在R中按标识符和打开/进程子集组织csv_使用Parallel和fread在r中同时按块导入CSV - 腾讯云开发者社区

Win+R 运行 wt.exe 都无法运行（打开后进程自动退出，且无 UI 提示），但是可以通过开始菜单和其他 terminal 中输入 wt.exe 运行可以通过 terminal 中输入 wt.exe...运行就说明并非是应用损坏，而是启动方式问题，直觉想到可能是 Win+X 菜单和 Win+R 附带了什么奇怪的参数，想到火绒剑记录系统日志分析，日志记录如下：发现两个 wt.exe 的路径竟然不一样...wt.exe 效果同 Win+R 打开（无反应），而打开软链接的 wt.exe 就可以正常运行那么现在有两个问题：同一个 wt.exe 命令，为什么 Win+R（Win+X 菜单实际上执行的也是...Win+R）和 terminal 找到并调用的文件位置不同？...调用逻辑重置 WindowsApps 权限这两个方案在国内论坛上都基本找不到相关资料，好在 Github 和 StackOverflow 上有遇到同样问题的老哥关于方案 1：需要修改注册表中的值

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2023.4生信马拉松day3-数据结构

")df2#如果"gene.csv"不在工作目录下会报错，需要：正确打开Rproj设置好工作目录/写明"gene.csv"所在路径；-（4）R语言内置数据如 Iris，letters，LETTERS，volcanovolcanoheatmap...df1[,-ncol(df1)]-（3）按名字取子集df1[,"gene"] #取“gene”那一列df1[,c('gene','change')] #取“gene”那一列和“change”那一列...-（4）按条件（逻辑值）取子集【理解！！！】...中有多少个元素在向量 s 中存在（要求用函数计算出具体个数）？...——注意矩阵中不能使用$进行取子集m[2,]m[,1]m[2,3]m[2:3,1:2]#矩阵的转置和转换mt(m)as.data.frame(m) class(m) #看着是把m变成了数据框

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R语言数据框、矩阵、列表的创建、修改、导出

数据框数据框的创建数据框来源主要包括用代码新建(data.frame)，由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作)，读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据函数...及txt导入*csv文件可用excel打开(直接打开)，记事本打开，或用R语言读入，读入后进行的修改不会同步到表格文件，除非导出**分隔符包括空格，逗号，制表符（tab）,csv是一个逗号分隔的纯文本文件...，它的后缀没有意义，也有可能实际上是一个制表符分割的tsv改变文件名而来的，此时用csv打开会报错，该知识点用于防止部分代码中错误应用csv套用tsv等#文件读写部分(文件位于R_02的Rproject...导入后生成一个数据框#ex2 <- read.csv("ex2.csv") #读入该文件后会发现原文件第一列被错误当作数据而非行名，且列名的.变成了-，R语言将列名的特殊字符-转化了，该编号可能与其他数据中编号无法匹配..."$"取子集df1$gene为对数据框df1列名的向量取子集*输入df1$后按tab键可以输出待选的列名mean(df1$score) #对取出的向量可以进行运算坐标取子集df1[2,2] #取出(行数

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计算机二级Python考点解析12

文件的使用：文件打开、读写和关闭。２．数据组织的维度：一维数据和二维数据。３．一维数据的处理：表示、存储和处理。４．二维数据的处理：表示、存储和处理。５．...读写文件前，我们先必须了解一下，在磁盘上读写文件的功能都是由操作系统提供的，现代操作系统不允许普通的程序直接操作磁盘，所以，读写文件就是请求操作系统打开一个文件对象（通常称为文件描述符），然后，通过操作系统提供的接口从这个文件对象中读取数据...要以读文件的模式打开一个文件对象，使用Python内置的open()函数，传入文件名和标示符： >>> f = open('/Users/a/test.txt', 'r') 标示符'r'表示读，这样，我们就成功地打开了一个文件...第二部分：数据组织的维度：一维数据和二维数据。...与Excel文件不同，CSV文件中：值没有类型，所有值都是字符串不能指定字体颜色等样式不能指定单元格的宽高，不能合并单元格没有多个工作表不能嵌入图像图表在CSV文件中，以,作为分隔符，分隔两个单元格

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生信课程note-3

) ，iris,letters,LETTERS是r语言内部的数据，可以导出为表格文件打开，但没办法用别的软件直接打开数据框。...)#4.数据框取子集df1$score 向量取子集用的是[] 取score这一列df1$gene #删掉score，按tab键试试mean(df1$score)## 按坐标df1[2,2]df1[2,...用于取子集的逻辑值向量：与x对应，不必须由x生成。（例子中即通过score为gene取子集）记住，==是等于的意思，>-是赋值的意思## 代码思维#如何取数据框的最后一列？...rownames(df1) <- c("r1","r2","r3","r4")#只修改某一行/列的名colnames(df1)[2] <- "CHANGE"列名和行名都是向量#6.两个数据框的连接test1...test <- read.csv("exercise.csv")# 2.求test第一列数值的中位数median(test$Petal.Length)# 3.筛选test中，Species列的值为a或c

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R3数据结构和文件读取

、并集union、差集setdiff（x有哪些元素在y不存在）#重点向量筛选(取子集)[]：中括号里面是向量（有4种生成方式）将TRUE对应的值挑选出来，FALSE丢弃。...，变量 <-read.csv/table（按TAB键导入文件名，不要手动输入）# （3）读取表格文件view，dim，nrow,ncol,rownames,colnames,修改和取子集# （4）R语言内置数据...rownames(df1) <- c("r1","r2","r3","r4")#只修改某一行/列的名colnames(df1)[2] <- "CHANGE"#4.数据框取子集1$一次只能取1列，2按坐标...[1] 0.5## 按坐标df1[2,2]## [1] "up"df1[2,]#取[行，]继承行名和列名,筛选test中，Species列的值为a或c的行,test[test$Species %in%...，在文件夹二中调用文件夹一中的数据load("../1_data/xxx.Rdata") #..

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R基础-3

数据结构 3 数据框、矩阵和列表之前学过的，Vector向量是一维的数据框、矩阵和列表如下： 1）现在学“表格” 二维：二维有两个：（1）matix 矩阵 —— 二维，只允许一种数据类型。...3.1 数据框来源（1）用代码新建（2）由已有数据转换或处理得到（3）读取表格文件（4）R语言内置数据 3.2 新建数据框（数据框是以列为单位组织的） 3.2.1 用代码新建 data.frame...change = rep(c("up","down"),each = 2), score = c(5,3,-2,-4)) 可以R中跑一次上面的代码看看...3.2.2 从文件中读取 >df2<- read.csv("gene.csv") 3.3 数据框属性（数据框严格区分 “行” 和 “列”） #写上注释 > dim(df1) #维度 > nrow...(df1) #行 > ncol(df1) # 列 > rownames(df1) #行名 > colnames(df1) #列名 3.4 数据框取子集：$ 、[ ] 、按照名字、按条件（逻辑值

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四、数据结构--数据框

一、数据框来源（1）用代码新建（2）由已有数据转换或处理得到（3）读取表格文件（4）R语言内置数据 ### 打开R语言的那一刻，可以直接使用的数据。...("gene.csv") ###文件读取成功的关键是gene.csv这个文件已经在工作目录中df2 gene change score1 gene1 up 52 gene2...52 gene2 up 3图片4.4.2筛选score > 0的基因得出的是基因的名字df1[df1$score > 0,1] ###按数据库取子集的方式...df1) <- c("r1","r2","r3","r4") ### 改全部行名colnames(df1)[2] <- "CHANGE" ##改一个列名修改第二列的列名，...test[test$Species == c("a","c"),] 不能写==，是因为在循环补齐的过程中==会把a，c看成一个整体图片六、两个数据框的连接图片merge(test1,test2,by="

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R语言基础-02（数据框、下载包）

)#返回向量，行名## [1] "1" "2" "3" "4"colnames(df1)#返回向量，列名## [1] "gene" "change" "score"#修改数据框就是修改向量#改行名和列名...rownames(df1) 0,]#取出df1中#筛选test中，Species列的值为a或c的行test[test$Species!...首先考虑原因1.2，多搜索多尝试提示connection、download：网络问题提示writable、permission：权限问题，管理员方式打开R图片读取表格、fread函数input <- read.csv...)input <- fread("data/input.csv",header = T,row.names = 1,sep = ",")Tips：输出文件时不要覆盖原文件需要用非proj的文件夹内的文件时

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R语言-03数据框、矩阵和列表

（没有赋值就可以直接使用的数据，例如iris） 2.新建数据框* 读取文件 df2<-read.csv("gene.csv") df2 #读取"gene.csv"文件，赋值df2 3.数据框属性 4.数据框取子集...df1$gene #"$"前是数据框名称后是列名；提取该列的向量 #按名字取子集 df1 行，列图片 5.数据框修改取子集，赋值 #改行名和列名 rownames(df1) <- c(..."r1","r2","r3","r4") #修改全部行名 #只修改某一行/列的名 colnames(df1){2} <- "CHANGE" #修改一个列名 6.两个数据框的连接按照共同的列名取交集...= F,cluster_rows = F) #修改默认聚类列表新建和取子集（列表可装万物） x[1] x$m1 #列表取子集元素的“名字”-names（）后置的难点数据框按照逻辑值取子集 #...将逻辑值赋值给k，按逻辑值在df1中取子集**实战中会经常遇到删除变量数据结构总结以上来源，生信技能树

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Day3

每列是向量，只允许一种数据类型新建用代码新建df1 <- data.frame(列名 =向量(列的内容), 列名 =向量(列的内容))###由已有数据转换或处理得到读取表格文件df2 <- read.csv...("gene.csv")R语言内置数据属性dim(df1)#维度nrow(df1)#行数ncol(df1)#列数rownames(df1)#行名colnames(df1)#列名取子集:取列: $按坐标:...-$接原来表格中不存在的列。...df1$p.value <- c(0.01,0.02,0.07,0.05)改行和列名--赋值全部：rownames(df1) <- c("r1","r2","r3","r4")一个-取出后赋值：colnames...“名字”-names()难点：数据框按逻辑值取子集删除变量：一个rm(x)多个rm(df1,m)全部rm(list = ls())清空控制台快捷键ctrl+l函数与参数括号前为函数，形式参数为作者设置

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20分钟吃掉Linux常用命令40式

退出 29, &后台执行符号 &符号放在命令末尾表示在新的进程中运行命令例：python test.py & 在一个新的进程中运行test.py脚本 30 nohup 不挂断执行命令 nohup 放在命令开始表示即使用户退出登录...和>>符号输入和输出流重定向利用和>>可以将输出流不打印到屏幕而是写入或追加到文件中。...Appendix A， vim基础用法 39，vim 文本编辑器例1: vim helloworld.py 创建/打开文件例2：按i/a 进入编辑模式例3：按Esc退出编辑模式，进入命令模式例...xxx.py文件, Ctrl+W在不同窗口间切换例9：vimdiff aa.txt bb.txt 逐行比较两个文件例10: 按Esc+g回到第一行，按Esc+Shift+g跳转到最后一行例11...(3)，~/.bash_profile 用来设置一些环境变量，功能和/etc/profile 类似，但是这个是针对用户来设定的，也就是说，你在/home/user1/.bash_profile 中设定了环境变量

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从零开始的异世界生信学习 R语言部分 02 数据结构之数据框、矩阵、列表

("gene.csv") #读取文件的时候注意文件路径，默认只会从工作目录中读取文件，否则可能出现报错 df2 图片数据框属性数据框属性 # dim(df1) # nrow(df1) #输出行数...ncol(df1) #输出列数 # rownames(df1) #输出行名 colnames(df1) #输出列名数据框取子集数据主要操作为按列取子集，取出来的为向量；按行去子集取出的仍为数据框。...#4.数据框取子集 df1$gene #删掉score，按tab键试试 mean(df1$score) ## 按坐标 df1[2,2] # 取第二行第二列 df1[2,] #取第二行 df1[,2]...## 中括号中的逗号表示维度的分隔 ## 按名字 df1[,"gene"] df1[,c('gene','change')] ## 按条件（逻辑值） df1[df1$score>0,] ## 代码思维...增加一列在$后面写一个不存在的列名表示增加一列 df1$p.value <- c(0.01,0.02,0.07,0.05) df1 #改行名和列名 rownames(df1) <- c("r1",

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Jelys Note之生信入门class5

>ls("package:stringr")前提：要先把R包加载成功，才能用ls列出来列出一个包都有哪些函数或数据 3.R语言里的符号（）--函数、赋值和输出、先运行 []---向量、数据框...、矩阵取子集 [[]]---列表取子集 $ 数据框取列，列表取子集 <- 赋值 = 赋值，连接形式参数与实际参数 == 判断是否相等 !...[[]] · 而文件名称应该：1.在实际参数位置2.且在能识别文件名称的函数括号内3.带引号 5. 解决问题的正确姿势（1）检查代码与环境代码错误？环境问题？工作目录？重启？...一切操作在r语言中进行（4）R特有的数据保存格式：Rdata Rdata：保存的是变量，不是表格文件支持多个变量存到同一个Rdata 是R语言特有的数据存储格式，其他软件无法打开 · 相关命令：...read.table(file,header=F---表格中的第一行是否是列名！)

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SELinux深入理解

在SELinux中，访问控制属性叫做安全上下文。所有客体（文件、进程间通讯通道、套接字、网络主机等）和主体（进程）都有与其关联的安全上下文，一个安全上下文由三部分组成：用户、角色和类型标识符。...，对于进程，用户和角色标识符显得更有意义，因为它们是用于控制类型和用户标识符的联合体，这样就会与Linux用户账号关联起来；然而，对于客体，用户和角色标识符几乎很少使用，为了规范管理，客体的角色常常是object_r...标准Linux安全中的用户ID和安全上下文中的用户标识符之间的区别，就技术而论，它们是正交标识符，分别用于标准的和安全增强的访问控制机制，这两者之间的任一相互关联都是通过登陆进程按照规范严格规定的，而不是通过...在标准Linux中，主体的访问控制属性是与进程通过在内核中的进程结构关联的真实有效的用户和组ID，这些属性通过内核利用大量工具进行保护，包括登陆进程和setuid程序，对于客体（如文件），文件的inode...标识符file是定义在策略中的客体类别名称(在这里，表示一个普通的文件)，大括号中包括的许可是文件客体类别有效许可的一个子集，这个规则解释如下：拥有域类型user_t的进程可以读/执行或获取具有

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Python csv、xlsx、json、二进制(MP3) 文件读写基本使用

二、文件读写方式读取方式描述 r 只读(默认)，文件需存在； r+ 可读取也可以写入，文件需存在； rb 表示以二进制方式读取文件，文件需存在； w 只写，打开一个新文件写入，如果该文件存在则会覆盖...； w+ 可读取也可以写入，打开创建新文件并写入数据，如果文件已存在，则覆盖； wb 二进制写入，打开一个新文件写入，如果该文件存在则会覆盖； a 追加写入，文件需存在，在文件内容结尾处继续写入新内容；...a+ 追加写入，文件不存在则会创建一个新文件，在文件内容结尾处继续写入新内容；三、csv文件读写 1.csv 简介 CSV文件通常使用逗号来分割每个特定数据值（也可用’: ::’，’; ;;'等）...它基于 ECMAScript（European Computer Manufacturers Association, 欧洲计算机协会制定的js规范）的一个子集，采用完全独立于编程语言的文本格式来存储和表示数据...这一系统中，通常用两个不同的符号0（代表零）和1（代表一）来表示 [1] 。数字电子电路中，逻辑门的实现直接应用了二进制，现代的计算机和依赖计算机的设备里都使用二进制。

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SELINUX工作原理

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Learn R 函数和R包

R语言中的函数（）前的是函数 [] 是取子集，一定是个数据【】里有“，”->向量或矩阵 [[]] 前的通常是个列表列表取子集 $ 数据框取子集 <- 赋值 = 赋值，或连接形式参数与实际参数...否定 { } 用于容纳多行代码 #注释 " " 字符型数据：：包：：函数 #文件名必须带引号，且在能识别文件名称的函数括号里面，实际参数位置上文件的读写 csv格式 > read.csv("ex3....csv的默认格式是表格； #2.记事本也可以打开； #3.sublime（适用大文件）打开 #4.R语言读取 #表格文件读到R语言中，就得到了一个数据框，对数据框进行的修改不会同步到表格文件，需重新导出...(原文件名,file="xxx.txt") #把该文件导出为名为xxx的txt格式 R语言特有的数据保存格式 #Rdata R语言中特有的数据储存格式，无法用其他软件打开 #保存的是变量（向量、...#当前在一个文件夹中想要调用另一个文件夹的Rdata #方法一复制路径下载 getwd() [1] "/Users/zhuo/learn /R_02" #找到当前目录复制路径进行修改

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Jelys Note之生信入门class3

>df2 <- read.csv("gene.csv");df2 报错情况：如果没有用R.project的方式打开工作目录，而你所要的目的文件在project里，就算你输入的代码是正确的你也是是打不开的...正确处理：只有你所要读取的目的文件在你开着的R.project的同个文件夹中才能运行代码打开 3.数据框的属性【这个属性是指数据框中黑色加粗的字体，不属于表格内容！只是表格的属性！...，是维度的分割【中括号是取子集的函数】 eg. > df1[c(1,3),1:2] 中括号表示是取df1中的数据，c（1，3)是取第一行和第三行的数据，逗号表示维度的分割，1：2是取第一列与第二列的数据...] 不可以 >x[c(1,5)] 可以运行，c(1,5)是一个长度为2的整数向量，它告诉R语言要选择x向量中的第1个和第5个元素。...取出来的是符合条件的子集】筛选score > 0的基因 > df1[df1$score > 0,]内容写在逗号前取子集是按行来取子集取df1数据框中score那一列大于0的df1值如第一行、第二行

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Linux命令大总结，一篇就够了(建议新手收藏)

文件的组织查看路径 pwd 显示当前目录的路径 which 查看命令的可执行文件所在路径， Linux 下，每一条命令其实都对应一个可执行程序，在终端中输入命令，按回车的时候，就是执行了对应的那个程序...查看进程在 Windows 中通过 Ctrl + Alt + Delete 快捷键查看软件进程。 w 帮助我们快速了解系统中目前有哪些用户登录着，以及他们在干什么。...用一张图表示三种模式如何切换：基本操作打开 Vim 在终端命令行中输入 vim 回车后 Vim 就会被运行起来，也可以用 Vim 来打开一个文件，只需要在 vim 后面再加文件名。...替换一个字符在交互模式下，将光标置于想要替换的字符上。按下 r 键，接着输入你要替换的字符即可。...ls # 在Vim中打开的文件所在的目录运行ls命令可视模式前面只讲了 Vim 的三种模式，其实还有一种模式叫做可视模式。

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关于Windows Terminal无法在Win+X菜单和Win+R中通过wt.exe打开的问题

2023.4生信马拉松day3-数据结构

R语言数据框、矩阵、列表的创建、修改、导出

计算机二级Python考点解析12

生信课程note-3

R3数据结构和文件读取

R基础-3

四、数据结构--数据框

R语言基础-02（数据框、下载包）

R语言-03数据框、矩阵和列表

Day3

20分钟吃掉Linux常用命令40式

从零开始的异世界生信学习 R语言部分 02 数据结构之数据框、矩阵、列表

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SELinux深入理解

Python csv、xlsx、json、二进制(MP3) 文件读写基本使用

SELINUX工作原理

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