用pip时的失败提示 ③再试试用pip安装一下其他的东西,结果和上一步一样 ④再试试用PyCharm创建一个Django项目,结果在自动使用 pip install django...到此这篇关于在PyCharm中遇到pip安装 失败问题及解决方案(pip失效时的解决方案)的文章就介绍到这了,更多相关PyCharm中pip安装失败内容请搜索ZaLou.Cn以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持
下面,我将首先介绍TwoSampleMR包的安装 注意,TwoSampleMR这个包是存储在GitHub库里的,所以我们需要使用devtools来安装,具体代码如下: install.packages(...‘devtools’) devtools::install_github(‘MRCIEU/TwoSampleMR’) 上述代码是用来安装最新TwoSampleMR包的,如果你想使用老版的TwoSampleMR...万事开头难,我身边不少小伙伴在安装TwoSampleMR包时出现问题,米老鼠给大家总结了几点原因以及相关解决办法,可以一试: (1)出现网络连接不畅的问题,这可能是你频繁地从GitHub上获取数据,或者是...(2)出现某个依赖包安装失败时(比如“MRIntruments“),可以先安装这个依赖包试试,逐步排查问题,在安装过程中不要随便更新其它R包!只有当一个R包不更新便无法导致安装时,再更新这个R包。...(3)如果更新一个R包失败的话,先关闭R环境,然后回到原来R包所在文件夹,手动删除该包后启动R重新安装。 上述三点是最常见的问题,希望大家别碰到!
因此我们可以看到docker可以屏蔽环境差异,也就是说,只要你的程序打包到了docker中,那么无论运行在什么环境下程序的行为都是一致的,程序员再也无法施展表演才华了,不会再有“在我的环境上可以运行”,...本文主要介绍使用Docker File 的方法搭建自己镜像的过程,,涉及的软件主要为Python和R平台,最终会用Jupyter lab加载镜像 使用Docker file 安装Python/R包 使用...使用清华镜像加速 使用Install.packages 安装R包 RUN R -e 'install.packages("textshaping",repos="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn.../CRAN/")' # 使用清华镜像 使用devtools下载github R包 RUN mamba install -y -q -c conda-forge r-devtools RUN R -e '...devtools::install_github("saeyslab/nichenetr")' 建议每个包单个命令安装,有防报错 conda安装nichenetr中存在包的冲突 可以使用devtools
在R语言的广泛包中,大部分可以直接install.packages()直接命令安装,但是有些包安装过程比较复杂,例如'lightgbm,ggplot2所依赖的‘rlang’包,devtools所依赖的‘...pkgload’,这三个包是我目前经常遇到的需要编译的包,安装过程比较复杂且慢。...当我首先发现install.packages()安装rlang和pkgload时出错 ? ?...首先: 下载Rtools,根据R语言版本选择对应的Rtools 下载Rtools过程注意选择默认路径,且将Rtools下载路径加入系统变量path 重启Rstudio,重新安装上述包 getOption...('repos') install.packages("rlang", lib="D:/R.Rstudio/R/R-3.3.3/library") install.packages('devtools'
dyno是一个R包,需要R/Rstudio运行环境,目前的存放地址是在github- https://github.com/dynverse/dyno,所以我们用devtools进行安装,打开Rstudio...)•再次重新安装:devtools::install_github("dynverse/dyno") 其他安装问题 如果没有devtools是不能安装dyno的,所以有些时候devtools的安装也会出现一些问题...windows10/MACOS用户快速体验方式 dyno的整个安装过程会非常漫长,如果是windows10或者MACOS用户可以在安装docker之后用我构建的R镜像:seqyuan/seqyuan-r...:v0.0.1(R version 3.6.1)进行体验,这个R镜像安装了dyno、tidyverse及Seurat等包,可以免去安装过程快速体验dyno的强大,具体使用会在文章最后一节介绍。...快速免安装体验方式 对于MACOS或者有root权限的用户,如果想快速体验dyno,可以在安装并启动docker之后,执行以下命令行进入docker环境命令行,然后打开R终端。
参见:https://zhuanlan.zhihu.com/p/146355865[1] 与别人分享代码时,常常会因为不同人机器的R与R 包的版本差异,而导致了出现报错。...,在使用其他设备或平台的R 时,都可以避免版本产生的问题。...比如安装A 包依赖B 包,需要更新C 包,这就可能改变我们本身目录中的R 包环境,一旦出现问题,各种依赖和版本问题非常麻烦,我们可以通过packrat 建立临时的“快照”,出问题直接恢复即可。...,在非R project 下,用unbundle 打开该包: 进入环境后,直接on 就可以操作了。...快照信息存在~/.checkpoint 但目前还是没有明白,其是如何读取或者与默认R 包安装目录相分离的。 docker 我们可以直接通过docker 获得别人的R 环境。
可以从中学到其他人的代码技巧,比如判断哪些包没有安装,甚至批量安装R包 cat(sprintf("\n\n##=========== checking if required packages are...跟着jimmy学docker系列之第4讲:docker容器资源调度问题(MAC版本) 使用阿里云+Docker分析RNA-Seq与ChIP-Seq Docker应用之一键化安装Wordpress(无需代码基础...,就是基于codeocean的r-base:3.4.4-ubuntu16.04这个初始化的空白电脑系统,然后安装几个这篇文章绘图需要的R包,就可以啦!...FROM registry.codeocean.com/codeocean/r-base:3.4.4-ubuntu16.04 ARG DEBIAN_FRONTEND=noninteractive RUN...}, bg.border = NA) circos.clear() } 主要是 chordDiagram 和 circos.trackPlotRegion两个函数,来自于circlize这个R包
(1)R包安装 按需索取,目的不是学会某个具体的R包,而是找所有R包使用的规律。 不需要安装所有的R包,需要哪一个,装哪一个。...#library是判断R包是否安装成功的唯一标准, require() 一次安装,每次打开新的session(交互式会话)都要加载。...根据反馈出来的逻辑值判断是否安装成功。 require() 返回逻辑值是TRUE时,说明已经安装,而 !...")) #安装R包 if(!...R语言版本与R包不符 可能原因4:包过时了 2)是否更新 图片 3)加载A包,报错B包不存在 先安装B包,成功后再安装A包 4)依赖包的版本不够新 图片 更新一个包:重新安装,或先删除再重新安装 更新所有的包
require(devtools) install_github("ramnathv/rCharts") (如果出现问题,可以尝试先安装以下三个包,再试一下) library("curl") library...("openssl") library("httr") ###安装出现问题,可以尝试先加载前面三个包试试,自己安装时候搞了好久 require(devtools) install_github("...SepalLength ~ SepalWidth | Species, data = iris, color = 'Species', type = 'point',x="vehwv") rc$save('r1
在本教程中,我们将讨论如何安装devtools并使用它直接从GitHub安装R包。...第3步 - 从GitHub安装R包 在这一步中,我们将直接从GitHub安装Shiny的最新开发版本,这是一个R的Web应用程序框架。...使用以下命令安装: devtools::install_github('rstudio/shiny') 当我们在输出结尾附近看到以下行并返回到R提示时,安装已成功完成: . . . ** testing...检查防火墙 Shiny是一个Web应用程序框架,因此为了在浏览器中查看其示例,我们需要确保在我们的防火墙上允许Web流量。内置Web服务器在每次启动时随机选择一个端口,除非我们使用特定值启动它。...cat /usr/local/lib/R/site-library/shiny/DESCRIPTION 结论 在本教程中,我们直接从GitHub安装了最新的Shiny软件包,并学习了如何从CRAN重新安装其稳定版本
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