众所周知，GNN和传统NN的主要区别就是以图的结构为指导，通过聚合邻居信息来学习节点表示。下面展示了GNN的经典聚合过程。 ? GNN的应用实际有个潜在的假设：图结构是正确的。...图上连接都是真实可信的。例如，社交图中的边暗示了真实的朋友关系。 但是，最近的研究发现，实际上图的结构并不是那么的可靠，如噪音连接和偶发连接。...错误的图结构加上GNN的扩散过程，会极大的降低节点表示及下游任务的表现(garbage in，garbage out)。这引发了一些关于图结构的研究，即所谓的图结构学习。...自动化所的Yanqiao Zhu等人最近发布了一篇关于图结构学习的综述，建议围观一波。 ? 如下图所示，原始的图结构经过一定的修改变成了图结构，进而提升了后续节点表示和相关任务的效果。 ?
对于解决大量数据的问题，使用Theano可能获得与手工用C实现差不多的性能。另外通过利用GPU，它能获得比CPU上快很多数量级的性能。...作者：吴茂贵，王冬，李涛，杨本法 如需转载请联系大数据（ID：hzdashuju） Theano开发者在2010年公布的测试报告中指出：在CPU上执行程序时，Theano程序性能是NumPy的1.8倍，...而在GPU上是NumPy的11倍。...Theano实际采用符号计算图模型来实现。首先创建表达式所需的变量，然后通过操作符（op）把这些变量结合在一起，如前文图2-1所示。...这种变量的值在多个函数可直接共享。可以用符号变量的地方都可以用共享变量。 但不同的是，共享变量有一个内部状态的值，这个值可以被多个函数共享。它可以存储在显存中，利用GPU提高性能。
今天的推文没有详细介绍代码，代码的介绍会以视频形式放到B站，欢迎大家关注我的B站 小明的数据分析笔记本 https://space.bilibili.com/355787260 image.png 首先是示例数据的格式...画热图的数据 image.png 用来添加文本的数据 image.png 如果还有其他文本需要添加，可以再准备一份数据 image.png 加载需要用到的R包 library(ggplot2...) library(tidyverse) #install.packages("see") library(see) ggplot2 是用来作图的 tidyverse 是用来做数据整理的 see 这个包里有很多配色函数...读取热图的数据作图 dfa<-read.csv("20211007.csv") head(dfa) pivot_longer(dfa, !...小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记
但哪怕是 K8s 老兵，也很难保证不在 etcd 上翻车： 无论是从内存泄露到数据不一致，还是从节点 crash 到性能慢，再到死锁、OOM 等稳定性问题等，甚至听说还有人通过混沌工程发现并修复了多个数据不一致...这张图出自腾讯云资深工程师唐聪，他是腾讯云 etcd 负责人、这几年他一直在和 Redis、etcd 打交道，解决过很多大规模业务增长中的存储稳定性、可扩展性等问题，积累了丰富的大规模集群实战、治理经验...唐聪说，这个专栏是他自己多年经验的交付，能解决你在学习、使用 etcd 过程中的很多问题。...在实践篇中，唐聪为你解读了 etcd 实际使用过程中可能会出现的各种典型问题，和各类复杂 etcd 问题的解决方案。...更多实践篇内容，可以参考下面的思维导图： 另外，我觉得这个课最宝贵的一点，是他利用拆解法，为你制定了大、中、小三级目标，让你每节课都有收获，通过每个小目标的实现，最终达成个人能力的提升，彻底掌握 etcd
什么是持续集成剧场 “CI 剧场描述了在实践持续集成 (CI) 时产生的幻觉，但实际上并没有在实践它。”...现实中的持续集成表演 CI长期是红色 流水线一直在失败，无人响应，有的设置了定时任务，在相当长的周期内（超过几个月时间），一直是失败状态。...不过，容易导致A创建一个用，B也创建另外一个，某天A走了，C继续开始创建新的。 结果，就是一堆流水线垃圾，纯纯的浪费。他们不明白什么是流水线的分层分级，不知道什么是抽象复用。...上面这个比较极端，还有一种情况是确实在跑流水线，但是没有任何代码变更，做无效功。 养“兵”千日用”兵“一次 军队的养兵是持续加强训练，我这里提的养兵是”圈养流水线“。...可是，你的持续集成真的做好了吗？你的团队知道什么是快速反馈立即修复吗？ DevOps三部法中的反馈是核心环节，它通过监控工具快速发现问题，通过快速修复解决问题，并通过持续的反馈优化整个开发运维流程。
前言 先前提到了60-R可视化-8-用ggsignif做统计分析绘图 (qq.com)这个包。 当时挖了一个坑： 那么问题来了，我的字体该加到哪里呢？...基本的ggplot 就够了 比如你可以将内容以captain 的形式加在图片的侧方。 ggstatsplot 就是个很好的例子： subtitle, captain 都是很不错的选择。...个人感觉，比较常见的场景是：画好了柱状图，希望在柱状图上标记出相应的数字。...当然先给你们展示一下效果啦： 在画图前，先提一个技巧。...65-R茶话会14-柱状图用col还是bar，你可以省一点空间 (qq.com) 下面简单的对数据框操作一下： iris2 <- iris iris2$group <- sample(c("a","b"
从事软件开发多年对于C/C++用的比较多，可以明确说这两种编程语言也是支持跨平台，肯定还是有很多人问什么是真正意义上的跨平台，所谓的跨平台就是同一套代码在不同的操作系统都能直接去运行，这里面涉及到一个很重要的问题...，在java这门编程语言刚开始流行的时候就提到了跨平台的功能，在windows上运行的jar包直接放在linux上也能直接去运行，单纯从C/C++角度出发也是能够实现这种功能的，因为其语法实现是相同的。...，在具体软件的核心架构上代码是一致的，和平台相关的代码还是需要单独去实现，就拿简单的线程的实现，不同的操作系统的接口就存在很大的差异，所以完全意义上的跨平台方面距离高级编程语言还是存在差异。...编译器是一种工具包的集合，内部的实现也涉及到C/C++的编程，编译器的通常说的编程代码还是存在一定的差异，编译器是为代码转化做服务的，真正实现跨平台的基础部件编译器算是一种，因为不同的操作系统或者计算机架构需要具体的对应实现...，特别是在入门的时候显得困难一些，但是入门之后会更加有意思。
图4：在图像分割中，其任务目标是对图像中的不同对象进行分类，并确定对象边界。 卷积神经网络可以帮助我们处理这个复杂的任务吗？对于更复杂的图像，我们可以使用卷积神经网络来区分图像中的不同对象及其边界吗？...在Fast R-CNN中，通过选择性搜索方法创建这些区域，这是一个相当缓慢的过程，被认为是整个流程的短板。 ? 图11：微软研究院首席研究员孙剑是Faster R-CNN网络团队的领导者。...图13：区域建议网络在CNN特征图谱上依次滑动一个窗口。在每个窗口位置上，网络在每个锚点上输出一个分值和一个边界框。因此，一共有4k个边界框坐标，其中k是锚点的数量。...图14：一般来说，带有人物形象的边框往往是竖长的矩形。我们可以使用这种常理，通过创建这样维度的位置，来指导生成区域建议网络。 直观上，我们知道图像中的对象应该符合某些常见的纵横比和大小。...例如，我们想要创建一些适合人类形状的矩形框。这样当遇到非常窄的边界框时可以排除是人类对象的可能性。以这种方式，我们创建大小为k的通用长宽比，称为锚点盒（anchor box）。
10【课前准备】因为我的电脑内存比较小，所以我是在服务器上跑R，是4.1版本，里面有一些之前的数据和安装的很多的R包。...，然后尽可能优先使用本地，因为我们主要是做基于r语言的统计格式化，实际上对大的计算资源要求并不高。...18【课前准备】想请教一下，安装完R包发现里面没有视频里老师讲的KEGG.db怎么办 这个包可能是过期了，没关系的，不影响上课。...23【R绘图】我今天尝试在课件中的堆叠条形图代码的基础上增加黑色边框，其中与黑色边框设置的代码如图，但是运行后得到的边框始终是红色，未见报错，想问一下原因和解决办法 根据数据变化的参数放在aes里，这个...因为rstudio是在r这个频道里，我们没有添加过，所以找不到。另外，因为我们用的大多数r包是在bioconda频道里的，即使需要安装r包，一般也不需要添加r这个频道的。
求助老师，这个神奇的org.Hs.eg.db包到底怎样装才对，总是装的时候没问题，加载就报错，包还用不了 这个包可能是在更新，很多人最近遇到了这个问题，试试安装旧版本 关于 library("org.Hs.eg.db...还是有什么其他的好法子呢 等待老师赐教[愉快] 有几种解决方法，一、联系你们服务器管理员升级一下服务器上的R；二、自己用conda创建一个小环境，装R 4.0，然后在小环境装这个包 方法一比较方便一些，...k大小写 在做生存分析的数据准备的时候，在以code作为行名的时候出现了这种状况怎么处理？这种是正常的吗？ ? ? 这个数据也是xena下载的，为什么？...我不知道你说的三图联动是两张图，分别画的意思，是吗？...子图和子图之间本来就应该有间隔，如果你觉得非常重要，必须去掉，那你只能去搜一下ggpl里面怎样能把分面的时候两张图之间的间隔调整一下，有可能会有那样的参数。 这个该如何解决？ ?
R-FCN 还记得 Fast R-CNN 是如何通过在所有 region proposal 上共享同一个 CNN，来改善检测速度的吗？...以下是 R-FCN 的工作方式： 在输入图像上运行一个 CNN（本例中使用的是 ResNet）。 添加一个全卷积层，以生成位置敏感分数图的 score bank。...比如，如果我们处在「上-左」子区域，那我们就会获取与这个目标「上-左」子区域对应的分数图，并且在感兴趣区域（RoI region）里对那些值取平均。对每个类我们都要进行这个过程。...下面是 R-FCN 的示意图，用 RPN 生成 RoI： ? 当然，即便有上述文字以及图片的解释，你可能仍然不太明白这个模型的工作方式。...，「这看起来像是婴儿的『上-中』部分吗？」，「这看起来像是婴儿的『上-右』部分吗？」等等。系统会对所有类重复这个过程。如果有足够的子区域表示「是的，我的确匹配婴儿的这个部分！」
这些数据类型在我们运用R语言解决实际问题的时候都非常有用，在上节的例子中我们是在R里面直接生成的数据，但是实际数据分析中，如何快速灵活的读取和处理多种格式的外部数据呢？...图4：函数fix()的使用（2） 第一种方法是在创建data.txt字符串之后，用函数read.table()创建数据框data.1。这种用法可以让我们把数据嵌入R代码中去。...从文本文件导入数据 要求：必须掌握 在上文的第一种方法中，函数read.table()是从键盘输入的字符串变量里面创建数据框的，这种方法并不适用，实际上read.table()函数的功能要更加强大一些...函数read.table()更加常用的是从带有分隔符的文本文件中读入数据并创建数据框（实际上csv文件就是常见的带分隔符的文本文件，其分隔符是逗号“，”，csv文件可以通过文本编辑器或者excel软件创建...这个函数的命名和用法都和read.table()非常类似（如图9），大家不妨自己尝试一下如何使用这个函数。 ? 图8:包openxlsx的安装 ? 图9:函数read.xlsx()的参数 4.
在图像分割中，我们的目的是对图像中的不同目标进行分类，并确定其边界。来源：Mask R-CNN 卷积神经网络可以帮我们处理如此复杂的任务吗？...Faster R-CNN 在 CNN 特征的顶部添加了一个简单的完全卷积网络，创建了所谓的区域提案网络。 ? 区域提案网络在 CNN 的特征上滑动一个窗口。...考虑到这些锚点框，我们来看看区域提案网络的输入和输出： 输入：CNN 特征图。 输出：每个锚点的边界框。分值表征边界框中的图像作为目标的可能性。...我们能进一步扩展这些技术，定位每个目标的精确像素，而非仅限于边框吗？这个问题被称为图像分割。...输出：在像素属于目标的所有位置上都有 1s 的矩阵，其他位置为 0s（这称为二进制 mask）。 但 Mask R-CNN 作者不得不进行一个小的调整，使这个流程按预期工作。
线程池的源码解析较为繁琐。各位同学必须先大体上理解线程池的核心原理后，方可进入线程池的源码分析过程。...corePoolSize核心线程 线程池的基本大小，即在没有任务需要执行的时候线程池的大小，并且只有在工作队列满了的情况下才会创建超出这个数量的线程。 核心线程是否会被回收？...核心线程将一直保存在线程池中 哪怕核心线程是处于空闲状态，也可以不回收 allowCoreThreadTimeOut参数可以控制是否回收核心线程 在刚刚创建线程池的时候，核心线程并不会立即启动，而是要等到有任务提交时才会启动...这里值得一提的是largestPoolSize，该变量记录了线程池在整个生命周期中曾经出现的最大线程个数。为什么说是曾经呢？...非核心线程是会被回收的 keepAliveTime/unit控制非核心线程最大的空闲时间，超过这个时间还没有任务可以执行，非核心线程将会被回收 线程工厂 顾名思义，现场工厂就是线程池创建线程的工厂。
老师，这个是r的版本不行，所以没安装吗 这个是已经安装好了的意思 warning不用管 不是报错。...老师，我在将数据导出成pptx格式的时候，发现那个火山图出来的pptx可能因为数据点太多，导致程序动不了了，有什么好的解决办法不？...点太多了，几万个可编辑元素一起上，扛不住就对了,导出成pdf格式 在ai中打开。 老师 我用pheatmap做了这张热图，想把这张热图中右边高表达的放在上面，应该怎么设置参数实现呢？...5套单细胞数据分析代码，腾讯微云里面：https://share.weiyun.com/R4F8i9Hu 老师，我这个PCA图用上课时候的代码运行的，分组只有RA，PCA图做出来也没有control 组...我装salmon的时候遇到这个报错，可以请老师帮忙看一下嘛？（我是装在自己买的云服务器上的） 这个问题授课提到的，有一个error pdf。
如果对比左右两张图，你可能会发现右图的脸颊更宽，而左图中更瘦，尤其是靠近下巴一块；右图的嘴角下垂，而左图嘴唇是微笑的状态。 但如果只看左图呢？你能看出来脸颊被 P 过的痕迹吗？...三张图的嘴角弧度不同，原图很明显是下垂的，而修过的图片则是微笑唇，撤销修图后的图片嘴角弧度则处于中间状态。 这些图像被 P 过吗？ 研究人员训练了一个卷积神经网络，以识别出修改过的人脸图像。...能还原回去吗？ 这个工具还能确定面部修改的特定区域和方法。此外，在实验中，该工具可以将修改后的图像还原至它们初始状态，还原效果相当不错。...具体而言，研究人员预测从原图 X_orig ∈ R^(H×W×3) 到修改后的图 X 的光流场（optical flow field）Uˆ ∈ R^(H×W×2)。...UC Berkeley 的教授 Alexei A. Efros 说道：「这听起来似乎是不可能的，因为面部几何形状存在着大量的变化。
识别 PS 照片的问题，还是需要依靠推出 PS 的公司 Adobe 来解决。 现在的社交媒体上充斥着各种自拍，而且其中大部分人物都长得挺好看。但大家心知肚明的是，这些照片大多被 P 过。...如果对比左右两张图，你可能会发现右图的脸颊更宽，而左图中更瘦，尤其是靠近下巴一块；右图的嘴角下垂，而左图嘴唇是微笑的状态。 但如果只看左图呢？你能看出来脸颊被 P 过的痕迹吗？...三张图的嘴角弧度不同，原图很明显是下垂的，而修过的图片则是微笑唇，撤销修图后的图片嘴角弧度则处于中间状态。 这些图像被 P 过吗？ 研究人员训练了一个卷积神经网络，以识别出修改过的人脸图像。...能还原回去吗？ 这个工具还能确定面部修改的特定区域和方法。此外，在实验中，该工具可以将修改后的图像还原至它们初始状态，还原效果相当不错。...具体而言，研究人员预测从原图 X_orig ∈ R^(H×W×3) 到修改后的图 X 的光流场（optical flow field）Uˆ ∈ R^(H×W×2)。
如果可以访问还需要运行这一部分吗 是访问起来比较慢，如果你在海外就不需要设置镜像啦。 7请问这个warning 是报错吗 这是你的网络访问清华镜像有点问题，你试试换个网络环境。...会影响吗？ 不需要，没有影响。 14我的R是4.3.0版本，这个安装包是要求4.3.1，我怎么升级我的R版本到4.3.1，不影响之前包的使用啊 ？...25小洁老师使用的截图软件是这个么 对。 26“=”和“<-”可以理解为是具有同样的赋值功能么 是的，这两个是等价的。 27我想问一下这个位置就是显示的已经安装过的R包吗？ 对的。...34这个新建的矩阵；如一：得到的是5行2列；如二得到的是4行3列；创建的时候，我们指定了行，那几列是怎么生成的 矩阵数据的元素数量/nrow，如果是小数就进一。...57请问大家在rna环境中安装multiqc这个软件时会有安装不上的情况吗，具体表现为一直在solving environment，但切换安装同一环境下的其他软件时却可以 可能是遇到了软件之间的冲突 如果持续遇到相同的问题
以下是解决任何ML问题时我所采取的步骤： a.了解数据——下载数据后，开始探索功能。 查看数据类型。 检查变量类。 创建一些单变量-双变量图来了解变量的性质。...如果一个人在Kaggle上做得很好，那么她会在她的职业生涯中成为一名成功的数据科学家吗？ 有一定比例的重叠，特别是在制作预测模型时，通过python / R处理数据并创建报告和可视化。...可能只是其他算法在处理这个任务时比其他算法更好（例如基于树的应用程序应该能够处理这个）。 28.通常，营销研究问题主要通过标准回归技术来处理 - 线性和逻辑回归，聚类，因子分析等。...它们在某种意义上是有用的，你可以很有可能提高准确度（在预测上我们说营销反应）与线性模型（如回归）。 解释输出是很困难的，在我看来，这不是必要的，因为我们一般都会走向更多的黑盒子和复杂的解决方案。...一段时间后，你将创建可以相对较快处理这个的管道。 但是，你总是需要在这方面花时间。 32.如何在没有强大的机器的情况下计算大数据？
原因就是：你没看到tools:layout_editor_absoluteX="189dp"这个属性吗？这个属性是系统帮我们生成的X轴的绝对坐标。...2.Baseline，end和start属性 关于end和start属性我之前说过区别，Baseline(基线)可能没有提到，官方有一张图可以很好的表达出来，如下： ?...百分比尺寸（Percent Dimensions）和 宽高比（Ratio） 关于这个宽高比，我上一篇文章说过，就是app:layout_constraintDimensionRatio="16:6"这个属性...Placeholder placeholder这个词在英文中的意思是占位符，顾名思义，它就是用来占位的。...我们直接代码，我的目的是在布局底部的左右两边各放一个Imageview,第一部先创建一个placeholder的文件夹，和平时创建一样，内容如下： ?
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