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R语言在RCT中调整基线时对错误指定的稳健性

p=6400 众所周知，调整一个或多个基线协变量可以增加随机对照试验中的统计功效。...调整分析未被更广泛使用的一个原因可能是因为研究人员可能担心如果基线协变量的影响在结果的回归模型中没有正确建模，结果可能会有偏差。 建立 我们假设我们有关于受试者的双臂试验的数据。...我们让表示受试者是否被随机分配到新治疗组或标准治疗组的二元指标。在一些情况下，基线协变量可以是在随访时测量的相同变量（例如血压）的测量值。...错误指定的可靠性 我们现在提出这样一个问题：普通最小二乘估计是否是无偏的，即使假设的线性回归模型未必正确指定？答案是肯定的 。...我们进行了三次分析：1）使用lm（）进行未经调整的分析，相当于两个样本t检验，2）调整后的分析，包括线性，因此错误指定结果模型，以及3）正确的调整分析，包括线性和二次效应。

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R中优雅的处理长标签文本

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝在使用ggplot2包绘制图形时，若轴文本标签过长则非常难受需要经过处理才能完美的嵌合图形。...本次来介绍了两种处理长标签的方法，希望对各位观众老爷有所帮助，可根据自己的数据需求选择合适的解决方案。...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(patchwork) 创建数据 df <- tibble( x = c("This is a *very &……longggggg...ANOTHER incredibly long long long long label"), y = c(10, 20, 30) ) 使用scale_x_discrete ❝这种方法直接在坐标轴设置中处理长标签...优点:灵活性高，可以进行更复杂的文本操作,易于扩展到其他类型的图表或分析。 缺点:代码稍显复杂,修改了数据结构，增加了新的列。

14110
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免疫浸润结果可视化

免疫浸润结果可视化 在之前的推文中我们介绍了2行代码实现9种免疫浸润方法，今天给大家介绍下常见的免疫浸润结果的可视化。 就以大家最常见的cibersort为例进行介绍。...首先大家要对每种免疫浸润方法的结果有一个大体的认知，比如cibersort的结果是各种免疫细胞在样本中的比例，所以一个样本中所有的免疫细胞比例加起来总和是1！ 但是ssGSEA就不是这样了。...P值，所以我知道大家想自己画的更加花里胡哨一点，在很久之前我就介绍过了这个方法了：R语言ggplot2画相关性热图 画图前先准备下数据，把P值数据和相关系数数据整合到一起，所以借助linkET包也是有缺点的...element_blank(), panel.background=element_blank()) ggsave("df_cor.png",height = 4,width = 9) # 保存时不断调整长宽比即可得到满意的图形...element_text(color="black",size = 14), axis.text.y = element_text(color = text_color,size = 14)#给标签上色没想到特别好的方法

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Canonical 标签以及在 WordPress 中的应用

Canonical 标签，中文叫做 URL 范式，是 Google，雅虎，微软等搜索引擎在2009年一起推出的一个标签（百度在2013年也终于支持），它主要用来解决由于 URL 形式不同而造成的重复内容的问题...，都是“Canonical 标签以及在 WordPress 中的应用”这篇日志的内容，对于搜索引擎来说，这样两个不同的 URL 是无法判断是同一篇日志的，搜索引擎为了更多收录内容，就会同时收录这两个链接...); 因此 WordPress 是调用 rel_canonical() 这个函数来输出 rel="canonical" 标签的 HTML 代码。...标签，而又没有在 WordPress 中屏蔽默认的 filter 的话，则会输出重复的 Canonical 标签。...个人建议使用 WordPress 默认输出的 Canonical 标签已经足够了。 ----

86320

R语言调整随机对照试验中的基线协变量

参与者被随机分配到两个（有时更多）的群体这一事实确保了，至少在期望中，两个治疗组在测量的，重要的是可能影响结果的未测量因素方面是平衡的。...即使在各组之间的某些基线变量出现不平衡的情况下也是如此。这是因为偏差被定义为估计量（由我们的统计程序给出，如线性回归）是否在重复样本中具有等于目标参数的期望。...有时估计值会高于真实值，有时低于真实值，但只要平均值等于目标值，我们就会说估算值是无偏见的。 协变量调整 现在让我们考虑调整一个或多个基线协变量，在我们的分析中随机化时。...通过调整X获得的估计值更接近真实值1，并且标准误差更小，表明更精确的估计。通过调整协变量获得的精确度取决于协变量和结果之间的相关性的强度。...该回归模型假设Y的平均值线性地取决于X，并且该关系的斜率在两组中是相同的。无法保证这些假设在任何特定研究中都能成立。因此，如果这些假设不成立，我们可能会担心使用协变量调整分析。

1.6K10

在pytorch中动态调整优化器的学习率方式

在深度学习中，经常需要动态调整学习率，以达到更好地训练效果，本文纪录在pytorch中的实现方法，其优化器实例为SGD优化器，其他如Adam优化器同样适用。...一般来说，在以SGD优化器作为基本优化器，然后根据epoch实现学习率指数下降，代码如下: step = [10,20,30,40] base_lr = 1e-4 sgd_opt = torch.optim.SGD...output_x 将文本转换为数值形式 def trans_num(word2idx,text): text_list=[] for i in text: s=i.rstrip().replace('\r'...，后续导入到LSTM模型中 def establish_word2vec_matrix(model): #负责将数值索引转为要输入的数据 word2idx = {"_PAD": 0} # 初始化 `[.../extract_model.pkl')#加载保存好的模型 pred_val_y=w_extract(val_x).argmax(dim=2) 以上这篇在pytorch中动态调整优化器的学习率方式就是小编分享给大家的全部内容了

1.3K21

在vscode中配置R的开发环境

并且在1.21中完善了windows系统下的extension的bug。...整体看起来效果还是非常不错的，开发者在整体上还是保留了Rstudio和visual studio中对于View()这个函数的配置，还在此基础上添加了search功能，此外对Rshiny可视化的支持也非常棒...▶ pip install radian 四 在R中安装languageserver和jsonlite R LSP client需要借助languageserver实现函数的智能识别，R session...的配置 Path中添加R的执行文件的路径，当然也可以选择radian.exe的路径（该路径存在于python的scripts文件夹中）。...中运行的话，则会出现R session watcher不启用的状况，data和plot的review窗口则会自动调用自身gui所带的review窗口，以在windows中选择radian.exe路径为例

11.3K20

数学相关函数在PHP中的应用简介

数学相关函数在PHP中的应用简介 对于数学计算来说，最常见的其实还是我们使用各种操作符的操作，比如说 +加、-减 之类的。当然，PHP 中也为我们提供了一些可以方便地进行其他数学运算的操作函数。...var_dump(mt_getrandmax()); // int(2147483647) var_dump(mt_rand()); var_dump(mt_rand(5, 15)); mt_ 开头的这三个随机数相关的函数在使用上和普通的...它产生随机数的平均速度比 rand() 快四倍，这是官方文档中说的，而且，mt_rand() 在文档中也说了是非正式用来替换 rand() 函数的。...前面带 a 的都是对应三角函数的反函数，后面带 h 的都是对应三角函数的双曲函数，又带 a 又带 h 的就是反双曲函数了。 在最后两段测试代码中，我们的数据出现了 NAN 这种情况。...测试代码： https://github.com/zhangyue0503/dev-blog/blob/master/php/202012/source/9.数学相关函数在PHP中的应用简介.php 参考文档

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DECLARE在SQL中的用法及相关等等

大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 允许用户创建游标， 用于在一个大的查询里面检索少数几行数据。...变量是在批处理或过程的主体中用 DECLARE 语句声明的，并用 SET 或 SELECT 语句赋值。游标变量可使用此语句声明，并可用于其他与游标相关的语句。...在表中添加新行时，SQL Server 将为列提供一个唯一的增量值。标识列通常与 PRIMARY KEY 约束一起用作表的唯一行标识符。...* 如果当前没有给游标变量分配游标，则可在 EXECUTE 语句中作为输出游标参数的目标引用。 * 应被看作是指向游标的指针。有关游标变量的详细信息，请参阅 Transact-SQL 游标。...在它后面的两个 SELECT 语句返回 @MyTableVar 中的值以及 Employee 表中更新操作的结果。

2.7K20

【R语言】因子在临床分组中的应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子（factor） 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。 我们还是以TCGA数据中的CHOL（胆管癌）这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper...☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 接下来我们先读入临床数据 #读取临床数据 clin=read.table("clinical.tsv...参考资料： ☞【R语言】R中的因子（factor） ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper ☞R生成临床信息统计表...☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub

3.2K21

在vue中的html标签{{}}内可以调用函数方法

今天领导提个需求，要求在金额上强制保留两位小数，本想着后台直接返回数据时，带着两位的小数，前端只是做个显示作用，后台说保留了小数但在传输过程中去掉了，可能他们做了格式转化。...没办法了只能又是我们前端操作了，牵扯价钱的太多了，很多时候又有for 循环，怎么办呢？ 思路：{{}}里面的是一个表达式，可不可以是个函数呢？...经测试是可以的，具体实现方法如下： 写一个公共的强制保留两位小数的js方法 function toDecimal2 (x) { var f = parseFloat(x) if (isNaN(f....' } while (s.length <= rs + 2) { s += '0' } return s } export default { toDecimal2 } 在main.js...中引用： import newPrice from '.

30.3K20

深度 | 在 R 中估计 GARCH 参数存在的问题

在原假设下，滚珠轴承的平均直径不会改变，而在备择假设中，在制造过程中的某些未知点处，机器变得未校准并且滚珠轴承的平均直径发生变化。然后，检验在这两个假设之间做出决定。...下面是一个辅助函数，用于通过 garchFit()（在计算过程中屏蔽所有 garchFit() 的输出）来提取特定拟合的系数和标准差。...我在本文中强调的问题让我更加意识到选择在优化方法中的重要性。我最初的目标是编写一个函数，用于根据 GARCH 模型中的结构性变化执行统计检验。...这是一个我自认知之甚少的主题，如果 R 社区中的某个人已经观察到了这种行为并且知道如何解决它，我希望他们会在评论或电子邮件中告诉我。...我之前从未怀疑或质疑过统计软件的计算结果，甚至没有考虑过这个问题。今后在处理其他统计模型的参数估计问题时，务必首先用模拟数据检验一下相关软件的结果稳健性。

6.5K10

R8在Android手Q中的应用

，将AppView中DexClass集合转成dex文件输出。...三、R8在手Q应用中遇到的问题3.1 Liveness Analyze过程—根可达性算法在介绍补丁问题前，先简单介绍Liveness Analyze过程，后面的几个问题都和Liveness Analyze...理解根可达性算法前需要先理解四个概念：1、Root: 在proguard 配置文件中明确要keep的对象，算法的输入。...根可达性算法伪代码如下：图片3.2 和Liveness Analyze过程相关的问题手q中和Liveness Analyze过程相关的问题主要有两个补丁Diff问题和主dex严重超标问题，下面一一分析。...在使用R8过程中，我们发现同样的代码，构建多次，高概率出现不正常的dexDiff，具体表现如下：IDragview 的clinit方法有时候存在，有时不存在，导致生成的补丁不稳定。

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TidyFriday Excel 用户的福音！在 R 中实现 Excel 的功能

许多 R 的新用户在金融、市场、商业分析等领域有丰富的行业经验，但是他们并没有太多的编程背景，所以日常工作中还是选择 Excel、PowerBI 这些传统的工具进行工作；tidyquant 的作者意识到了这些痛点...(tidyverse) library(tidyquant) library(knitr) 在 R 中实现透视表 很多 Excel 的用户青睐它的数据透视表功能，现在 R 也可以通过 pivot_table...R 中实现 VLOOKUP Excel 中另一个强大的函数是 VLOOKUP，VLOOKUP 的主要功能如下： ?...company) [1] "Amazon" 不过我们在 Excel 中使用 VLOOKUP 是想在一个表中添加列，这列的值要去另一个表中查找， 在 R 中怎么做呢？...在 R 中实现各种「IFS」函数 很多同学喜欢 Excel 是因为它的条件筛选功能，比如SUMIFS(), COUNTIFS(), AVERAGEIFS()等； ? 在 R 中如何实现呢？

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