在R中更新dplyr时出现"no package called‘data_frame’“错误

在R中更新dplyr时出现"no package called ‘data_frame’"错误是因为dplyr包的更新可能导致与其他依赖包的版本不兼容。解决这个问题的方法是重新安装dplyr包，并确保所有依赖包也是最新版本。

以下是解决该问题的步骤：

首先，确保你的R版本是最新的。你可以在R官方网站上下载最新版本的R。
打开R的控制台，运行以下命令卸载dplyr包：

remove.packages("dplyr")

然后，重新安装dplyr包。运行以下命令：

install.packages("dplyr")

如果在安装dplyr包时出现依赖包的错误，可以尝试手动安装这些依赖包。例如，如果出现"no package called ‘data_frame’"错误，可以运行以下命令安装tidyverse包，该包包含了dplyr和其他一些常用的数据处理包：

install.packages("tidyverse")

安装完所有依赖包后，再次尝试更新dplyr包。运行以下命令：

update.packages("dplyr")

如果更新成功，可以尝试加载dplyr包并进行测试：

library(dplyr)

如果以上步骤都顺利完成，你应该能够成功更新dplyr包并使用它进行数据处理和分析。

腾讯云相关产品和产品介绍链接地址：

腾讯云官方网站：https://cloud.tencent.com/
云服务器（CVM）：https://cloud.tencent.com/product/cvm
云数据库 MySQL 版：https://cloud.tencent.com/product/cdb_mysql
云原生应用引擎（TKE）：https://cloud.tencent.com/product/tke
人工智能平台（AI Lab）：https://cloud.tencent.com/product/ai
物联网开发平台（IoT Explorer）：https://cloud.tencent.com/product/iotexplorer
移动开发平台（MPS）：https://cloud.tencent.com/product/mps
云存储（COS）：https://cloud.tencent.com/product/cos
区块链服务（BCS）：https://cloud.tencent.com/product/bcs
腾讯云元宇宙：https://cloud.tencent.com/solution/virtual-universe

相关·内容

R语言在RCT中调整基线时对错误指定的稳健性

p=6400 众所周知，调整一个或多个基线协变量可以增加随机对照试验中的统计功效。...调整分析未被更广泛使用的一个原因可能是因为研究人员可能担心如果基线协变量的影响在结果的回归模型中没有正确建模，结果可能会有偏差。建立我们假设我们有关于受试者的双臂试验的数据。...在一些情况下，基线协变量可以是在随访时测量的相同变量（例如血压）的测量值。错误指定的可靠性我们现在提出这样一个问题：普通最小二乘估计是否是无偏的，即使假设的线性回归模型未必正确指定？...这意味着对于通过线性回归分析的连续结果，我们不需要担心通过潜在错误指定效应，我们可能会将偏差引入治疗效果估计。模拟为了说明这些结果，我们进行了一项小型模拟研究。...我们进行了三次分析：1）使用lm（）进行未经调整的分析，相当于两个样本t检验，2）调整后的分析，包括线性，因此错误指定结果模型，以及3）正确的调整分析，包括线性和二次效应。

1.6K1 0

R 语言中常见的 10 个错误，看到第 7 个会不会感觉很神奇？

翻译：BioIT 爱好者（部分内容有调整）原文：The top 10 R errors, the 7th one will surprise you 就像你学习走路时遇到了一些问题，你在学习 R 的过程中可能也会遇到一些错误...本文章的目标是对学习 R 时最常见的一些错误进行整理，并一一的去解释它们，以便您了解如何解决这些问题。面对问题，最重要的建议是：“阅读错误信息”。...5. there is no package called 'diplyr' 错误代码： > library(diplyr) Error in library(diplyr) : there is no...package called ‘diplyr’ 出现这样的错误有两种可能： CASE 1 : 您拼错了库的名字。...在错误消息中包含解决方案。 Correction : 在错误消息中已经给出了如何校正的方法。您只输入了一个=，但条件必须用==编写。

6.2K1 0

关于在vs2010中编译Qt项目时出现“无法解析的外部命令”的错误

用CMake将Qt、VTK和ITK整合后，打开解决方案后添加新类时运行会出现“n个无法解析的外部命令”的错误。...2.在新生成的选项中，填上相关内容： ? 具体如下：命令行："$(QTDIR)\bin\moc.exe" "%(FullPath)" -o "....关于moc文件，查看：qt中moc的作用简单来说：moc是QT的预编译器，用来处理代码中的slot，signal，emit，Q_OBJECT等。

6.4K2 0

生存分析模型的时间依赖性ROC曲线可视化

当随时间推移观察到结果时，其预测性能取决于评估时间 _t_。直观地说，在零时间测量的标记值应该变得不那么相关。因此，ROC测得的预测性能（区分）是时间_t_的函数。...## 提取AUC auc = map_dbl(survivalROC, magrittr::extract2, "AUC"), ## 在data_frame..., magrittr::extract2, "AUC"), ## 在data_frame中放相关的值 df_risksetROC = map(risksetROC...结论总之，我们研究了时间依赖的ROC及其R实现。累积病例ROC可能与_风险_ （累积发生率）预测模型的概念更兼容。新发病例ROC可用于检查时间零标记在预测后续事件时的相关性。.... ---- 本文摘选《R语言中生存分析模型的时间依赖性ROC曲线可视化》

2K2 0

R包出现namespace ‘XXXX’ 1.2-18 is already loaded, but >= 1.4.2 is required及其解决方案

a 安装R包出现下面的错误: installing to /opt/R/R-4.0.2/lib64/R/library/00LOCK-rms/00new/rms/libs ** R ** demo **...Calls: ... namespaceImportFrom -> asNamespace -> loadNamespace Execution halted 报错信息是大致是说在安装或使用某个...R包时，它的依赖包dplyr不能正常使用，原因是版本过低....更新版本后安装: #rms #namespace ‘Matrix’ 1.2-18 is already loaded, but >= 1.4.2 is required package_url="https...://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Matrix/Matrix_1.5-0.tar.gz" install.packages(package_url, repos

9702 0

别人运行的好好的R代码，到我这怎么就冲突了？

培训时，同一段代码，大家都运行的好好的，而你却出现问题了，一般都是考虑包里的函数冲突了。这时需要一个个去排查到底是哪个函数发生了冲突，有没有更好的办法呢？.../conflicted") 加载包后，存在冲突的函数会无法运行并且提供了两种解决方法，都在错误提示中。...（学程序语言，看错误提示并且能理解错误提示很重要） library(conflicted) library(dplyr) filter(mtcars, cyl == 8) #> Error: [conflicted...另外，在Rstuido中，还会有函数自动补全功能，输入dplyr::后会列出这个包里面所有外部可用函数。相对应的还有dplyr:::可以调用dplyr中没有export出的函数。...] Will prefer dplyr::filter over any other package filter(mtcars, am & cyl == 8) #> mpg cyl disp

7221 0

函数冲突报错就完了吗

一个星期前我指出来了R语言包开发的一个现象：R语言的繁荣背后何尝没有隐患，很多函数名字被多个R包使用，这样就出现了冲突，所以我们需要显示调用具体的某个R包的某个函数。...summarise 查询了一下这个出现冲突了的函数是什么情况： Summarise a data frame....from other packages (in package plotly in library /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources.../library) Summarise each group to fewer rows (in package dplyr in library /Library/Frameworks/R.framework...《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》《生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)》把R的知识点路线图搞定，如下：了解常量和变量概念加减乘除等运算（计算器）多种数据类型（数值

1.1K2 0

R tips：自杀式R包的安装

：一个已经打开过的R或Rstudio项目，且上次退出时保存过R数据，而且大概率是你这些R数据直接/间接依赖了一个dbplyr包，如果全新打开一个R界面则这个错误并不会出现。...Tips: 由于一些编译型R包可能也在安装时载入R，为避免可能的编译错误，建议将这所code的输出隐藏，比如我的Rprofile.site文件中是添加的如下代码： suppressWarnings(library...slots 如何安装一个NULL subclasses error的包下图是一个示例，这个包第一次安装是成功的，再次重新安装就会报错：可以看到这个报错的直接原因还是会定位到dbpyr包，但是它是出现在安装其他依赖这个包的包时出现的...R包的依赖项管理是在DESCRIPTION中记录着，比如下面的dbplyr的DESCRIPTION里面的内容： Type: Package Package: dbplyr Title: A 'dplyr...Depends是代表这个依赖项会载入到全局环境中。 Imports是代表这个依赖项只会在当前包的环境中载入。 Suggests一般是用于帮助文档渲染时使用的依赖项。

3071 0

你不需要真的这个包，而仅仅是需要它里面的数据

: R (>= 3.3), Biobase Imports: biomaRt, circlize, ComplexHeatmap, corrplot, DESeq, DESeq2, dplyr...另外一个选择是，你压根就没有必要去安装这个包，因为你仅仅是需要它里面的数据，你再仔细看教程，其实就是：To load a CountDataSet object called ‘cds’, type:...，其实就存储在 data 文件夹：存储在 data 文件夹你不需要安装这样的包，也不需要加载它，仅仅是load这个压缩包里面的文件夹里面的对应的R数据对象文件即可。...对象，那么你就无法load对应的R数据对象文件成功，报错如下： > cds 载入需要的程辑包：DESeq Error in .requirePackage(package) : unable to...= TRUE, logical.return = TRUE, : 不存在叫‘DESeq’这个名字的程辑包载入需要的程辑包：DESeq 收捲时出错: unable to find required

1.3K5 1

plotly-express-4-常见绘图参数

在堆叠的面积图形中，每行的DF数据代表多边形的最高点。...列中的值用于笛卡尔坐标中沿 X 轴的定位标记。图表类型为水平柱状图时，这些值用作参数histfunc的入参； y ：指定列名。列中的值用于笛卡尔坐标中沿 Y 轴的定位标记。...所有列的值，显示在悬停提示内容中，位于x/y值的下方。指定的列与x/y重复时仅显示1条数据； text：指定列名。...列中的值，在图的标记中显示为文本标签，同时也显示在悬停提示内容中； facet_row：指定列名。...默认情况下，在Python 3.6+中，轴，图例和构面中的分类值的顺序取决于在data_frame中首次出现的顺序，而在3.6以下的Python中，默认不保证顺序，该参数即为解决此类问题而设计； labels

4.9K1 0

学习小组DAY6-Creep

今天的学习内容是R包，R包是多个函数的集合，本次主要是学习dplyr包。安装和加载R包设置镜像每次下载R包时，都需要重新配置镜像。...为了避免这种繁琐的操作可以使用file.edit('~/.Rprofile')建一个R的配置文件文件直接进行设置，在配置文件中运行以下代码options("repos" = c(CRAN="https:...https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源然后保存，再重启一下RStudio，运行options()$repos和options()$BioC_mirror出现以下内容就发现已经配置好了...：‘dplyr’The following objects are masked from ‘package:stats’:filter, lagThe following objects are masked...:102),]dplyr五个基础函数mutate()，新增列select(),按列筛选filter()筛选行arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序summarise()：汇总进行汇总时可以结合

1488 0

fuzzyjoin实现模糊匹配连接

fuzzyjoin包是dplyr连接操作的变体，它可以支持模糊（匹配）连接，比如忽略单词之间的大小写，根据正则表达式进行连接，忽略单词的拼写错误等。...该包中的函数命名也很简单易懂，对于六个dplyr中join操作的每个变体，只要在前面加上统一的前缀即可，比如，根据正则表达式进行连接： regex_inner_join regex_left_join...中的各种连接不支持忽略大小写的连接。...library(dplyr) ## ## Attaching package: 'dplyr' ## The following objects are masked from 'package:stats...根据距离连接可以忽略某些单词的拼写错误、空格、标点符号等。

2346 1

「R」使用modules包来组织R的函数集合

如果不想要在全局直接访问包内的函数，在导入时设定attach=FALSE。...` from: base 5 `setequal` from: base 6 `union` from: base 7> select 8错误: 找不到对象'select' 9> dp$select...4[1] "TCGA-55-7913-01B-11D-2237-01" 目前放置的几个代码文件都可以在代码库https://github.com/BioSisyphus/Rlib中查看。...这里一个对绝大部分读者有用的函数是install()，它之前被放在R包wfun中。我前几天把它重新进行了迁移和修改。.../R/R_Library 40Using temp directory: /Volumes/Extra/R/Rtmp/ 41** testing if installed package can be

1.1K2 0

生信入门马拉松之R语言基础-函数和R包(day 4)

1941 0

使用clusterProfiler包利用eggnog-mapper软件注释结果做GO和KEGG富集分析

利用R语言将注释结果整理成enricher函数需要的输入格式 GO富集 library(stringr) library(dplyr) egg<-read.table("out.emapper.annotations...gterms[row,"GOs"], ",", simplify = FALSE)[[1]] gene_id <- gterms[row, "query_name"][[1]] tmp <- data_frame...001018179.1 GO:0005575 5 NP_001018179.1 GO:0005622 6 NP_001018179.1 GO:0005623 获得一个两列的数据框，有了这个数据框就可以做GO富集分析了在...接下来可以做GO富集分析了首先准备一个基因列表，我这里选取gene2go中的前40个基因作为测试还需要为TERM2GENE=参数准备一个数据框，第一列是term，第二列是基因ID，只需要把gene2go...",sep="\t",header=T) egg[egg==""]<-NA gene2ko % dplyr::select(GID = query_name, Ko = KEGG_ko

9.6K4 2

生信星球——生信入门DAY6:学习R包

(package)将加载名为package的命名空间，并添加到包的搜索列表中。...加载前对搜索列表进行检查并更新，如果package不存在则报错，如果之前已加载package，则不会重复加载。如没有参数package即library()，则列出lib.loc指定的库中的所有可用包。...require() : require(package)将加载名为package的命名空间，并添加到包的搜索列表中，与library(package)一致。...加载前对搜索列表进行检查并更新，如果package不存在（不可用），则返回FALSE而不报错，如果存在则返回TRUE。...从该文件读取和分析输入，直到到达文件的结尾，然后在选定的环境中按顺序解析表达式。简单来讲，library更像装载，require不会报错，source装载的方式则不太一样。

1151 0

R 茶话会（二：包函数名冲突问题）

要是R 可以帮我们区分，环境中是否发生冲突就好了。即如果环境中有两个函数名相同，就告诉我们要显式调用。...我们可以参照：将conflicted 包加载在启动配置中。...可是在你的环境中不冲突的函数，未必在别人的环境不冲突呀。.../library) Summarise each group to fewer rows (in package dplyr in library /Library/Frameworks/R.framework.../Versions/4.0/Resources/library) 这个时候加载的顺序也就是函数在环境中的优先级，可见dplyr 所在的位置优先级靠后，因此在使用函数时，R 首先认为是plyr 这个包中的函数

1K1 0

R||R语言基础（三）_R包

今天继续学习R语言基础的R包使用，以R包：dplyr为例数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”)...#务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号部分人可能会因为镜像的问题失败，解决方法https://mp.weixin.qq.com...:102),] 这里的“,”怎么理解呢，在我们上一期推文中提到，提取元素时z[x,y]指代提取z中第x行，第y列，如果我们只需要提取行，则应该写作z[x,],同理，如果只需要提取列，应该写作z[,y]...的两个实用技能 1.count统计某列各元素出现的次数 count(test,Species) 2.管道操作 %>%（CTRL+SHIFT+M）加载任意一个tidyverse包都可以使用管道符号...+命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档如果你能独立处理这些问题，那么恭喜你，你的R应该没问题啦！应该没问题了！！！！吧？

3.3K5 0

100000个故事的情节分析:一个简单案例

在这篇文章中，我将会进行一个简单的分析来检验在故事中的特定情节上，哪些词会频繁出现，比如一些提示了故事开端开始，中间情节或结局的词。...但所有的文章和代码都可以在GitHub上找到。建立我从GitHub上下载并解压缩了plots.zip文件。然后我们将这些文件读入R，然后将它们与dplyr使用结合。...这种结构可以用单词的量化结构来表现-- 有些词汇应该被期望在开始时出现，而一些词词则在应该在结尾出现。一个简单的测量方法，我们将记录每个单词的位置的中值，同时也记录它出现的次数。...上图种有一个有趣特征，大多数单词出现频率最高的时候是在开始或结束时，但在90％的点上，像“grabs”, “rushes”, 和 “shoots”这样的词在故事的90%部分最常出现，说明故事的高潮一般在这里...在故事中出现的词语受到对出现在故事高潮时出现的单词的分析的启发，我们可以观察哪些单词出现在故事情节的中间部分，而不是一直盯着开头和结尾不放。

1.9K5 0

Apache Spark 2.2.0 中文文档 - SparkR (R on Spark) | ApacheCN

在概念上相当于关系数据库中的 table 表或 R 中的 data frame，但在该引擎下有更多的优化....要开始, 确保已经在环境变量中设置好 SPARK_HOME (您可以检测下 Sys.getenv), 加载 SparkR package, 并且像下面一样调用 sparkR.session....更多信息请参考 R API Structured Streaming Programming Guide R 函数名冲突当在R中加载或引入(attach)一个新package时, 可能会发生函数名冲突...dplyr中同名....更正spark.lda 错误设置优化器的bug. 更新模型概况输出 coefficients as matrix.

2.2K5 0

点击加载更多

扫码

添加站长进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云