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R中的数据导入与导出

1、数据的导入导入文本文件使用read.table函数导入普通文本文件 read.table(file,header=FALSE,sep="",...)...#导入csv文件 data1 <- read.table("1.csv", header=TRUE, sep=",", fileEncoding="UTF-8", stringsAsFactors=FALSE...read.csv("3.xxx", header=FALSE, sep=","); #指定分隔符 data3 <- read.csv("3.xxx", header=FALSE, sep="\t") 2、数据的导出

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【R语言在最优化中的应用】igraph 包在图与网络分析中的应用

igraph 包在图与网络分析中的应用 igraph 包是一个非常强大的包，它可以快速轻松地创建、绘制和分析无向图及有向图(图的顶点和边允许百万以上），并解决了经典图论问题，如最小生成树、最大网络流量、...source 和target 分别代表网络中要求最大流的起始点和终点，capacity 为边的权重。...该图中任意两顶点之间的最短路程(考虑方向)。 ? 解：这三个问题是图论中的典型问题。首先，应该在R中构造该图，然后分别调用相关命令即可。...由15 – 23 行(最短路矩阵) 可以知道该网络上每两个定点的最短路。如顶点0 到顶点7 的最短路为10(矩阵中第1 行第8 列对应的元素)。...需要说明的是，第6，11 行结果表示这是R软件打开的第35，36 个tk 图形设备，与本题的具体内容无关。

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在vscode中配置R的开发环境

并且在1.21中完善了windows系统下的extension的bug。...整体看起来效果还是非常不错的，开发者在整体上还是保留了Rstudio和visual studio中对于View()这个函数的配置，还在此基础上添加了search功能，此外对Rshiny可视化的支持也非常棒...▶ pip install radian 四在R中安装languageserver和jsonlite R LSP client需要借助languageserver实现函数的智能识别，R session...的配置 Path中添加R的执行文件的路径，当然也可以选择radian.exe的路径（该路径存在于python的scripts文件夹中）。...中运行的话，则会出现R session watcher不启用的状况，data和plot的review窗口则会自动调用自身gui所带的review窗口，以在windows中选择radian.exe路径为例

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「R」ggplot2在R包开发中的使用

尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...同样地，导入ggplot2全部450个导出对象到你的命名空间会让分离你的包和ggplot2包的责任变得困难，特别是读者会搞不清这些函数到底来自哪里。我个人碰到过很多这种情况。...有时候在开发R包时为了保证正常运行，不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法，但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的

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在VSCode中调用Jupyterlab和R

接下来，我们还要配置一些设置，来更快捷的使用。拓展程序安装虽然目前我们能在Jupyterlab中使用R了，但是实际用的时候会发现代码补全和一些快捷键不方便，而Rstudio中各种辅助配置非常完善了。...这时候我们就需要VScode中的一些插件来方便我们写代码。我们直接在左侧的拓展中搜索R，然后安装即可。...然后是代码补全：当我们把鼠标放到函数上时，还能看到帮助文档：如果需要直接在jupyter中安装R的内核，可以直接在终端打开的R中进行操作：install.packages('IRkernel')IRkernel...总结总的来说，R语言的IDE中，Rstudio是最为常用和流行的。而JupyterLab则更多地被应用在Python数据分析领域。...但是，VS Code也是一个非常强大的编辑器，通过安装一些插件，可以实现很多功能。在本文中，我们介绍了如何通过安装插件，在VS Code中远程连接服务器，并愉快地开始编写Python和R代码。

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在jupyter notebook中运行R语言

要想在jupyter notebook中运行R语言其实非常简单，按顺序安装下面扩展包即可： install.package('repr','IRdisplay','evaluate','crayon',...devtools','uuid','digest') library(devtools) install_github("IRkernel/IRkernel") IRkernel::installspec() 在R...中执行上述四行代码，重新打开你的jupyternotebook即可看到对于R的支持标志： ?

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常见概率分布及在R中的应用

概率函数为f(k;r,p)=choose(k+r-1,r-1)*p^r*(1-p)^k, 当r=1时这个特例分布是几何分布 rnbinom(n,size,prob,mu) 其中n是需要产生的随机数个数，...size是概率函数中的r，即连续成功的次数，prob是单词成功的概率，mu未知.....如某一服务设施在一定时间内到达的人数，电话交换机接到呼叫的次数，汽车站台的候客人数，机器出现的故障数，自然灾害发生的次数等等. rpois(n, lambda) dpois(x,lambda) 连续型...mean+3sd)几乎是在肯定的。...Gamma分布中的参数α，称为形状参数（shape parameter），即上式中的s，β称为尺度参数（scale parameter）上式中的a E(x)=s*a, Var(x)=s*a^2.

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Python中的导入类中运行线程

如果你的类需要在创建的每个实例中运行一个线程，你可以在类中定义线程的行为，并在类的初始化方法中启动线程。1、问题背景在一个项目中，需要使用一个 GSM900 调制解调器和一个树莓派来进行通信。...在主 Python 应用程序（sniffer.py）中导入该库并使用 serialworker 类中的 start() 函数时，遇到了一个问题：start() 函数一运行，代码就会阻塞，导致无法继续执行后面的代码...，在 start() 函数和 checkgsm900online() 函数中添加了锁。...要注意的是，在 Python 中使用锁时，必须确保在所有可能导致死锁的地方释放锁。...在上面的代码中，锁只在 start() 函数和 checkgsm900online() 函数中使用，因此不会出现死锁问题。如果需要在代码的其他部分使用锁，则必须确保在适当的地方释放锁。

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【R语言】因子在临床分组中的应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子（factor）今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。我们还是以TCGA数据中的CHOL（胆管癌）这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper...☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息接下来我们先读入临床数据 #读取临床数据 clin=read.table("clinical.tsv...参考资料： ☞【R语言】R中的因子（factor） ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper ☞R生成临床信息统计表...☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub

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在 Spark 数据导入中的一些实践细节

网络环境：万兆。图谱大小：十亿级别节点（属性较少），百亿级别边（有向，无属性或带权值）。...这里推荐先建立索引的原因是：批量导入仅在非线上图谱进行，虽然建立索引可以选择是否在提供服务的同时进行，但是为了防止后续 REBUILD 出现问题，这边可以优先建好索引。...带来的问题就是在批量导入结点时相对较慢。...如果使用的是单独的 Spark 集群可能不会出现 Spark 集群有冲突包的问题，该问题主要是 sst.generator 中存在可能和 Spark 环境内的其他包产生冲突，解决方法是 shade 掉这些冲突的包...3.4 关于 PR 因为在较早的版本使用了 Spark 导入，自然也有一些不太完善的地方，这边也提出了一些拙见，对 SparkClientGenerator.scala 略作了修改。

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在高PR值的网站中怎么获得导入连接

这几天忙着在给公司的年会做策划，真累呀，每年的沈阳·K友汇都是公司一个大项目，所以投入的精力还是比较大的，前几天谈论了一个站长要做到是持之以恒，坚持不懈得到了需要朋友的认可，很高兴，今天谈谈关于在高PR...的网站上获得导入连接的几个方法； ?....导航站有两种，一种是导航站在网站首页发出公告，告诉站长如果想要让自己的网站在导航站首页显示，需要做那些工作；另一种是互利的网络营销，只有自己宣传了导航站，自己的网站才允许加入到导航站的首页.下面想解一下...，只要通过审核，网站都能显示在首页中，由此可以获得一个高质量的外部连接。...总之，导入连接和美国选举总统差不多的，需要投票选举，一个网站的获得的票数越多，越说明有威望，那么高质量的导入连接相当于一个在社会上有威望、有地位的名流投的票，有可能会引导其他人也同样投票，而普通的导入连接就是社会上普通民众

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Tensor在神经网络中的角色

激活函数输出Tensor在神经网络中的角色在神经网络中，tensor（张量）是一个核心概念，扮演着数据容器的角色。张量可以看作是标量、向量和矩阵的高维推广，能够存储多维数组的数据。...在神经网络中，张量通常用于表示输入数据、权重、偏置项、激活值、梯度以及最终的输出等。...Tensor（张量）在神经网络中扮演着数据容器的核心角色，其数据结构可以看作是标量、向量和矩阵的高维推广。...这些操作使得Tensor在神经网络中能够灵活地处理和传输数据。综上所述，Tensor的数据结构是灵活且强大的，它能够适应不同维度的数据表示需求，并在神经网络中发挥着核心作用。...激活函数输出激活函数是神经网络中用于引入非线性的重要组件。激活函数的输出同样存储在Tensor中，这些输出将作为下一层的输入。

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图论方法在大脑网络中的应用

温故而知新，建议结合以下脑网络相关解读阅读大脑网络结构、功能和控制的物理学脑网络研究中的图论指标详解从宏观尺度脑网络的角度看结构--功能关系图论在静息态和动态脑连接评估中的应用：构建脑网络的方法...现代物理评论：大脑网络中的动力学控制图论在识别人脑网络连通性模式中的应用网络神经科学中模型的性质和使用动态脑网络与创造力引言 21世纪一些最艰巨的科学挑战涉及复杂的社会、技术和生物系统——从全球金融和经济网络的稳定到流行病的传播...在真实网络中，这些类别通常出现在可与适当（随机）零模型的分布进行比较的特征频率中。在大脑中，模块分析已被广泛应用于结构图和功能图。大多数高分辨率的大脑结构网络并不是完全相连的，甚至也不是紧密相连的。...这种度量在大脑网络中特别有用，因为它可以同时应用于结构网络和功能网络数据。...最近，单形在人类连接组数据上的应用表明，该方法在识别密集连接的节点组以及有助于并行处理的其他连接模式（如环状路径）。最后，拓扑数据分析的相关领域试图检测、量化和比较复杂网络数据中存在的中尺度结构。

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Mathematica 在图与网络中的应用

1 导读版本 11 在其图与网络领域既有的强大功能基础上作了大量扩展与改进. 其中包括新增的图构建器、新的审编数据的图属性以及新的针对特定领域的网络....工作性能改进可在全方位功能中使用. 2 1 案例下面小编用Mathematica来向大家展示其在图和网络中的应用. 示例1:绘图主题集版本 11 增加了一个内容广泛的有关图的绘图主题集....示例2:更高保真度绘图图和网络的更高保真度绘制. ‍ 示例3:找出图的连通分量根据荷叶密度模拟青蛙跳网络....荷花池中的青蛙要从25片荷叶中的一片跳到另一片上面,它一跳能够跳1.5英尺. 随机取样一个荷花池. 找出青蛙可以在之间跳跃的最大的荷叶集找出青蛙要访问所有的荷叶而需要游水的次数....选用一个不同的 GraphLayout. 示例5:文字的语法结构用新的 TextStructure 函数制作并可视化一个句子或结构中的语法依赖关系. ‍‍ 短语结构

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【大数据问答】R语言如何导入其他统计软件中的数据？

R语言如何导入其他统计软件中的数据？ R导入SAS数据集可以使用 foreign 包中的 read.ssd() 和 Hmisc 包中的 sas.get() 。...在SAS中使用 PROC EXPORT 将SAS数据集保存为一个逗号分隔的文本文件，使用从.csv格式的文件中导入数据，使用read.csv()函数或者read.table()函数。...或者一款名为Stat/Transfer的商业软件将SAS数据集为R数据框。...R导入SPSS数据集可以通过 foreign 包中的 read.spss()函数或者Hmisc 包中的 spss.get() 函数。...导入Stata数据集可以通过foreign包中的read.dta()函数。【温馨提示】foreign包和Hmisc包都是的R的扩展包，因此在使用之前，若是没有安装，需要先安装。

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R沟通｜在Rstudio中运行tex文件

简介 R文档沟通前两期内容： R沟通｜舍弃Latex，拥抱Rbeamer吧！ R沟通｜制作个性化ppt！...这期主要介绍下如何在Rstudio中运行和使用.tex文件，并给大家安利一个非常nice的模板和根据该模板制作的案例。...使用教程在ElegantPaper[1]网站中下载整个仓库，可以直接下载到本地github或者下载压缩包。 ?...具体如何下载可以参考TinyTeX 中文文档[2] 具体样例小编研究生一年级期末作业（数据包络分析，复杂网络，回归分析等）就是用这个模板制作的，现在正好出文档沟通系列，就给大家献丑下?。 ? ?...>> 当然该模板也有很多别人使用，制作后的文章和文件都在github中： Risk Awareness（风险意识）文档说明[3] Bank Custody （银行存管）说明[4

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一文学会网络分析——Co-occurrence网络图在R中的实现

作者：陈亮单位：中科院微生物所编者按：上个月菌群月坛，在军科院听取王军组陈亮博士分享网络分析的经验，不仅使我对网络的背景知识有了更全面的认识，更使我手上一个关于菌根的课题有极大的启示。...下面是正文：网络分析背景知识近年来，随着计算机技术的发展，网络科学研究在社会网络方面的分析方法已经成熟，从而促进了网络分析方法向其他领域的渗透，例如：信号传导网络、神经网络、代谢通路网络、基因调控网络...)来展示实体之间的关系，通过量化以节点和连接为组件的网络结构指数(Index)，从而能够在统一的框架下寻找复杂系统的共性。...目前生态学领域大家用到的网络图多为基于群落数据相关性构建的Co-occurrence网络图。此类网络可以采用R中igraph包构建并实现出图。...常用网络参数有：平均路径长度(Average path length)：网络中任意两个节点之间的距离的平均值。其反映网络中各个节点间的分离程度。

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深度 | 在 R 中估计 GARCH 参数存在的问题

在原假设下，滚珠轴承的平均直径不会改变，而在备择假设中，在制造过程中的某些未知点处，机器变得未校准并且滚珠轴承的平均直径发生变化。然后，检验在这两个假设之间做出决定。...我们希望将我们的检验应用于检测 GARCH 模型中的结构性变化，这是金融时间序列中的常见模型。据我所知，用于 GARCH 模型估计和推断（以及其他工作）的“最新技术” R 包是 fGarch。...下面是一个辅助函数，用于通过 garchFit()（在计算过程中屏蔽所有 garchFit() 的输出）来提取特定拟合的系数和标准差。...我在本文中强调的问题让我更加意识到选择在优化方法中的重要性。我最初的目标是编写一个函数，用于根据 GARCH 模型中的结构性变化执行统计检验。...这是一个我自认知之甚少的主题，如果 R 社区中的某个人已经观察到了这种行为并且知道如何解决它，我希望他们会在评论或电子邮件中告诉我。

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深度学习中的检测网络：SSDFaster R-CNNYOLO

深度学习中的检测任务（Detection）是指检测出图片中的物体位置，一般需要进行画框。比如下图中把人、羊，还有狗都框出来了，具体来说，网络需要输出框的坐标。 ? 检测网络有哪些？...常用的检测可以大致可以分为两类：two stage和one stage. Two stage是说在检测网络分两步，第一步是框出物体，第二步是确定这个物体的分类。...One stage就是根据提取的特征，直接使用回归网络得出其分类和检测框。其中，Faster R-CNN属于two stage，SSD和YOLO属于one stage....YOLO则没有这方面的设计，只有一个特征输出到Detections网络中。 ?...另外，在SSD原始论文中用到的是VGG骨架来提取特征，现在很多更好的特征提取网络，例如ResNet，mobilenet也在大量应用，进一步提高精度或者加快速度。

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R8在Android手Q中的应用

R8作为一个新工具，鲁棒性不如proguard，在面对手Q这个庞然大物时，出现了一些问题，本文主要分享一下R8在手Q应用遇到的问题，供后面有需要的同学参考。...dex中，也是在Enqueuer中实现，traceMainDex方法中；5、IRConvert , 将class字节码转换为Dex的过程，其中IR(Intermediate Representation...三、R8在手Q应用中遇到的问题3.1 Liveness Analyze过程—根可达性算法在介绍补丁问题前，先简单介绍Liveness Analyze过程，后面的几个问题都和Liveness Analyze...理解根可达性算法前需要先理解四个概念：1、Root: 在proguard 配置文件中明确要keep的对象，算法的输入。...在使用R8过程中，我们发现同样的代码，构建多次，高概率出现不正常的dexDiff，具体表现如下：IDragview 的clinit方法有时候存在，有时不存在，导致生成的补丁不稳定。

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