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R语言Rcpp加速Metropolis-Hastings抽样估计贝叶斯逻辑回归模型参数

p=6690 最近一篇文章,我描述了一个Metropolis-in-Gibbs采样器,用于估计贝叶斯逻辑回归模型参数。 这篇文章就此问题进行了研究,以展示Rcpp如何帮助克服这一瓶颈。...TLDR:只需用C ++编写log-posterior而不是矢量化R函数,我们就可以大大减少运行时间。 我模拟了模型数据: ?...前者使用对数后验编码作为向量化R函数。后者使用C ++(log\_post.cpp)log-posterior编码,并使用Rcpp编译成R函数。...Armadillo库对C ++矩阵和向量类很有用。 ---- 因此,每次迭代,提出了系数向量。下面红线表示链,表示生成数据参数值。...平均接受概率采样运行收敛到约20%。 那么Rcpp实现与R实现相比如何呢?Rcpp运行时间明显较低。

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Dubbo,模板方法模式 真6!

请参考文章:快速掌握模板方法模式 Dubbo 是阿里开源框架,后面捐献给了Apache,所以现在都叫Apache Dubbo,但是日常,很多人也更喜欢简称Dubbo。...我们可以使用上面的这种方式去Dubbo,只要有类似的,那就是模板方法模式Dubbo中使用。...一个截面上碰撞概率高,但调用量越大分布越均匀,而且按概率使用权重后也比较均匀,有利于动态调整提供者权重。 轮循,按公约后权重设置轮循比率。...: 这不就是所谓模板方法模式Dubbo使用场景之一么?...我们在看源码时候,只要看到上面的通用代码模板类似的,我们就可以认为这就是模板方法模式Dubbo应用。

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Linux分区或逻辑创建文件系统方法

前言 学习在你系统创建一个文件系统,并且长期或者非长期地挂载它。 计算技术,文件系统控制如何存储和检索数据,并且帮助组织存储媒介文件。...文件系统通过为存储数据文件提供名称,并且文件系统磁盘上维护文件和目录表以及它们开始和结束位置、总大小等来帮助管理所有的这些信息。... Linux ,当你创建一个硬盘分区或者逻辑卷之后,接下来通常是通过格式化这个分区或逻辑卷来创建文件系统。...这个操作方法假设你已经知道如何创建分区或逻辑卷,并且你希望将它格式化为包含有文件系统,并且挂载它。...上面的挂载命令使用设备名称是 /dev/sda1 。 blkid 命令 UUID 编码替换它。注意, /mnt 下一个被新创建目录挂载了 /dev/sda1 。

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PHP中使用SPL库对象方法进行XML与数组转换

PHP中使用SPL库对象方法进行XML与数组转换 虽说现在很多服务提供商都会提供 JSON 接口供我们使用,但是,还是有不少服务依然必须使用 XML 作为接口格式,这就需要我们来对 XML...今天,我们介绍是使用 SPL 扩展库一些对象方法来处理 XML 数据格式转换。首先,我们定义一个类,就相当于封装一个操作 XML 数据转换类,方便我们将来使用。...我们客户端生成了 SimpleXMLIterator 对象,并传递到 xmlToArray() 方法。...因为 phpToXml() 方法是需要递归调用每次递归时候我们不需要重新去创建根结点,只需要在根结点下面使用 addChild() 添加子结点就可以了。...测试代码: https://github.com/zhangyue0503/dev-blog/blob/master/php/202009/source/PHP中使用SPL库对象方法进行XML与数组转换

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R地图上绘制网络图三种方法

作者:严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物信息学方向)伪码农,R语言爱好者,爱开源 地理网络图与传统网络图不同,当引用地理位置进行节点网络可视化时,需要将这些节点放置地图上,然后绘制他们之间连结...首先准备需要R包,当需要一次性加载多个R包时,我们可以利用pacman,它整合了library包一些相关函数,利用pacman包p_load函数可以自动加载需要R包,如果没有找到则会自动安装缺失...这里介绍一个技巧,我们可以将绘图代码放置(),运行一句命令即可将图形显示在你RStudio,而不需要再次运行p_base。...下面创建第一个需要覆盖地图上图层——各节点之间连线(edges)。...之后还需要手动多次调整p_edges和p_nodes垂直方向上位置。

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Win10中使用Linux版本R和Python

“ 想象一下,你 Linux 版本 Tensorflow 建立了一个美妙 RNN 模型,然后无缝切换到 Windows Excel 直接编辑结果,画了一幅 fancy 图给你老板。...” 写 在前面 相信Windows中使用 Python 和 R 小伙伴为数不少,虽然 Python 和 R 并不挑平台,但是总还有一些情况 Linux 版本更有优势,这些情况包括: R Linux...中使用并行计算包 Parallel 更快,因为 R 可以直接调用 Linux 内核 fork 功能复制 N 个“一摸一样”线程,但是 Window ,fork 并不被支持,想要创建多线程,就必须先创建一个主线程...” Okay,那就让我们直接进入正题:和在Win10中使用Linux版本R和Python 启用 Linux 子系统 1.... Linux 命令行输入 jupyter lab,然后 Windows 中使用浏览器打开 locolhost:8888(默认端口为8888)。如果你 Linux 命令行出现类似信息: ?

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R语言最优化应用】goalprog包求解 线性目标规划

标规划问题及其数学模型 目标规划(goal programming) 是运筹学一个重要分支,它是为解决多目标决策问题而发展起来一种数学方法。...目标规划可以按照确定若干目标值及其实现优先次序,在给定约束条件下寻找偏离目标值最小数学方法。...可以证明,模型2有解情况下,可以将其化为只含有目标约束目标规划问题,方法是给所有的绝对约束赋予足够高级别的优先因子,从这个角度来看,线性规划为目标规划特殊情况,而目标规划则为线性规划自然推广。...goalprog包求解目标规划 R,goalprog包 (Novomestky, 2008) 可以求解形式为模型(3) 目标规划问题,核心函数为llgp(),用法如下: llgp(coefficients...该模型符合模型 (3) 形式,可以直接调用 llgp() 函数来求解该问题,注意:R根据achievements数据框 priority 来判断绝对优先级别,不用再设置 P1,P2,P3。

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【视频】R语言逻辑回归(Logistic回归)模型分类预测病人冠心病风险|数据分享|附代码数据

本文介绍了逻辑回归并在R语言中用逻辑回归(Logistic回归)模型分类预测病人冠心病风险数据逻辑回归是机器学习借用另一种统计分析方法。当我们因变量是二分或二元时使用它。...规则是逻辑回归值必须在 0 和 1 之间。由于它不能超过值 1 限制,图形上它会形成一条“S”形曲线。这是识别 Sigmoid 函数或逻辑函数简单方法。关于逻辑回归,使用概念是阈值。...、决策树、随机森林分析心脏病数据并高维可视化R语言基于树方法:决策树,随机森林,Bagging,增强树R语言逻辑回归、决策树和随机森林对信贷数据集进行分类预测spss modeler决策树神经网络预测...ST股票R语言中使用线性模型、回归决策树自动组合特征因子水平R语言中自编基尼系数CART回归决策树实现R语言rle,svm和rpart决策树进行时间序列预测pythonScikit-learn...)算法进行回归、分类和动态可视化如何用R语言机器学习建立集成模型?

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【视频】R语言逻辑回归(Logistic回归)模型分类预测病人冠心病风险|数据分享

本文介绍了逻辑回归并在R语言中用逻辑回归(Logistic回归)模型分类预测病人冠心病风险数据逻辑回归是机器学习借用另一种统计分析方法。当我们因变量是二分或二元时使用它。...规则是逻辑回归值必须在 0 和 1 之间。由于它不能超过值 1 限制,图形上它会形成一条“S”形曲线。这是识别 Sigmoid 函数或逻辑函数简单方法。关于逻辑回归,使用概念是阈值。...、决策树、随机森林分析心脏病数据并高维可视化R语言基于树方法:决策树,随机森林,Bagging,增强树R语言逻辑回归、决策树和随机森林对信贷数据集进行分类预测spss modeler决策树神经网络预测...ST股票R语言中使用线性模型、回归决策树自动组合特征因子水平R语言中自编基尼系数CART回归决策树实现R语言rle,svm和rpart决策树进行时间序列预测pythonScikit-learn...)算法进行回归、分类和动态可视化如何用R语言机器学习建立集成模型?

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【视频】R语言逻辑回归(Logistic回归)模型分类预测病人冠心病风险|数据分享|附代码数据

本文介绍了逻辑回归并在R语言中用逻辑回归(Logistic回归)模型分类预测病人冠心病风险数据逻辑回归是机器学习借用另一种统计分析方法。当我们因变量是二分或二元时使用它。...规则是逻辑回归值必须在 0 和 1 之间。由于它不能超过值 1 限制,图形上它会形成一条“S”形曲线。这是识别 Sigmoid 函数或逻辑函数简单方法。关于逻辑回归,使用概念是阈值。...、决策树、随机森林分析心脏病数据并高维可视化R语言基于树方法:决策树,随机森林,Bagging,增强树R语言逻辑回归、决策树和随机森林对信贷数据集进行分类预测spss modeler决策树神经网络预测...ST股票R语言中使用线性模型、回归决策树自动组合特征因子水平R语言中自编基尼系数CART回归决策树实现R语言rle,svm和rpart决策树进行时间序列预测pythonScikit-learn...)算法进行回归、分类和动态可视化如何用R语言机器学习建立集成模型?

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【视频】R语言逻辑回归(Logistic回归)模型分类预测病人冠心病风险|数据分享|附代码数据

本文介绍了逻辑回归并在R语言中用逻辑回归(Logistic回归)模型分类预测病人冠心病风险数据逻辑回归是机器学习借用另一种统计分析方法。当我们因变量是二分或二元时使用它。...规则是逻辑回归值必须在 0 和 1 之间。由于它不能超过值 1 限制,图形上它会形成一条“S”形曲线。这是识别 Sigmoid 函数或逻辑函数简单方法。关于逻辑回归,使用概念是阈值。...、决策树、随机森林分析心脏病数据并高维可视化R语言基于树方法:决策树,随机森林,Bagging,增强树R语言逻辑回归、决策树和随机森林对信贷数据集进行分类预测spss modeler决策树神经网络预测...ST股票R语言中使用线性模型、回归决策树自动组合特征因子水平R语言中自编基尼系数CART回归决策树实现R语言rle,svm和rpart决策树进行时间序列预测pythonScikit-learn...)算法进行回归、分类和动态可视化如何用R语言机器学习建立集成模型?

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R语言最优化应用】Rdonlp2 包求解光滑非线性规划

矩阵和向量来表示非线性函数数学模型如下: (4) 模型 (4) ,z = f(x) 为目标函数,三个约束条件,第一个为定义域约束,第二个为线性约束 (A为系数矩阵),第三个为非线性约束。... Rdonlp2 包求解光滑非线性规划 对于无约束或者约束条件相对简单非线性优化问题,stats 包 optim()、optimize()、constrOptim()、nlm()、nlminb...()等函数可以完美地解决,并且它们使用方法相当简单。...鉴于该包为默认安装包,大多数人比较熟悉,下面着重探讨专门解决非线性优化 Rdonlp2 包用法。 R,Rdonlp2包是一个非常强大包,可以方便快速地解决光滑非线性规划问题。...),这方法同样适合于下面要说非线性约束条件控制。

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详解线性回归、朴素贝叶斯、随机森林R和Python实现应用!(附代码)

主要学习R语言和Python这些算法理论和实现应用。 谁能从这篇指南中获益最多? 本文要讲内容,可能是作者写过最有价值指南了。...这就是线性回归实际生活应用例子。这个孩子实际上已经发现了身高、体型与体重之间有一定关系,此关系类似于上面的等式。...现在,你可以试着通过以下链接编码窗口Python来构建自己线性回归模型了: https://id.analyticsvidhya.com/auth/login/?...然而,如果题目是一道五年级历史题,你只有30%可能性会回答正确。这就是逻辑回归能提供给你。 从数学上看,结果机率对数使用是预测变量线性组合模型。 p是兴趣特征出现概率。.../ Python 代码: R 语言代码: 如果你了解R语言中Caret包的话,以下是实现LightGBM快速方法

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Python正则化Lasso、岭回归预测房价、随机森林交叉验证鸢尾花数据可视化2案例

另一种简化模型方法是通过正则化向模型添加偏差。正则化是什么,为什么我们需要它?正则化技术机器学习模型开发起着至关重要作用。尤其是复杂模型,如神经网络,容易过拟合训练数据。...执行L2正则化时,我们损失函数添加正则化项是所有特征权重平方和:L2正则化返回解决方案是非稀疏,因为权重不会为零(尽管某些权重可能接近于0)。...----最受欢迎见解1.R语言多元Logistic逻辑回归 应用案例2.面板平滑转移回归(PSTR)分析案例实现3.matlab偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)4.R语言泊松Poisson...回归模型分析案例5.R语言回归Hosmer-Lemeshow拟合优度检验6.r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和Elastic Net模型实现7.R语言中实现Logistic逻辑回归8.python...线性回归预测股票价格9.R语言如何在生存分析与Cox回归中计算IDI,NRI指标

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(数据科学学习手札58)R处理有缺失值数据高级方法

一、简介   实际工作,遇到数据带有缺失值是非常常见现象,简单粗暴做法如直接删除包含缺失值记录、删除缺失值比例过大变量、0填充缺失值等,但这些做法会很大程度上影响原始数据分布或者浪费来之不易数据信息...,因此怎样妥当地处理缺失值是一个持续活跃领域,贡献出众多巧妙方法不浪费信息和不破坏原始数据分布上试图寻得一个平衡点,R中用于处理缺失值包有很多,本文将对最为广泛被使用mice和VIM包中常用功能进行介绍...: 因为mice绝大部分方法拟合方式以含缺失值变量之外其他变量为自变量,缺失值为因变量构建回归或分类模型,以达到预测插补目的,而参数predictorMatrix则用于控制在对每一个含缺失值变量插补过程作为自变量有哪些其他变量..."" "" "" ""   可以看到对应缺失变量Ozone和Solar.R插补拟合方法为pmm,下面我们把它们改成CART决策树回归: #将变量Ozone插补方法从pmm...mice函数输出结果 action: 当只希望从合成出m个数据框取得某个单独数据框时,可以设置action参数,如action=3便代表取得m个数据框第3个 mild: 逻辑型变量,当为TRUE

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python接口测试:一个例文件调用另一个例文件定义方法

简单说明 进行接口测试时,经常会遇到不同接口间传递参数情况,即一个接口某个参数需要取另一个接口返回值; 平常写脚本过程,我经常会在同一个py文件,把相关接口调用方法都写好,这样同一个文件能够很方便进行调用...,需要调整很多地方; 所以,当我们一个例py文件写好某个接口调用方法,后续如果在其他py文件也要用到这个接口返回值,则直接引用先前py文件定义好接口调用方法即可。...:CreateActivity, 继承自unittest.TestCase 然后setUp方法中进行了一些必要初始化工作 最后创建了一个名为push_file_download方法,它作用就是调某个接口...………… except Exception as e: logger.error("例执行错误信息:%r", e) print("例执行错误信息...,当跨例文件进行调用某个方法时,需要看下这个方法是否依赖于其他方法,如果有依赖的话,则需要先调用其将依赖方法

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