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用R图上绘制网络图三种方法

作者:严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物信息学方向)伪码农,R语言爱好者,爱开源 地理网络图与传统网络图不同,当引用地理位置进行节点网络可视化时,需要将这些节点放置图上,然后绘制他们之间连结...此外我们需要定义aesthetic来规定数据如何可视化映射在地图上 对于节点(nodes):将各个地理坐标映射到画板x、y位置,并且节点大小取决于权重大小; 对于连线(edges):使用edges_for_plot...注意:geoms顺序很重要,因为它定义了先绘制哪个对象,先绘制将被后面的图层覆盖。因此我们先绘制了连线(edges),然后绘制节点(nodes),最后绘制节点标签(labels)。...下面创建第一个需要覆盖图上图层——各节点之间连线(edges)。...之后还需要手动多次调整p_edges和p_nodes垂直方向位置。

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数据科学 IPython 笔记本 8.16 地理数据和 Basemap

有用是这里显示地球不仅仅是一个图像; 它是一个功能齐全 Matplotlib 轴域,它可以理解球面坐标,这使我们可以轻松图上绘制数据!...这些预测是人类历史进程中发展起来,有很多选择!取决于地图投影预期用途,有一些地图特征,保留它们很有用(例如,方向,区域,距离,形状或其他考虑因素)。...():绘制恒定经度线条 drawmapscale():图上绘制线性刻度 全球图像 bluemarble():将 NASA 蓝色大理石图像投影到地图上 shadedrelief():将阴影浮雕图像投影到地图上...etopo():图上绘制一个 etopo 浮雕图像 warpimage():将用户提供图像投影到地图上 对于基于边界特性,必须在创建 Basemap 图像时设置所需分辨率。...这个选项很重要:例如,全局地图上设置高分辨率边界可能非常慢。 这是绘制/海洋边界,以及分辨率参数效果示例。我们将创建苏格兰美丽斯凯岛低分辨率和高分辨率地图。

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打造基于GitHubO2O应用:超炫地图交互

下图是一个结合百度地图省市区与地图联动: 我们可以在这个应用里选择,相应省市区然后地图会跳转到相应地图。当我们图上漫游时候,如果没有显示当前省市区是不是变得很难使用。...但是这些数据意味着,我们不需要依靠于在线地图就可以完成大部分功能了。在线地图一直都是一个缓慢存在,并且Google Map多数人那都是不可用。...要将用户数据成功存成GEO信息。...最初时候要用Event形式来实现,但是发现这样似乎会让其紧耦合。就改用了监听Hash Change形式来实现,图上每一个省都有一个对应ID,这个ID会对应相应数据。...从地图上跳转到对应时候: 用Aajx请求获取这个省GeoJSON文件 获取这个市中心位置,并对其进行缩放 将上面的每个市绘制到地图上 在这个过程中遇到最大坑是:中国有北京、上海、天津、

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Google Earth Engine——全球摩擦面列举了北纬85度和南纬60度之间所有陆像素2015年名义年迁移速度。

was produced through a collaboration between the University of Oxford Malaria Atlas Project (MAP), Google...to produce the map include roads (comprising the first ever global-scale use of Open Street Map and Google...这个全球摩擦面列举了北纬85度和南纬60度之间所有陆像素2015年名义年旅行速度。该地图是由牛津大学疟疾地图集项目(MAP)、谷歌、欧盟联合研究中心(JRC)和荷兰特文特大学合作制作。...用于制作该地图基础数据集包括道路(包括首次全球范围内使用开放街道地图和谷歌道路数据集)、铁路、河流、湖泊、海洋、地形条件(坡度和海拔)、土地覆盖类型以及国家边界。...然后,这些数据集被合并以产生 "摩擦面",在这张地图上,每个像素都被分配了一个基于该像素内发生类型名义总旅行速度,与该像素相交最快旅行模式被用来确定该像素旅行速度(有一些例外,如国家边界,它具有施加旅行时间处罚效果

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常用60类图表使用场景、制作工具推荐!

密度图 密度图 (Density Plot) 又称为「密度曲线图」,用于显示数据连续时间段内分布状况。...南丁格尔玫瑰图中,代表数值是分段面积,而不是其半径。 推荐制作工具有:Datamatic、Infogr.am。...推荐制作工具有:Arpit Narechania's Block。 径向条形图 径向条形图是极坐标系上绘制条形图。 虽然看起来很美观,但径向条形图上条形长度可能会被人误解。...此外,较大地区会比较小区域更加显眼,影响读者对数值感知。 绘制地区分布图时常见错误:对原始数据值(例如人口)进行运算,而不是使用归一化值(例:计算每平方公里的人口)。...字云图上使用颜色通常都是毫无意义,主要是为了美观,但我们可以用颜色对单词进行分类。

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60 种常用可视化图表,该怎么用?

密度图 密度图 (Density Plot) 又称为「密度曲线图」,用于显示数据连续时间段内分布状况。...南丁格尔玫瑰图中,代表数值是分段面积,而不是其半径。 推荐制作工具有:Datamatic、Infogr.am。...推荐制作工具有:Arpit Narechania's Block。 径向条形图 径向条形图是极坐标系上绘制条形图。 虽然看起来很美观,但径向条形图上条形长度可能会被人误解。...此外,较大地区会比较小区域更加显眼,影响读者对数值感知。 绘制地区分布图时常见错误:对原始数据值(例如人口)进行运算,而不是使用归一化值(例:计算每平方公里的人口)。...字云图上使用颜色通常都是毫无意义,主要是为了美观,但我们可以用颜色对单词进行分类。

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可视化图表样式使用大全

折线图用于连续间隔或时间跨度上显示定量数值,最常用来显示趋势和关系。 此外,折线图也能给出某时间段内「整体概览」,看看数据在这段时间内发展情况。...密度图 (Density Plot) 又称为「密度曲线图」,用于显示数据连续时间段内分布状况。...南丁格尔玫瑰图中,代表数值是分段面积,而不是其半径。 推荐制作工具有:Datamatic、Infogr.am。 旭日图 ?...径向条形图是极坐标系上绘制条形图。 虽然看起来很美观,但径向条形图上条形长度可能会被人误解。 推荐制作工具有:AnyChart。 径向柱图 ? 也称为「圆形柱图」或「星图」。...此外,较大地区会比较小区域更加显眼,影响读者对数值感知。 绘制地区分布图时常见错误:对原始数据值(例如人口)进行运算,而不是使用归一化值(例:计算每平方公里的人口)。

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地图开发知识之-投影坐标

由于投影变形,地图上所表示地物,如大陆、岛屿、海洋等几何特性(长度、面积、角度、形状)也随之发生变形。每一幅地图都有不同程度变形;同一幅图上,不同地区变形情况也不相同。...墨卡托投影没有角度变形,由每一点向各方向长度比相等,它经纬线都是平行直线,且相交成直角,经线间隔相等,纬线间隔从基准纬线处向两极逐渐增大墨卡托投影图上长度和面积变形明显,但基准纬线处无变形,从基准纬线处向两极变形逐渐增大...,但因为它具有各个方向均等扩大特性,保持了方向和相互位置关系正确。...地图中常使用各种坐标 以google地图,百度地图举例。...转换公式为 像素坐标 = |平面坐标 × Math.pow(2, zoom - 18)| 图块坐标 地图软件里面,每一个缩放级别有不同区块地图。百度与google地图相似。

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Google Earth Engine——Murray全球潮间带变化数据集潮滩分类,用于开发陆卫星协变量层卫星图像数量

Murray全球潮间带变化数据集包含了通过对707,528张Landsat Archive图像进行监督分类而产生全球潮间带生态系统地图。...参照全球分布训练数据集,每个像素都被划分为潮滩、永久水域或其他。 1984年1月1日至2016年12月31日,分类工作沿着北纬60°和南纬60°之间整个全球海岸线进行。...;2005-2007;2008-2010;2011-2013;2014-2016) 潮滩分类每个时间步骤中,用于开发陆卫星协变量层卫星图像数量。...图像集合中每张图像指的是一个时间步骤。...Dataset Availability 1984-01-01T00:00:00 - 2017-01-01T00:00:00 Dataset Provider Murray/UQ/Google/USGS

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60种常用可视化图表使用场景——(下)

此外,较大地区会比较小区域更加显眼,影响读者对数值感知。 绘制地区分布图时常见错误:对原始数据值(例如人口)进行运算,而不是使用归一化值(例:计算每平方公里的人口)。...39、流向地图 流向地图 (Flow Map) 图上显示信息或物体从一个位置到另一个位置移动及其数量,通常用来显示人物、动物和产品迁移数据。...绘制记数符号图表时,将类别、数值或间隔放置同一个轴或列(通常为 Y 轴或左侧第一列)上。每当出现数值时,相应列或行中添加记数符号。...如果是按比例绘制时间线,我们可以通过查看不同事件之间时间间隔,了解事件发生时间或即将在何时发生,从中查找时间段内事件是否遵循任何模式,或者事件该时间段内如何分布。...词云图上使用颜色通常都是毫无意义,主要是为了美观,但我们可以用颜色对单词进行分类。

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十分钟带你看 Google IO 2018 亮点(视频中英双字)

针对不方便打开视频小伙伴,CDA字幕组也贴心整理了文字版本,如下: 欢迎来到Google I/O。 对于像我这样成长过程中没有手机的人,我清楚记得,接触到科技能如何影响你生活。...它集中了我们这些年在自然语言处理、深度学习、文本到语音中所有投入。 我很兴奋宣布新Google新闻。通过新Google新闻,我们能帮助你完成三项事情。...Google Maps+Google Lens 地图是用于帮助每个人。我们已绘制了超过220个国家和领土,并在地图上标注了大量地点。 兴趣推荐 我们图上添加For You新标签。...问题是你完全不知道哪边是南,因此你看着地图上蓝点试着走,看看是否与你往同一个方向移动。 我们团队结合了相机功能、计算机视觉以及街景和地图,重新构想导航。 Google地图中会是这样。...注意你也在看地图,那么你始终能确定方向,你能看到附近地点和周围事物。 ? 从现实到电子世界 如今通过智能文字选择,你现在能将看到文字结合想要答案和行动。

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google maps api_js调用谷歌浏览器接口

3.hl=zh-CN 这个是设定地图上除了地图图片以外诸如控件名称、版权声明、使用提示等所需要显示文本语言版本时候用,假如没有指定这个参数就使用 API 默认值,对itu.google.com...假如能够双击缩放,返回”真”; enableContinuousZoom():设置地图可以连续平滑缩放。...disableContinuousZoom():禁止地图连续平滑缩放。 continuousZoomEnabled():返回地图是否可以连续平滑缩放布尔值。...假如能够连续平滑缩放,返回”真”;否则返回”假”。 enableScrollWheelZoom():设置地图可以由鼠标滚轮控制缩放。...removeOverlay(overlay) 图上删除指定标注.假如该标注确实在地图上.

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天天Get 新技能!!

如你所见,直方图上叠加核密度图,专业来说,核密度估计是用于估计随机变量概率密度函数一种非参数方法。核密度图是用来观察连续型变量分布有效方法。...箱线图 箱线图(又称为盒须图)通过绘制连续型变量五数总括,即最小数、下四分位数、中位数(第50百分数)、上四分位数(第75百分数)以及最大值,描述了连续型变量分布。...一个公式为y ~ A,这将为类别型变量A每个值并列生成数值型变量y箱线图。...小提琴图基本上是核密度图以镜像方式箱线图上添加。图中,白点是中位数,黑色盒型范围是下四分位点到上四分位点,细黑线表示须,外部形状即核密度估计。...点图 点图提供一种简单水平刻度上绘制大量有标签值方法 。

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AI 绘制版《漠河舞厅》MV 火了,网友:感觉 AI 读懂了歌词

歌曲间奏部分,AI画还是漠河夜晚美丽极光、人影重重舞厅、朝着月光方向舞姿蹁跹女子、戴着贝雷帽短发女孩和极光划破天际夜晚。...不得不说,Up主“拯救世界狗子”和AI共同创造了令人惊叹作品,不仅人物风格有着相同延续,不同场景色彩鲜亮且构图精巧,尤其是红日、日光和舞厅人形剪影那张,AI居然能把这些元素如此合理放在一张图上,...如果在AI作画时只输入歌词,这样文字描述对于AI来说远远不够,必须要由人类作者把想象画面精准描述出来,AI才可以听懂要绘制怎样画作,而且AI作画不是一蹴而就,需要人类创作者n张有相同或相似描述图像中选出最贴合歌词意象那一张...正如《 漠河舞厅》AI绘制版本MV创作者“拯救世界狗子”回应,(不是AI读懂了歌词)“而是我读懂了歌词,用蹩脚英文给AI描述。”...也许未来AI就不是一帧一帧作画,而是创作连续动画,我们期待那一天到来。 更多内容,点击下方关注: 扫码添加 AI 科技评论 微信号,投稿&进群:

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R语言绘图之ggplot2

微调图型:严格意义上说,这一类函数不是再实现图层,而是在做局部调整。...彩虹图(连续x值上表示y范围,例如Tufte著名拿破仑远征图) geom_rug 触须 geom_segment 线段 geom_smooth 平滑条件均值 geom_step 阶梯图 geom_text...绘制Q-Q图 stat_quantile 连续分位线 stat_smooth 添加平滑曲线 stat_spoke 绘制方向数据点(由x和y指定位置,angle指定角度) stat_sum 绘制不重复取值之和...(通常用在三点图上) stat_summary 绘制汇总数据 stat_unique 绘制不同数值,去掉重复数值 stat_vline 绘制竖直线 标度函数 描述 scale_alpha alpha...一组连续数据可以映射到X轴坐标,也可以映射到一组连续渐变色彩。

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AI绘制版《漠河舞厅》MV火了,网友:感觉AI读懂了歌词

歌曲间奏部分,AI画还是漠河夜晚美丽极光、人影重重舞厅、朝着月光方向舞姿蹁跹女子、戴着贝雷帽短发女孩和极光划破天际夜晚。...不得不说,Up主“拯救世界狗子”和AI共同创造了令人惊叹作品,不仅人物风格有着相同延续,不同场景色彩鲜亮且构图精巧,尤其是红日、日光和舞厅人形剪影那张,AI居然能把这些元素如此合理放在一张图上,...如果在AI作画时只输入歌词,这样文字描述对于AI来说远远不够,必须要由人类作者把想象画面精准描述出来,AI才可以听懂要绘制怎样画作,而且AI作画不是一蹴而就,需要人类创作者n张有相同或相似描述图像中选出最贴合歌词意象那一张...正如《 漠河舞厅》AI绘制版本MV创作者“拯救世界狗子”回应,(不是AI读懂了歌词)“而是我读懂了歌词,用蹩脚英文给AI描述。”...也许未来AI就不是一帧一帧作画,而是创作连续动画,我们期待那一天到来。 点「在看」的人都变好看了哦!

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52个数据可视化图表鉴赏

它是一个处于不断演变之中概念,其边界不断扩大。...例如,可以有一个折线图,其中各行显示每个客户细分一段时间内平均销售额,然后可以有另一行显示所有客户细分组合平均值。 16.连接地图 连接地图是通过直线或曲线将放置图上点连接起来绘制。...重要是,不是纯粹根据数据更改半径,而是按比例更改半径,以便每个线段面积随数据变化而变化。更改原始半径值将不成比例更改面积,导致人们错误感知数据。...37.圆型条形图 圆型条形图只是极坐标系上绘制条形图,而不是笛卡尔坐标系上绘制条形图。虽然看起来很酷,但圆型条形图问题是条形长度可能会被误解。...例如,如果我们要显示一年数据,我们可以图表上为每个月指定一种颜色。 48.流图 这种类型可视化是堆叠面积图一种变体,它不是针对固定直轴绘制值,而是围绕变化中心基线移动值。

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R in action读书笔记(4)-第六章:基本图形(下)

6.3直方图 hist() 其中x是一个由数据值组成数值向量。参数freq=FALSE表示根据概率密度而不是频数绘制图形。参数breaks用于控制组数量。...定义直方图中单元时,默认将生成等距切分。...6.4核密度图 核密度估计是用于估计随机变量概率密度函数一种非参数方法。绘制密度图方法(不叠加到另一幅图上方)为: plot(density(x)) 其中x是一个数值型向量。...6.5箱线图 箱线图(又称盒须图)通过绘制连续型变量五数总括,即最小值、下四分位数(第25百分 位数)、中位数(第50百分位数)、上四分位数(第75百分位数)以及最大值,描述了连续型变量 分布。...6.6点图 点图提供了一种简单水平刻度上绘制大量有标签值方法。

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gggenes绘制多物种基因结构比较

make_alignment_dummies()会根据给定数据和待对齐基因,生成一组空基因;再使用geom_blank()将这些空基因添加到绘图中,就可以填充两侧空白,以图上直观对齐所选基因...用geom_gene_label()标记基因 把基因名字所在列名字映射到label属性可以图上标记每个基因名字。...如果forward为TRUE(默认值),或者任何强制为TRUE值(如1),则该基因将被绘制为指向正常方向,即xmin和xmax所暗指方向。...如果forward为FALSE,或者任何强制为假值(如-1),则该基因将按暗指方向相反方向绘制。...使用geom_subgene_label()给子区域图上加标签,它工作原理类似于geom_gene_label(),但主要区别是它需要xsubmin和xsubmax属性 (而不是xmin和xmax

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孩子喜欢飞机,于是我给她做了一个雷达

上周,我们花园里待了一个小时,她坐在我肩上,看着飞机一架接一架夜空中闪烁。 后来我找到了FlightRadar24,它能显示覆盖图上飞机位置,但美中不足是,我必须自己调整方向。...可以看到,天空中飞机数量和集群看起来都差不多,但位置却相差甚远。忽然,我灵光一闪,原来还需要使用注释图上绘制飞机。...这应该会给我们带来我们想要很酷、完全定向雷达效果。 地图注释 iOS 17中,图上绘制注释非常简单。...我使用飞行高度地图注释中添加了一些简单对数缩放,以便更高飞机屏幕上显得更大。此外,我使用飞机真实属性,结合核心位置中用户方向,来显示飞机面向正确方向。...我和女儿一起去看飞机,现在我们有了真实地图注释,能在地图上显示用户位置和方向。最重要是,它能够准确找到飞机! 这获得了巨大成功,因为我们在这上面找到了飞机。 初步测试还得出了两条重要信息。

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