ChAMP 包提供了完整的分析illumina甲基化芯片的pipeline, 和普通的Bioconductor 包的安装一样，代码只有简单的两行 source("http://bioconductor.org.../biocLite.R") biocLite("ChAMP") 我用的电脑是windows 操作系统，64位的R-3.4.3，安装过程中除了网速较慢，花费一点时间安装之外，并没有出现任何的问题。...dll 文件就是windows操作系统下的动态链接库，在加载R包的过程中，如果这个R包有对应的动态链接库，那么就会加载进来。...解决方案就是设置环境变量R_MAX_NUM_DLLS, 不管是什么操作系统，R语言对应的环境变量都可以在.Renviron文件中进行设置。...("d:/Documents/.Renviron", mustWork = FALSE) 第一个参数为.Renviron文件的真实路径，然后在加载ChAMP包就可以了 >> Package version
尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...有时候在开发R包时为了保证正常运行，不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。...如果没有，则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中，而该字节码可能与安装的ggplot2不一致！...如果ggplot2或者你代码的改变对可视化输出引入了改变，当你在本地或者Travis运行测试时会失败。
第1步：安装Stow 在这个例子中，我们使用的是CentOS，因此我们需要扩展的EPEL库。...此位置只是步骤2中选定的目录，其中包名称作为单独的文件夹添加。这会导致文件安装到给定位置，如下所示： ? 现在我们将包中所需的所有文件放在stow目录的文件夹中。...现在输入： stow hello 该软件包现已安装在您的系统上。这是“hello”命令的截图： ? 第5步：删除包 关于装载最酷的部分是从系统中移除包装是多么容易。无需保留源包或任何东西。...就系统而言，包已被完全删除！记住文件实际上并没有消失是件好事。他们仍然在“hello”目录中。您可以使用stow命令再次轻松地安装软件包。...总结 以上所述是小编给大家介绍的在Linux中如何轻松删除源安装的软件包，希望对大家有所帮助，如果大家有任何疑问请给我留言，小编会及时回复大家的。
第1步：安装Stow 在这个例子中，我们使用的是CentOS，因此我们需要扩展的EPEL库。...此位置只是步骤2中选定的目录，其中包名称作为单独的文件夹添加。这会导致文件安装到给定位置，如下所示： ? 现在我们将包中所需的所有文件放在stow目录的文件夹中。...现在输入： stow hello 该软件包现已安装在您的系统上。这是“hello”命令的截图： ? 第5步：删除包 关于装载最酷的部分是从系统中移除包装是多么容易。无需保留源包或任何东西。...就系统而言，包已被完全删除！记住文件实际上并没有消失是件好事。他们仍然在“hello”目录中。您可以使用stow命令再次轻松地安装软件包。...总结 以上所述是小编给大家介绍的在Linux中怎么轻松删除源安装的软件包，希望对大家有所帮助，如果大家有任何疑问请给我留言，小编会及时回复大家的。
这是《Bioconductor 中的 R 包安装教程》的第二篇，完整的文章可以点击阅读原文查阅。...安装新版本的 Bioconductor R 包 Bioconductor 是与特定版本的 R 绑定的，正常来说当 Bioconductor 的包都来自同一版本时，它们的效果最佳。...以 DiffBind 包为例，DiffBind==3.4.0 是基于 Bioconductor==3.14（对应 R-4.1）开发的；我们在 Bioconductor==3.13（对应 R-4.0）中执行...源码方式安装 如果想要在 Bioconductor==3.13（对应 R-4.0）中安装 DiffBind==3.4.0，可以直接通过源码包的方式安装： > packageurl <- "http://...BiocInstaller 安装 我们以在 R-3.4（Bioconductor==3.6）中安装最新版本的 clusterProfiler 为例。
一、通过install.packages安装 步骤： 1、在R中先装rJava包 install.packages(“rJava”) 2、没有装JDK的要到这里去下载： http://www.Oracle.com...二、通过Rwordseg的zip包进行离线安装 不出意外，大部分版本的R都可以通过以上方式安装好Rwordseg包。 我在帮小伙伴安装的时候，也确实遇到过疑难杂症，按照步骤，依旧搞不定，不断报错。...如果您的电脑或者目前正在使用的R版本实在无法通过install.packages的在线方式安装Rwordseg包。...当然不用苦恼，有更便捷的方式，就是直接下载Rwordseg的zip包，在R中加载zip包进行离线安装，只需几秒钟即可。...方法：在程序包中选择(install packages from local files)，离线安装zip包即可。 ? 我将Rwordseg的压缩包上传至了资源中，大家可以下载进行离线安装。
1.文档编写目的 ---- 继上一章如何在Redhat中配置R环境后，我们知道对于多数企业来说是没有外网环境的，在离线环境下如何安装R的包，能否搭建R的私有源对R的包进行管理。...本文档主要讲述如何在Redhat中安装R的包及搭建R的私有源。...1.Linux已安装Apache2服务并正常运行 2.R已安装完成并正常使用 2.Package的安装 ---- R的Package安装主要分为在线安装和离线安装两种方式，如下： 1.在线安装 在R的控制台输入...在Linux下通过命令行的方式安装离线包 首先下载需要安装的Package包 [ec2-user@ip-172-31-26-102 bin]$ sudo wget https://mirror.las.iastate.edu...（如果是自己制作的R包，同理在PACKAGES末尾添加包的描述信息也是可行的，未做验证有兴趣的朋友可以验证下告诉Fayson）。
file=orientdb-community-2.1.9.tar.gz&os=linux 这里下载的是一个包含预编译二进制文件的压缩包，所以我们可以使用 tar 指令来操作解压它： $ tar -zxf...在下载时，您将在您的下载文件夹中获得二进制包。...步骤2 - 解压并安装OrientDB 在Linux中 下载后，您将在您的下载文件夹中获得orientdb-community-2.1.9.tar.gz文件。...您可以在OrientDB安装目录的$ ORIENTDB_HOME / bin / orientdb.sh的bin /目录中找到它。...根据操作系统这是唯一的。 在Linux中 按照给定的步骤在Linux中验证OrientDB安装。 运行服务器：可以使用以下命令启动服务器。 $ cd $ORIENTDB_HOME/bin $ .
Hanlp是由一系列模型与算法组成的javag工具包，目标是普及自然语言处理再生环境中的应用。...有很多人在安装hanlp的时候会遇到安装失败的情况，下面就是某大神的分享的在python环境中安装失败的解决方法，大家可以借鉴学习以下！...HANLP.jpg 由于要使用hanlp进行分词，而我们的环境是python环境所以得安装pyhanlp，但是安装过程总是出现这样的问题 图1.png 看上去感觉是缺少了visual c++环境，于是安装...install jpype1发现果然失败，最终手动安装pip install D:\soft\JPype1-0.6.2-cp36-cp36m-win_amd64.whl 安装成功。...安装包地址：www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#jpype 注意如果出现 JPype1-0.6.3-cp36-cp36m-win_amd64.whl is not a
步骤1 - 下载OrientDB二进制设置文件 OrientDB自带了内置的安装文件，在系统上安装数据库。它为不同的操作系统提供不同的预编译二进制包(tarred或zipped包)。...下面的截图显示了OrientDB的下载页面。您可以通过单击适当的操作系统图标下载压缩或tarred文件。 在下载时，您将在您的下载文件夹中获得二进制包。...在Linux中 下载后，您将在您的下载文件夹中获得orientdb-community-2.1.9.tar.gz文件。 您可以使用以下命令提取tarred文件。...该过程不同，具体取决于您的操作系统。 在Linux中 OrientDB提供了一个名为orientdb.sh的脚本文件，以作为守护程序运行数据库。...在Linux中 按照给定的步骤在Linux中验证OrientDB安装。 运行服务器：可以使用以下命令启动服务器。 $ cd $ORIENTDB_HOME/bin $ .
引言有些时候会存在需要安装特定版本 R 软件的需求，比如为了满足特定软件包的安装使用要求或减少不同平台迁移成本。...但是，不同于 Windows 平台拥有便捷的 R 版本切换功能，MacOS 和 Linux 平台都存在着不同程度的安装和切换困难。...因此，本文以 Ubuntu 为例分享一下 R 在 Linux 等操作系统上的特定版本安装和 rstudio-server 中 R 版本的切换。...引用The Comprehensive R Archive NetworkUbuntu Packages For R - Older Releases安装低版本的 R 语言、和自行下载安装各个版本的 R...语言包、以及多环境运行 R_r 官网怎么找旧版本的 r-CSDN 博客20.04 - How to install specific R version in ubuntu - Ask UbuntuPosit
安装完成后，开发者可以通过命令行工具或集成开发环境（IDE）来编写、编译、运行和调试Java程序。 下面将详细介绍在Linux系统中安装JDK的步骤，帮助读者轻松搭建Java开发环境。...正文内容 一、检查Java版本 在安装JDK之前，建议先检查系统中是否已经安装了Java以及Java的版本。...在终端中输入以下命令： java -version 如果系统中已经安装了Java，则会显示当前Java的版本信息。如果未安装Java或版本过旧，则需要安装新的JDK。...二、下载JDK安装包 访问Oracle官方网站或其他JDK提供商的官方网站，下载适合Linux系统的JDK安装包，请确保选择与您的 Linux 系统兼容的 JDK 版本。...总结 通过以上步骤，您应该可以在Linux系统中成功安装并配置JDK。接下来，您可以开始使用Java进行开发了。如果在安装过程中遇到任何问题，请查阅相关文档或寻求社区帮助。
ERROR: Registering runner... failed runner=R5udHcCx status=couldn't execute POST against
我们常见的视频流接入协议包括RTSP协议、RTMP协议、GB28181协议三种，针对这三种协议，TSINGSEE青犀视频研发了不同的视频解决方案，其中EasyDSS是支持推流协议RTMP接入的平台，它与其他平台不同的点在于...EasyDSS也具备双系统的版本，近期我们测试在Linux脚下运行start.sh 失败，失败信息提示有/r存在，但缺乏文件或者目录。...有/r证明该文档是在Windows操作系统下生成的，因此出现问题。在Windows系统下，/r/n才是回车键，在其他操作系统下/n代表回车键。...这个问题当中我们需要把所有的/r都去除掉，运行以下命令，去除所有的 \r 即可： sed -i 's/\r//' start.sh 修改完毕后，可以正常运行。
总结一下用源代码安装LAMP环境中遇到常见的错误，从错误3开始是因为安装php后面带参数，导到没有找到开发包例如:..... configure: error: No curses/termcap library found 解决方法:yum install ncurses --缺少ncurses安装包...2.1)安装gd库出现以下错误: In file included from /root/php-5.3.6/ext/gd/libgd/gd_compat.c:8: /usr/local...Solutions: 解决方法:yum install mysql-devel 8.没有安装snmp开发包 checking for SNMP support... yes checking OpenSSL...listening sockets available, shutting down Unable to open logs [root@redhat1 bin]# 解决方法:80端口被占用了,杀掉占用80端口的进程
写在前面：大家都反映了这个 velocyto.R 是不可能在Windows安装成功的，不过我本来就是不怎么使用Windows，所以并不想耗费时间去摸索。...不过，除了服务器，我也在自己的苹果电脑上面试了试，在Mac操作系统还是蛮简单的，本来应该是就一句话安装啦： remotes::install_github("velocyto-team/velocyto.R...再怎么强调生物信息学数据分析学习过程的计算机基础知识的打磨都不为过，我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化，以及基于Linux的NGS数据处理： 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 《生信分析人员如何系统入门...第3阶段：元字符，通配符及shell中的各种扩展，从此linux操作不再神秘！ 第4阶段：高级目录管理：软硬链接，绝对路径和相对路径，环境变量。 第5阶段：任务提交及批处理，脚本编写解放你的双手。...第6阶段：软件安装及conda管理，让linux系统实用性放飞自我。
可以证明，在模型2有解的情况下，可以将其化为只含有目标约束的目标规划问题，方法是给所有的绝对约束赋予足够高级别的优先因子，从这个角度来看，线性规划为目标规划的特殊情况，而目标规划则为线性规划的自然推广。...用goalprog包求解目标规划 R中，goalprog包 (Novomestky, 2008) 可以求解形式为模型(3) 的目标规划问题，核心函数为llgp()，用法如下： llgp(coefficients...) 中的矩阵 A。...例 某工厂生产两种产品，受到原材料供应和设备工时的限制，在单位利润等有关数据已知的条件下，要求制定一个获利最大的生产计划，具体数据见表在决策时，按重要程度的先后顺序，要考虑如下意见： 1.原材料严重短缺...该模型符合模型 (3) 的形式，可以直接调用 llgp() 函数来求解该问题，注意：R中根据achievements数据框中的 priority 来判断绝对优先级别，不用再设置 P1，P2，P3。
Hat和Debian旗下的Linux系统上分别安装，而且还会有互相转换的问题，但是用压缩包就没有这个问题了，尽管相对要繁琐一些。...13_linux-x64_bin.tar.gz -rw-rw-r--. 1 user user 188711447 9月 19 11:13 jdk-13_linux-x64_bin.tar.gz 在一些...解压JDK安装包中的文件 接下来使用tar指令解压压缩包，解压至/usr/lib/jvm目录下： [root@localhost /usr/download]$ mkdir /usr/lib/jvm [...，但是很可惜我们现在是手动安装，JDK的工作依赖于大量的环境变量中的路径。...总结 以上所述是小编给大家介绍的在Linux环境下采用压缩包方式安装JDK 13的方法，希望对大家有所帮助！
本内容为站长安装vsFTPd过程的笔记，如有疏漏之处欢迎指出，谢谢！...//———-安装环境———- //Linux版本：CentOS 5.5 //vsFTPd版本：vsFTPd 2.2.2 //———-准备工作———- //开始安装前，请确认系统中是否安装了db4-utils...包，如没有则先安装。...，并自定默认目录 #useradd -d /www vftp #chown -R vftp.vftp /www #chmod 744 /www #vi /etc/vsftpd.conf //编辑.../中为每个用户创建与用户名一致的权限文件 #vi /etc/vsftpd/user_config_dir/sunbloger //创建名为sunbloger的用户权限文件，并向其中写入如下权限参数：
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 按照本说明，你就可以成功的在Debian 10(Buster) Linux服务器中安装好drupal 8.8.0版本，已亲测能稳定运行。...先决条件 在开始安装之前，对安装的最低要求是： 数据库服务器，如MySQL、MariaDB、PostgreSQL、Percona、SQLite等。 Web服务器，如Nginx、Apache。...同时，要更新你的Debian 10(Buster) Linux服务器，依次运行以下命令： sudo apt update sudo apt -y upgrade sudo reboot 安装数据库、PHP...、及Web Server的说明 然后在Debian 10(Buster) Linux上为Drupal 8创建数据库和用户： $ mysql -u root -p 安装PHP及扩展： sudo apt...“在CentOS 8/RHEL 8上安装和配置Drupal 8的方法”，在上面已给出了链接，在浏览器中运行 http://example.com(以上配置的网站域) 就可以进行配置安装了，需要填写的信息相当的简单
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