stats中的optim函数是解决优化问题的一个简易的方法。...首先，简单介绍牛顿法： 牛顿法基于目标函数的二阶导数（海森矩阵），收敛速度快，迭代次数少，尤其在最优值附近，收敛速度是二次的。...同时，牛顿法在每次迭代时不能保证海森矩阵总是正定的，一旦其不是正定，优化方向就会跑偏，从而使牛顿法失效，也证明了牛顿法的鲁棒性较差。...可以把解决方法限制到box里，是optim中仅有的方法。 SANN method 模拟退火法(simulated annealing)的变种。 特点： 1. 随机算法 2....可以在其他函数中包含 How to use optim ? control options ? components of returned value ?
在撰写本文时，ggplot2涉及在CRAN上的超过2,000个包和其他地方的更多包！在包中使用ggplot2编程增加了几个约束，特别是如果你想将包提交给CRAN。...尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...有时候在开发R包时为了保证正常运行，不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。...如果没有，则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中，而该字节码可能与安装的ggplot2不一致！
json用到的lib包大致有一下几个： commons-logging-1.0.4.jar commons-lang-2.3.jar commons-collections-3.2.jar commons-beanutils...-1.7.0.jar 另外还需要两个单独一点的包 json-lib-2.2.1-jdk15.jar和ezmorph-1.0.4.jar
一年前我写了一篇文章，关于在 R 中估计 GARCH(1, 1) 模型参数时遇到的问题。我记录了参数估计的行为（重点是 β ），以及使用 fGarch 计算这些估计值时发现的病态行为。...我在 R 社区呼吁帮助，包括通过 R Finance 邮件列表发送我的博客文章。 反馈没有让我感到失望。...RMetrics 套件包（包括 fGarch）由 ETH Zürich 的 Diethelm Würtz 教授维护。他在 2016 年的车祸中丧生。 Dr....with R Examples中），所以我非常感谢这个建议。...我将探讨包支持的不同优化程序。我不会像我在第一篇文章中那样画图，这些图只是为了表明存在的问题及其严重性。相反，我将考察由不同优化程序生成的估计器的特性。
问题 你想知道包里有什么。 方案 在一个新的 R 会话中使用 search() 可以查看默认加载的包。...package:ggplot2" "package:car" #> [13] "package:carData" "package:sm" #> [15] "package:stats...[19] "package:datasets" "package:methods" #> [21] "Autoloads" "package:base" 以下提供的函数能够列出包中的函数和对象...showPackageContents <- function(packageName) { # 获取特定包所有内容的列表 funlist <- objects(packageName)...qr.resid qr.solve qr.X quarters quarters.Date quarters.POSIXt quit R_system_version R.home R.Version
ChAMP 包提供了完整的分析illumina甲基化芯片的pipeline, 和普通的Bioconductor 包的安装一样，代码只有简单的两行 source("http://bioconductor.org.../biocLite.R") biocLite("ChAMP") 我用的电脑是windows 操作系统，64位的R-3.4.3，安装过程中除了网速较慢，花费一点时间安装之外，并没有出现任何的问题。...dll 文件就是windows操作系统下的动态链接库，在加载R包的过程中，如果这个R包有对应的动态链接库，那么就会加载进来。...解决方案就是设置环境变量R_MAX_NUM_DLLS, 不管是什么操作系统，R语言对应的环境变量都可以在.Renviron文件中进行设置。...("d:/Documents/.Renviron", mustWork = FALSE) 第一个参数为.Renviron文件的真实路径，然后在加载ChAMP包就可以了 >> Package version
可以证明，在模型2有解的情况下，可以将其化为只含有目标约束的目标规划问题，方法是给所有的绝对约束赋予足够高级别的优先因子，从这个角度来看，线性规划为目标规划的特殊情况，而目标规划则为线性规划的自然推广。...用goalprog包求解目标规划 R中，goalprog包 (Novomestky, 2008) 可以求解形式为模型(3) 的目标规划问题，核心函数为llgp()，用法如下： llgp(coefficients...) 中的矩阵 A。...例 某工厂生产两种产品，受到原材料供应和设备工时的限制，在单位利润等有关数据已知的条件下，要求制定一个获利最大的生产计划，具体数据见表在决策时，按重要程度的先后顺序，要考虑如下意见： 1.原材料严重短缺...该模型符合模型 (3) 的形式，可以直接调用 llgp() 函数来求解该问题，注意：R中根据achievements数据框中的 priority 来判断绝对优先级别，不用再设置 P1，P2，P3。
查看Ubuntu系统以及R版本 cat /etc/issue 通常来说，很多R包的安装对R版本是有要求的，比如BiocManager需要 R (≥ 3.5.0)，但是并不需要最新版R语言。...会删除软件包而保留软件的配置文件r # apt-get purge 会同时清除软件包和软件的配置文件 #然后更新Ubuntu源文件 ## 这里，不同Ubuntu系统有点不一样： cat /etc/issue...r-base-core r-base-dev 使用sudo安装一些必备包 这里只是举例，我比较常用的包，安装非常耗时，一般来说小半天就过去了。...BiocManager::install("scater") BiocManager::install("Seurat") BiocManager::install("monocle") 至于这R包用法...web/packages/Seurat/index.html http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/monocle.html R包安装失败通常是
python与R处理数据都十分方便，不过功能侧重点不是很一样，python作为一种通用型语言用处更加广泛；而R在可视化和统计分析等方面更加方便。...有时候在python的代码中插入R的code会更快捷的实现我们想要的功能，rpy2这个包则可以让我们实现这一功能。...3.在notebook中直接使用 加载rpy2.ipython： %load_ext rpy2.ipython 在cell中调用R： ?...这样就可以实现在jupyter notebook中写python的同时也能写R了！...此外，在python中也可以调用shell命令，一个比较简单的方法是导入os模块来实现，如下所示： import os os.system("ls") # 列出当前文件夹所有的文件 # 输出test文件的内容
安装某些软件包时可能会出现一些问题。一个窍门是打开终端 然后使用sudo命令安装一些软件包， （输入密码后）。...apt-get install r-cran-plyr r-cran-xml r-cran-reshape r-cran-reshape2 r-cran-rmysqlsudo apt-get install...r-cran-rjavasudo apt-get install r-cran-glmnetsudo apt-get build-dep r-cran-bootsudo apt-get build-dep...r-cran-classsudo apt-get build-dep r-cran-clustersudo apt-get build-dep r-cran-codetoolssudo apt-get...apt-get build-dep 然后，在RStudio中，输入 install.packages("RCurl")install.packages("xml")install.packages("
R包安装方法有： 1. 自动安装（在线安装） 在R的控制台,输入install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra 若要指定安装目录 (e.g....手动安装（离线安装） Windows:下载package.zip文件 打开R的菜单栏->Packages->“Install package from local zip file…” ---- 在Rstudio...中也会经常遇到R包安装错误的提示。...以Rstudio中的安装错误为例，给大家做一个本地安装示例。 最近安装tidyverse包遇到过类似的问题： 包找不到啦！ 校验包的大小与下载的包大小不一样！...Github上的R包路径") 2.更新R包列表（Rstudio） 这里仅说明Rstudio中的一键更新功能。
R代码及运行结果如下: ?...lpSolve 包和指派问题 指派问题(assignment problem) 属于0 - 1 整数规划，是一种特殊的整数规划问题。...R中，lpSolve包提供了函数lp.assign() 来求解标准指派问题，其用法如下： lp.assign(cost.mat,direction = "min", presolve = 0, compute.sens...在实际应用中，常会遇到各种非标准形式的指派问题，有时不能直接调用函数，处理方法是将它们化为标准形式(胡运权, 2007)，然后再通过标准方法求解。...同运输问题一样，LINGO 在解决指派问题时，也必须通过各种命令建立数据集、模型、目标函数、约束函数等，比较繁琐，相比之下，R两三句代码就可以快速解决问题，较之LINGO 软件，的确方便快捷了许多。
这是《Bioconductor 中的 R 包安装教程》的第二篇，完整的文章可以点击阅读原文查阅。...以 DiffBind 包为例，DiffBind==3.4.0 是基于 Bioconductor==3.14（对应 R-4.1）开发的；我们在 Bioconductor==3.13（对应 R-4.0）中执行...源码方式安装 如果想要在 Bioconductor==3.13（对应 R-4.0）中安装 DiffBind==3.4.0，可以直接通过源码包的方式安装： > packageurl <- "http://...BiocInstaller 安装 我们以在 R-3.4（Bioconductor==3.6）中安装最新版本的 clusterProfiler 为例。...在 Aanconda2 环境 R==3.4.3 中安装 clusterProfiler，发现package ‘clusterProfile’ is not available (for R version
SAP HANA Modeler中不同类型的包： 如果图片不显示，可以关注公众号SAP Technical 包：包是SAP HANA模型的第一个逻辑存储组件。...在包中，您可以定义一个或多个属性视图，分析视图，计算视图，分析特权，决策表，过程。 1. 结构 -包有助于在逻辑树中组织内容。 2.非结构 - 包含信息对象。非结构是由默认创建的。...结构包装： 让我们创建一个父包“ZS_Australia”和子包“ZS_Australia.NSW” 步骤1： 右键单击Content <New <Package ? 第2步： 输入名称和说明。...如果要将此包作为父包转到“属性”并将“结构包”更改为“是”。默认情况下为“否”。 第三步： 单击“编辑包”。结构：是的。然后单击“确定” ? 第4步： 创建Sub Package NSW。... 在ZS_Australia之后进入NSW。 - >子包。输入名称和描述。 单击确定。 第6步： 这是最终输出。
要想在jupyter notebook中运行R语言其实非常简单，按顺序安装下面扩展包即可： install.package('repr','IRdisplay','evaluate','crayon',...devtools','uuid','digest') library(devtools) install_github("IRkernel/IRkernel") IRkernel::installspec() 在R...中执行上述四行代码，重新打开你的jupyternotebook即可看到对于R的支持标志： ?
1.文档编写目的 ---- 继上一章如何在Redhat中配置R环境后，我们知道对于多数企业来说是没有外网环境的，在离线环境下如何安装R的包，能否搭建R的私有源对R的包进行管理。...本文档主要讲述如何在Redhat中安装R的包及搭建R的私有源。...搭建需要注意，PACKAGES文件中记录了所有包的描述信息，且每个包只有一个版本。...（如果是自己制作的R包，同理在PACKAGES末尾添加包的描述信息也是可行的，未做验证有兴趣的朋友可以验证下告诉Fayson）。...4.配置R使用私有源 ---- 1.在$R_HOME/ lib64/R/etc目录下增加配置文件Rprofile.site 在Rprofile.site文件中增加如下内容： [root@ip-172-31
并且在1.21中完善了windows系统下的extension的bug。...整体看起来效果还是非常不错的，开发者在整体上还是保留了Rstudio和visual studio中对于View()这个函数的配置，还在此基础上添加了search功能，此外对Rshiny可视化的支持也非常棒...▶ pip install radian 四 在R中安装languageserver和jsonlite R LSP client需要借助languageserver实现函数的智能识别，R session.../R/etc路径中 ? 3 勾选vscode-R中的Enable R session watcher ? 4 勾选Bracket Paste与Always Use Active Terminal ?...中运行的话，则会出现R session watcher不启用的状况，data和plot的review窗口则会自动调用自身gui所带的review窗口，以在windows中选择radian.exe路径为例
简介 R文档沟通前两期内容： R沟通｜舍弃Latex，拥抱Rbeamer吧！ R沟通｜制作个性化ppt！...这期主要介绍下如何在Rstudio中运行和使用.tex文件，并给大家安利一个非常nice的模板和根据该模板制作的案例。...使用教程 在ElegantPaper[1]网站中下载整个仓库，可以直接下载到本地github或者下载压缩包。 ?...解压压缩包，找到主要的.tex文件（比如这里的中文文件cn），通过Rstudio打开。 ? 点击Compile PDF即可得到模板对应的paper了。 ? ?...>> 当然该模板也有很多别人使用，制作后的文章和文件都在github中： Risk Awareness（风险意识）文档说明[3] Bank Custody （银行存管）说明[4
一、通过install.packages安装 步骤： 1、在R中先装rJava包 install.packages(“rJava”) 2、没有装JDK的要到这里去下载： http://www.Oracle.com...完成以上几步后，开始装Rwordseg包： install.packages(“Rwordseg”, repos = “http://R-Forge.R-project.org“) 4、library...如果您的电脑或者目前正在使用的R版本实在无法通过install.packages的在线方式安装Rwordseg包。...当然不用苦恼，有更便捷的方式，就是直接下载Rwordseg的zip包，在R中加载zip包进行离线安装，只需几秒钟即可。...方法：在程序包中选择(install packages from local files)，离线安装zip包即可。 ? 我将Rwordseg的压缩包上传至了资源中，大家可以下载进行离线安装。
如何使用ry2 （1）在Python中加载R软件包 需要用到robjects中的packages里面的importr函数，我们以R中的stats包和ggplot2包为例，ggplot2是R中超级强大的绘图包...当然，需要先在R软件中加载这两个包。 ? （2）访问R实例 需要用到robjects.r，它是在Python中的嵌入式R进程，把r当作从python走向R的通道来看就可以了。...example1： 得到下面的结果： example2:利用R的ggplot2包绘图 得到如下结果： （6）调用R的stats包进行方差分析 得到如下结果： ?...总结 本文主要介绍了利用rpy2包在Python中访问R语言包和函数，其中最重要的子包是robjects，可以生成R中的数据结构；最重要的实例是rojects.r(' ')，可以通过三种方式访问R中的数据和函数...，甚至可以利用其在Python中进行R编程；最重要的函数是importr(' ')，它可以加载所有R语言中安装的包。
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