在撰写本文时，ggplot2涉及在CRAN上的超过2,000个包和其他地方的更多包！在包中使用ggplot2编程增加了几个约束，特别是如果你想将包提交给CRAN。...尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...由用户指定列名和表达式，而你想要你的函数能够有aes()同样的方式执行非标准计算。 如果你已经像上面的例子一样事先知道了列名，你可以使用来自rlang[2]的代词.data指代你要使用的图层数据。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法，但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的
该点子来源于一个小作业，作业要求是使用R平台相关绘图工具绘制中国疫情热力图(10分)，参考效果如下图： ? 第一次使用R绘制地图的我，一脸懵逼。...于是我开始翻书（《R语言数据可视化之美》，《ggplot2》），《R数据科学》），以及百度搜索。找到了几篇很实在的blog（见文末）。...,xs,type="full")#基于id进行连接 a = data.frame(unique(china_map@data$NAME))#省份名称 接下来准备我们的数据，数据主要来自丁香园，是某一天的中国各省数据...基于两个表格相同属性（NAME）进行合并，这样就可以把模板中的地理信息一起合在一起了，这是关键步骤。 ?...data_dt.csv",header=T,as.is=T) china_data <- join(china_map_data, mydata, type="full")#基于NAME字段进行连接，NAME字段来自于地图文件中
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何通过R代码绘制调色板图，大家可根据自己喜爱整理常用的调色板方便后期使用，整个过程仅参考。希望对各位观众老爷能有所帮助。..."col.xls") rgb_df <- col2rgb(hex_df$color_hex) lab_df <- convertColor(t(rgb_df), 'sRGB', 'Lab') 绘制单个调色板...df <- data.frame(color = hex_df$color_hex[order(lab_df[, 'L'])]) df %>% ggplot(aes(x = color, y...(colors = colors, x = 1:length(colors)) p <- ggplot(df, aes(x = x, y = 1, fill = colors)) +...，使用上方代码整合成调色版图进而还可制作成R包方便后期使用，本节介绍到此结束
下面是如何使用样本数据集exrates1准备数据的说明。 图1提供了该数据集中时间序列的可视化。...此函数仅产生SV流程的实现，并返回svsim类的对象，该对象具有自己的print，summary和plot方法。 下面给出了使用svsim的示例代码，该模拟实例显示在图2中。...svsample的返回值是svdraws类型的对象，该对象是具有八个元素的命名列表，其中包含（1）参数在para中绘制，（2）潜在的对数波动率，（3）初始潜在的对数波动率绘制latent0，（4）y中提供的数据...，（5）运行时中的采样运行时，（6）先验中的先验超参数，（7）细化中的细化值，以及（8）这些图的汇总统计信息，以及一些常见的转换。...如果showpara为TRUE（默认设置），则会显示参数绘制的值/摘要。如果showlatent为TRUE（默认值），则显示潜在变量绘制的值/摘要。在下面的示例中，仅显示参数绘制的摘要。
= Sample) 并使用geom_smooth in 绘制带有数据的拟合线 ggplot ggplot(Sample, aes(x, y)) + geom_point() + geom_smooth(...---- 点击标题查阅往期内容 【视频】广义相加模型（GAM）在电力负荷预测中的应用 左右滑动查看更多 01 02 03 04 运行分析 在R中运行GAM。...您可以通过plot 在拟合的gam模型上调用函数来绘制局部效果 ，还可以查看参数项，也可以使用 termplot 函数。...点击标题查阅往期内容 【视频】广义相加模型（GAM）在电力负荷预测中的应用 分位数回归、GAM样条曲线、指数平滑和SARIMA对电力负荷时间序列预测 实现广义相加模型GAM和普通最小二乘(OLS)回归...R语言中的多项式回归、B样条曲线(B-spline Curves)回归 R语言广义相加模型 (GAMs)分析预测CO2时间序列数据 R语言中实现广义相加模型GAM和普通最小二乘(OLS)回归 在r语言中使用
之前在公众号中分享过绘制LOGO的R包"gglogo"，详情请戳蓝字“绘制序列标识图-gglogo”。今天再给大家分享一个R包-"ggseqlogo"，绘制序列LOGO完全无需美颜。...这个R包是ggplot2的扩展包，应用起来简单明了，下边就给大家详细测试下，看看是不是那么美，那么好！...logo ggseqlogo(seqs_dna$MA0001.1, col_scheme=cs2) 多序列logo绘图 在facet的帮助下，可以同时绘制多个序列标识。"...中，用ggplot2将注释覆盖到序列标志上是很简单的。...，可见作者在编写的过程中还是很用心的，R包说明文档写得也很详细，在这里推荐给大家，快来试试看吧！
今天小编给大家推荐一个优秀的颜色映射R包-ggchromatic，该包提供了额外的fill和colour等选项，可将变量值映射到不用的颜色值上，且其作为ggplot2的拓展包，用起来也十分方便。...) library(LaCroixColoR) library(RColorBrewer) library(ggchromatic) #可视化绘制 ggplot(mtcars, aes(mpg, disp...()」 + geom_point(aes(colour = rgb_spec(mpg, drat, wt)),size=4) + Colour Example02 Of rgb_spec() 或者绘制一下效果...： ggplot(iris, aes(Sepal.Width, Sepal.Length)) + geom_point(aes(colour = rgb_spec(Species, sample(...R-ggchromatic包的颜色映射功能，较常规映射，其提供的颜色样式更加多样，且图例也更加丰富，虽然色彩空间可能不是解释数据可视化的最直观的工具，但对于可视化作品来说，合理的颜色设置对于数据所表现的内容来说
Lubridate包可以减少在R中操作时间变量，内置函数提供了很好的解析日期与时间的便利方法。lubridate 包是 Hadley Wickham开发的用于高效处理时间数据的 R 包。...在ggplot2中有两个主要绘图函数：qplot()以及ggplot()。 qplot: 顾名思义，快速绘图； ggplot：远比qplot()强大，可以一步步绘制十分复杂的图形。...由ggplot2绘制出来的ggplot图可以作为一个变量，然后由print()显示出来。 本文将使用R语言gcookbook包内数据集pg_mean。...（4）地图 使用maps包绘制的地图与其他ggplot2图形的结合变得十分方便。...可以方便的与ggplot进行涂层叠加，实现在R中的地图绘制需求。 ggmap包中的函数 get_map：ggmap包中最基本函数，用来下载地图。 geocode：用来返回某地的经纬度。
本期推文我们就介绍下使用R进行核密度估计、空间插值计算以及ggplot2+sf的可视化绘制操作。...涉及的主要知识点如下： R-sm包计算核密度估计结果 R-SP包转换网格插值结果 R-ggplot2+sf包绘制网格插值结果 R-sf包实现完美“裁剪” R-sm包计算核密度估计结果 sf包散点位置可视化...在计算核密度估计之前，我们先使用sf包进行散点的可视化绘制。...使用data.frame()将结果转成data.frame()类型便于ggplot2和sf包绘制。...R-ggplot2+sf包绘制网格插值结果 接下来，我们将上方的核密度估计结果进行可视化绘制，首先，我们绘制插值的网格结果： #自定义颜色 my_colormap <- colorRampPalette
今天小编给大家推荐一个优秀的颜色映射R包-ggchromatic，该包提供了额外的fill和colour等选项，可将变量值映射到不用的颜色值上，且其作为ggplot2的拓展包，用起来也十分方便。...) library(LaCroixColoR) library(RColorBrewer) library(ggchromatic) #可视化绘制 ggplot(mtcars, aes(mpg, disp...()」 + geom_point(aes(colour = rgb_spec(mpg, drat, wt)),size=4) + Colour Example02 Of rgb_spec() 或者绘制一下效果...包样例的简单介绍，更多详细绘图函数及参数，可参考R-ggchromatic包官网[1] 总计 今天的推文我们简单介绍了R-ggchromatic包的颜色映射功能，较常规映射，其提供的颜色样式更加多样，且图例也更加丰富...，虽然色彩空间可能不是解释数据可视化的最直观的工具，但对于可视化作品来说，合理的颜色设置对于数据所表现的内容来说，还是蛮重要的，希望本期的推文能够对大家有所帮助~~ 参考资料 [1]R-ggchromatic
简介 在生物信息分析中，经常会做序列分析图（sequence logo），这里的序列指的是核苷酸(DNA/RNA链中)或氨基酸(在蛋白质序列中)。...sequence logo图是用来可视化一段序列某个位点的保守性，据根提供的序列组展示位点信息。常用于描述序列特征，如DNA中的蛋白质结合位点或蛋白质中的功能单元。...实现以上可视化过程的工具有很多，本文介绍一个使用起来非常简单，不拖泥带水的R包ggseqlogo，只要你根据此包要求的数据格式上传一堆DNA序列或者氨基酸序列，再根据现成的命令流程就能画出logo图。...ggseqlogo(seqs_dna$MA0001.1) 输入格式 ggseqlogo支持以下几种类型数据输入： 序列 矩阵 下面是使用数据中的位置频率矩阵生成的seqlogo ggseqlogo(pfms_dna...R统计和作图 Graphpad，经典绘图工具初学初探 维恩(Venn)图绘制工具大全 （在线+R包） 在R中赞扬下努力工作的你，奖励一份CheatShet 别人的电子书，你的电子书，都在bookdown
主要功能是可以把html文件保存为 png 或者 pdf 格式 2 pez 系统全面的系统发育R包 3 ggprism 在 YuLabSMU 公众号看到的推文 用ggplot2出GraphPad prism...的图，坐标轴好多可选 4 r3dmol 在 YuLabSMU 公众号看到的推文 在R中对分子结构进行3D可视化 5 epiR 该包集合了流行病学中诸多描述性分析的函数。...19 tastypie 绘制漂亮的饼图的R版 公众号 R语言统计与绘图 推文 tastypie包，绘制漂亮的饼图R包 ? image.png ?...，这个时候可以用这个包中的函数 如下代码 library(ggnewscale) library(ggplot2) df1<-data.frame(A=1:4, B=LETTERS...图片来自于公众号 R语言数据分析指南 如果只用gplot2的函数把坐标调整成这种效果，还是不太容易的 26 visdat 可视化展示数据框中的变量类型和缺失值 代码 install.packages("
----点击标题查阅往期内容【视频】广义相加模型（GAM）在电力负荷预测中的应用左右滑动查看更多01020304运行分析在R中运行GAM。...要运行GAM，我们使用：gam_y <- gam(y ~ s(x), method = "REML")要提取拟合值，我们可以predict ：predict(gam_y, data.frame(x =...您可以通过plot 在拟合的gam模型上调用函数来绘制局部效果 ，还可以查看参数项，也可以使用 termplot 函数。...点击标题查阅往期内容【视频】广义相加模型（GAM）在电力负荷预测中的应用分位数回归、GAM样条曲线、指数平滑和SARIMA对电力负荷时间序列预测实现广义相加模型GAM和普通最小二乘(OLS)回归R语言非参数模型厘定保险费率...(B-spline Curves)回归R语言广义相加模型 (GAMs)分析预测CO2时间序列数据R语言中实现广义相加模型GAM和普通最小二乘(OLS)回归在r语言中使用GAM（广义相加模型）进行电力负荷时间序列分析
背景介绍 最近小编在阅读文献发现了文献中使用了一些精美的树状图，觉得非常漂亮，随后又去网上学习树状图的画法，顺便还学习了一种有趣的圆形树状图，在这里小编一起分享给大家，并且介绍今天的主角，树状图绘制R包...ggtree是一个功能强大的系统发育树可视化及注释R语言软件包，在Bioconductor中发布，是ggplot2的扩展包。ggtree可以读取多种数据格式的系统发育树，并对其进行注释分析。...但是它只能将与树相关的数据的数字值绘制为气泡，并且无法生成图例。Phylobase还不支持将关联数据改变例如颜色，大小和形状等特征。这些特征需要大家手动添加。..., length.out = 5), lab = names(geospiza_raw$data)) ## 使用存储在“g2”中的数据直接绘制气泡图 p1 <- ggtree...输入是ggplot图形对象的命名列表（可以是任何类型的图表）。还可以使用ggplotify将其他功能生成的图转换为ggplot对象，然后在geom_inset中使用该对象。
绘制这种图表也是超级简单的，只需使用R-ggpol包进行绘制即可，当然，改包还提供其他优秀的绘图函数，下面就一起来看下吧。...R-ggpol包简介 R-ggpol包实例介绍(议会图为主) R-ggpol包简介 官网： https://github.com/erocoar/ggpol 绘图函数 作为ggplot2绘图系统中的一员...geom_tshighlight(): 可对绘制时间序列的图表进行突出作用，也是比较常用的绘图技巧。 geom_boxjitter(): 绘制了一个混合箱形图-半箱形图且带有误差线的图。...geom_boxjitter example 顺便提一下，很喜欢sci包的这个配色，特适合绘制科研图表哦~~ 「geom_tshighlight」 (可对绘制时间序列的图表进行突出作用，也是比较常用的绘图技巧...geom_arcbar example 这里我们在hrbrthemes::theme_ipsum() 主题基础上进行了一些修改，具体代码中均有解释。
在这篇文章中，我们将学习如何操控R中的字符串，主要用的是Biostrings包。...IRanges 就像Views能够被用来查看子序列。一个通常的任务是描述染色体一系列的起始位点，并接着查看每个起始位点给定长度后的子序列。...我们将会使用来自UCSC基因组资源库的人类基因组版本19中8号染色体的数据(If you have plenty of space and a larger computer, you can prepare...当然，你也可以下载 seqChr8.fasta 到你的工作目录，然后运行： seqChr8 = readDNAStringSet("seqChr8.fasta")[[1]] 下一步，我们用R下载CpG岛在基因组上的位置数据...), rgb(1, 0, 0, 0.5))) 用ggplot来画： ggplot(freqCombined) + geom_histogram(aes(fill = type, x = freq),
（譬如个人在下面10个维度的得分，可以知道数学、英语、生物、音乐及运动等部分还需加强） image.png 本文主要介绍在R中如何绘制雷达图，并计算雷达图的面积。...radarchart(df, cglty = 1, cglcol = "gray", pcol = 4, plwd = 2, pfcol = rgb...绘制 ggplot绘制就不再赘述，请见：BEAUTIFUL RADAR CHART IN R USING FMSB AND GGPLOT PACKAGES image.png 2.雷达图面积计算 这里稍微复杂一点...但是过程很复杂放弃了，如果你们有更好的方法，可以帮忙补充。。。 这里有其他大神提供的思路：how-to-measure-the-area-of-a-polygon-in-ggplot2但是过于复杂。...先绘制一个雷达图的形状。然后确定各个点的坐标位置。
这个R教程讲解如何使用R和ggplot2包创建线图。 在一个线图中，观察值都按照x排列并连接起来。 可以使用函数geom_line()、geom_step()或geom_path()。...x值可以是： 日期：对于时间序列数据 文本 离散的数值 连续的数值 ?...ggplot2 line plot - R software and data visualization 基本的线图 数据 这里使用的数据来自数据集ToothGrowth，描述了不同剂量药物下牙齿的生长情况...观察值还可以使用函数geom_step()或geom_path() 进行连接： ggplot(data=df, aes(x=dose, y=len, group=1)) + geom_step()+...阅读ggplot2图例： ggplot2 legend[5] 带数值型x轴的线图 如果x轴的变量是数值型，我可以可以将它根据自己的需要看做连续值或转换为因子变量。
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