简介 R文档沟通前两期内容： R沟通｜舍弃Latex，拥抱Rbeamer吧！ R沟通｜制作个性化ppt！...这期主要介绍下如何在Rstudio中运行和使用.tex文件，并给大家安利一个非常nice的模板和根据该模板制作的案例。...使用教程 在ElegantPaper[1]网站中下载整个仓库，可以直接下载到本地github或者下载压缩包。 ?...解压压缩包，找到主要的.tex文件（比如这里的中文文件cn），通过Rstudio打开。 ? 点击Compile PDF即可得到模板对应的paper了。 ? ?...>> 当然该模板也有很多别人使用，制作后的文章和文件都在github中： Risk Awareness（风险意识）文档说明[3] Bank Custody （银行存管）说明[4
而基于容器编排技术的Kubernetes，已然成为业界事实标准，容器化，云原生一跃成为近几年云计算领域最火的关键字，是企业数字化转型过程中的重要技术选型环节。 ?...service服务发现pod在集群内部的ip是变化的，给对外服务提供代理。...计算存储分离保证RDS的数据一致 数据一致是有状态服务的基础，在没有Docker和K8S平台的时期，计算存储分离是早期IOE的经典架构，计算和存储节点之间利用高速网络互联，如10GB万兆以太网，16GB...存储资源独立扩展, 架构更清晰, 部署更容易 将有状态的数据下沉到存储层, Scheduler 调度时, 无需感知计算节点的存储介质, 只需调度到满足计算资源要求的 Node, 数据库实例启动时, 只需在分布式文件系统挂载...但有个特点，就是新RDS应用的IP会和之前不一样。而对应的结果就是要更新keepalived配置文件中的realserver(rs)。
由于RDS(Oracle)不直接支持SSH，FTP(基于安全因素吧).所以原有系统expdp或exp出来的dmp文件，不能直接导入到RDS中。...查找各种文档发现，可以通过Oracle自身的UTL_FILE包来写dmp文件到RDS的文件夹里，读取EC2里的本地文件部分通过Python脚本实现，这样变相实现了，从EC2本地上传到RDS的功能。...代码如下: def cpy_to_rds(): file_name = 'test4.dmp' src_name = 'c:/testdata/test4.dmp' #在RDS,...UTL_FILE_CREATE_FILE语句也可以转换为RDS中的一个Function函数: create or replace function gen_dmp(i_name IN VARCHAR2,...中调用此函数，这样chunk就可以设置到32767最大值了. def cpy_to_rds_func(): file_name = 'tes4.dmp' src_name = 'c:/testdata
看到一个成熟的R包，所以推荐一下 https://knausb.github.io/vcfR_documentation/ https://cran.r-project.org/web/packages.../vcfR/vignettes/intro_to_vcfR.html 最重要的使用方法，当然是读入vcf文件啦，如下： library(vcfR) vcf_file='/Users/jmzeng/germline.../merge.dbsnp.vcf' vcf <- read.vcfR( vcf_file, verbose = FALSE ) 十几秒钟就轻轻松松读入一个300多M的vcf文件啦，成为一个S4对象： >...212,875 variants Object size: 356.6 Mb 0 percent missing data ***** ***** ***** > 懂R的朋友就应该是知道如何去查看帮助文档来学习它啦...，而fix存储在vcf的固定列，gt存储在样本基因型信息。
语法 以下是在代码中引用资源的语法： [.]R.....比如：anim=0x01占用1个字节，那么在这个编译出的所有R文件中anim 的值都是 0x01】 EntryId:是在具体的类型下资源实例的id值，从0开始，依次递增，他占用四个字节。...源码依赖的 Lib 库的 R 文件会重新在 app 模块的 build 目录中重新生成一个相同的R 文件只不过 资源ID 前面添加了 final 关键词变成了常量； aar 依赖的 Lib 库的R 文件会更具....txt 文件中的内容，在 app 模块的 build 目录中重新生成一个R 文件而且 资源ID 是添加了 final 关键词的常量； 其 R 文件的生成目录和 主app 的 R 文件是相同的； [APP_R_JAVA.png...主工程的代码编译时在R 文件生成之后的，所以主工程的资源引用值都是常量且内联为常量值。 其实这一点也和之前 R 文件结构中的知识点对应起来。R文件 是在编译主工程的时候进行合并、排序、赋值的。
要想在jupyter notebook中运行R语言其实非常简单，按顺序安装下面扩展包即可： install.package('repr','IRdisplay','evaluate','crayon',...devtools','uuid','digest') library(devtools) install_github("IRkernel/IRkernel") IRkernel::installspec() 在R...中执行上述四行代码，重新打开你的jupyternotebook即可看到对于R的支持标志： ?
尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...引用ggplot2函数 与引用其他包类似，你需要在DESCRIPTION文件下的Imports条目下列出ggplot2，并使用::访问ggplot2提供的函数。...有时候在开发R包时为了保证正常运行，不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。...= 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法，但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的
并且在1.21中完善了windows系统下的extension的bug。...▶ pip install radian 四 在R中安装languageserver和jsonlite R LSP client需要借助languageserver实现函数的智能识别，R session...的配置 Path中添加R的执行文件的路径，当然也可以选择radian.exe的路径（该路径存在于python的scripts文件夹中）。...2 在文件中找到Rprofile.site文件，编辑脚本，插入以下这段代码 ▶ source(file.path(if (.Platform$OS.type == "windows") file.path...中运行的话，则会出现R session watcher不启用的状况，data和plot的review窗口则会自动调用自身gui所带的review窗口，以在windows中选择radian.exe路径为例
我希望每次在docker容器中安装vi的时候谁会给我1美元...我想要一个在运行的docker容器编辑文件的更简单的方式。首先，尝试避免编辑文件，这违背了容器的哲学理念（见最后一段）。...– copy（复制）在选择的容器中并启用 ，最后输出zedrem会话的远程链接。...zedrem客户端 在指定的路径中为文件服务的小程序。...Jérôme Petazzoni提供了一个带有帮助脚本:docker-enter包装好的nsenter。...如果你真的需要在docker容器中编辑文件，请使用卷。 如果你已经启用了一个容器，并且有问题的文件又不在一个卷上，这个方法还是很好用的。
步骤①：打开设置，【Files】→【Settings】 步骤②：打开文件类型设置界面，【Editor】→【File Types】→【Ignored Files and Folders】，忽略文件或文件夹显示...步骤③：添加你要隐藏的文件名称或文件夹名称，可以使用*号通配符，表示任意，设置完毕即可 到这里就做完了，其实就是Idea的一个小功能 总结 Idea中隐藏指定文件或指定类型文件 【Files】→
在Linux系统中，有时候我们需要批量重命名文件夹中的所有文件，以便更好地组织和管理文件。本文将详细介绍几种在Linux中重命名文件夹中所有文件的方法，包括使用命令行工具和脚本等方式。...在执行mv命令之前，可以先执行一个测试命令来确认重命名操作是否符合预期。ls -l这将列出文件夹中的文件，并显示它们的详细信息。确保重命名操作没有出现错误，并且文件名已按预期修改。执行重命名操作。...然后，在终端中运行以下命令来执行脚本：bash rename_script.sh脚本将遍历文件夹中的所有文件，检查文件的扩展名是否为.txt，如果是，则将其重命名为.md。...结语通过使用mv命令、rename命令和脚本，我们可以在Linux中轻松地重命名文件夹中的所有文件。本文详细介绍了三种常用的方法，包括使用mv命令、rename命令和编写脚本来实现批量重命名操作。...使用mv命令可以直接在命令行中执行简单的重命名操作，适用于简单的文件名修改。通过结合通配符和新旧文件名模式，我们可以轻松地重命名文件夹中的所有文件。
前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子（factor） 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。 我们还是以TCGA数据中的CHOL（胆管癌）这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper...☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 接下来我们先读入临床数据 #读取临床数据 clin=read.table("clinical.tsv...】R中的因子（factor） ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper ☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息...☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub
概率函数为f(k;r,p)=choose(k+r-1,r-1)*p^r*(1-p)^k, 当r=1时这个特例分布是几何分布 rnbinom(n,size,prob,mu) 其中n是需要产生的随机数个数，...size是概率函数中的r，即连续成功的次数，prob是单词成功的概率，mu未知.....如某一服务设施在一定时间内到达的人数，电话交换机接到呼叫的次数，汽车站台的候客人数，机器出现的故障数，自然灾害发生的次数等等. rpois(n, lambda) dpois(x,lambda) 连续型...mean+3sd)几乎是在肯定的。...Gamma分布中的参数α，称为形状参数（shape parameter），即上式中的s，β称为尺度参数（scale parameter）上式中的a E(x)=s*a, Var(x)=s*a^2.
有时候我们想提取PDF中的文本不得不借助一些转化软件，本次教程给大家介绍一下如何简单从pdf文件中提取文本的R包。 安装R包： install.packages("pdftools")。...读取文本的命令： txt=pdf_txt(“文件路径”)。 获取每页的内容，命令：txt[n] 获取第n页的内容。 获取pdf文件目录： doc=pdf_toc(“文件路径”)。...当然doc变量中的目录还不是标准化的格式，那么我们需要一个通用json格式，需要安装R包jsoblite。
在Ubuntu中安装Samba文件服务安装 samba 服务root@v:~# apt install samba samba-commonroot@v:~# 创建共享目录root@v:~# mkdir.../cby/smb/ -pvroot@v:~# chmod 777 -R /cby/smb/root@v:~# 修改配置文件# 编写配置文件 实现匿名访问[share]path = /cby/smbpublic
[toc] 在R中根据shapefile进行点的抠取 当我们有一个图层文件时候，然后再放些采样点在该图层上，发现，某些采样点落在地图的外面，如下图所示。...如果用Arcgis操作，很容易把外围的点抹去，保留图层内的点，那么如果在R里面，实现该操作呢。 image.png 本篇文章，主要介绍在R中实现根据shp文件进行地图点的抠取。...数据准备 首先我们利用广西，云南为案例，随机生成一些散在的点。...#### 根据shp文件进行抠图 library(rgdal) spg = df_point # 1)point change to SpatialPixelsDataFrame coordinates...= raster(shape, res=0.05) shape_r = rasterize(shape, r, "val") plot(shape_r) plot(shape,add=T) 参考
当你在你的 Linux 桌面、服务器或任何应用中遇到问题时，你会首先查看各自的日志文件。日志文件通常是来自应用的文本和信息流，上面有一个时间戳。它可以帮助你缩小具体的实例，并帮助你找到任何问题的原因。...一般来说，所有的日志文件都位于 /var/log 中。这个目录包含以 .log 为扩展名的特定应用、服务的日志文件，它还包含单独的其他目录，这些目录包含其日志文件。.../log/dmesg 如果你想监控 http 或 sftp 或任何服务器，你也可以在这个命令中监控它们各自的日志文件。...使用 lnav（日志文件浏览器） lnav Running lnav 是一个很好的工具，你可以用它来通过彩色编码的信息以更有条理的方式监控日志文件。在 Linux 系统中，它不是默认安装的。...使用 lnav，你可以通过 SQL 查询日志文件，以及其他很酷的功能，你可以在它的 官方网站 上了解。
与基本的文本编辑相比，nano提供许多额外的特性，例如：交互式的查找和替换，定位到指定的行列，自动缩进，特性切换，国际化支持，以及文件名标记完成。本教程中，我们将介绍一些帮助您入门的基本知识。...使用nano打开系统文件 从终端输入nano和文件名。如果该文件不存在，nano将在您指定的位置创建一个新的临时版本。...在此示例中，我们将使用sudo权限打开系统的hosts文件： sudo nano /etc/hosts 使用上面的示例打开系统主机文件，结果类似于以下内容： 在默认视图中，nano将在顶部标题栏的中心显示正在编辑的文件...在底部，快捷方式列表显示常用命令，其中^代表CTRL键。要保存，按住CTRL并按O（对于Write * O * ut）; 按CTRL + X退出。...nano快捷方式 ^ W：在打开的文件中搜索 ALT + W：找到下一个搜索实例 ^ O：保存文件 ^ K：删除整行 ^ U：粘贴整行 ^ T：查看文件浏览器 ^ X：退出 更多信息 有关此主题的其他信息
First Frost 在Ubuntu中安装Samba文件服务 Samba是一个能让Linux系统应用Microsoft网络通讯协议的软件，而SMB是Server Message Block...后来微软又把 SMB 改名为 CIFS（Common Internet File System），即公共 Internet 文件系统，并且加入了许多新的功能，这样一来，使得Samba具有了更强大的功能。...apt install samba samba-common root@v:~# 创建共享目录 root@v:~# mkdir /cby/smb/ -pv root@v:~# chmod 777 -R.../cby/smb/ root@v:~# 修改配置文件 # 编写配置文件 实现匿名访问 [share] path = /cby/smb public = yes read only = no guest
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